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滇水金凤花距发育相关基因MADS-EJ2和MADS2的克隆及表达分析
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作者 王天野 杨梦情 +3 位作者 马慧 梁光容 黄美娟 黄海泉 《山东农业科学》 北大核心 2025年第9期1-8,共8页
E类MADS-box转录因子基因SEPALLATA(SEP)-like在花器官发育方面发挥着重要作用。为了探究基因SEP-like在滇水金凤(Impatiens uliginosa)花距发育中的功能,本研究成功克隆出基因MADS-EJ2和MADS2,分别命名为IuMADS-EJ2和IuMADS2,其cDNA全... E类MADS-box转录因子基因SEPALLATA(SEP)-like在花器官发育方面发挥着重要作用。为了探究基因SEP-like在滇水金凤(Impatiens uliginosa)花距发育中的功能,本研究成功克隆出基因MADS-EJ2和MADS2,分别命名为IuMADS-EJ2和IuMADS2,其cDNA全长均为762 bp,编码253 aa。生物信息学分析表明,IuMADS-EJ2为亲水性稳定蛋白,IuMADS2为亲水性不稳定蛋白,二者均含MIKC结构,在C-端都有其亚家族特异的SEPⅠ和SEPⅡ基序,均为E类基因;亚细胞定位预测IuMADS-EJ2和IuMADS2均定位在细胞核。IuMADS-EJ2和IuMADS2的氨基酸序列与喜马拉雅凤仙花的同源序列相似性分别为98.03%和95.26%。qRT-PCR分析表明,两基因在滇水金凤花距发育的3个时期及2个不同部位均有表达,IuMADS-EJ2在花苞期距部的表达量最高,IuMADS2在花苞期檐部的表达量最高,推测两基因调控花距发育且主要在花距发育初期发挥作用。本研究结果可为凤仙花花距发育分子机制解析、花形改良和新品种培育提供一定的基础数据和理论依据。 展开更多
关键词 滇水金凤 花距发育 madS-EJ2基因 madS2基因 生物信息学分析 表达分析
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Ⅰ型MADS-box基因SlMADS79调控番茄株型的功能研究
2
作者 郭绪虎 李灵芝 +2 位作者 李凤 马博岩 贾晓宇 《作物学报》 北大核心 2025年第4期982-991,共10页
MADS-box基因在植物生长发育全过程中具有重要调控功能。目前,关于番茄Ⅱ型MADS-box基因的功能研究较多,而Ⅰ型MADS-box基因却鲜有报道。本研究克隆了Ⅰ型MADS-box基因SlMADS79,该基因在番茄根、叶和侧芽中表达水平相对较高,推测其可能... MADS-box基因在植物生长发育全过程中具有重要调控功能。目前,关于番茄Ⅱ型MADS-box基因的功能研究较多,而Ⅰ型MADS-box基因却鲜有报道。本研究克隆了Ⅰ型MADS-box基因SlMADS79,该基因在番茄根、叶和侧芽中表达水平相对较高,推测其可能参与番茄营养器官生长调控。本研究以经典番茄栽培品种Ailsa Craig(AC^(++))为背景材料,采用RNA干扰技术沉默SlMADS79基因。与野生型相比,SlMADS79基因沉默株系顶端优势度降低、植株矮小;叶片的长度、宽度、周长以及面积均小于野生型植株;根系总长度、总表面积、总投影面积、根系体积、分叉数、根尖数均显著减少。解剖学研究表明,沉默植株茎秆的纵切面细胞较小,然而其平均数量明显增加。在激素水平上,SlMADS79沉默株系中IAA(吲哚-3-乙酸)、TZR(转玉米素核糖苷)以及CS(栗木甾酮)含量降低。在分子水平上,生长素应答基因IAA3和赤霉素合成基因GA3ox1在SlMADS79沉默株系中显著下调,而细胞周期基因CyCA3;1在沉默株系中显著上调。本研究从形态、解剖、激素和分子水平上进一步解析了SlMADS79基因的生物学功能,丰富了番茄Ⅰ型MADS-box基因家族的研究,为番茄株型调控研究提供了可靠的理论依据。 展开更多
关键词 番茄 madS-BOX SlmadS79 株高 叶片形态 根系
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基于TGF-β1/Smads信号通路研究消痰通腑方防治放射性肺损伤的作用机制
3
作者 石变 褚俊峰 +2 位作者 李秋荐 王歌 刘怀民 《中医研究》 2025年第2期73-78,共6页
