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放射性肠损伤中辐射响应lncRNAs的验证及其剂量效应关系
1
作者 高莹 田雪蕾 +2 位作者 刘青杰 赵骅 张伟 《中国辐射卫生》 2025年第2期270-278,共9页
目的 探索lncRNAs作为放射性肠损伤标志物的潜力。方法 15 Gy^(60)Co γ射线照射小鼠腹部,分析照射后72 h小鼠肠组织病理损伤情况以判断放射性肠损伤模型是否构建成功。利用实时荧光定量PCR验证小鼠空肠、空肠隐窝、结肠组织和血浆中候... 目的 探索lncRNAs作为放射性肠损伤标志物的潜力。方法 15 Gy^(60)Co γ射线照射小鼠腹部,分析照射后72 h小鼠肠组织病理损伤情况以判断放射性肠损伤模型是否构建成功。利用实时荧光定量PCR验证小鼠空肠、空肠隐窝、结肠组织和血浆中候选辐射响应lncRNAs。0、5、10和15 Gy^(60)Co γ射线照射人小肠上皮细胞系HIEC-6和人结肠上皮细胞系NCM460,在照射后4、24、48和72 h检测候选lncRNAs表达水平随照射剂量的变化。结果 病理分析显示15 Gy局部照射成功建立急性放射性肠损伤小鼠模型,实时荧光定量PCR结果显示Dino、Lncpint、Meg3、Dnm^(3)os、Trp53cor1、Pvt1和Neat1能在放射性肠损伤发生后显著上调(P <0.05),其中小鼠血浆中Meg3和Dnm^(3)os在照射后显著上调(P <0.05),Gas5显著下调(P <0.05)。HIEC-6和NCM460细胞中DINO、MEG3、DNM3OS和GAS5表达水平在一定时间点存在剂量依赖性改变。结论 肠上皮细胞中的lncRNA MEG3、DNM3OS和GAS5更易响应电离辐射,且小鼠血浆及肠组织中能检测到一致的差异变化,有成为放射性肠损伤辐射生物标志物的潜力。 展开更多
关键词 lncrnas 放射性肠损伤 电离辐射 生物标志物
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参与肺癌靶向耐药的lncRNAs的作用及其机制
2
作者 杨素心 马丽浩 张景红 《华侨大学学报(自然科学版)》 2025年第4期369-378,共10页
对参与肺癌靶向耐药的长链非编码RNAs(lncRNAs)的作用及其机制进行综合分析,阐明治疗肺癌耐药的多种标志物。通过查阅近年相关文献,总结参与肺癌顺铂(DDP)耐药、靶向表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)抵抗、靶向间变性淋巴... 对参与肺癌靶向耐药的长链非编码RNAs(lncRNAs)的作用及其机制进行综合分析,阐明治疗肺癌耐药的多种标志物。通过查阅近年相关文献,总结参与肺癌顺铂(DDP)耐药、靶向表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)抵抗、靶向间变性淋巴瘤激酶酪氨酸激酶抑制剂(ALK-TKIs)抵抗,以及免疫治疗抵抗的各种长链非编码RNAs,分析其在逆转肺癌耐药中的作用和贡献。结果表明:在参与EGFR-TKIs靶向抵抗的lncRNAs中,LINC00460不仅通过激活miR-338-3p/小染色体维持蛋白4通路调控吉非替尼耐药,而且在奥西替尼耐药中同样发挥关键作用,而肺腺癌转移相关转录本1则通过调控主要组织相容性复合体蛋白和程序性死亡配体1的表达,进而影响免疫细胞群的耐药,其有望成为改善肺癌免疫治疗预后的关键靶点。 展开更多
关键词 长链非编码RNAs(lncrnas) 肺癌 顺铂耐药 靶向耐药 分子机制
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Identification of pyroptosis-related lncRNAs for constructing a prognostic model and their correlation with immune infiltration in pancreatic cancer
3
作者 Zhou Ye Qi-Jun Zhang +4 位作者 Wei Chen Xiao-Yu Weng Bing-Yi Lin Beng Yang Wei-Lin Wang 《Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International》 2025年第5期579-585,共7页
To the Editor:Pancreatic cancer is a malignancy characterized by a poor prog-nosis,with a 5-year survival rate of<10%[1].Furthermore,only a minority of patients(<20%)qualify for curative-intent resec-tion,and ev... To the Editor:Pancreatic cancer is a malignancy characterized by a poor prog-nosis,with a 5-year survival rate of<10%[1].Furthermore,only a minority of patients(<20%)qualify