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LAMA3基因与癌症关系研究进展 被引量:3
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作者 胡晓东 杨玉秀 《中华实用诊断与治疗杂志》 2016年第6期531-533,共3页
层黏连蛋白是由α、β、γ亚基通过卷曲螺旋域组装而成的异三聚体分子,是构成基底膜的主要成分,能维护基底膜功能,并在调节细胞迁移和机械信号转导、肿瘤侵袭和转移中发挥作用。LAMA3基因编码层黏连蛋白α亚基与癌症的发生关系密切。本... 层黏连蛋白是由α、β、γ亚基通过卷曲螺旋域组装而成的异三聚体分子,是构成基底膜的主要成分,能维护基底膜功能,并在调节细胞迁移和机械信号转导、肿瘤侵袭和转移中发挥作用。LAMA3基因编码层黏连蛋白α亚基与癌症的发生关系密切。本文对LAMA3基因和癌症的关系、LAMA3甲基化在癌症发病机制中作用的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 癌症 lama3基因 lama3甲基化 层黏连蛋白
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LAMA3基因在肿瘤中研究新进展 被引量:4
2
作者 黄勇志 李力 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期680-684,共5页
肿瘤的发生发展是一个受多因素影响的逐步发展的过程,其中全基因组低甲基化和局部性高甲基化是肿瘤产生的重要原因。LAMA3基因作为层黏连蛋白的编码基因,被证实参与肿瘤的发生发展。基因启动子区的高甲基化往往使得LAMA3低表达甚至沉默,... 肿瘤的发生发展是一个受多因素影响的逐步发展的过程,其中全基因组低甲基化和局部性高甲基化是肿瘤产生的重要原因。LAMA3基因作为层黏连蛋白的编码基因,被证实参与肿瘤的发生发展。基因启动子区的高甲基化往往使得LAMA3低表达甚至沉默,miRNA与RNA可变剪接等表观遗传修饰也调控肿瘤细胞中LAMA3的表达。LAMA3的异常表达还与黏着斑和细胞外基质-受体两条信号通路密切相关,从而影响肿瘤细胞的侵袭和转移。本文就LAMA3在肿瘤发生发展过程中的作用及其在肿瘤中异常表达与表观遗传学的关系作一综述。 展开更多
关键词 lama3 DNA甲基化 肿瘤 黏着斑 侵袭 转移
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LAMA3在胰腺癌中的预后价值及机制的生物信息学分析 被引量:3
3
作者 王维杰 赵森峰 +1 位作者 曹家辉 李冰洁 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2021年第9期533-538,共6页
目的通过生物信息学分析LAMA3的表达对胰腺癌预后的诊断价值及其与肿瘤临床特征的相关性。方法从TCGA和GEO数据库分别下载胰腺癌转录组及临床数据,R软件用于数据处理和分析。首先明确LAMA3的差异表达,继而Kaplan-Meier分析LAMA3的表达... 目的通过生物信息学分析LAMA3的表达对胰腺癌预后的诊断价值及其与肿瘤临床特征的相关性。方法从TCGA和GEO数据库分别下载胰腺癌转录组及临床数据,R软件用于数据处理和分析。首先明确LAMA3的差异表达,继而Kaplan-Meier分析LAMA3的表达与胰腺癌总生存时间的关系,进而采用Cox回归分析LAMA3的表达与临床病理特征的相关性。最后利用GSEA预测分析LAMA3在胰腺癌中可能的分子机制。结果差异表达分析提示LAMA3在胰腺癌中显著高表达(P<0.05);生存分析提示LAMA3高表达的患者总体生存期明显短于低表达患者;单因素及多因素Cox回归分析提示LAMA3可以作为胰腺癌的独立预后因子。GSEA通路富集分析表明:p53信号通路、细胞周期、DNA复制、剪接体、蛋白酶体及氧化磷酸化在LAMA3高表达表型中富集;细胞因子-细胞因子受体相互作用和细胞黏附分子在LAMA3低表达表型中富集。结论LAMA3高表达是胰腺癌一个独立的不良预后因子,促进了胰腺癌的增殖、侵袭和转移。 展开更多
关键词 胰腺癌 lama3 生物信息学分析 肿瘤预后 TCGA数据库 GEO数据库 基因集富集分析 KEGG数据库
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一例交界型大疱性表皮松解症患儿LAMA3基因突变检测 被引量:3
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作者 孔祥生 刘江波 +2 位作者 陈付英 胡小华 李明 《中国麻风皮肤病杂志》 2019年第5期269-272,共4页
