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乳清蛋白α基因LALBA表达模式和关键调控元件鉴定
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作者 张悦 王禹 +3 位作者 樊慧梅 李鑫妹 路钰怡 魏振宇 《中国畜禽种业》 2026年第3期28-40,共13页
α-乳白蛋白(α-lactalbumin,LALBA基因编码)是乳清蛋白的核心组分,对乳腺发育与乳汁合成具有关键作用。该研究旨在系统解析LALBA基因在多物种中的表达模式及转录调控机制。研究选取了包括奶牛、水牛、山羊、绵羊、马鹿和双峰驼等在内... α-乳白蛋白(α-lactalbumin,LALBA基因编码)是乳清蛋白的核心组分,对乳腺发育与乳汁合成具有关键作用。该研究旨在系统解析LALBA基因在多物种中的表达模式及转录调控机制。研究选取了包括奶牛、水牛、山羊、绵羊、马鹿和双峰驼等在内的11种哺乳动物的RNA-seq数据、6个物种的ATAC-seq数据,并结合奶牛多组织RNA-seq数据及其乳腺组织scRNA-seq数据。通过整合多组学数据,从物种、组织、细胞和分子水平系统分析LALBA的表达特征;利用染色质可及性分析与序列比对,鉴定其保守调控区域;进一步通过转录因子筛选与KEGG通路富集分析,探索其上游调控网络。结果表明,LALBA在11种哺乳动物乳腺组织中均呈现高特异性表达(TPM>4000),且在奶牛中主要定位于分泌型乳腺上皮细胞。研究在其上游及第一外显子附近鉴定出一个在反刍动物中序列高度相似(≥94.5%)且进化保守的调控区域,并筛选出IRF3、ELF5、NFIB等10个核心转录因子。KEGG富集通路分析发现这些转录因子显著富集于Toll样受体和NOD样受体信号通路。综上所述,LALBA的表达可能参与乳腺特异性发育以及免疫反应,其核心调控元件在偶蹄目物种中功能保守。 展开更多
关键词 lalba基因 RNA-SEQ ATAC-seq 转录调控 跨物种保守
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LALBA基因SNP与内蒙古白绒山羊经济性状的关联 被引量：3
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作者 蓝贤勇 陈宏 +4 位作者 田智泉 刘少卿 张永斌 王昕 房兴堂 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期169-174,共6页
利用PCR-SSCP和DNA测序技术检测452份内蒙古白绒山羊α-乳白蛋白(LALBA)基因单核苷酸多态性(SNP),并分析SNP与产绒量、绒厚、绒长和体重性状的关联。结果表明,仅P2引物位点存在SSCP多态,其外显子3区域存在1个突变位点:M63868:g.1897T&g... 利用PCR-SSCP和DNA测序技术检测452份内蒙古白绒山羊α-乳白蛋白(LALBA)基因单核苷酸多态性(SNP),并分析SNP与产绒量、绒厚、绒长和体重性状的关联。结果表明,仅P2引物位点存在SSCP多态,其外显子3区域存在1个突变位点:M63868:g.1897T>C。内蒙古白绒山羊群体LALBA基因M63868:g.1897位点以TT型为主,T等位基因频率为0.983,且处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。方差分析表明,LALBA基因M63868:g.1897位点多态仅与产绒量存在显著相关(P=0.017);1897位点TC基因型个体产绒量比TT基因型个体多产绒142.68g,高26.21%,且差异显著(P<0.05)。因此,TC基因型可作为山羊产绒性状标记辅助选择的有效DNA标记。 展开更多
关键词 山羊 α-乳白蛋白(lalba)基因 单核苷酸多态性(SNP) 经济性状 关联
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