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LAMP5基因在食管癌中的预后作用及免疫分析
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作者 朱俊菘 梅格格 +3 位作者 霍振宇 何泉禄 任飞 李芳 《长治医学院学报》 2025年第2期97-102,共6页
目的:探讨LAMP5在食管癌中的预后作用和潜在免疫功能。方法:从TCGA和GTEx数据库获取181例食管癌肿瘤组织转录组数据和668例正常组织转录组数据,使用在线工具分析LAMP5在食管癌肿瘤样本和正常样本及临床各分期中的表达情况。使用limma软... 目的:探讨LAMP5在食管癌中的预后作用和潜在免疫功能。方法:从TCGA和GTEx数据库获取181例食管癌肿瘤组织转录组数据和668例正常组织转录组数据,使用在线工具分析LAMP5在食管癌肿瘤样本和正常样本及临床各分期中的表达情况。使用limma软件包鉴定食管癌组织和正常组织的差异表达基因,并进行KEGG通路富集和GO功能富集分析。绘制Kaplan-Meier生存曲线,采用logrank检验和单变量Cox回归分析LAMP5表达与患者生存率的相关性。通过QUANTISEQ算法分别计算LAMP5表达与免疫细胞浸润的相关性以及与免疫检查点基因表达的相关性。结果:LAMP5在食管癌样本中高表达,在正常样本中低表达(P<0.001);LAMP5的表达在临床分期前3期中呈逐步增长的趋势(P<0.01);筛选出4896个差异表达基因,包括2861个上调基因以及2035个下调基因,通路富集分析结果显示,上调基因显著富集在细胞因子-细胞因子受体的相互作用、细胞周期等信号通路,下调基因显著富集在钙信号等通路;KM生存曲线结果表明低表达组患者的生存时间显著高于高表达组患者的生存时间;Cox回归模型风险比值结果表明LAMP5是食管癌的危险性因素;LAMP5的表达与Tregs、M2巨噬细胞等免疫细胞的浸润呈显著正相关,与7个免疫检查点基因的表达呈显著正相关。结论:LAMP5的表达与食管癌的预后密切相关,它在肿瘤微环境和抑制抗肿瘤免疫功能中发挥显著作用;LAMP5有望成为一种新型的食管癌诊断标志物,同时LAMP5在靶向免疫治疗药物开发中具有重要价值。 展开更多
关键词 lamp5 食管癌 预后 免疫分析 肿瘤微环境
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LAMP5在结直肠癌发生发展和预后中的作用 被引量:3
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作者 杨书瀚 裴筱涵 祁义军 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2022年第8期1338-1344,共7页
目的研究LAMP5在结直肠癌组织中的表达水平及其与临床预后相关性,探讨其在结直肠癌发生发展中的作用。方法使用GEPIA和LinkedOmics数据库分析LAMP5在结直肠癌组织和配对癌旁组织中的表达水平、临床参数结直肠癌患者生存预后的关系并通... 目的研究LAMP5在结直肠癌组织中的表达水平及其与临床预后相关性,探讨其在结直肠癌发生发展中的作用。方法使用GEPIA和LinkedOmics数据库分析LAMP5在结直肠癌组织和配对癌旁组织中的表达水平、临床参数结直肠癌患者生存预后的关系并通过临床样本验证。使用LinkedOmics数据库和DAVID网站进行基因富集分析,研究LAMP5在结直肠癌发生发展中涉及的分子功能和相关信号通路。结果免疫组化结果显示,LAMP5在结直肠癌组织中的表达水平高于配对癌旁组织(n=120,P<0.05);LAMP5表达水平与结直肠癌分化程度呈负相关,与N分期和M分期呈正相关(P<0.05),但与年龄、性别和T分期无相关性。GEPIA分析和临床样本Kaplan-Meier分析显示LAMP5高表达结直肠癌患者的总生存期和无病生存期均短于LAMP5低表达者(P<0.05),COX回归分析提示LAMP5高表达是结直肠癌患者独立预后因素。GO分析显示LAMP5与结直肠癌细胞外基质、细胞外基质黏附、细胞外基质定位和胶原定位等功能相关(P<0.05);KEGG分析显示LAMP5可能与TGF-β和PI3K-AKT通路相关(P<0.05)。结论LAMP5在结直肠癌组织中表达水平升高,并且与结直肠癌分化水平、淋巴结转移、远处转移和临床预后相关,因此LAMP5可能作为结直肠癌诊断、治疗和预后预测新的分子指标。 展开更多
