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lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌细胞增殖和侵袭的机制研究
被引量:
2
1
作者
王佳乐
李琤
李广明
《肝脏》
2022年第2期213-217,共5页
目的 探讨lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌(HCC)细胞增殖和侵袭的机制。方法 设肝癌Huh7细胞组、lncRNA TSIX mimics组、lncRNA TSIX inhibitor组;各组细胞培养48 h后,采用MTT法测定细胞活力,结晶紫染色测定单克隆形成数目...
目的 探讨lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌(HCC)细胞增殖和侵袭的机制。方法 设肝癌Huh7细胞组、lncRNA TSIX mimics组、lncRNA TSIX inhibitor组;各组细胞培养48 h后,采用MTT法测定细胞活力,结晶紫染色测定单克隆形成数目,流式细胞仪测定细胞凋亡水平,transwell腔室测定细胞侵袭水平,RT-PCR法测定细胞lncRNA TSIX、miR-548-a-3p水平。结果 lncRNA TSIX mimics组OD值、存活率、单克隆形成数目、穿膜数低于Huh7细胞组(t=8.725、5.437、120.834、64.321,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组OD值、存活率、单克隆形成数目、穿膜数高于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组(t=4.124、3.784、10.462、7.965、37.192、174.632、30.703、104.562,P<0.05)。lncRNA TSIX mimics组细胞凋亡率、lncRNA TSIX高于Huh7细胞组[(18.52±2.45)vs(15.63±2.13),(4.47±0.22)vs(2.89±0.21)](t=10.531、12.372,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组细胞凋亡率、lncRNA TSIX低于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组[(8.14±2.45)vs(15.63±2.13)、(18.52±2.45),(1.58±0.25)vs(2.89±0.21)、(4.47±0.22)](t=37.385、48.021、30.703、104.562,P<0.05)。lncRNA TSIX mimics组miR-548-a-3p低于Huh7细胞组[(2.39±0.19)vs(4.87±0.20)](t=11.265,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组miR-548-a-3p高于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组[(6.32±0.19)vs(4.87±0.20)、(2.39±0.19)](t=6.612、10.058,P<0.05)。结论 lncRNA TSIX明显抑制HCC细胞增殖、侵袭,促进HCC细胞凋亡;其机制可能与lncRNA TSIX负调节miR-548-a-3p有关。
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关键词
lncrna
tsix
miR-548-a-3p
肝细胞癌
细胞增殖
细胞侵袭
暂未订购
XIST和TSIX lncRNA在缺血性脑卒中中的作用及其机制
2
作者
卜国森
马建华
+1 位作者
康志东
木胡牙提
《山西医科大学学报》
2025年第11期1252-1259,共8页
目的通过对缺血性脑卒中患者外周血单个核细胞(PBMC)进行RNA-seq测序,探究缺血性脑卒中潜在的lncRNA生物学靶点。方法分别收集10例缺血性脑卒中患者(缺血性脑卒中组)和10例健康对照者(对照组)的新鲜全血样本,所有血液样本均使用抗凝管采...
目的通过对缺血性脑卒中患者外周血单个核细胞(PBMC)进行RNA-seq测序,探究缺血性脑卒中潜在的lncRNA生物学靶点。方法分别收集10例缺血性脑卒中患者(缺血性脑卒中组)和10例健康对照者(对照组)的新鲜全血样本,所有血液样本均使用抗凝管采集,提取PBMC的RNA,使用String Tie处理转录本进行筛选和过滤,DESeq2获取差异表达的lncRNA,实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证lncRNA生物学靶点在缺血性脑卒中患者PBMC中mRNA的表达情况。采用京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对lncRNA反式调控及lncRNA顺式调控潜在通路进行探索。结果通过对候选lncRNA进行筛选,缺血性脑卒中组与对照组共获得1391个表达转录本。采用DESeq2进行差异表达分析,共鉴定出408个显著差异表达的lncRNA,其中262个显著上调,146个显著下调。通过对测序结果的深入分析,确定lncRNA XIST和TSIX为缺血性脑卒中潜在的新型生物学靶点。与对照组相比,缺血性脑卒中组中XIST的mRNA表达水平下降,而TSIX的mRNA表达水平升高(均P<0.05)。进一步对差异表达的lncRNA与mRNA进行共表达分析发现,反式调控的差异lncRNA在分子功能上主要富集于蛋白结合,在生物过程中核心调控细胞黏附,且这些功能与细胞外囊泡密切相关。顺式调控的lncRNA则主要参与蛋白结合,在生物过程中以免疫反应为核心,且多位于细胞膜。KEGG通路富集分析表明,这两类调控方式均显著富集于细胞外基质-受体相互作用通路。结论XIST和TSIX lncRNA可能为缺血性脑卒中临床诊断的生物学标志物,通过调控细胞外基质-受体相互作用通路诱导缺血性脑卒中。
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关键词
缺血性脑卒中
lncrna
转录组测序
生物标志物
XIST
tsix
暂未订购
题名
lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌细胞增殖和侵袭的机制研究
被引量:
2
1
作者
王佳乐
李琤
李广明
机构
河南省传染病医院(郑州市第六人民医院)肝硬化科
出处
《肝脏》