目的:研究消痰通腑方通过转化生长因子(transforming growth factor,TGF)-β1/Sma和Mad相关蛋白(Sma and Mad related proteins Smads)通路治疗放射性肺损伤(radiation-induced lung injury,RILI)的作用机制。方法:将24只雄性SD大鼠随... 目的:研究消痰通腑方通过转化生长因子(transforming growth factor,TGF)-β1/Sma和Mad相关蛋白(Sma and Mad related proteins Smads)通路治疗放射性肺损伤(radiation-induced lung injury,RILI)的作用机制。方法:将24只雄性SD大鼠随机分为空白组、模型组和消痰通腑方组,每组8只。空白组予佯装照射,其余各组均采用6 MeV的X射线20 Gy单次照射全肺建立RILI大鼠模型。消痰通腑方组自造模前两周灌胃消痰通腑方,空白组和模型组分别灌胃等量生理盐水,1次/d,连续4周。苏木素-伊红染色法观察肺组织病理形态改变;酶联免疫吸附法检测血清白细胞介素(interleukin,IL)-1β、IL-6、IL-10、高迁移率族蛋白(high mobility group protein,HMG)B1、转化生长因子(transforming growth factor,TGF)-β1含量;实时定量聚合酶链反应检测肺组织中IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1、TGF-β1、Smad2、Smad3 mRNA表达水平;Western blot法检测肺组织中TGF-β1、Smad2、Smad3蛋白表达水平。结果:与空白组对比,模型组大鼠肺组织颜色晦暗伴肿胀充血、肠组织表面粗糙伴肠长缩短与肠重增加,肺组织病理发生炎性浸润及纤维化改变,血清IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1、TGF-β1含量增加(P<0.01),肺组织IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1 mRNA表达水平升高(P<0.05或P<0.01),TGF-β1、Smad2和Smad3的mRNA、蛋白表达水平均升高(P<0.01);与模型组对比,消痰通腑方组大鼠肺组织仅有轻微充血并伴整体病理损伤减轻、肠组织表明粗糙水肿程度减轻并伴肠长增加与肠重减轻,血清IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1、TGF-β1含量降低(P<0.01),肺组织IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1 mRNA表达水平下降(P<0.05或P<0.01),TGF-β1、Smad2和Smad3的mRNA、蛋白表达水平下降(P<0.05或P<0.01)。结论:消痰通腑方对放射性肺损伤大鼠具有防治作用,其机制可能与抑制TGF-β1/Smads信号通路活化、减轻炎症反应有关。 展开更多
关键词 放射性肺损伤 消痰通腑方 转化生长因子-Β1 Sma和mad相关蛋白 TGF-β1/Smads通路 炎症
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甘草酸对四氯化碳肝纤维化大鼠肝组织smad2免疫组织化学表达的影响 被引量:6
4
作者 周朝晖 蔡瑜 +2 位作者 沈锡中 朱腾方 王吉耀 《肝脏》 2006年第1期35-36,共2页
关键词 免疫组织化学方法 肝纤维化大鼠 甘草酸 Smad2 四氯化碳 肝组织 肝星状细胞激活 转化生长因子 Smad蛋白 mad2蛋白
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MADS-box转录因子家族基因对植物非生物胁迫的响应研究进展 被引量:1
5
作者 田诗 金钏 +3 位作者 刘亚杰 王雪松 张军保 刘丽杰 《高师理科学刊》 2025年第3期80-85,共6页
植物生长发育过程中会遇到多种逆境因素的影响,包括生物胁迫和非生物胁迫.研究表明,MADS-box转录因子可参与调控植物的非生物胁迫反应,对植物的生长发育起到重要作用.综述了MADS-box转录因子响应干旱胁迫、温度胁迫、盐胁迫以及其它非... 植物生长发育过程中会遇到多种逆境因素的影响,包括生物胁迫和非生物胁迫.研究表明,MADS-box转录因子可参与调控植物的非生物胁迫反应,对植物的生长发育起到重要作用.综述了MADS-box转录因子响应干旱胁迫、温度胁迫、盐胁迫以及其它非生物胁迫的研究进展,进一步分析了MADS-box转录因子家族基因的研究前景,即MADS-box基因应对非生物胁迫的信号通路,对各种胁迫之间相关基因的关系进行深入分析,从而更好地阐释各基因的功能,为作物抗逆新品种的培育奠定基础. 展开更多
关键词 madS-box转录因子 非生物胁迫 植物
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多花黄精MADS-box基因家族的鉴定及其在一个天然不育系中的表达分析
