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Bridge Sequence对M1GS核酶体外切割活性的影响 被引量:5
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作者 张文军 李月琴 +3 位作者 李泓剑 贾雪芳 张欣 周天鸿 《广东药学院学报》 CAS 2006年第5期537-540,552,共5页
目的探讨B ridge Sequence(桥序列)对M1GS核酶体外切割活性的影响,从而为人工M1GS核酶的优化设计提供一定的理论依据。方法以含大肠杆菌核酶P催化单位(M1 RNA)基因的pFL117质粒作为模板,通过巧妙设计不同的下游引物,经PCR扩增、扩增产... 目的探讨B ridge Sequence(桥序列)对M1GS核酶体外切割活性的影响,从而为人工M1GS核酶的优化设计提供一定的理论依据。方法以含大肠杆菌核酶P催化单位(M1 RNA)基因的pFL117质粒作为模板,通过巧妙设计不同的下游引物,经PCR扩增、扩增产物克隆及克隆基因的体外转录,构建一组具有不同桥序列的人工M1GS核酶。进一步将所构建的上述人工M1GS核酶分别与同位素标记的底物RNA片段进行体外切割试验,并通过同位素扫描成像系统对各M1GS核酶的切割产物加以分析。结果成功构建了针对HCMV UL54mRNA T7靶位的、四种不同桥序列长度的M1GS核酶,其桥序列长度分别为0n、t6nt、20nt和88nt,并依次命名为M1GS-T7(0)、M1GS-T7(6)、M1GS-T7(20)和M1GS-T7(88)。经体外切割试验证实,M1GS-T7(88)的靶向切割活性最强,M1GS-T7(20)的切割活性相对较弱,而M1GS-T7(0)及M1GS-T7(6)则无明显的切割活性。结论人工M1GS核酶中桥序列的长度对于其体外切割活性具有重要影响,提示在人工M1GS核酶的优化设计时,桥序列的长度是不可忽视的因素之一。 展开更多
关键词 桥序列 m1gs 体外切割 核酶P
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M1GS-HCV/C_(141)核酶的构建及其体外抗病毒活性测定 被引量:3
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作者 李喜芳 张文军 +2 位作者 黄志文 张成成 罗桂飞 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1786-1795,共10页
丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)是引起慢性肝炎的重要病因之一,严重危害公众健康。目前临床HCV感染常采用干扰素联合病毒唑进行治疗,然而应答率不高且易反复。因此,探索新型抗HCV治疗策略及药物显得尤为迫切。针对HCV核心基因的序... 丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)是引起慢性肝炎的重要病因之一,严重危害公众健康。目前临床HCV感染常采用干扰素联合病毒唑进行治疗,然而应答率不高且易反复。因此,探索新型抗HCV治疗策略及药物显得尤为迫切。针对HCV核心基因的序列,设计与之互补的引导序列(Guide Sequence,GS),通过PCR的方法将其共价连接于大肠杆菌核糖核酸酶P(RNase P)催化性亚基(M1 RNA)的3?末端,成功构建了一种靶向性M1GS核酶(M1GS-HCV/C141)。经体外切割试验、胞内反义效应及胞内毒性研究,结果表明:M1GS-HCV/C141核酶不仅能够在体外对靶RNA片段产生特异性切割,在HCV感染的Huh7.5.1细胞中,也能显著抑制病毒核心蛋白的表达,进而使HCV RNA的拷贝数减少约1 000倍。因此,文中构建的M1GS-HCV/C141核酶在体外具有显著的抗HCV活性,这为HCV治疗研究提供了一条新的潜在途径。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 核心基因 m1gs核酶 抗病毒
原文传递
HCMV UL97 mRNA序列特异性M1GS的构建及其体外切割活性研究(英文) 被引量:1
