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基于局域表面等离子体共振(LSPR)的核酸适配体筛选新方法的建立
被引量:
1
1
作者
郝俊芳
张英涛
+1 位作者
邢广旭
王方雨
《河南农业科学》
北大核心
2020年第3期151-156,共6页
为了快速、高效地筛选到靶标核酸适配体,急需通过指数富集的配基系统进化技术(SELEX)建立一种简便、高效和可视化筛选适配体的新方法.以链霉亲和素(SA)作为靶标模型,利用局域表面等离子体共振(LSPR)和毛细管电泳(CE)相结合的方法进行筛...
为了快速、高效地筛选到靶标核酸适配体,急需通过指数富集的配基系统进化技术(SELEX)建立一种简便、高效和可视化筛选适配体的新方法.以链霉亲和素(SA)作为靶标模型,利用局域表面等离子体共振(LSPR)和毛细管电泳(CE)相结合的方法进行筛选和验证.结果显示,在第1轮LSPR-SELEX中,筛选到SA结合的适配体(SBA),并且通过LSPR的Trace Drawer数据分析软件计算出SBA的KD值为107μmol/L;在第2轮LSPR-SELEX中,SBA的KD值为98 nmol/L.结果表明,采用LSPR-SELEX技术经2轮筛选,使SBA的亲和力提高了1000倍.随后,将筛选到的SBA进行CE验证,结果显示,SBA适配体与其靶标SA具有良好的亲和性和特异性.综上,鉴于LSPR从初始DNA文库中分离和收集靶标适配体的高效性,LSPR-SELEX技术可用于核酸适配体的筛选.
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关键词
适配体
lspr-selex
链霉亲和素
毛细管电泳
KD值
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职称材料
题名
基于局域表面等离子体共振(LSPR)的核酸适配体筛选新方法的建立
被引量:
1
1
作者
郝俊芳
张英涛
邢广旭
王方雨
机构
河南省农业科学院动物免疫学重点实验室
四川农业大学动物医学院禽病研究中心
河南省科学院生物研究所有限责任公司
出处
《河南农业科学》
北大核心
2020年第3期151-156,共6页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFC1602902)。
文摘
为了快速、高效地筛选到靶标核酸适配体,急需通过指数富集的配基系统进化技术(SELEX)建立一种简便、高效和可视化筛选适配体的新方法.以链霉亲和素(SA)作为靶标模型,利用局域表面等离子体共振(LSPR)和毛细管电泳(CE)相结合的方法进行筛选和验证.结果显示,在第1轮LSPR-SELEX中,筛选到SA结合的适配体(SBA),并且通过LSPR的Trace Drawer数据分析软件计算出SBA的KD值为107μmol/L;在第2轮LSPR-SELEX中,SBA的KD值为98 nmol/L.结果表明,采用LSPR-SELEX技术经2轮筛选,使SBA的亲和力提高了1000倍.随后,将筛选到的SBA进行CE验证,结果显示,SBA适配体与其靶标SA具有良好的亲和性和特异性.综上,鉴于LSPR从初始DNA文库中分离和收集靶标适配体的高效性,LSPR-SELEX技术可用于核酸适配体的筛选.
关键词
适配体
lspr-selex
链霉亲和素
毛细管电泳
KD值
Keywords
Aptamers
lspr-selex
Streptavidin
Capillary electrophoresis
K D value
分类号
S859.84 [农业科学—临床兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于局域表面等离子体共振(LSPR)的核酸适配体筛选新方法的建立
郝俊芳
张英涛
邢广旭
王方雨
《河南农业科学》
北大核心
2020
1
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