for curative-intent resec-tion,and even among those who undergo this procedure,the risk of recurrence within three years remains alarmingly high,reach-ing up to 70%[2].Due to the lack of specific clinical manifes-tations of pancreatic cancer,most cases have metastasized or in-vaded the major vessels around the pancreas at the time of initial diagnosis,resulting in a low surgical resection rate.Even patients who undergo surgical resection often face a poor prognosis[3].In recent years,neoadjuvant chemotherapy using agents such as gemcitabine,5-fluorouracil,albumin-bound paclitaxel,modified fluorouracil/leucovorin plus irinotecan,and oxaliplatin(mFOLFIRI-NOX),targeted therapies addressing molecular subtypes of pan-creatic cancer,and immunotherapies targeting PD-1 and PD-L1 have shown efficacy in improving the overall prognosis of patients with pancreatic cancer,although the impact remains modest[4,5].Therefore,novel therapeutic strategies and prognostic evaluation systems are urgently needed to enhance the survival of patients with pancreatic cancer. 展开更多
关键词 lncrnas PYROPTOSIS pancreatic cancer immune infiltration PROGNOSIS
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马BMSCs成软骨细胞诱导分化及其关键lncRNAs-mRNAs的筛选分析
4
作者 赵方歆 魏奥 +12 位作者 凌宇 房君 朱纯霄 焦如月 赵赟瑶 韩静 吴凯峰 李雪琼 李涛 曹俊伟 周欢敏 张焱如 刘春霞 《中国农业大学学报》 北大核心 2025年第2期94-106,共13页
为进一步筛选BMSCs(Bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)成软骨细胞诱导分化中关键lncRNAs、mRNAs,本研究以马BMSCs为研究对象,对向软骨细胞诱导不同分化阶段的细胞开展全转录组测序,筛选出在BMSCs成软骨细胞分化中具有重要功能... 为进一步筛选BMSCs(Bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)成软骨细胞诱导分化中关键lncRNAs、mRNAs,本研究以马BMSCs为研究对象,对向软骨细胞诱导不同分化阶段的细胞开展全转录组测序,筛选出在BMSCs成软骨细胞分化中具有重要功能的lncRNAs和mRNAs,并对mRNAs和lncRNAs及其靶基因进行验证,并构建lncRNAs对BMSCs成软骨细胞分化的调控网络。结果表明:1)体外成功建立了马BMSCs系,并成功诱导分化成软骨细胞。2)对不同分化阶段的BMSCs进行高通量转录组测序后,共鉴定出3592个lncRNAs,其中,差异高表达的lncRNAs有250个,低表达的116个,差异高表达的mRNAs有280条,低表达的105条。3)筛选并验证了5个调控马BMSCs向软骨细胞诱导分化中的潜在候选因子,包括lnc-cpm、lnc-traf3、lnc-22173、lnc-acvr2a及lnc-pde4d,以及9个对应靶标基因MDM2、TRAF3、USP25、ACVR2A、PDE4D、BCL2、WAF1、SIRT1及NRF2。4)构建了差异表达的lncRNA与mRNA互作调控网络,主要富集于Wnt信号通路、p53信号通路、MAPK及NF-κb信号通路中。综上,本研究经全转录组测序与分析,成功筛选到马BMSCs分化为软骨细胞过程中表达显著的差异基因,可为后续进一步揭示软骨细胞分化过程中lncRNAs与靶基因的互作机制奠定了必要的前期基础,为BMSCs用于软骨修复的细胞治疗提供了科学依据。 展开更多
关键词 BMSCS 诱导分化 软骨细胞 lncRNA
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What do we know about the role of lncRNAs in multiple sclerosis?
