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牦牛LCN6基因CDS的克隆及其在附睾不同区段中的表达
被引量:
3
1
作者
李鹏程
袁梦
+3 位作者
王红梅
杨刘玥玲
邱洁
赵旺生
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期5397-5402,共6页
为研究牦牛附睾组织中精子成熟有关机制,本研究从牦牛的附睾中克隆出LCN6基因,并采用生物信息学方法分析其生物学特点,同时分析该基因在牦牛附睾中的表达情况。以RT-PCR技术手段克隆所获牦牛的LCN6基因,而其在牦牛附睾的不同部位的表达...
为研究牦牛附睾组织中精子成熟有关机制,本研究从牦牛的附睾中克隆出LCN6基因,并采用生物信息学方法分析其生物学特点,同时分析该基因在牦牛附睾中的表达情况。以RT-PCR技术手段克隆所获牦牛的LCN6基因,而其在牦牛附睾的不同部位的表达丰度用实时荧光定量PCR进行检测。结果表明,所得牦牛LCN6基因的CDS含有一个564 bp长度的片段(登录号:XM_005887080.2),编码187个氨基酸;其对应的氨基酸具有跨膜结构,存在信号肽序列,归于不稳定的亲水性蛋白;分子量为20.934 ku,理论等电点是9.59,不稳定系数为53.95,平均亲水性系数为-0.127。牦牛LCN6基因编码氨基酸序列与绵羊和山羊等物种间同源性较高,亲缘关系远近与其系统进化情况一致。荧光定量PCR结果显示,LCN6基因在牦牛附睾组织的三个不同区段中均存在不同程度的表达,其中表达水平最高处位于附睾尾和附睾颈,显著高于附睾头(p<0.05)。本研究将为继续研究LCN6基因的功能提供基础数据。
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关键词
牦牛
lcn6
基因
生物信息学
组织表达
原文传递
题名
牦牛LCN6基因CDS的克隆及其在附睾不同区段中的表达
被引量:
3
1
作者
李鹏程
袁梦
王红梅
杨刘玥玲
邱洁
赵旺生
机构
西南科技大学生命科学与工程学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期5397-5402,共6页
基金
国家自然科学基金(31601946)
西南科技大学龙山人才支持计划(17LZX671,18lzx661)共同资助。
文摘
为研究牦牛附睾组织中精子成熟有关机制,本研究从牦牛的附睾中克隆出LCN6基因,并采用生物信息学方法分析其生物学特点,同时分析该基因在牦牛附睾中的表达情况。以RT-PCR技术手段克隆所获牦牛的LCN6基因,而其在牦牛附睾的不同部位的表达丰度用实时荧光定量PCR进行检测。结果表明,所得牦牛LCN6基因的CDS含有一个564 bp长度的片段(登录号:XM_005887080.2),编码187个氨基酸;其对应的氨基酸具有跨膜结构,存在信号肽序列,归于不稳定的亲水性蛋白;分子量为20.934 ku,理论等电点是9.59,不稳定系数为53.95,平均亲水性系数为-0.127。牦牛LCN6基因编码氨基酸序列与绵羊和山羊等物种间同源性较高,亲缘关系远近与其系统进化情况一致。荧光定量PCR结果显示,LCN6基因在牦牛附睾组织的三个不同区段中均存在不同程度的表达,其中表达水平最高处位于附睾尾和附睾颈,显著高于附睾头(p<0.05)。本研究将为继续研究LCN6基因的功能提供基础数据。
关键词
牦牛
lcn6
基因
生物信息学
组织表达
Keywords
Yak
lcn6
gene
Bioinformatics
Tissue expression
分类号
S823.85 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牦牛LCN6基因CDS的克隆及其在附睾不同区段中的表达
李鹏程
袁梦
王红梅
杨刘玥玲
邱洁
赵旺生
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
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