2022年第2期213-217,共5页
基金
河南省医学科技攻关计划项目(2018020849)。
文摘
目的 探讨lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌(HCC)细胞增殖和侵袭的机制。方法 设肝癌Huh7细胞组、lncRNA TSIX mimics组、lncRNA TSIX inhibitor组;各组细胞培养48 h后,采用MTT法测定细胞活力,结晶紫染色测定单克隆形成数目,流式细胞仪测定细胞凋亡水平,transwell腔室测定细胞侵袭水平,RT-PCR法测定细胞lncRNA TSIX、miR-548-a-3p水平。结果 lncRNA TSIX mimics组OD值、存活率、单克隆形成数目、穿膜数低于Huh7细胞组(t=8.725、5.437、120.834、64.321,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组OD值、存活率、单克隆形成数目、穿膜数高于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组(t=4.124、3.784、10.462、7.965、37.192、174.632、30.703、104.562,P<0.05)。lncRNA TSIX mimics组细胞凋亡率、lncRNA TSIX高于Huh7细胞组[(18.52±2.45)vs(15.63±2.13),(4.47±0.22)vs(2.89±0.21)](t=10.531、12.372,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组细胞凋亡率、lncRNA TSIX低于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组[(8.14±2.45)vs(15.63±2.13)、(18.52±2.45),(1.58±0.25)vs(2.89±0.21)、(4.47±0.22)](t=37.385、48.021、30.703、104.562,P<0.05)。lncRNA TSIX mimics组miR-548-a-3p低于Huh7细胞组[(2.39±0.19)vs(4.87±0.20)](t=11.265,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组miR-548-a-3p高于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组[(6.32±0.19)vs(4.87±0.20)、(2.39±0.19)](t=6.612、10.058,P<0.05)。结论 lncRNA TSIX明显抑制HCC细胞增殖、侵袭,促进HCC细胞凋亡;其机制可能与lncRNA TSIX负调节miR-548-a-3p有关。
关键词
lncrna
tsix
miR-548-a-3p
肝细胞癌
细胞增殖
细胞侵袭
Keywords
lncrna tsix
MiR-548-a-3p
Hepatocellular carcinoma
Cell proliferation
Cell invasion
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
暂未订购
题名
XIST和TSIX lncRNA在缺血性脑卒中中的作用及其机制
2
作者
卜国森
马建华
康志东
木胡牙提
机构
新疆医科大学第一附属医院神经内科
新疆阿克苏市人民医院神经外科
新疆医科大学第一附属医院综合心脏内科
出处
《山西医科大学学报》
2025年第11期1252-1259,共8页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目(2025D01C178)
新疆医科大学第一附属医院青年科研启航专项基金项目(2023YFY-QKQN-54)
天山英才-科技创新领军人才项目(2022TSYCI.J0065)。
文摘
目的通过对缺血性脑卒中患者外周血单个核细胞(PBMC)进行RNA-seq测序,探究缺血性脑卒中潜在的lncRNA生物学靶点。方法分别收集10例缺血性脑卒中患者(缺血性脑卒中组)和10例健康对照者(对照组)的新鲜全血样本,所有血液样本均使用抗凝管采集,提取PBMC的RNA,使用String Tie处理转录本进行筛选和过滤,DESeq2获取差异表达的lncRNA,实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证lncRNA生物学靶点在缺血性脑卒中患者PBMC中mRNA的表达情况。采用京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对lncRNA反式调控及lncRNA顺式调控潜在通路进行探索。结果通过对候选lncRNA进行筛选,缺血性脑卒中组与对照组共获得1391个表达转录本。采用DESeq2进行差异表达分析,共鉴定出408个显著差异表达的lncRNA,其中262个显著上调,146个显著下调。通过对测序结果的深入分析,确定lncRNA XIST和TSIX为缺血性脑卒中潜在的新型生物学靶点。与对照组相比,缺血性脑卒中组中XIST的mRNA表达水平下降,而TSIX的mRNA表达水平升高(均P<0.05)。进一步对差异表达的lncRNA与mRNA进行共表达分析发现,反式调控的差异lncRNA在分子功能上主要富集于蛋白结合,在生物过程中核心调控细胞黏附,且这些功能与细胞外囊泡密切相关。顺式调控的lncRNA则主要参与蛋白结合,在生物过程中以免疫反应为核心,且多位于细胞膜。KEGG通路富集分析表明,这两类调控方式均显著富集于细胞外基质-受体相互作用通路。结论XIST和TSIX lncRNA可能为缺血性脑卒中临床诊断的生物学标志物,通过调控细胞外基质-受体相互作用通路诱导缺血性脑卒中。
关键词
缺血性脑卒中
lncrna
转录组测序
生物标志物
XIST
tsix
Keywords
ischemic stroke
lncrna
transcriptome sequencing
biomarker
XIST
tsix
分类号
R743 [医药卫生—神经病学与精神病学]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌细胞增殖和侵袭的机制研究
王佳乐
李琤
李广明
《肝脏》
2022
2
暂未订购
2
XIST和TSIX lncRNA在缺血性脑卒中中的作用及其机制
卜国森
马建华
康志东
木胡牙提
《山西医科大学学报》
2025
0
暂未订购
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