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lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌细胞增殖和侵袭的机制研究 被引量:2
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作者 王佳乐 李琤 李广明 《肝脏》 2022年第2期213-217,共5页
目的 探讨lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌(HCC)细胞增殖和侵袭的机制。方法 设肝癌Huh7细胞组、lncRNA TSIX mimics组、lncRNA TSIX inhibitor组;各组细胞培养48 h后,采用MTT法测定细胞活力,结晶紫染色测定单克隆形成数目... 目的 探讨lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌(HCC)细胞增殖和侵袭的机制。方法 设肝癌Huh7细胞组、lncRNA TSIX mimics组、lncRNA TSIX inhibitor组;各组细胞培养48 h后,采用MTT法测定细胞活力,结晶紫染色测定单克隆形成数目,流式细胞仪测定细胞凋亡水平,transwell腔室测定细胞侵袭水平,RT-PCR法测定细胞lncRNA TSIX、miR-548-a-3p水平。结果 lncRNA TSIX mimics组OD值、存活率、单克隆形成数目、穿膜数低于Huh7细胞组(t=8.725、5.437、120.834、64.321,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组OD值、存活率、单克隆形成数目、穿膜数高于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组(t=4.124、3.784、10.462、7.965、37.192、174.632、30.703、104.562,P<0.05)。lncRNA TSIX mimics组细胞凋亡率、lncRNA TSIX高于Huh7细胞组[(18.52±2.45)vs(15.63±2.13),(4.47±0.22)vs(2.89±0.21)](t=10.531、12.372,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组细胞凋亡率、lncRNA TSIX低于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组[(8.14±2.45)vs(15.63±2.13)、(18.52±2.45),(1.58±0.25)vs(2.89±0.21)、(4.47±0.22)](t=37.385、48.021、30.703、104.562,P<0.05)。lncRNA TSIX mimics组miR-548-a-3p低于Huh7细胞组[(2.39±0.19)vs(4.87±0.20)](t=11.265,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组miR-548-a-3p高于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组[(6.32±0.19)vs(4.87±0.20)、(2.39±0.19)](t=6.612、10.058,P<0.05)。结论 lncRNA TSIX明显抑制HCC细胞增殖、侵袭,促进HCC细胞凋亡;其机制可能与lncRNA TSIX负调节miR-548-a-3p有关。 展开更多
关键词 lncrna tsix miR-548-a-3p 肝细胞癌 细胞增殖 细胞侵袭
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XIST和TSIX lncRNA在缺血性脑卒中中的作用及其机制
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作者 卜国森 马建华 +1 位作者 康志东 木胡牙提 《山西医科大学学报》 2025年第11期1252-1259,共8页
目的通过对缺血性脑卒中患者外周血单个核细胞(PBMC)进行RNA-seq测序,探究缺血性脑卒中潜在的lncRNA生物学靶点。方法分别收集10例缺血性脑卒中患者(缺血性脑卒中组)和10例健康对照者(对照组)的新鲜全血样本,所有血液样本均使用抗凝管采... 目的通过对缺血性脑卒中患者外周血单个核细胞(PBMC)进行RNA-seq测序,探究缺血性脑卒中潜在的lncRNA生物学靶点。方法分别收集10例缺血性脑卒中患者(缺血性脑卒中组)和10例健康对照者(对照组)的新鲜全血样本,所有血液样本均使用抗凝管采集,提取PBMC的RNA,使用String Tie处理转录本进行筛选和过滤,DESeq2获取差异表达的lncRNA,实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证lncRNA生物学靶点在缺血性脑卒中患者PBMC中mRNA的表达情况。采用京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对lncRNA反式调控及lncRNA顺式调控潜在通路进行探索。结果通过对候选lncRNA进行筛选,缺血性脑卒中组与对照组共获得1391个表达转录本。采用DESeq2进行差异表达分析,共鉴定出408个显著差异表达的lncRNA,其中262个显著上调,146个显著下调。通过对测序结果的深入分析,确定lncRNA XIST和TSIX为缺血性脑卒中潜在的新型生物学靶点。与对照组相比,缺血性脑卒中组中XIST的mRNA表达水平下降,而TSIX的mRNA表达水平升高(均P<0.05)。进一步对差异表达的lncRNA与mRNA进行共表达分析发现,反式调控的差异lncRNA在分子功能上主要富集于蛋白结合,在生物过程中核心调控细胞黏附,且这些功能与细胞外囊泡密切相关。顺式调控的lncRNA则主要参与蛋白结合,在生物过程中以免疫反应为核心,且多位于细胞膜。KEGG通路富集分析表明,这两类调控方式均显著富集于细胞外基质-受体相互作用通路。结论XIST和TSIX lncRNA可能为缺血性脑卒中临床诊断的生物学标志物,通过调控细胞外基质-受体相互作用通路诱导缺血性脑卒中。 展开更多
关键词 缺血性脑卒中 lncrna 转录组测序 生物标志物 XIST tsix
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