5
作者 Viviana Nociti Massimo Santoro 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2021年第9期1715-1722,共8页
Multiple sclerosis is a chronic, inflammatory and degenerative disease of the central nervous system of unknown aetiology although well-defined evidence supports an autoimmune pathogenesis. So far, the exact mechanism... Multiple sclerosis is a chronic, inflammatory and degenerative disease of the central nervous system of unknown aetiology although well-defined evidence supports an autoimmune pathogenesis. So far, the exact mechanisms leading to autoimmune diseases are still only partially understood. We know that genetic, epigenetic, molecular, and cellular factors resulting in pathogenic inflammatory responses are certainly involved. Long non-coding RNAs(lncRNAs) are non-protein coding transcripts longer than 200 nucleotides that play an important role in both innate and acquired immunity, so there is great interest in lncRNAs involved in autoimmune diseases. The research on multiple sclerosis has been enriched with many studies on the molecular role of lncRNAs in the pathogenesis of the disease and their potential application as diagnostic and prognostic biomarkers. In particular, many multiple sclerosis fields of research are based on the identification of lncRNAs as possible biomarkers able to predict the onset of the disease, its activity degree, its progression phase and the response to disease-modifying drugs. Last but not least, studies on lncRNAs can provide a new molecular target for new therapies, missing, so far, a cure for multiple sclerosis. While our knowledge on the role of lncRNA in multiple sclerosis has recently improved, further studies are required to better understand the specific role of lncRNAs in this neurological disease. In this review, we present the most recent studies on molecular characterization of lncRNAs in multiple sclerosis disorder discussing their clinical relevance as biomarkers for diagnosis and treatments. 展开更多
关键词 antisense lncrnas enhancer lncrnas EPIGENETICS immune system intergenic lncRNA intronic lncRNA multiple sclerosis sense lncrnas single nucleotide polymorphisms
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lncRNAs参与基因表达调控机制的研究进展 被引量:7
6
作者 杨倩 黄宏斌 +3 位作者 龚朝建 熊炜 曾朝阳 李桂源 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期91-95,共5页
