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香蕉柠檬酸合酶基因MaGCS的克隆及生物信息学分析 被引量:5
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作者 迟光红 周雪丽 +2 位作者 李美英 徐碧玉 金志强 《热带农业科学》 2009年第8期12-18,共7页
采用RACE-PCR的方法首次在香蕉中获得一个柠檬酸合酶基因的cDNA序列。经序列测定和Blastx比对分析表明,该cDNA全长1885bp,编码513个氨基酸残基,具有植物柠檬酸合酶基因的特征结构域,并与其他植物来源的乙醛酸循环体的柠檬酸合酶具有很... 采用RACE-PCR的方法首次在香蕉中获得一个柠檬酸合酶基因的cDNA序列。经序列测定和Blastx比对分析表明,该cDNA全长1885bp,编码513个氨基酸残基,具有植物柠檬酸合酶基因的特征结构域,并与其他植物来源的乙醛酸循环体的柠檬酸合酶具有很高的序列相似性,将其命名为MaGCS(Musa glyoxysomal citrate synthase),并对其进行生物信息学分析,初步预测其理化性质及功能等。 展开更多
关键词 香蕉(Musa acuminate l.aaa group cv.Brazilian) 柠檬酸合酶基因 生物信息学分析
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香蕉腺苷酸核糖基化作用因子1(MaArf1)基因的克隆及序列结构分析 被引量:1
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作者 王园 王甲水 +1 位作者 张建斌 徐碧玉 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期404-409,共6页
Arf(ADP-ribosylation factors)作为小G蛋白家族中的一类,在植物细胞的胞内运输中起着重要的作用。从采后2d的香蕉(Musa accuminata L.AAA group)果实cDNA文库中筛选到一条Arf基因,命名为MaArf1。序列分析表明,MaArf1在植物中是高度保... Arf(ADP-ribosylation factors)作为小G蛋白家族中的一类,在植物细胞的胞内运输中起着重要的作用。从采后2d的香蕉(Musa accuminata L.AAA group)果实cDNA文库中筛选到一条Arf基因,命名为MaArf1。序列分析表明,MaArf1在植物中是高度保守的。与水稻、苜蓿、马铃薯、小麦和拟南芥等物种中Arf基因的相似性都超过95%。并且MaArf1分别在24-31(序列为GLDAAGKT,Arf蛋白P结构域),67-71(序列为DVGGQ,G'结构域),126-130(序列为NKQDL,G结构域)的氨基酸处也具有保守的GTP结合结构域。根据已获得的cDNA序列设计引物,研究又获得了该基因的基因组序列。对其结构分析发现,该序列全长1998bp,由5个外显子和4个内含子组成。内含子序列中存在大量的重复序列,并且在第4个内含子中有一个完整的开放阅读框,推测这些序列可能参与基因的表达调控,也可能与RNA水平上的可变剪接有关。 展开更多
关键词 香蕉(Musaaccuminata l.aaa group) MaArf1 CDNA 基因组序列
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巴西蕉WRKY转录因子的鉴定及其枯萎病胁迫下的表达
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作者 贾彩红 王卓 +3 位作者 王静毅 张建斌 金志强 徐碧玉 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第23期7700-7705,共6页
为了明确巴西蕉与香蕉枯萎病菌互作过程中WRKY转录因子的作用,对巴西蕉与香蕉枯萎病菌互作2 d的转录组中WRKY基因的表达量进行分析。结果表明,在互作过程中筛选到log值大于1的基因有55个,1个基因是上调表达的,其余是下调表达。55个基因... 为了明确巴西蕉与香蕉枯萎病菌互作过程中WRKY转录因子的作用,对巴西蕉与香蕉枯萎病菌互作2 d的转录组中WRKY基因的表达量进行分析。结果表明,在互作过程中筛选到log值大于1的基因有55个,1个基因是上调表达的,其余是下调表达。55个基因中第Ⅰ类家族包含5个基因;Ⅱa亚家族中包含8个基因,Ⅱb亚家族中包含5个基因,Ⅱc亚家族中包含13个基因,Ⅱd亚家族中包含7个基因,Ⅱe亚家族中包含3个基因;第Ⅲ类家族中包含14个基因。55个基因在根中的表达量均大于在叶和果中的表达量。选取MaWRKY003、MaWRKY010、MaWRKY063和MaWRKY075四个差异显著的基因进行荧光定量PCR分析,结果表明与转录组数据结果趋势一致。对4个基因的启动子进行分析,发现4个基因启动子中所包含的元件不同,MaWRKY003、Ma WRKY063和MaWRKY075基因启动子中含有响应与病相关的激素响应元件,而MaWRKY010基因启动子中没有响应与病相关的响应元件,推测MaWRKY003、MaWRKY063和MaWRKY075三个基因可能是通过激素途径来响应香蕉枯萎病菌,而MaWRKY010可能是通过其他途径来响应香蕉枯萎病菌。以上结果表明MaWRKYs基因在巴西蕉与枯萎病菌互作过程中下调表达可能是巴西蕉易感枯萎病的原因之一。 展开更多
