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一株Lineage7和Lineage8重组PRRSV的全基因组分析
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作者 许浒 李金昊 +16 位作者 张思钰 孙琪 张梦琳 郭镇洋 龚帮俊 李超 相丽润 彭金美 王倩 周国辉 汤艳东 冷超粮 赵款 安同庆 蔡雪辉 张洪亮 田志军 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第7期745-750,共6页
Lineage7 PRRSV最早出现于美国,2005年Lineage7 PRRSV在我国首次发现,但近20年一直无该分支PRRSV的报道。2024年黑龙江省某猪场疑似出现PRRS疫情,保育猪出现咳嗽、消瘦等临床症状。为明确引起猪发病的病原,本研究采集14份保育猪血清,经... Lineage7 PRRSV最早出现于美国,2005年Lineage7 PRRSV在我国首次发现,但近20年一直无该分支PRRSV的报道。2024年黑龙江省某猪场疑似出现PRRS疫情,保育猪出现咳嗽、消瘦等临床症状。为明确引起猪发病的病原,本研究采集14份保育猪血清,经荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)鉴定并测序分析。结果显示其中2份为PRRSV-2阳性,测序结果显示,2份阳性血清样品中PRRSV-2的基因序列一致,且于同一猪场发生,表明两株PRRSV-2相同,将其命名为HLJ3897株。利用高通量测序技术对HLJ3897株全基因组测序,利用Megalign软件分析HLJ3897株与各谱系PRRSV-2代表株全基因组序列的相似性;利用MEGA7.0软件构建PRRSV ORF5基因、部分Nsp2基因和全基因组序列的遗传进化树,分析其遗传变异情况;利用Simplot3.5.1和RDP4软件分析HLJ3897株的重组事件;利用Megalign软件比对各谱系PRRSV Nsp2的氨基酸序列,分析其氨基酸序列的变异。结果显示测序获得的HLJ3897株全基因组序列长15 409 bp,全基因组序列相似性比对结果显示,HLJ3897株与Lineage 8 HP-PRRSV代表株JXA1的相似性最高达96.5%,与其他谱系PRRSV代表株的相似性为83.6%~93.3%。ORF5基因和全基因组序列的遗传进化树结果显示,HLJ3897株与Lineage8的HP-PRRSV处于同一进化分支,为Lineage8 PRRSV,与相似性分析结果一致,而基于部分Nsp2基因的遗传进化树显示HLJ3897株与Lineage7 PRRSV处于同一进化分支,这表明我国HP-PRRSV出现了新的变异。重组分析结果显示,HLJ3897株是以HP-PRRSV JXA1株为主要亲本,Lineage7 PRRSV APRRS株提供部分Nsp2基因片段的重组病毒,重组断点分别位于nt1 507和nt3 205。根据重组断点前(nt1~nt1 507)、中(nt1 508~nt3 205)、后(nt3 206~nt15 409)3个片段构建的遗传进化树验证了上述重组分析的结果。氨基酸比对结果显示,HLJ3897株Nsp2氨基酸序列均未出现Lineage7 PRRSV和HP-PRRSV的特征性氨基酸序列的插入或缺失。本研究在中国首次发现并报道了Lineage7 PRRSV与Lineage8 HP-PRRSV的重组野毒株,提示我国PRRSV-2的流行日趋复杂,应加大监测力度,关注PRRSV-2变异株对我国养猪业的危害。本研究对了解我国PRRSV-2的流行现状以及PRRS的防控均具有重要指导意义。 展开更多
关键词 Lineage7 prrsv lineage8 prrsv 重组病毒 首次发现
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