长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一组内源性、长度超过200 nt、缺少特异完整的开放阅读框(open reading frame,ORF)、无或很少有蛋白编码功能的RNAs分子。近年来的研究发现,lncRNAs与许多重要的生物学过程相关,如基因... 长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一组内源性、长度超过200 nt、缺少特异完整的开放阅读框(open reading frame,ORF)、无或很少有蛋白编码功能的RNAs分子。近年来的研究发现,lncRNAs与许多重要的生物学过程相关,如基因组印记、细胞分化、免疫反应等。lncRNAs在表观遗传水平、转录水平和转录后水平等多个层面调节基因的表达,通过介导染色质重塑和组蛋白修饰、干扰转录、调节选择性剪接模式、生成小RNAs、调节蛋白质活性、改变蛋白质定位等方式,参与机体生长、发育、衰老及死亡等重要生命活动的调控。关于lncRNAs参与基因表达调控的机制有待进一步研究,这将有助于深入理解疾病的发病机制,为寻找疾病分子标记物、药物靶点提供新的方向。 展开更多
关键词 lncrnas 表观遗传调控 转录调控 转录后调控
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LncRNAs在卵巢癌诊断和预后评估研究中的进展 被引量:5
7
作者 张春兰 贺红英 +2 位作者 韦露薇 翟艳芝 廖婷 《中国肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期852-860,共9页
近期,越来越多的研究关注长链非编码RNA(LncRNAs)对卵巢癌发展的关键调控作用。在卵巢癌组织及细胞中常常能检测到LncRNAs的失调,且失调的LncRNAs可极大地促进卵巢癌恶性表型的变化。该文阐述LncRNAs对卵巢癌细胞增殖、凋亡、细胞周期... 近期,越来越多的研究关注长链非编码RNA(LncRNAs)对卵巢癌发展的关键调控作用。在卵巢癌组织及细胞中常常能检测到LncRNAs的失调,且失调的LncRNAs可极大地促进卵巢癌恶性表型的变化。该文阐述LncRNAs对卵巢癌细胞增殖、凋亡、细胞周期、迁移、侵袭、转移和耐药性等细胞活动的作用及影响机制,讨论LncRNAs在卵巢癌诊断和预后评估中的价值,建议LncRNAs可作为卵巢癌诊断及预后评估的潜在生物标志物,也是卵巢癌治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 lncrnas 卵巢癌 细胞增殖 细胞凋亡 转移 诊断 预后
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转录组数据揭示滩羊肌内脂肪沉积相关lncRNAs及其相关基因与通路
8
作者 王丁香 李承隆 +2 位作者 郭晨浩 冯登侦 康晓龙 《华北农学报》 北大核心 2025年第6期202-211,共10页
肌内脂肪沉积作为影响肉品质(如嫩度、风味和多汁性)的关键因素,其调控机制与长链非编码RNA(lncRNA)对脂肪生成和脂质代谢的调节密切相关。基于前期研究发现,滩羊肌内脂肪含量显著高于杜泊羊和小尾寒羊,以这3个绵羊品种的背最长肌为研... 肌内脂肪沉积作为影响肉品质(如嫩度、风味和多汁性)的关键因素,其调控机制与长链非编码RNA(lncRNA)对脂肪生成和脂质代谢的调节密切相关。基于前期研究发现,滩羊肌内脂肪含量显著高于杜泊羊和小尾寒羊,以这3个绵羊品种的背最长肌为研究对象,通过转录组测序筛选差异表达mRNAs(DE mRNAs)和lncRNAs(DE lncRNAs)及其相关通路,旨在揭示滩羊高肌内脂肪沉积的分子机制。结果表明:在小尾寒羊和滩羊组筛选出836个DE mRNAs,832个DE lncRNAs,杜泊羊和滩羊组筛选出578个DE mRNAs,700个DE lncRNAs。两组分别取交集共得到226 DE mRNAs,308个DE lncRNAs,通过对308个DE lncRNAs进行靶基因预测,共预测到1475个靶基因,其中预测到co_expression(共表达)靶基因687个,co_localization(共定位)靶基因有788个;通过对DE mRNAs进行GO和KEGG富集发现,其中与脂肪沉积相关的通路有肌动蛋白细胞骨架调节、催乳素信号通路等,其中FGF14、FGF9等基因被报道参与动物的脂肪代谢过程。通过对预测到的共表达靶基因和共定位靶基因进行GO和KEGG富集分析,发现它们富集到与脂肪代谢的相关通路,如cAMP信号通路、催乳素信号通路、胰岛素信号通路等;通过对通路和功能分析进一步筛选出和脂肪代谢相关的CREBBP、ATP1B3、PPP1R3C、PIK3R1等基因,这些基因在绵羊肌内脂肪沉积方面可能发挥重要调控作用。随机选择的6个DE mRNAs和6个DE lncRNAs的qRT-PCR结果与转录组测序结果趋势一致。 展开更多
关键词 滩羊 肌内脂肪沉积 转录组 lncRNA
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乳腺癌lncRNAs表达谱的检测 被引量:2
9
作者 张霞 宋志旺 +2 位作者 朱蕾蕾 高勇 董春燕 《同济大学学报(医学版)》 CAS 2015年第6期31-35,共5页
目的初步探讨人乳腺癌lncRNAs基因表达谱的筛选。方法在EBI数据库中的Array Express子数据库选取两组代表乳腺癌基因表达的基因芯片数据,从一组数据下载原始CEL数据文件,运用RMA(Robust Multichip Average)方法对原始CEL文件进行标准化... 目的初步探讨人乳腺癌lncRNAs基因表达谱的筛选。方法在EBI数据库中的Array Express子数据库选取两组代表乳腺癌基因表达的基因芯片数据,从一组数据下载原始CEL数据文件,运用RMA(Robust Multichip Average)方法对原始CEL文件进行标准化及背景校正。得到乳腺癌与癌旁组织中的探针表达谱矩阵,将其与Net Affx注释文件结合。提取出Ref Seq转录本ID和(或)Ensembl基因ID的探针集。对于Refseq ID的探针集,只保留那些NR者(代表非编码RNA)。对于Ensembl基因ID的探针集,只保留注释为LncRNA,加工过的转录本或"misc_RNA"。对上述步骤得到的数据进行过滤,得到存在差异表达的lncRNA数量,将这一结果在另一组乳腺癌芯片数据中进行验证。结果共筛选出表达差异显著且方向一致的18个LncRNA,其中2种LncRNAs表达明显上调,16种LncRNAs表达明显下调。结论筛选出与乳腺癌相关的差异表达lncRNAs,为进一步研究其在乳腺癌中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 lncrnas 芯片分析