6
作者 邵博闻 杨美森 +6 位作者 陈凯 邹辉 韩之刚 李聪 石艳 斯金平 陈东红 《中国中药杂志》 北大核心 2025年第21期6027-6038,共12页
黄精是中华传统药食同源植物,具补气养阴、润肺、健脾及益肾等诸多功效。MADS-box基因是在植物中广泛存在,参与多种生长发育过程的转录因子。该研究利用生物信息学方法在多花黄精中鉴定出74个MADS-box基因,分为14个亚类,同一亚类基因在... 黄精是中华传统药食同源植物,具补气养阴、润肺、健脾及益肾等诸多功效。MADS-box基因是在植物中广泛存在,参与多种生长发育过程的转录因子。该研究利用生物信息学方法在多花黄精中鉴定出74个MADS-box基因,分为14个亚类,同一亚类基因在系统进化树中聚集在同一分支上,具有相同的保守基序及结构域;它们不均匀分布于11条染色体上。另外,在一个多花黄精天然不育材料(QyS1)中,通过细胞学观察发现QyS1花器官同源转化为类似花丝或花被的结构导致不育,相应地,转录组分析发现3个AGAMOUS同源基因PcMADS46、56、68在不育系花苞时期表达量较野生型显著下调,可能是导致其不育的关键因素。通过加权共表达网络分析进一步提出导致QyS1花器官发育异常的调控模型:不育系中C类基因表达量降低,引起下游表观遗传抑制因子表达下调、生长素信号通路和转运蛋白基因上调,从而导致雌/雄蕊器官出现同源转化和不育。该研究基于MADS-box基因家族鉴定分析及多花黄精中的不育现象展开研究,为多花黄精的种质资源保存和育种提供理论依据和生产指导。 展开更多
关键词 多花黄精 madS-BOX 天然不育系 细胞学观察 转录组
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水稻MADS-box家族基因研究进展
7
作者 王晓清 王航 +3 位作者 张泽霖 胡霞菲 贺浩华 胡丽芳 《福建农业学报》 北大核心 2025年第7期743-750,共8页
MADS-box家族是序列较为保守的一类蛋白家族,其可通过结合CarG[CC(A/T)_(6)GG]元件调控下游基因的表达来参与一系列植物发育过程。水稻中共存在76个MADS-box基因,本文对参与调控水稻花器官发育、开花时间、营养生长和胁迫响应的相关MADS... MADS-box家族是序列较为保守的一类蛋白家族,其可通过结合CarG[CC(A/T)_(6)GG]元件调控下游基因的表达来参与一系列植物发育过程。水稻中共存在76个MADS-box基因,本文对参与调控水稻花器官发育、开花时间、营养生长和胁迫响应的相关MADS-box基因的功能及作用机理进行了综述,将有助于加深对水稻MADS-box家族基因的认知,为后续研究其分子调控网络并为其它物种MADS-box基因家族的研究提供理论参考。 展开更多
关键词 水稻 madS-BOX基因 功能
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辣椒MADS-box转录因子基因CaAGL61的耐热功能分析
8
作者 王梦园 魏倩睿 +4 位作者 李海艳 杨巧敏 宇军 黄炜 逯明辉 《中国农业科学》 北大核心 2025年第8期1604-1616,共13页
【目的】MADS-box转录因子是植物最大的转录因子家族之一,在植物生长发育和胁迫响应中均发挥重要功能。前期通过转录组数据获得一个辣椒热响应基因,该基因编码MADS-box转录因子家族成员CaAGL61(Agamous-like MADS-box protein AGL61)。... 【目的】MADS-box转录因子是植物最大的转录因子家族之一,在植物生长发育和胁迫响应中均发挥重要功能。前期通过转录组数据获得一个辣椒热响应基因,该基因编码MADS-box转录因子家族成员CaAGL61(Agamous-like MADS-box protein AGL61)。在此基础上,进一步研究CaAGL61在辣椒耐热性调控中的功能,为深入了解辣椒耐热分子机制提供理论参考,为辣椒耐热性的遗传改良提供基因位点。【方法】通过SMART在线工具预测CaAGL61保守结构域,使用MEGA7构建辣椒和其他植物物种AGL61蛋白的系统发育树,利用实时荧光定量PCR技术探究CaAGL61在辣椒中的表达模式,运用烟草亚细胞定位技术和酵母双杂交自激活系统检测CaAGL61的转录因子特性,利用病毒诱导的基因沉默技术和基因瞬时过表达技术探究CaAGL61表达对辣椒耐热性的影响。【结果】CaAGL61编码179个氨基酸,包含一个MADS结构域,在系统进化方面高度保守。CaAGL61在辣椒花器官中的表达量最高、其次是茎和果实,根中的表达量最低;进一步分析发现CaAGL61的表达量随着花器官的成熟而增加,尤其在授粉坐果期的花药中表达量最高;45℃高温处理显著上调了CaAGL61的表达水平。亚细胞定位显示,CaAGL61定位于细胞核中;酵母转录激活分析表明,CaAGL61具有转录激活活性。CaAGL61沉默植株的耐热性显著增强,热胁迫处理后,与对照相比,CaAGL61沉默植株生长点萎蔫程度减轻,叶片相对电导率降低,丙二醛含量、死细胞和活性氧积累减少,而叶绿素含量升高。相反,CaAGL61瞬时过表达降低了辣椒的耐热性,与对照相比,表现为植株受热胁迫损伤程度更严重,叶片相对电导率升高,丙二醛含量、死细胞和活性氧积累增多,叶绿素含量下降。【结论】鉴定了一个辣椒热响应MADS-box转录因子基因CaAGL61,该基因通过加剧氧化胁迫而负调控辣椒耐热性。 展开更多
