目的检测1例下切牙先天缺失家系的基因突变情况,确定突变位点并探究突变对蛋白结构和功能的潜在影响,为下切牙先天缺失的发生机制提供新的见解。方法通过全外显子组测序及Sanger测序筛选该家系可能的致病基因,并对验证后的基因进行功能...目的检测1例下切牙先天缺失家系的基因突变情况,确定突变位点并探究突变对蛋白结构和功能的潜在影响,为下切牙先天缺失的发生机制提供新的见解。方法通过全外显子组测序及Sanger测序筛选该家系可能的致病基因,并对验证后的基因进行功能预测及突变位点氨基酸保守性分析。利用AlphaFold和PyMOL预测该蛋白的三维结构。使用小鼠基因组信息学和时空转录组图谱对候选基因表达进行分析。使用单细胞RNA测序数据分析白细胞受体簇成员9(leukocyte receptor cluster member 9,LENG9)基因可能参与调控的下游通路。结果在临床诊疗过程中发现1例下切牙先天缺失的家系。先证者及先证者的弟弟存在先天缺失下切牙的表型,先证者两侧磨牙远中关系、尖牙远中关系、上前牙轻度拥挤、下颌散在间隙、深覆牙合、深覆盖,而先证者的父母无缺牙表型。通过全外显子组测序发现在LENG9基因外显子1上存在(c.392C>T:p.Arg131His)的突变,且第131号的精氨酸在各物种间具有高度保守性。生物信息学分析显示LENG9在颌骨和牙齿中有表达。GO和KEGG通路注释分析表明,LENG9可能通过调控氧化磷酸化相关通路参与先天缺牙的发生。结论本研究报道了1例下切牙先天缺失的家系和1个LENG9(c.392C>T:p.Arg131His)的新发突变,研究结果提示该突变可能是导致该家系下切牙先天缺失的致病基因。展开更多
文摘目的检测1例下切牙先天缺失家系的基因突变情况,确定突变位点并探究突变对蛋白结构和功能的潜在影响,为下切牙先天缺失的发生机制提供新的见解。方法通过全外显子组测序及Sanger测序筛选该家系可能的致病基因,并对验证后的基因进行功能预测及突变位点氨基酸保守性分析。利用AlphaFold和PyMOL预测该蛋白的三维结构。使用小鼠基因组信息学和时空转录组图谱对候选基因表达进行分析。使用单细胞RNA测序数据分析白细胞受体簇成员9(leukocyte receptor cluster member 9,LENG9)基因可能参与调控的下游通路。结果在临床诊疗过程中发现1例下切牙先天缺失的家系。先证者及先证者的弟弟存在先天缺失下切牙的表型,先证者两侧磨牙远中关系、尖牙远中关系、上前牙轻度拥挤、下颌散在间隙、深覆牙合、深覆盖,而先证者的父母无缺牙表型。通过全外显子组测序发现在LENG9基因外显子1上存在(c.392C>T:p.Arg131His)的突变,且第131号的精氨酸在各物种间具有高度保守性。生物信息学分析显示LENG9在颌骨和牙齿中有表达。GO和KEGG通路注释分析表明,LENG9可能通过调控氧化磷酸化相关通路参与先天缺牙的发生。结论本研究报道了1例下切牙先天缺失的家系和1个LENG9(c.392C>T:p.Arg131His)的新发突变,研究结果提示该突变可能是导致该家系下切牙先天缺失的致病基因。