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基于铜死亡相关lncRNAs的胰腺癌预后模型构建与验证 被引量:1
10
作者 黄菲菲 杨馨奕 +2 位作者 秦振溜 张杰 金约朋 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2024年第6期348-359,共12页
目的研究铜死亡相关lncRNAs在胰腺癌(PAAD)患者中的预后预测价值,并进一步构建预后预测模型。方法从TCGA数据库中下载胰腺癌患者的转录组测序数据和相应临床信息,通过Pearson相关性分析筛选与预后相关的铜死亡相关lncRNAs,先后利用单因... 目的研究铜死亡相关lncRNAs在胰腺癌(PAAD)患者中的预后预测价值,并进一步构建预后预测模型。方法从TCGA数据库中下载胰腺癌患者的转录组测序数据和相应临床信息,通过Pearson相关性分析筛选与预后相关的铜死亡相关lncRNAs,先后利用单因素Cox回归和Lasso回归分析并进一步构建预后模型。根据模型的风险评分中位数,将所有患者分为高风险组和低风险组。通过Kaplan-Meier生存分析、亚组分析、ROC曲线分析及一致性指数分析评估模型的预后预测价值,并利用单因素和多因素回归分析验证模型的独立性。对高、低风险组的差异表达基因进行GO及KEGG功能富集分析,并对高、低风险组患者进行肿瘤突变负荷(TMB)分析、免疫治疗反应预测以及药物敏感性分析。结果通过Pearson相关性分析,确定了127个铜死亡相关的lncRNAs,先后利用单因素Cox回归分析及Lasso回归分析构建了一个基于6个铜死亡相关lncRNAs的预后预测模型。根据模型计算结果将PAAD患者队列分成高风险组和低风险组,Kaplan-Meier生存分析表明低风险组患者的生存时间要长于高风险组(P<0.05)。ROC曲线证明了该模型对胰腺癌患者预后的预测性能良好:1、3、5年ROC曲线下面积分别为0.687、0.753、0.771;基因功能富集分析表明,高、低风险组差异表达基因主要富集于免疫相关通路。此外,高风险组患者的TMB值明显大于低风险组,而TIDE评分明显低于低风险组。最后,通过药物敏感性分析发现不同组的胰腺癌患者对特定药物的敏感性存在统计学差异,对临床用药具有一定的指导意义。结论本研究基于铜死亡相关lncRNAs成功构建了一个PAAD患者预后模型,可精准预测PAAD患者的预后,并为患者的临床药物治疗选择提供个性化指导。 展开更多
关键词 胰腺癌 铜死亡 长链非编码RNA(lncrnas) 预后模型 构建与验证
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Potential effect of endothelial progenitor cells on pentylenetetrazole induced seizures in rats:an evaluation of relevant lncRNAs
11
作者 Shimaa O.ALI Nancy N.SHAHIN +1 位作者 Marwa M.SAFAR Sherine M.RIZK 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 2025年第8期789-804,共16页
Objective:The use of stem cells is a promising strategy for seizure treatment owing to their unique characteristics.We investigated the role of endothelial progenitor cells(EPCs)in a pentylenetetrazole(PTZ)-induced ra... Objective:The use of stem cells is a promising strategy for seizure treatment owing to their unique characteristics.We investigated the role of endothelial progenitor cells(EPCs)in a pentylenetetrazole(PTZ)-induced rat seizure model.A selected panel of long noncoding RNAs(lncRNAs),which maintain an elaborate balance in brain neural regulatory networks as well as the autophagy pathway,was also targeted.Methods:The impact of intravenously administered EPCs on PTZ-induced kindling in rats was evaluated by measuring the expression of neuronal damage markers,neurotrophic factors,and relevant lncRNA genes.Rat behavior was assessed using Y-maze test and open field test(OFT).Results:EPCs mitigated seizure associated neurological damage and reversed PTZ-induced