关键词 辣椒 耐热 madS-box转录因子 CaAGL61 负调控
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微小RNA-155-5p靶向沉默信息调节因子1调节转化生长因子-β/Sma和Mad相关蛋白信号通路对糖尿病肾脏疾病大鼠肾纤维化作用机制的研究 被引量:2
9
作者 廖青 王小平 《中国糖尿病杂志》 北大核心 2025年第1期57-64,共8页
目的 研究miR-155-5p靶向沉默信息调节因子1(SIRT1)调节TGF-β/Sma和Mad相关蛋白(TGF-β/Smad)信号通路,对DKD大鼠肾纤维化的影响机制。方法 48只大鼠随机分为正常对照(NC)组、模型(Mod)组、抑制剂阴性对照(anti-NC)组、miR-155-5p抑制... 目的 研究miR-155-5p靶向沉默信息调节因子1(SIRT1)调节TGF-β/Sma和Mad相关蛋白(TGF-β/Smad)信号通路,对DKD大鼠肾纤维化的影响机制。方法 48只大鼠随机分为正常对照(NC)组、模型(Mod)组、抑制剂阴性对照(anti-NC)组、miR-155-5p抑制剂(anti-miR-155-5p)组、miR-155-5p抑制剂+小分子干扰RNA阴性对照(anti-miR-155-5p+si-NC)组、miR-155-5p抑制剂+SIRT1小分子干扰RNA(anti-miR-155-5p+si-SIRT1)组,每组8只。检测各组FPG、24 h UAlb、BUN、血肌酐(Scr)。HE、Masson染色比较各组肾组织病理变化,计算胶原容积分数(CVF)。RT-qRCR检测miR-155-5p、SIRT1 mRNA表达,Western blot法检测各组SIRT1、TGF-β1、Smad3、Smad7、结缔组织生长因子(CTGF)、Ⅰ型胶原蛋白(COLⅠ)蛋白表达。结果 与NC组比较,Mod、anti-NC组FPG、24 hUAlb、BUN、Scr、CVF、miR-155-5p表达及TGF-β1、Smad3、CTGF、COLⅠ蛋白表达升高,SIRT1 mRNA和蛋白表达、Smad7蛋白表达降低(P<0.05)。与anti-NC组比较,anti-miR-155-5p、anti-miR-155-5p+si-NC组SIRT1 mRNA和蛋白表达、Smad7蛋白表达升高(P<0.05),FPG、24 hUAlb、BUN、Scr、CVF、miR-155-5p表达及TGF-β1、Smad3、CTGF、COLⅠ蛋白表达降低(P<0.05)。与anti-miR-155-5p、anti-miR-155-5p+si-NC组比较,anti-miR-155-5p+si-SIRT1组FPG、24h UAlb、BUN、Scr、CVF、miR-155-5p表达及TGF-β1、Smad3、CTGF、COLⅠ蛋白表达升高(P<0.05),SIRT1 mRNA和蛋白表达、Smad7蛋白表达降低(P<0.05)。SIRT1 mRNA的3’UTR含有miR-155-5p序列保守碱基。结论 DKD大鼠中升高miR-155-5p可靶向调控SIRT1,改善肾纤维化。 展开更多
关键词 微小RNA-155-5p 沉默信息调节因子1 转化生长因子-β/Sma和mad相关蛋白信号通路 糖尿病肾脏疾病 肾纤维化
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绿豆MADS-box基因家族鉴定及表达分析
10
作者 姚晓琳 张晓芳 +4 位作者 李昆洛 郝俊莹 隋梦宇 张沿政 李帅 《山东农业科学》 北大核心 2025年第5期11-28,共18页
