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荔枝LcGAMYB基因家族鉴定及矮化相关分子标记开发
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作者 符书英 杨明超 +6 位作者 陈丁 何玉坤 邓海达 陈哲 严婷婷 王祥和 胡福初 《热带作物学报》 北大核心 2026年第3期588-602,共15页
矮化是荔枝重要的育种与栽培性状。本研究以矮化相关的候选基因LcGAMYB23为核心,基于前期QTL定位结果,系统评估MYB家族背景及其分子应用潜力。通过全基因组层面的生物信息学鉴定,共获得151个LcMYB家族成员。保守基序与结构域解析表明,... 矮化是荔枝重要的育种与栽培性状。本研究以矮化相关的候选基因LcGAMYB23为核心,基于前期QTL定位结果,系统评估MYB家族背景及其分子应用潜力。通过全基因组层面的生物信息学鉴定,共获得151个LcMYB家族成员。保守基序与结构域解析表明,所有成员均含Myb_DNA-binding结构域,表明该家族在荔枝中序列保守性较高。进一步克隆并比对3个乔化荔枝品种(9918、妃子笑、三月红)和3个矮化荔枝品种(糯米糍、鸭姆笼、紫娘喜)的LcGAMYB23序列,发现两类材料在该基因上存在稳定的序列差异。基于差异单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点设计分子标记,并在70个品种中验证,结果显示,该标记可在cDNA水平有效区分乔化与矮化类型,且在DNA水平判别结果一致。上述结果为荔枝矮化性状的分子分型与分子辅助育种提供了有效工具,并为LcGAMYB23的功能阐释奠定基础。 展开更多
关键词 荔枝 lcgamyb23 基因家族 生物信息学分析 分子标记
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