目的:检测1例交界型大疱性表皮松解症患儿LAMA3基因突变情况。方法:提取1例交界型大疱性表皮松解症患儿及其父母的外周血DNA,通过靶向捕获-高通量测序检测患儿的基因突变,用Sanger测序法进行父母验证,同时通过cDNA测序来验证异常的RNA... 目的:检测1例交界型大疱性表皮松解症患儿LAMA3基因突变情况。方法:提取1例交界型大疱性表皮松解症患儿及其父母的外周血DNA,通过靶向捕获-高通量测序检测患儿的基因突变,用Sanger测序法进行父母验证,同时通过cDNA测序来验证异常的RNA剪接。结果:在患儿LAMA3基因上检测到两个新的影响RNA剪接的突变,即c.1478+5G>A(导致在mRNA上c.1381_1478del)和c.4647+5G>C(导致在mRNA上c.4647_4648ins74),患儿的这2个突变分别遗传自其父亲和母亲。结论:本次检测到的LAMA3基因上的2个致病突变,可能因严重破坏层粘连蛋白-332的功能性α3肽链的合成而导致患儿发病。 展开更多
关键词 交界型大疱性表皮松解症 lama3基因
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LAMA3基因突变导致婴儿Herlitz型交界型大疱性表皮松解症1例 被引量:1
5
作者 陈晶晶 汪希珂 +1 位作者 崔玉霞 刘征 《贵州医药》 CAS 2021年第7期1034-1036,共3页
目的探讨Herlitz型交界型大疱性表皮松解症临床特征及致病基因。方法回顾分析贵州省人民医院儿科1例Herlitz型交界型大疱性表皮松解症患儿临床资料,采集患儿及父母外周静脉血DNA,采用GenCap技术捕获全部编码区外显子及其上下游100 bp邻... 目的探讨Herlitz型交界型大疱性表皮松解症临床特征及致病基因。方法回顾分析贵州省人民医院儿科1例Herlitz型交界型大疱性表皮松解症患儿临床资料,采集患儿及父母外周静脉血DNA,采用GenCap技术捕获全部编码区外显子及其上下游100 bp邻接内含子区域。运用Illumina HiSeq2 000测序平台对突变基因进行Sanger测序。结果患儿LAMA3基因存在1个纯合突变(c.1591_1602delinsT),导致氨基酸发生移码(p.E531fs),突变来源于父母。结论交界型大疱性表皮松解症发病率低、预后差,至今无有效治疗方法,产前诊断是主要干预手段。全基因组外显子测序可明确基因类型,帮助诊断。 展开更多
关键词 Herlitz型 交界型 大疱性表皮松解症 lama3基因突变 全外显子组测序法
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LAMA3在胰腺癌中的表达及其临床意义 被引量:4
6
作者 李晨 宋洪亮 +1 位作者 俞海波 单云峰 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2021年第2期85-88,95,共5页
目的探讨层粘连蛋白3(laminin 3,LAMA3)在胰腺癌患者中的表达,并分析其临床意义。方法采用回顾性分析法收集温州医科大学定理临床学院2011年5月至2018年12月胰腺癌病例40例,利用免疫组化、qRT-PCR、Western blotting等方法检测胰腺癌患... 目的探讨层粘连蛋白3(laminin 3,LAMA3)在胰腺癌患者中的表达,并分析其临床意义。方法采用回顾性分析法收集温州医科大学定理临床学院2011年5月至2018年12月胰腺癌病例40例,利用免疫组化、qRT-PCR、Western blotting等方法检测胰腺癌患者手术切除癌组织及癌旁正常组织的LAMA3表达情况,分析LAMA3表达与临床病理特征及肿瘤预后的相关性。利用GEO及Oncomine生物信息数据库验证LAMA3在胰腺癌组织中的表达情况。结果免疫组化检测结果表明胰腺癌组织中的LAMA3蛋白高表达率比癌旁组织中显著升高(60.0%vs 25.0%,χ2=10.026,P<0.05)。LAMA3蛋白表达与肿瘤大小、TNM分期显著相关(χ2=9.184,7.111,P<0.05),与性别、年龄、CA199、分化程度、淋巴结转移等因素无明显相关(P>0.05)。生存分析表明LAMA3高表达提示预后不良(P<0.05)。对GEO及Oncomine数据库分析显示,与正常癌旁组织相比LAMA3在胰腺癌组织中呈明显高表达(GSE16515,P<0.0001;GSE15471,P<0.0001;GSE3654,P<0.0001)。结论本研究表明LAMA3在胰腺癌组织中表达上调,其表达情况与患者的肿瘤大小、TNM分期显著相关,LAMA3可能是胰腺癌预后不良的预测因子。 展开更多
关键词 胰腺癌 层粘连蛋白3(lama3) TMN分期 肿瘤大小 胰腺癌预后
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LAMA3在泛癌中的表达水平及其与泛癌预后、免疫微环境的相关性分析 被引量:1
7
作者 张梦杰 刘俊丽 +2 位作者 杨娜 杨玲 韩继明 《延安大学学报(医学科学版)》 2022年第4期6-11,共6页
