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基于生物信息学分析LPAR5在甲状腺乳头状癌中的表达及其意义
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作者 李娜 连续 +1 位作者 兰宏伟 许红昕 《中国现代医生》 2021年第9期1-4,9,F0003,共6页
目的通过生物信息学的方法分析溶血磷脂酸受体5(LPAR5)在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及临床意义,为PTC分子生物研究和生物标志物筛选提供理论依据。方法2020年5月开始从GEO数据库中筛选数据,最终筛选出编号为GSE3678的基因芯片,并对样... 目的通过生物信息学的方法分析溶血磷脂酸受体5(LPAR5)在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及临床意义,为PTC分子生物研究和生物标志物筛选提供理论依据。方法2020年5月开始从GEO数据库中筛选数据,最终筛选出编号为GSE3678的基因芯片,并对样本进行规范化处理,筛选出差异表达基因LPAR5。利用TCGA数据库验证LPAR5在甲状腺癌组织和正常甲状腺组织差异表达情况,同时在ulcan数据库分析LPAR5表达与PTC患者临床特征之间的关系。通过GEPIA2分析LPAR5基因与甲状腺癌生存率之间的关系。结果共筛选出甲状腺癌差异基因755个,其中表达上调差异基因314个,表达下调差异基因441个,基于TCGA基因表达数据分析得出LPAR5在甲状腺癌中表达高于正常甲状腺组织,LPAR5表达量与甲状腺癌患者的临床分期和N分期密切相关(P<0.05),而与性别、年龄未见相关性(P>0.05),GEPIA2分析显示甲状腺癌患者LPAR5高表达组总生存率高于低表达组(P<0.05),而在甲状腺癌患者无病生存期中LPAR5高表达组与低表达组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论本研究通过生物信息学分析得到了甲状腺癌中的部分差异基因,并通过TCGA数据库分析进一步验证了LPAR5在甲状腺癌中的高表达,且与肿瘤临床分期和N分期密切相关,进一步证明了LPAR5可能参与PTC的发生发展,并影响PTC淋巴结转移。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 lpar5 生物信息学 GEO TCGA GEPIA2
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