为了解绿豆MADS-box基因的进化过程,本研究通过全基因组分析鉴定出77个VrMADS-box基因,分布在11条染色体上,其中7号染色体上最多,共有18个。VrMADS-box基因主要分为Ⅰ型和Ⅱ型,Ⅰ型VrMADS-box基因又划分为Mα(15)、Mβ(4)和Mγ(11)三个... 为了解绿豆MADS-box基因的进化过程,本研究通过全基因组分析鉴定出77个VrMADS-box基因,分布在11条染色体上,其中7号染色体上最多,共有18个。VrMADS-box基因主要分为Ⅰ型和Ⅱ型,Ⅰ型VrMADS-box基因又划分为Mα(15)、Mβ(4)和Mγ(11)三个亚支;Ⅱ型VrMADS-box基因则划分为MIKCc(44)和MIKC∗(3)两个亚支。MIKCc可划分为12个亚家族,绿豆缺少开花位点C(FLC)亚家族。绿豆MADS-box基因种内存在18个重复基因对,种间共线性分析表明绿豆和拟南芥(Arabidopsis thaliana)、大豆(Glycine max)MADS-box基因间分别存在39个和171个同源基因对。不同亚家族VrMADS-box基因在结构和表达模式等方面存在显著差异,表明它们在绿豆生长发育过程中可能发挥不同作用。本研究揭示了VrMADS-box基因家族的信息和表达模式,有助于进一步研究绿豆VrMADS-box家族基因的功能及分子机制。 展开更多
关键词 madS-BOX 绿豆 基因家族分析 基因表达
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珙桐MADS-box基因家族的鉴定、表达及调控分析
11
作者 刘晋芸 胡小盼 +3 位作者 朱大海 叶天意 李培瑶 魏炜 《四川大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期215-227,共13页
为了对珙桐MADS-box基因家族进行全面系统的研究,了解其对珙桐花器官特性和苞片发育的影响,本研究在珙桐全基因组范围内对MADS-box基因家族进行鉴定和分类,并与近缘物种进行同源性分析.通过物种内共线性基因计算珙桐MADS-box基因家族的... 为了对珙桐MADS-box基因家族进行全面系统的研究,了解其对珙桐花器官特性和苞片发育的影响,本研究在珙桐全基因组范围内对MADS-box基因家族进行鉴定和分类,并与近缘物种进行同源性分析.通过物种内共线性基因计算珙桐MADS-box基因家族的选择压力.成功鉴定了103个珙桐MADS-box基因家族成员,其中MIKCC类基因受到更为强烈的纯化选择.通过与近缘物种的MADS-box基因家族的同源性分析发现珙桐AGL2/SEP亚家族和SQUA亚家族的MADS-box基因数目存在明显的扩张.利用转录组测序技术以及qRTPCR检测了MADS-box基因家族在3个发育阶段的苞片和叶片中的表达模式,并利用转录因子结合位点对部分关键差异表达基因所编码的转录因子进行了靶基因的初步预测,发现珙桐花瓣状苞片的形成可能是花器官特征决定基因AP1-like、AP3-like和SEP-like的同源基因在苞片中的异位表达所导致. 展开更多
关键词 珙桐 madS-box基因家族 花瓣状苞片 基因异位表达
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紫玉兰‘红元宝’MIKC型MADS-box家族鉴定及其在多季成花中的作用探析
12
作者 陈小珺 朱森宇 +4 位作者 田丰 王晶晶 吴超 申亚梅 马晶晶 《热带亚热带植物学报》 北大核心 2025年第3期269-281,共13页
为了解紫玉兰(Yulania liliiflora) MADS-box基因家族成员的功能和表达模式,基于‘红元宝’(‘Hongyuanbao’)转录组数据,对其MIKC型MADS-box基因家族成员进行鉴定、理化性质、系统进化和保守结构域分析。结果表明,共鉴定出19个MIKC型MA... 为了解紫玉兰(Yulania liliiflora) MADS-box基因家族成员的功能和表达模式,基于‘红元宝’(‘Hongyuanbao’)转录组数据,对其MIKC型MADS-box基因家族成员进行鉴定、理化性质、系统进化和保守结构域分析。结果表明,共鉴定出19个MIKC型MADS-box基因家族成员,均定位于细胞核中且拥有共同的MADS或K-box保守结构域。大部分MlMADSs在花器官建成中发挥功能,且MlAGL6和MlAGL12-c作为蛋白质互作网络的中心节点可能发挥关键作用。Ml MADS-box成员在雄蕊、花芽和茎等组织中均有较高的表达水平,在花器官形成和花发育过程中发挥重要作用,并筛选到调控紫玉兰‘红元宝’2次成花的候选关键基因Ml AGL6。这为探索MIKC型MADS-box基因在紫玉兰‘红元宝’生殖发育过程的功能提供数据支持。 展开更多
关键词 紫玉兰 MIKC型madS-box基因家族 花发育 基因表达
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SLEEP-MAD模式护理干预在结直肠癌术后患者中的应用 被引量:1
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作者 孙雪蕾 王雯娅 +2 位作者 刘清 花璐 拾春婷 《护理实践与研究》 2025年第9期1315-1320,共6页