working memory and locomotor activity deficits,as evidenced by improved performance in the Y-maze test and OFT.EPC treatment reversed the downregulation of the expression of the lncRNAs Evf2,Pnky,Dlx1,APF,HOTAIR,and FLJ11812.EPCs also boosted vascular endothelial growth factor(VEGF)expression.The ameliorative effect achieved by EPCs was comparable to that produced by valproate.Conclusions:These findings indicate that EPCs ameliorate kindling epileptic seizures and their associated abnormalities and that the effect of EPCs may be mediated via the upregulation of certain regulatory lncRNAs. 展开更多
关键词 Endothelial progenitor cell(EPC) Long noncoding RNA(lncRNA) Pentylenetetrazole(PTZ) Neuronal damage SEIZURE
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LncRNAs与泌尿男性生殖系统肿瘤 被引量:1
12
作者 刘璐 赵文钺 刘福囡 《解剖科学进展》 CAS 2015年第4期397-400,共4页
长链非编码RNAs(lnc RNAs)是一类在真核细胞基因组被普遍转录的一类转录本长度在200 nt^100 kb之间的非编码RNA分子。起初认为lnc RNA是基因组转录的"噪音",不具备生物学功能。但越来越多的研究表明,它调节着基因的表观遗传,... 长链非编码RNAs(lnc RNAs)是一类在真核细胞基因组被普遍转录的一类转录本长度在200 nt^100 kb之间的非编码RNA分子。起初认为lnc RNA是基因组转录的"噪音",不具备生物学功能。但越来越多的研究表明,它调节着基因的表观遗传,转录和转录后水平,从而影响着细胞的增殖,分化,代谢,凋亡,并且在癌症组织和正常组织中存在着差异性表达,有望成为癌症治疗的新靶点。在这篇综述中,我们具体介绍了多种lnc RNAs在肾癌,前列腺癌,膀胱癌中的差异性表达,以及它们对肿瘤细胞增殖,迁移,侵袭的影响。 展开更多
关键词 膀胱癌细胞 细胞基因组 lncrnas 转录本 性表达 细胞增殖 RNA 膀胱癌组织 基因沉默 尿路上皮癌
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膀胱癌ceRNA网络的构建和相关lncRNAs的筛选 被引量:1
13
作者 田虹 陈颖 +1 位作者 唐力 顾昊 《中国科技论文在线精品论文》 2024年第2期213-223,共11页
目的:探讨膀胱癌差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)、微小RNA(microRNAs,miRNAs)和竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)之间的相互作用机制,筛选潜在的lncRNA生物标志物。方法:使用生物信息学方法对多... 目的:探讨膀胱癌差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)、微小RNA(microRNAs,miRNAs)和竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)之间的相互作用机制,筛选潜在的lncRNA生物标志物。方法:使用生物信息学方法对多种数据库进行数据挖掘,得到膀胱癌差异表达的lncRNAs、miRNAs和mRNAs,并构建lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络。为了分析ceRNA网络行使的生物学功能,对ceRNA网络中的mRNAs进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析并构建蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络。对ceRNA网络中的lncRNAs进行Kaplan-Meier生存曲线分析,筛选出与膀胱癌患者预后存在显著相关性的lncRNAs。结果:ceRNA网络中包括了17个lncRNAs、32个miRNAs和78个mRNAs。GO功能分析发现相关失调基因主要集中在蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶途径、酪氨酸激酶途径等方面。KEGG通路富集分析结果显示这些基因集中在MAPK信号途径、脂质和动脉粥样硬化通路等方面。PPI网络中可以看出核心蛋白质主要围绕在MAPK1、HSPA8和HNRNPD等方面。通过Kaplan-Meier生存曲线分析发现共有6个lncRNAs与膀胱癌患者预后存在显著相关性,分别为C3orf35、ZBTB20-AS1、LINC00112、ARHGAP5-AS1、ARAP1-AS2和CYB561D2。结论:不同的lncRNAs参与了膀胱癌的发病机制;构建的ceRNA调控网络有助于增加对膀胱癌发病分子机制的认识;筛选的lncRNAs为后续的实验研究提供了基础。 展开更多
关键词 肿瘤学 膀胱癌 ceRNA lncrnas 生物标志物