关键词 巴西蕉(Musa acuminata l.aaa group cv.Cavendish) 香蕉枯萎病菌 WRKY转录因子 生物信息学 功能分析
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香蕉果实的1个14-3-3蛋白同源基因的克隆及序列分析(简报)
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作者 李美英 徐碧玉 +2 位作者 刘菊华 杨小亮 金志强 《热带作物学报》 CSCD 2008年第4期415-418,共4页
根据在香蕉果实抑制缩减文库中获得的1个14-3-3蛋白基因片段,采用PCR和RACE相结合的方法从香蕉(Musaacuminate L. AAA group cv. Brazilian)cDNA文库中筛选到其全长cDNA序列。序列测定和Blastx比对分析结果表明,该cDNA全长1 037 bp,含有... 根据在香蕉果实抑制缩减文库中获得的1个14-3-3蛋白基因片段,采用PCR和RACE相结合的方法从香蕉(Musaacuminate L. AAA group cv. Brazilian)cDNA文库中筛选到其全长cDNA序列。序列测定和Blastx比对分析结果表明,该cDNA全长1 037 bp,含有1个完整的阅读框,其编码区编码261个氨基酸残基,具有植物14-3-3蛋白基因的保守结构域,并与其他植物来源的14-3-3蛋白具有很高的同源性,将其命名为Ma-14-3-3b(Musa acuminate 14-3-3)。采用遗传进化系统发育树的分析结果表明,Ma-14-3-3b与来源于单子叶植物的多数14-3-3蛋白基因序列在同一个进化枝上。采用RT-PCR对其在香蕉果实发育不同时期的表达进行分析结果表明,在香蕉果实发育的不同时期差异表达,推测其可能在果实的发育中起作用。 展开更多
关键词 香蕉(Musancuminate l.aaa group cv.Brazilian) Ma-14—3—3b 14—3—3蛋白
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香蕉乙醇脱氢酶基因的克隆及其逆境胁迫表达 被引量:4
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作者 贾彩红 金志强 +5 位作者 王绍华 王卓 苗红霞 刘菊华 张建斌 徐碧玉 《中国农学通报》 CSCD 2014年第7期109-115,共7页
香蕉乙醇脱氢酶基因的克隆及在逆境胁迫下的表达分析,将为进一步研究ADH在香蕉中的功能奠定基础。本研究从香蕉果实抑制差减文库中获得一条香蕉乙醇脱氢酶基因片段,采用RACE技术获得其全长,命名为MaADH。MaADH的cDNA全长1140 bp,编码37... 香蕉乙醇脱氢酶基因的克隆及在逆境胁迫下的表达分析,将为进一步研究ADH在香蕉中的功能奠定基础。本研究从香蕉果实抑制差减文库中获得一条香蕉乙醇脱氢酶基因片段,采用RACE技术获得其全长,命名为MaADH。MaADH的cDNA全长1140 bp,编码379个氨基酸。生物信息学分析该基因编码的蛋白分子量为40.7 kDa,等电点为7.09。保守结构域分析发现,该基因具有MDR保守结构域,包含22个NAD结合位点、11个底物结合位点和4个锌结合位点。系统进化树分析表明,MaADH与拟南芥和甘蓝亲缘关系较近。MaADH在盐胁迫和低温胁迫处理的香蕉苗中上调表达;在干旱胁迫下该基因是先上调表达,随后下调表达;在伤害胁迫下是先下调表达后上调表达,但变化不明显。研究说明,香蕉中的乙醇脱氢酶基因在香蕉适应盐、低温、干旱和伤害等逆境中发挥重要的作用。 展开更多
关键词 香蕉 乙醇脱氢酶 序列分析 逆境胁迫 表达分析
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香蕉辐射诱变抗寒株系果实中淀粉和糖含量的变化 被引量:2
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作者 黄旭 王安邦 +4 位作者 苗红霞 刘菊华 贾彩红 金志强 徐碧玉 《热带生物学报》 2015年第3期269-272,共4页
以巴西蕉(Musa acuminata L.AAA group,‘Brazilian’)未成熟雄花诱导的愈伤组织和芽体作为外值体,通过60Co-γ辐射诱变和低温筛选获得了2个抗寒株系(抗寒9号、抗寒11号),测定了抗寒株系和非诱变对照果实中的淀粉、总糖、葡萄糖、果糖... 以巴西蕉(Musa acuminata L.AAA group,‘Brazilian’)未成熟雄花诱导的愈伤组织和芽体作为外值体,通过60Co-γ辐射诱变和低温筛选获得了2个抗寒株系(抗寒9号、抗寒11号),测定了抗寒株系和非诱变对照果实中的淀粉、总糖、葡萄糖、果糖和蔗糖的含量。结果表明:2个抗寒株系果实的总糖、蔗糖、果糖和葡萄糖含量均极显著高于对照(P<0.01);2个抗寒株系果实的总淀粉、直链淀粉和支链淀粉含量也高于对照,但抗寒11号株系直/支比低于对照。 展开更多
关键词 香蕉 抗寒株系 淀粉含量 糖含量
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