目的分析层粘连蛋白3(Laminin subunit alpha 3,LAMA3)在泛癌中的表达水平及其与泛癌患者预后、免疫微环境之间的关系。方法本研究从多个数据库中收集转录组、预后、免疫相关数据,可视化分析LAMA3在泛癌中的表达水平及其与泛癌预后、免... 目的分析层粘连蛋白3(Laminin subunit alpha 3,LAMA3)在泛癌中的表达水平及其与泛癌患者预后、免疫微环境之间的关系。方法本研究从多个数据库中收集转录组、预后、免疫相关数据,可视化分析LAMA3在泛癌中的表达水平及其与泛癌预后、免疫微环境的相关性。结果与正常组织相比,LAMA3在11种肿瘤中显著高表达,如结肠癌(colon adenocarcinoma,COAD),肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC),胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)等;在11种肿瘤中显著低表达,如胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)、脑低级别胶质瘤(brain lower grade glioma,LGG)、皮肤黑色素瘤(skin cutaneous melanoma,SKCM)等。LAMA3表达水平不仅与包括PAAD在内的多种肿瘤预后显著相关,还与SKCM等多种肿瘤的肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)、微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)和肿瘤免疫浸润显著相关。此外,基因共表达分析结果表明LAMA3与多种常见的免疫基因表达显著相关。结论LAMA3可作为泛癌预后、免疫治疗反应评估的生物标志物。 展开更多
关键词 层粘连蛋白3 泛癌 预后 免疫微环境
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LAMA3基因新突变致喉甲皮肤综合征一家系研究
8
作者 李翠莲 刘玲 +5 位作者 马静 祖金艳 马秀丽 孙美华 舒虹 周军 《临床耳鼻咽喉头颈外科杂志》 CSCD 北大核心 2022年第3期212-216,共5页
目的:报道1例喉甲皮肤综合征,检测其基因突变,探讨可能的分子生物学致病原因。方法:采集先证者及其父母的外周血,提取DNA,高通量测序方法进行基因检测,对先证者及其家属进行突变位点的Sanger测序验证分析。结果:先证者基因检测发现LAMA... 目的:报道1例喉甲皮肤综合征,检测其基因突变,探讨可能的分子生物学致病原因。方法:采集先证者及其父母的外周血,提取DNA,高通量测序方法进行基因检测,对先证者及其家属进行突变位点的Sanger测序验证分析。结果:先证者基因检测发现LAMA3基因c.171+1G>A位点纯合突变,为剪接突变,是新发突变位点。先证者父母表型正常,基因检测出该位点杂合突变。结论:LAMA3基因c.171+1G>A纯合突变是先证者的可疑致病突变,该研究扩充了LAMA3基因的突变谱;喉甲皮肤综合征的临床表型表达具有高度可变性,多学科联合诊疗可有效避免漏诊和误诊。 展开更多
关键词 喉甲皮肤综合征 lama3基因 DNA突变分析
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LAMC1, LAMA2 and LAMA3 gene polymorphisms and the risk for severe pelvic organ prolapse 被引量:1
9
作者 Lei Li Jia Kang +6 位作者 Ye Zhang Meng Mao Yuxiang Yang Jinghe Lang Zhijing Sun Juan Chen Lan Zhu 《Science Bulletin》 SCIE EI CAS CSCD 2019年第7期466-468,共3页
Pelvic organ prolapse (POP) is the descent of the pelvic organs,including bladder, uterus, vagina and rectum, resulting in pelvic discomfort, urinary and fecal incontinence and sexual dysfunction(1)The prevalence of s... Pelvic organ prolapse (POP) is the descent of the pelvic organs,including bladder, uterus, vagina and rectum, resulting in pelvic discomfort, urinary and fecal incontinence and sexual dysfunction(1)The prevalence of symptomatic POP in China is 9.56%according to a cross-sectional study involving 54,000 adult women in six provinces in the mainland of China (unpublished data). The etiology of this disorder is multifactorial, including race, age, body mass index(BMI), parity and menopause (1)The loss of the integrity of vaginal connective tissue has been demonstrated to weaken the pelvic floor support and promote the development of POP. 展开更多