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作者 张文军 李弘剑 +4 位作者 李月琴 何华坤 唐冬生 张欣 周天鸿 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1205-1212,共8页
HCMVUL97基因编码一种蛋白激酶,该酶参与调控病毒DNA的复制和衣壳的形成,且序列异常保守,可作为抗HCMV治疗的重要靶位。基于HCMVUL97mRNAT3位点附近的序列,设计一段与该位点互补的引导序列(GuideSequence,GS),并将其与大肠杆菌核酶P催... HCMVUL97基因编码一种蛋白激酶,该酶参与调控病毒DNA的复制和衣壳的形成,且序列异常保守,可作为抗HCMV治疗的重要靶位。基于HCMVUL97mRNAT3位点附近的序列,设计一段与该位点互补的引导序列(GuideSequence,GS),并将其与大肠杆菌核酶P催化亚基(M1RNA)的3′末端共价连接,构建了一种序列特异性的M1GS(M1-T3)。体外实验证实,所构建的M1-T3可与UL97mRNA的T3位点特异性结合并产生有效的切割作用。进一步研究M1-T3的结构与其对底物片段靶向切割活性的关系,结果发现在M1RNA与GS之间增加一段88核苷酸桥连序列的M1-T3(即M1-T3*),其靶向切割活性大大增强。此外,去除M1-T33′末端的CCA序列,其靶向切割活性将基本丧失。上述结果表明,这段桥连序列和3′末端的CCA序列是M1-T3重要的结构元件。这不仅有助于阐明M1GS与其底物的相互作用机制,同时也为进一步评价M1-T3在体内对UL97基因表达及病毒复制的抑制活性奠定了基础。 展开更多
关键词 核酶P(RNase P) m1gs 人巨细胞病毒 UL97
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HCV5'UTR靶向性人工M1GS核酶的胞内抗病毒活性
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作者 张文军 黄志文 +2 位作者 李喜芳 张成成 刘映乐 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2013年第8期986-991,共6页
目的基于大肠埃希菌核糖核酸酶P的催化性RNA亚基(M1 RNA),人工构建一种抗丙肝病毒(HCV)的新型靶向性核酶,并进一步鉴定其胞外靶向切割活性及胞内抗病毒作用。方法首先采用计算机软件对HCV基因组保守区———5'非翻译区(5'UTR)... 目的基于大肠埃希菌核糖核酸酶P的催化性RNA亚基(M1 RNA),人工构建一种抗丙肝病毒(HCV)的新型靶向性核酶,并进一步鉴定其胞外靶向切割活性及胞内抗病毒作用。方法首先采用计算机软件对HCV基因组保守区———5'非翻译区(5'UTR)的序列与结构进行分析,以确定候选靶位。针对靶位的侧翼序列,设计与之互补的引导序列(GS),然后通过PCR将其共价连接至M1 RNA的3'末端,从而构建靶向性的M1GS核酶。结果针对HCV 5'UTR第67位的胞嘧啶成功构建了一种M1GS核酶———M1GS-HCV/C67。该人工核酶不仅在体外可对靶RNA片段产生特异性切割,在HCV感染的宿主细胞内也能够显著抑制HCV核心蛋白的表达(P<0.05),并使上清液HCV RNA的拷贝数减少约800倍(P<0.01)。结论 M1GS-HCV/C67这种新型靶向性核酶具有良好的体外抗HCV活性,其成功构建为HCV感染的治疗研究提供了另一种潜在途径。 展开更多
关键词 m1gs核酶 丙型肝炎病毒 5’非翻译区 抗病毒
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M1GS的结构和活性的联系
5
作者 郑永霞 徐煌 董波 《嘉兴学院学报》 2008年第3期42-45,共4页
