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题名小麦TaLSD1锌指蛋白基因的电子克隆及序列分析
被引量：14
- 1
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作者
黄新杰
郭军
屈志鹏
黄丽丽
康振生
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机构
西北农林科技大学植物保护学院
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第11期2147-2152,共6页
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基金
教育部重大科技培育项目(2004-295)
教育部长江学者和创新团队发展计划资助(IRT0558)
+1 种基金
国家自然科学基金资助项目(30671350)
高等学校学科创新引智计划资助项目(B07049)
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文摘
采用电子克隆与RT-PCR相结合的技术,在条锈菌(Pucciniastriiformis f.sp.tritici)侵染的小麦中克隆了一个LSD1型锌指蛋白基因,命名为TaLSD1(GenBank登录号为EF553327)。序列分析表明,该基因全长1024bp,编码生成1个包含3个保守LSD1型锌指结构(CxxCxRxxLMYxxGASxVxCxxC)且长度为146个氨基酸的多肽。进化树分析表明,TaLSD1与水稻(Oryza sativa)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和芜菁(Brassica rapa)中部分含有3个保守LSD1型锌指结构的同源基因亲缘关系较近,而与其它包含不同数目的LSD1型锌指结构基因亲缘关系较远。推测TaLSD1在进化中丢失了部分序列,进而执行新的功能。半定量RT-PCR结果显示,该基因在亲和以及非亲和组合中的表达模式很相似,均表现在前期基因表达被抑制而后期恢复正常。初步推测TaLSD1在转录水平上的表达受光诱导,同时,作为一个细胞程序性死亡的负调控因子在小麦与条锈菌互作过程中起作用。
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关键词
条锈菌
电子克隆
进化树分析
半定量RT-PCR
lsdl型锌指结构
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Keywords
stripe rust fungus
in silico cloning
phylogenetic tree analysis
semi-quantitative RT-PCR
LSD1type zinc finger motif
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分类号
Q789
[生物学—分子生物学]
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题名LSD1在恶性肿瘤中的研究进展
被引量：1
- 2
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作者
荆璟
陈公琰
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机构
哈尔滨医科大学附属肿瘤医院内一科
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出处
《实用肿瘤学杂志》
CAS
2014年第6期569-572,共4页
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文摘
赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶（LSDl）是一个黄素腺嘌呤二核苷酸（FAD）依赖性单胺氧化酶，它能够特异性脱去单甲基化和二甲基化H3K4和H3K9位点上的甲基基团，从而调节基因的转录活性。LSDl对哺乳动物的发育至关重要，并参与许多生物学过程，包括细胞类型的分化、基因活化和基因抑制。目前证实LSDl可促进细胞相变（缺乏LSDl导致部分细胞周期阻滞在G2／M期）和细胞增殖。提示其过表达可促进肿瘤的发生。LSDl作为一种去甲基化酶，有可能成为一个新的抗肿瘤治疗靶点。现对LSDl的结构、作用方式以及其与肿瘤发生的关系等方面进行综述。
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关键词
lsdl
去甲基化
恶性肿瘤
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Keywords
LSDI
Demethylation
Malignant tumors
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分类号
R730.1
[医药卫生—肿瘤]
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题名小麦锌指蛋白基因TaLOL2的克隆及特征分析
被引量：2
- 3
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作者
白鹏飞
杨倩
康振生
郭军
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机构
旱区作物逆境生物学国家重点实验室
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期2151-2156,共6页
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基金
国家重点基础研究发展计划(2013CB127700)
国家自然科学基金(30930064,31171795)
+2 种基金
国家现代农业产业技术体系岗位科学家专项(CARS-3-1-11)
“111”引智项目(B07049)
中央高校基本科研业务费(QN2009035)
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文摘
通过电子克隆与RT-PCR相结合的方法,在条锈菌诱导的小麦叶片中克隆获得1个新的LSD1型锌指蛋白基因TaLOL2,并用qRT-PCR技术分析了其转录表达特征。结果显示:(1)小麦锌指蛋白基因TaLOL2的cDNA全长1 095bp,编码179个氨基酸。(2)TaLOL2含有3个典型的zf-LSD1型(CxxCxRxxLMYxxGASxVxCxxC)保守结构域,与水稻、拟南芥、大麦等植物LSD1型锌指蛋白序列具有高度相似性,其中与水稻OsLOL2相似度达86.0%。(3)进化树分析表明,TaLOL2与水稻、拟南芥和大麦中部分含有3个保守zf-LSD1锌指结构的基因亲缘关系较近,而与其它包含不同数目的zf-LSD1锌指结构的基因亲缘关系较远。(4)qRT-PCR定量分析表明,TaLOL2在条锈菌侵染前期呈上调表达,在亲和及非亲和反应中差异表达。研究表明,TaLOL2参与了条锈菌诱导的小麦抗病防卫反应,很可能作为正调控因子参与了小麦-条锈菌非亲和互作中对条锈菌的抗性信号途径。
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关键词
条锈菌
电子克隆
LSD1型锌指蛋白
TaLOL2
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Keywords
stripe rust fungus
in silico cloning
lsdl-type zinc finger protein
TaLOL2
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分类号
Q786
[生物学—分子生物学]
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