目的探讨SLEEP-MAD模式护理干预对结直肠癌患者术后睡眠质量、癌因性疲乏、心理状况及生活质量的影响。方法选择在徐州市肿瘤医院2022年5月—2023年5月住院的104例结直肠癌患者为研究对象,按照基线资料具有可比性原则分为观察组和对照组... 目的探讨SLEEP-MAD模式护理干预对结直肠癌患者术后睡眠质量、癌因性疲乏、心理状况及生活质量的影响。方法选择在徐州市肿瘤医院2022年5月—2023年5月住院的104例结直肠癌患者为研究对象,按照基线资料具有可比性原则分为观察组和对照组各52例。对照组行常规护理,观察组成立睡眠干预小组,在对照组基础上行SLEEP-MAD模式护理干预,包括睡眠评估、确定睡眠目标、制定睡眠计划。对两组睡眠质量、癌因性疲乏评分、焦虑抑郁情绪评分、生活质量进行比较。结果干预后,在睡眠质量评分方面,观察组低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。干预后,观察组癌因性疲乏中认知疲乏、情感疲乏、躯体疲乏评分及总评分均低于对照组,焦虑抑郁情绪评分低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。干预后,在生活质量评分方面观察组躯体、情绪、角色、认知、社会各维度评分高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论SLEEP-MAD模式护理干预能有效改善直肠癌患者术后睡眠质量,减轻患者癌因性疲乏情况及心理应激反应,从而提高患者生活质量。 展开更多
关键词 SLEEP-mad模式 结直肠癌 睡眠质量 癌因性疲乏 心理状况 生活质量
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薄壳山核桃MADS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
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作者 方欣妍 何秀琼 +3 位作者 黄丹 彭兵阳 孙佳雯 吕佳斌 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第6期1080-1094,共15页
MADS基因是一类重要的转录调控因子,具有广泛的生物学功能,参与多个物种的生长发育和信号传导,在多个物种中的生物学特性已被鉴定。本研究通过生物信息学方法对薄壳山核桃的MADS基因家族成员进行鉴定分析,最终鉴定出81个MADS基因家族成... MADS基因是一类重要的转录调控因子,具有广泛的生物学功能,参与多个物种的生长发育和信号传导,在多个物种中的生物学特性已被鉴定。本研究通过生物信息学方法对薄壳山核桃的MADS基因家族成员进行鉴定分析,最终鉴定出81个MADS基因家族成员,不均匀分布在16条染色体上,根据系统进化树分析结果MADS蛋白分为type-Ⅰ型(20个)和type-Ⅱ型(61个)。薄壳山核桃该家族基因具有较多顺式作用元件,植物激素响应元件、逆境胁迫响应元件和光响应元件等,研究发现这些作用元件广泛存在于MADS基因的启动子区域,表明MADS基因在薄壳山核桃适应环境变化及生长发育过程中充当重要角色。不同薄壳山核桃MADS家族基因在不同组织中和不同时期的表达量差异较大,如CiMADS46在茎、CiMADS7在果实具有较高表达量,CiMADS11的表达量随着时间推移递减。MADS基因具有不同的组织特异性表达模式,推测MADS基因家族可能在成花及果实发育过程中发挥重要作用,在不同发育阶段具有一定程度的功能多样性。本研究结果为进一步研究CiMADS基因功能与特性奠定了基础,并为其他物种的MADS基因家族成员的鉴定和表征提供参考。 展开更多
关键词 薄壳山核桃 madS基因家族 生物信息学 表达分析
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浅地层剖面上规律性声脉冲噪声的压制:一种基于MAD的开关中值滤波方法
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作者 肖壹宝 李西双 +3 位作者 刘乐军 马龙 刘晨光 郭若舜 《海洋学报》 北大核心 2025年第6期119-128,共10页