关键词 POP LAMA2 and lama3 gene polymorphisms and the RISK for SEVERE PELVIC ORGAN PROLAPSE LAMC1
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Novel variants in LAMA3 and COL7A1 and recurrent variant in KRT5 underlying epidermolysis bullosa in five Chinese families
10
作者 Rongrong Wang Liwei Sun +5 位作者 Xiaerbati Habulieti Jiawei Liu Kexin Guo Xueting Yang Donglai Ma Xue Zhang 《Frontiers of Medicine》 SCIE CSCD 2022年第5期808-814,共7页
Epidermolysis bullosa(EB)is a group of clinically and genetically heterogeneous diseases characterized by trauma-induced mucocutaneous fragility and blister formation.Here,we investigated five Chinese families with EB... Epidermolysis bullosa(EB)is a group of clinically and genetically heterogeneous diseases characterized by trauma-induced mucocutaneous fragility and blister formation.Here,we investigated five Chinese families with EB,and eight variants including a novel nonsense variant(c.47G>A,p.W16*)in LAMA3,a known recurrent variant(c.74C>T,p.P25L)in KRT5,2 novel(c.2531T>A,p.V844E;c.6811_6814del,p.R2271fs)and 4 known(c.6187C>T,p.R2063W;c.7097G>A,p.G2366D;c.8569G>T,p.E2857*;c.3625_3635del,p.S1209fs)variants in COL7A1 were detected.Notably,this study identified a nonsense variant in LAMA3 that causes EB within the Chinese population and revealed that this variant resulted in a reduction in LAMA3 mRNA and protein expression levels by nonsense-mediated mRNA decay.Our study expands the mutation spectra of Chinese patients with EB. 展开更多
关键词 epidermolysis bullosa lama3 COL7A1 KRT5 Chinese families
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基于生物信息学分析寻找胰腺癌新的诊断和治疗靶点 被引量:2
11
作者 杨佳启 李昊 +6 位作者 姜楠 闫洪锋 孙培鸣 张涛 周金莲 孙宏伟 崔彦 《生物信息学》 2022年第2期100-112,共13页
胰腺癌作为一种消化系统高度恶性的肿瘤性疾病,其发生和进展的分子机制仍不确定。为寻找与胰腺癌发生和进展有关的新的有效治疗靶点和潜在的生物标志物。利用GEO数据库中的GEO2R在线工具对胰腺癌组织和正常对照组织的基因表达进行差异... 胰腺癌作为一种消化系统高度恶性的肿瘤性疾病,其发生和进展的分子机制仍不确定。为寻找与胰腺癌发生和进展有关的新的有效治疗靶点和潜在的生物标志物。利用GEO数据库中的GEO2R在线工具对胰腺癌组织和正常对照组织的基因表达进行差异分析并对差异表达基因(DEGs)进行GO功能和KEGG通路富集分析。然后通过GEPIA数据库中胰腺癌的转录数据对候选基因的表达进行验证。Kaplan-Meier法分析各候选基因的预后价值。利用starBase数据库中的7个预测程序对候选基因上游潜在的miRNAs进行预测。此外,还使用miRNet和starBase预测了hsa-miR-20b-5p的上游lncRNAs并利用lncATLAS数据库对潜在的lncRNAs进行亚细胞定位。在本研究中,我们发现胰腺癌组织中LAMA3基因的转录水平明显高于健康对照组织。同时,LAMA3的过表达与胰腺癌患者较差的临床预后相关。随后,预测了21个可能靶向LAMA3的潜在上游miRNAs。在预测到的miRNA-mRNA调控轴中,has-miR-20b-5p-LAMA3轴在胰腺癌的发生和进展中具有较高的潜力。进一步研究发现,FGD5-AS1潜在的抑制has-miR-20b-5p-LAMA3调控轴的作用可能能够在胰腺癌中作为诊断和治疗的有效靶点。FGD5-AS1-has-miR-20b-5p-LAMA3调控网络在胰腺癌发生和发展中的具有关键作用,可作为胰腺癌临床诊断和治疗的潜在靶点和生物标志物。 展开更多