核酶的空间构象能影响其活性。文章以温度为切入点,探讨了人工核酶M1GS在不同温度下的二级结构对其活性的影响。以人巨细胞病毒DNA聚合酶基因(UL54)为靶基因,构建了具有切割效率的核酶M1GS-T7。不同温度的M1GS-T7的二级结构可以采用维... 核酶的空间构象能影响其活性。文章以温度为切入点,探讨了人工核酶M1GS在不同温度下的二级结构对其活性的影响。以人巨细胞病毒DNA聚合酶基因(UL54)为靶基因,构建了具有切割效率的核酶M1GS-T7。不同温度的M1GS-T7的二级结构可以采用维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包进行二级结构模拟获得,并通过实验对相应温度下的核酶的体外切割活性进行测定。结果显示:对比37℃和20℃的M1RNA的结构,M1RNA活性位点在空间上无法靠近,活性区域无法形成;对比37℃和55℃的M1RNA结构,两者空间构象基本相似,只有M1RNA的活性中心存在细小的差别。体外切割实验结果显示:20℃的M1GS-T7未显示体外切割活性,而55℃的M1GS-T7比37℃的M1GS-T7活性提高了30%。由此得出:活性部位的形成是核酶有活性的必要条件,且活性部位相对于非活性部位有较高的柔性。 展开更多
关键词 核酶 m1gs 柔性 温度
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温度变化对M1GS的结构和活性的影响
6
作者 郑永霞 《山东科学》 CAS 2007年第6期36-39,共4页
为研究M1GS的二级结构和活性随温度变化的规律,以人巨细胞病毒DNA聚合酶基因(UL54)为靶基因,构建了具有切割效率的核酶M1GS-T7。采用维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包分别对20℃,37℃,55℃的M1GS-T7进行二级结构模拟,并对20℃,37... 为研究M1GS的二级结构和活性随温度变化的规律,以人巨细胞病毒DNA聚合酶基因(UL54)为靶基因,构建了具有切割效率的核酶M1GS-T7。采用维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包分别对20℃,37℃,55℃的M1GS-T7进行二级结构模拟,并对20℃,37℃,55℃下的核酶的体外切割活性进行比较。软件模拟结果显示,对比37℃和20℃的M1RNA的结构,两者的碱基互补性存在明显差异,活性区域无法形成;对比37℃和55℃的M1RNA结构,两者只有M1RNA的活性中心存在差别,非活性部位改变较少。体外切割实验结果显示,20℃的M1GS-T7未显示体外切割活性,而55℃的M1GS-T7比37℃的M1GS-T7活性提高了30%。结果说明,活性部位的形成是核酶有活性的必要条件,且活性部位相对于非活性部位有较高的柔性。 展开更多
关键词 核酶 m1gs 柔性 温度
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AIV PB2基因靶向性M1GS核酶的构建及其体外切割活性测定 被引量:1
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作者 李小英 伍婧茹 +1 位作者 刘琳 张文军 《广东药科大学学报》 CAS 2017年第1期103-107,共5页
目的针对禽流感病毒(AIV)复制酶PB2亚基的基因构建具有靶向切割作用的M1GS核酶,为新型抗AIV反义药物的开发奠定基础。方法基于大肠埃希菌的核糖核酸酶P(RNase P),根据AIV PB2基因的序列特征,设计一小段与之互补的引导序列GS,通过PCR技... 目的针对禽流感病毒(AIV)复制酶PB2亚基的基因构建具有靶向切割作用的M1GS核酶,为新型抗AIV反义药物的开发奠定基础。方法基于大肠埃希菌的核糖核酸酶P(RNase P),根据AIV PB2基因的序列特征,设计一小段与之互补的引导序列GS,通过PCR技术将其共价连接至大肠埃希菌RNase P催化性亚基(M1 RNA)的3'末端,以构建靶向性M1GS核酶。通过体外切割试验测定M1GS核酶的活性。结果构建了M1GS-T_(436)、M1GS-C_(341)两种M1GS核酶。体外切割实验证实,核酶M1GS-T_(436)可对靶RNA片段产生特异性切割;核酶M1GS-C_(341)虽可切割靶RNA片段,但可能属于非特异性切割。结论成功构建并筛选出一种具有显著体外切割活性的M1GS核酶(M1GS-T_(436)),为今后进一步研究其胞内及体内抗病毒活性奠定了基础。 展开更多
关键词 m1gs核酶 禽流感病毒 PB2基因 抗病毒
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丙肝病毒核心基因靶向性M1GS核酶的体外抗病毒活性 被引量:3
8