关键词 结直肠癌 lamp5 预后
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胃癌中LAMP5表达及预后意义分析 被引量:2
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作者 张翔 周宏 周云海 《交通医学》 2023年第1期33-38,共6页
目的:探究溶酶体相关膜蛋白5(LAMP5)在胃癌中的表达及预后意义。方法:选择胃癌组织130例及其邻近正常胃组织标本40例,采用组织芯片免疫组化检测LAMP5蛋白表达,分析LAMP5表达与患者临床病理特征及预后的关系。通过TCGA数据库验证胃癌与... 目的:探究溶酶体相关膜蛋白5(LAMP5)在胃癌中的表达及预后意义。方法:选择胃癌组织130例及其邻近正常胃组织标本40例,采用组织芯片免疫组化检测LAMP5蛋白表达,分析LAMP5表达与患者临床病理特征及预后的关系。通过TCGA数据库验证胃癌与正常胃组织中LAMP5表达差异,LAMP5表达与患者临床病理特征及总体生存期(overall survival,OS)的关系。采用基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)研究LAMP5可能的作用机制。结果:组织芯片免疫组化表明,与正常胃组织相比,胃癌组织LAMP5表达增高,LAMP5表达与胃癌分期(P=0.045)、肿瘤大小(P=0.006)相关。Kaplan-Meier生存曲线分析表明,LAMP5表达与胃癌患者OS呈负相关(P=0.035)。TCGA数据分析显示,与正常胃组织相比,胃癌组织中LAMP5表达增高(P=0.016);Kruskal检验表明LAMP5表达与肿瘤分级G3/G1(P=0.024)及G3/G2(P<0.001),分期SⅡ/Ⅰ(P<0.001)、SⅢ/Ⅰ(P<0.001)及SⅣ/Ⅰ(P<0.001),肿瘤大小T2/T1(P=0.002)、T3/T1(P<0.001)、T4/T1(P<0.001)、T3/T2(P=0.026)及T4/T2(P=0.005)相关。Kaplan-Meier生存曲线分析显示LAMP5表达越高,胃癌患者OS越短(P=0.007)。单因素COX回归分析表明,年龄(P=0.006)、分期(P<0.001)、肿瘤大小(P=0.032)、淋巴结转移(P=0.006)、远处转移(P=0.024)和LAMP5表达(P=0.004)可作为胃癌患者的预后指标;多因素COX回归分析表明,年龄(P<0.001)、性别(P=0.047)和LAMP5表达(P<0.001)可作为胃癌患者预后的独立指标。Gene Ontology(GO)富集分析显示,LAMP5可能参与促进胶原结合、细胞外基质结构成分、糖胺聚糖结合、生长因子结合、整合素结合等通路,抑制呼吸作用、线粒体呼吸链复合物组件、呼吸电子传输链、NADH脱氢酶复合物组件、核糖体结构成分等通路。Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析表明,LAMP5可能促进ECM受体相互作用、焦点粘附、TGF-β信号通路、Hedgehog信号通路、癌症途径等通路,抑制阿尔茨海默病、氧化磷酸化、亨廷顿病、帕金森病、核糖体等通路。结论:LAMP5在胃癌组织中高表达,LAMP5表达越高,患者总体生存期越差,LAMP5可作为胃癌患者预后的独立影响因素。 展开更多
关键词 胃癌 溶酶体相关膜蛋白5 预后 免疫组化
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