海上综合工程物探调查过程中,当缺少声学同步器时,多波束等其他声学设备发出的声脉冲对于浅地层剖面测量来说是一种噪声,作为一种干扰波会严重影响浅地层剖面资料的信噪比与分辨率。此类噪声在频率上与有效信号相近,振幅强且可能出现于... 海上综合工程物探调查过程中,当缺少声学同步器时,多波束等其他声学设备发出的声脉冲对于浅地层剖面测量来说是一种噪声,作为一种干扰波会严重影响浅地层剖面资料的信噪比与分辨率。此类噪声在频率上与有效信号相近,振幅强且可能出现于地震记录的任何位置。尽管现有的中值滤波可以对此类干扰波进行压制,但也在一定程度上损害了有效信号。本文提出了一种改进的开关中值滤波方法,该方法首先基于MAD准则来判断浅地层剖面中的干扰波的位置,然后又使用中值滤波方法对干扰波附近的信号进行去噪处理,不含噪声的信号则不进行处理。利用该方法对南黄海陆架获得浅地层剖面进行处理,结果显示,与以往的方法相比,本文提出的改进的开关中值滤波法不但可以有效地衰减与多波束声脉冲类似的声学干扰波,而且尽可能地避免了有效信号的损失。 展开更多
关键词 浅地层剖面 多波束声脉冲 mad 开关中值滤波
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GhMADS3基因组成型表达对矮牵牛花形和花色的影响 被引量:12
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作者 郑亚东 郭余龙 +3 位作者 陈旭 李艳冬 欧建龙 李名扬 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期985-990,共6页
利用农杆菌介导法将GhMADS3基因转入矮牵牛。对14株转基因植株进行分析鉴定,GUS染色表明外源基因在转基因植株中表达,PCR检测显示GhMADS3整合到矮牵牛的基因组中,RT-PCR分析表明GhMADS3在转基因植株中表达。转基因植株花器官普遍较野生... 利用农杆菌介导法将GhMADS3基因转入矮牵牛。对14株转基因植株进行分析鉴定,GUS染色表明外源基因在转基因植株中表达,PCR检测显示GhMADS3整合到矮牵牛的基因组中,RT-PCR分析表明GhMADS3在转基因植株中表达。转基因植株花器官普遍较野生型小,花萼膨大、顶尖向内弯翘,花冠深裂且边缘伴有不规则褶皱,柱头裸露在外,花器官颜色较野生型变淡甚至完全白化。测定花瓣、花萼中花色素苷和花萼中叶绿素含量,结果表明转基因植株均较对照偏低。说明GhMADS3的导入使得矮牵牛花形、花色发生改变。 展开更多
关键词 矮牵牛 花色 花形 madS-BOX GhmadS3
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金钗石斛花发育和胁迫的转录模式及MADS家族表达分析
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作者 陈宏宇 于莹 桑思宏 《安徽农学通报》 2025年第20期104-109,共6页
本研究以金钗石斛花为试验材料,利用转录组学对该植物的3个发育阶段[小花苞期(Ⅰ期)、大花苞期(Ⅱ期)、开放期(Ⅲ期)]和3种胁迫(低温、高温和机械损伤,均以Ⅲ期样本为材料)的样本进行测序,分析其发育(Ⅰ期vsⅡ期、Ⅱ期vsⅢ期和Ⅰ期vsⅢ... 本研究以金钗石斛花为试验材料,利用转录组学对该植物的3个发育阶段[小花苞期(Ⅰ期)、大花苞期(Ⅱ期)、开放期(Ⅲ期)]和3种胁迫(低温、高温和机械损伤,均以Ⅲ期样本为材料)的样本进行测序,分析其发育(Ⅰ期vsⅡ期、Ⅱ期vsⅢ期和Ⅰ期vsⅢ期)和胁迫(Ⅲ期胁迫vsⅢ期)的转录模式及MADS转录因子的差异表达特征。结果表明,Ⅰ期vsⅡ期、Ⅱ期vsⅢ期和Ⅰ期vsⅢ期、低温、高温和机械损伤分别识别了26 598、29 680、30 263、7 495、13 713和8 764个差异表达基因。GO功能聚类表明,差异表达基因主要聚集在生物过程、细胞组分和分子功能;KEGG调控通路分析表明,差异表达基因主要与植物激素信号转导、氨基糖和核苷酸糖代谢、植物病原体相互作用及植物MAPK信号通路等过程有关。金钗石斛花不同发育阶段和胁迫下差异表达的MADS转录因子共有74个,Ⅰ期vsⅡ期、Ⅱ期vsⅢ期和Ⅰ期vsⅢ期、低温、高温、机械损伤分别有40、34、40、17、25、16个。研究结果为解析金钗石斛花发育和胁迫应答分子机制提供参考。 展开更多
关键词 金钗石斛花 转录模式 发育 胁迫 madS家族
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森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆 被引量:4
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作者 周厚成 李刚 +2 位作者 赵霞 康兆茹 郭蔼光 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1630-1638,共9页