关键词 胰腺癌 ceRNAs MIRNA lncRNA lama3 生物标志物
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卵巢恶性肿瘤相关基因的研究进展 被引量:1
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作者 贺怡心 张静 黄守国 《湘南学院学报(医学版)》 2024年第4期74-78,共5页
卵巢癌是一种具有高度侵袭性和致死性的妇科肿瘤,其生物学特性受到多种基因的调控,真核翻译起始因子5A2基因、配对框8基因、成纤维细胞生长因子18基因、磷酸酶和紧张素同源物基因、层粘连蛋白3基因、克虏伯样因子4等基因研究逐渐揭示了... 卵巢癌是一种具有高度侵袭性和致死性的妇科肿瘤,其生物学特性受到多种基因的调控,真核翻译起始因子5A2基因、配对框8基因、成纤维细胞生长因子18基因、磷酸酶和紧张素同源物基因、层粘连蛋白3基因、克虏伯样因子4等基因研究逐渐揭示了它们在卵巢癌的发生、发展及预后中的重要作用。这些基因不仅参与肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭等生物学过程,还可能成为卵巢癌的潜在生物标志物和靶向治疗的靶点。目前对这些基因的具体功能及其相互作用机制仍需进一步探索。本综述旨在系统回顾上述基因在卵巢癌中的表达特征、功能机制及其潜在的临床应用,以期为卵巢癌的早期诊断和靶向治疗提供新的思路和依据。 展开更多
关键词 卵巢癌 EIF5A2 PAX8 FGF18 PTEN lama3 KLF4
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诱导特异性CD8^+T细胞产生的肝细胞癌相关新抗原分析 被引量:3
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作者 王艳梅 赵博慧 +2 位作者 陈坤 李正江 曲春枫 《中华肿瘤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期429-434,共6页
目的寻找肝细胞癌(HCC)突变相关肿瘤新抗原,确定其诱导产生的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)可特异性作用于肿瘤细胞,为进行HCC的疫苗免疫治疗提供理论依据.方法分析HCC患者肿瘤组织及其配对的正常组织全基因组和外显子测序数据,寻找肿瘤相关... 目的寻找肝细胞癌(HCC)突变相关肿瘤新抗原,确定其诱导产生的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)可特异性作用于肿瘤细胞,为进行HCC的疫苗免疫治疗提供理论依据.方法分析HCC患者肿瘤组织及其配对的正常组织全基因组和外显子测序数据,寻找肿瘤相关体细胞突变,结合患者人类白细胞抗原(HLA)表型,利用NetMHC软件预测具有较高结合力的突变表位,由此合成相应的多肽.在GEO数据库中选取GSE25097,利用GPL10687平台统计突变基因在肝癌组织和正常组织中的表达差异.采用实时荧光定量PCR法和免疫组化染色,检测10例HCC患者的肿瘤组织和配对癌旁正常组织中相关基因及其蛋白的表达差异.采用预测的带有突变位点的肿瘤新抗原合成多肽,诱导特异性CTL,检测其对负载有相应抗原的肿瘤细胞的杀伤效果.结果在全基因组和外显子测序的HCC组织中,TP53的突变率约为40%,LAMA3的突变率约为8%.在GSE25097数据库中,TP53和LAMA3 mRNA在肿瘤组织中的相对表达量分别为1.57±0.02和1.37±0.10,均高于正常组织(分别为0.54±0.01和0.36±0.01,均P<0.05).实时荧光定量PCR法检测结果显示,TP53 mRNA在肿瘤组织中的相对表达量为0.24±0.03,明显高于癌旁组织(0.11±0.01,P<0.05);LAMA3 mRNA在肿瘤组织中的相对表达量为0.13± 0.06,明显高于癌旁组织( 0.01± 0.01,P<0.05).免疫组化染色检测 TP53 和LAMA3蛋白的表达情况,与实时荧光定量PCR检测结果一致.对中国人群Ⅰ型主要组织相容性抗原(MHC-Ⅰ)基因亚型的统计结果显示,HLA-A2、HLA-A11或HLA-A24三者所占比列高达70%.预测的带有TP53和LAMA3突变位点的肿瘤新抗原多肽所诱导的CTL对负载有相应抗原的靶细胞具有显著杀伤作用,但不具有杀伤负载同一肽段带有正常非突变抗原的靶细胞,对机体正常细胞无杀伤作用.结论 TP53和LAMA3在HCC组织中存在高突变,并且其表达高于正常组织.带有突变位点的肿瘤新抗原多肽所诱导产生的CTL,对表达有该抗原的靶细胞具有特异性杀伤作用,但不影响机体正常细胞. 展开更多
关键词 肝细胞癌 肿瘤新抗原 TP53 lama3
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