作者 张文军 李喜芳 +2 位作者 罗桂飞 黄志文 刘映乐 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期875-881,共7页
【目的】丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)是引起病毒性肝炎的重要病原。目前临床HCV感染多采用干扰素联合病毒唑进行治疗,但其应答率低且感染易反复,探索新型抗HCV治疗策略与药物具有紧迫的现实意义。【方法】基于大肠埃希菌来源... 【目的】丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)是引起病毒性肝炎的重要病原。目前临床HCV感染多采用干扰素联合病毒唑进行治疗,但其应答率低且感染易反复,探索新型抗HCV治疗策略与药物具有紧迫的现实意义。【方法】基于大肠埃希菌来源的核糖核酸酶P(RNase P),针对HCV核心基因的序列,设计一小段与之互补的外部引导序列(Guide Sequence,GS),通过PCR将其共价连接至大肠埃希菌RNase P催化性亚基(M1 RNA)的3'末端,从而构建一种靶向性的核酶——M1GS。【结果】构建的M1GS-HCV/C52核酶在体外可对靶RNA片段产生特异性切割;在HCV感染的Huh7.5.1细胞,该人工核酶也能够显著抑制HCV核心基因的表达,并使培养上清中HCV RNA的拷贝数减少约1500倍。【结论】本研究构建的M1GS-HCV/C52核酶具有显著的体外抗病毒活性,从而为HCV的治疗研究提供了一条潜在途径。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 核心基因 m1gs核酶 抗病毒
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丙型肝炎病毒核心基因靶向性M1 GS核酶的构建及鉴定
9
作者 刘碧瑜 张文军 《广东药学院学报》 CAS 2011年第2期183-186,共4页
目的构建一种具有丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)靶向性的M1GS核酶,为进一步研究引导序列(guide sequence,GS)引导核酶P在RNA水平阻断HCV核心基因(core gene,C)的表达作前期基础。方法选择HCV基因组中序列相对保守且在病毒复制过... 目的构建一种具有丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)靶向性的M1GS核酶,为进一步研究引导序列(guide sequence,GS)引导核酶P在RNA水平阻断HCV核心基因(core gene,C)的表达作前期基础。方法选择HCV基因组中序列相对保守且在病毒复制过程中起关键作用的核心基因作为靶基因,针对该基因mRNA中的潜在切割位点(第52位),设计相应的引导序列及桥序列(bridge sequence),以PCR扩增M1GS,将其插入pGEM-3Z克隆载体;重组的克隆载体经EcoRⅠ和HindⅢ双酶切、测序及体外转录鉴定。结果 M1GS-HCV/C52克隆载体经双酶切、琼脂糖凝胶电泳证明插入片段与M1RNA片段大小相符;体外转录产生的M1GS-HCV/C52核酶在体外切割实验中将HCV核心基因RNA切割成2个片段,片段大小符合预期。结论成功构建出具有体外靶向切割活性的HCV核心基因靶向性M1GS核酶。 展开更多
关键词 m1gs 核酶 靶向 丙型肝炎病毒 核心基因
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M1RNA及其在基因治疗上的研究进展
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作者 莫雪华 周天鸿 《国外医学(分子生物学分册)》 CAS CSCD 2001年第4期241-244,共4页
M1RNA是 E.coli体内一种具有催化活性的 RNA分子 ,能特异性的切割靶 RNA分子 ,可用来抑制基因的表达。由 M1RNA发展而来的 M1GS是一种潜在的基因治疗药物 。
关键词 核酶 M1RNA 基因治疗 EGS m1gs 设计
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