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LncRNAs与血管疾病发生机制关系研究进展
14
作者 严茂胜 方森洲 +3 位作者 张丹英 徐国勇 林欣琪 晏华 《中国职业医学》 CAS 北大核心 2021年第1期103-106,共4页
职业性手臂振动病(HAVD)是我国的法定职业病,振动性血管损伤是其发病的重要机制。HAVD一旦发生较难恢复,对手传振动作业工人造成巨大伤害,但现有技术,较难早期发现和评估其发生和进展,不利于疾病的早期预防和治疗。长链非编码核糖核酸(l... 职业性手臂振动病(HAVD)是我国的法定职业病,振动性血管损伤是其发病的重要机制。HAVD一旦发生较难恢复,对手传振动作业工人造成巨大伤害,但现有技术,较难早期发现和评估其发生和进展,不利于疾病的早期预防和治疗。长链非编码核糖核酸(lncRNAs)在调节血管的发育、生长和重塑等生物过程有重要作用。本文对lncRNAs在血管损伤中作用及机制进行综述,为HAVD早期诊断和治疗研究提供科学理论依据。 展开更多
关键词 lncrnas 内皮细胞 血管平滑肌细胞 血管新生 生物标志物 手臂振动病 研究进展
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LncRNAs与心脏重构研究进展
15
作者 张博文 张明宇 +3 位作者 姜媛 孙佳斌 伍江姣 许超千 《解剖科学进展》 2019年第6期713-716,共4页
心脏重构主要表现为心肌受到外界刺激后引发的一种病理性改变,包括心肌细胞肥大,凋亡,自噬以及成纤维细胞的分化和增殖等病理过程,最终导致心脏体积增大,心肌重量增加,产生心功不全、心力衰竭等严重的心血管疾病。有证据表明,通过调控... 心脏重构主要表现为心肌受到外界刺激后引发的一种病理性改变,包括心肌细胞肥大,凋亡,自噬以及成纤维细胞的分化和增殖等病理过程,最终导致心脏体积增大,心肌重量增加,产生心功不全、心力衰竭等严重的心血管疾病。有证据表明,通过调控不同功能的长链非编码RNA(lncRNAs)在相关心脏疾病中的表达水平,可以加重或逆转心脏重构的病理过程。因此,lncRNAs作为心脏重构的重要调节靶点,有望成为治疗心脏重构的新的研究方向。 展开更多
关键词 心脏重构 lncrnas 心肌细胞凋亡 lncrnas
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基于随机游走算法预测lncRNAs与疾病关系的研究进展
16
作者 赵琪 梁丹 +2 位作者 胡桓 张力 刘宏生 《辽宁大学学报(自然科学版)》 CAS 2018年第3期273-280,共8页
近年来,lncRNAs引起了研究者的广泛关注.随着实验技术与智能计算方法的快速发展,lncRNAs已经被证明与人类的许多复杂疾病息息相关.相比一般的实验方法而言,智能算法能够更高效、更便捷的预测与疾病相关的lncRNAs,并且挑选出可能性最高的... 近年来,lncRNAs引起了研究者的广泛关注.随着实验技术与智能计算方法的快速发展,lncRNAs已经被证明与人类的许多复杂疾病息息相关.相比一般的实验方法而言,智能算法能够更高效、更便捷的预测与疾病相关的lncRNAs,并且挑选出可能性最高的lncRNAs加以实验验证,从而提高效率增强可靠性.文章以随机游走算法为例,首先综述了lncRNAs与随机游走智能算法的相关概念及随机游走算法的应用范围与局限性,其次在预测lncRNAs与疾病关系中,通过数学模型来说明传统随机游走与改进随机游走的本质区别,最后讨论了其发展趋势. 展开更多
关键词 lncrnas 疾病 随机游走 智能算法
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探索m6A相关lncRNAs预测胃腺癌患者总体生存率
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作者 潘辉 姚文霞 +1 位作者 梁敏 周新科 《肿瘤预防与治疗》 2023年第5期373-388,共16页
目的:胃腺癌是胃癌最常见的亚型。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)和长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)在胃腺癌的预后价值中起着至关重要的作用。因此,辨别与m6A相关的lncRNA在胃腺癌研究中至关重要。方法:本研究从TCG... 目的:胃腺癌是胃癌最常见的亚型。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)和长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)在胃腺癌的预后价值中起着至关重要的作用。因此,辨别与m6A相关的lncRNA在胃腺癌研究中至关重要。方法:本研究从TCGA数据库中获取了胃腺癌研究的RNA序列转录组数据、相关临床信息。使用R语言的“limma”包对15 901个lncRNAs按肿瘤组织和正常组织分组进行差异表达分析。采用单因素Cox回归分析从TCGA数据集中的347个与m6A相关lncRNAs中筛选出与预后相关的基因67个(P <0.05)。使用R包“glmnet”对67个入选lncRNAs进行LASSO Cox回归分析,确定12个m6A相关的lncRNAs与胃腺癌患者的总生存期明显相关,并采用多因素Cox回归分析建立起m6A相关的lncRNAs风险评分模型。单因素和多因素回归分析结果表明风险评分模型是患者预后的独立影响因素(HR=3.45,95%CI为2.46~4.99,P <0.001)。分析风险评分与肿瘤免疫微环境细胞浸润的关系。最后,基于独立的预后影响因素(年龄、性别、风险评分、T分期、N分期)建立列线图。结果:确定12个m6A相关的lncRNAs与胃腺癌患者的总生存期明显相关,建立起m6A相关的lncRNAs风险评分模型。并证明该模型与肿瘤微环境细胞浸润存在相关性。基于独立的预后影响因素建立列线图,模型的C-index为0.73,模型预测有效性较高。结论:通过对lncRNAs风险模型的反复验证,证实了12个m6A相关lncRNAs可以作为胃腺癌患者风险预测的指标。 展开更多