本文利用生物信息学方法对森林草莓(Fragaria vesca)基因组数据库中MADS-box基因的数量、结构类型、序列特征及染色体定位进行分析。结果表明,获得70个含SRF-TF结构域的森林草莓Fv MADS基因,DNA长度289~14 596 bp,编码66~1 437个氨基... 本文利用生物信息学方法对森林草莓(Fragaria vesca)基因组数据库中MADS-box基因的数量、结构类型、序列特征及染色体定位进行分析。结果表明,获得70个含SRF-TF结构域的森林草莓Fv MADS基因,DNA长度289~14 596 bp,编码66~1 437个氨基酸残基,有21个Fv MADS没有内含子,在7条染色体上呈不均匀分布;68个Fv MADS蛋白序列含有保守基序Motif 1,最佳匹配序列为"RQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF"。另外,从栽培品种‘丰香’草莓果实中克隆了Fa MADS1基因,该基因属于MADS-box基因家族,c DNA全长1 167 bp,编码区750 bp,推导编码249个氨基酸,具有MADS结构域和K-box结构域。 展开更多
关键词 草莓 madS-BOX 转录因子 生物信息学 FamadS1基因
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植物MADS-box基因研究进展 被引量:11
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作者 马辉 张智俊 罗淑萍 《生物技术通报》 CAS CSCD 2006年第6期14-18,共5页
植物中的MADS-box基因是一个序列特异的调节基因家族,其编码的MADS-box蛋白转录因子以二聚体化的形式通过保守的MADS结构域与特定的DNA序列结合来调控基因的表达,从而调节植物的生长发育.对植物MADS-box基因的分布、分类、结构、功能和... 植物中的MADS-box基因是一个序列特异的调节基因家族,其编码的MADS-box蛋白转录因子以二聚体化的形式通过保守的MADS结构域与特定的DNA序列结合来调控基因的表达,从而调节植物的生长发育.对植物MADS-box基因的分布、分类、结构、功能和前景作了简要的综述。 展开更多
关键词 madS-BOX基因 madS-box蛋白转录因子 植物
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番茄MADS-box基因Lemads1的可变剪接与表达模式分析 被引量:4
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作者 刘旦梅 张彦洁 裴雁曦 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期641-648,共8页
可变剪接(alternative splicing)是真核基因转录的普遍现象和重要调控方式,在生物体的各种生理过程中发挥着重要的作用。植物转录因子MADS-box基因在植物生长发育中发挥重要作用。番茄(Solanum lycopersicum L.)SEPALLATA(SEP)亚族基因L... 可变剪接(alternative splicing)是真核基因转录的普遍现象和重要调控方式,在生物体的各种生理过程中发挥着重要的作用。植物转录因子MADS-box基因在植物生长发育中发挥重要作用。番茄(Solanum lycopersicum L.)SEPALLATA(SEP)亚族基因Lemads1是1个在番茄果实成熟过程中具有关键作用的MADS-box家族成员,但至今尚未见其转录剪接模式的详细报道。本研究发现,Lemads1基因在转录时存在可变剪接现象,并检测到4种Lemads1可变剪接转录本,其扩增长度依次为:699 bp、741 bp、1 404 bp和1 539 bp。剪接方式有外显子选择性切除和内含子保留两种。这4种转录本编码长度为232 aa、246 aa和266 aa的3种蛋白质。氨基酸序列比对和系统进化分析结果表明,这3种蛋白序列的差异主要集中在C区,但并不影响它们的系统进化地位。在进化上,它们仍属于SEP亚家族LOFSEP亚支中的FBP9/23分支,与它们亲缘关系最近的番茄SEP类蛋白是SLMBP21。Lemads1反义RNA转基因植株表型观察结果表明,该基因可能参与番茄果实成熟和萼片发育过程;而组织特异性表达分析表明,该基因的4种转录本具有相似但并不完全相同的表达模式,它们都在萼片和果实中高表达,但在这2个组织发育过程中的表达变化却有明显差异。暗示这些可变剪接转录本在萼片和果实发育过程中扮演了不同的角色。本研究提供了番茄Lemads1基因存在可变剪切的重要信息,对该基因功能的深度发掘具有指导意义。 展开更多
关键词 可变剪接 番茄 madS-BOX Lemads1
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