关键词 m6A lncrnas 胃腺癌 预后 生物标志物
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铁死亡相关的LncRNAs在甲状腺癌中的预后价值及预后风险模型构建
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作者 章静 王黎明 +3 位作者 周金宝 刘贺 潘越 朱峰 《现代生物医学进展》 CAS 2022年第2期282-288,共7页
目的:探讨铁死亡相关的长链非编码RNAs(LncRNAs)在甲状腺癌中的预后价值并构建预后风险模型。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载甲状腺癌的转录本数据和临床数据,铁死亡相关的基因数据集是从铁死亡数据库(http://www.zhounan.org/f... 目的:探讨铁死亡相关的长链非编码RNAs(LncRNAs)在甲状腺癌中的预后价值并构建预后风险模型。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载甲状腺癌的转录本数据和临床数据,铁死亡相关的基因数据集是从铁死亡数据库(http://www.zhounan.org/ferrdb/)下载的259个基因集。得到铁死亡相关LncRNAs,与患者临床信息合并后,通过单因素Cox回归分析和Kaplan-Meier生存分析两种方法得到与甲状腺癌预后相关的铁死亡LncRNAs,通过R的survival包构建COX模型以此来建立最佳预后风险模型并予以验证。结果:获得30个铁死亡相关的LncRNAs,多因素cox分析得到10个与甲状腺癌预后相关的铁死亡LncRNAs,包括AL136366.1、AL162231.2、CRNDE、AC004918.3、LINC02471、AC092279.1、AC046143.1、LINC02454、DOCK9-DT、AC008063.1。Kaplan-Meier生存分析表明高风险组预后较差。单因素和多因素Cox分析表明风险评分可以作为独立预后因子。KEGG通路富集分析发现,差异基因可能与嘧啶代谢、核苷酸切除修复、NOTCH_信号通路等通路有关。结论:通过生物信息学方法筛选出10个与甲状腺癌预后的铁死亡相关LncRNAs,并成功构建预后风险模型。 展开更多
关键词 甲状腺癌 铁死亡 lncrnas 生物信息学 预后 风险模型
原文传递
lncRNAs的分子功能及其在干细胞多能性中的研究进展
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作者 王香梅 彭智 《齐齐哈尔医学院学报》 2012年第24期3402-3404,共3页
长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)是调控基因表达的新重点,其本身的脱帽和降解可能会是它功能的一个极其重要的方面,尤其是在可诱导基因的转录调控中起到重要作用。lncRNAs具有作为信号、诱饵、向导和支架等多种分子功能。... 长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)是调控基因表达的新重点,其本身的脱帽和降解可能会是它功能的一个极其重要的方面,尤其是在可诱导基因的转录调控中起到重要作用。lncRNAs具有作为信号、诱饵、向导和支架等多种分子功能。干细胞的研究证实lncRNAs在维持干细胞多能状态中起作用,是干细胞多能性及神经生成等的关键调节器,而且主要通过反式作用影响全体基因表达。随着研究的深入,越来越多的具有重要调控功能的lncRNAs被发现,但是要阐明其调控生物学进程的具体的分子机制及信号通路还需要更多更深入的研究。 展开更多
关键词 lncrnas 分子功能 干细胞
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LncRNAs在鼻咽癌中作用机制的研究进展 被引量:4
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作者 胡锦程 钟田雨 +2 位作者 胡晓梅 肖永伟 彭韶平 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第6期823-826,共4页
鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是中国常见的恶性肿瘤之一,其发病机制通常与环境因素、EB病毒感染等有关。最近越来越多的研究发现,一些异常表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在鼻咽癌的发生发展起重要作用。LncR... 鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是中国常见的恶性肿瘤之一,其发病机制通常与环境因素、EB病毒感染等有关。最近越来越多的研究发现,一些异常表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在鼻咽癌的发生发展起重要作用。LncRNAs是一类长度>200个核苷酸,缺乏蛋白质编码能力,可以调控很多基因的表达。尽管很多证据表明LncRNAs在鼻咽癌中的重要性,但目前还没有系统性地阐明这些lncRNAs与鼻咽癌的关系。这篇文章总结LncRNAs在鼻咽癌中的作用机制,并介绍LncRNAs可能作为鼻咽癌诊断、预后生物标志物以及潜在的治疗靶标。 展开更多
关键词 lncrnas 鼻咽癌 作用机制 标志物 治疗靶标
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