期刊文献+
共找到34篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
番石榴实蝇和瓜实蝇的线粒体L-rRNA基因测序及双翅目昆虫L-rRNA基因的结构特征与系统发育关系分析 被引量:1
1
作者 吴培福 熊忠平 +2 位作者 徐磊 黄阳洋 潘涌智 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期921-932,共12页
RNA二级结构比一级结构包含更多的信息,在物种系统发育分析中更能反应真实情况。因而,本研究对番石榴实蝇Bactrocera correcta和瓜实蝇B. cucurbitae的L-rRNA全基因进行了测序,构建了双翅目L-rRNA基因二级结构的模式图,并分析了其结构特... RNA二级结构比一级结构包含更多的信息,在物种系统发育分析中更能反应真实情况。因而,本研究对番石榴实蝇Bactrocera correcta和瓜实蝇B. cucurbitae的L-rRNA全基因进行了测序,构建了双翅目L-rRNA基因二级结构的模式图,并分析了其结构特征,而后基于H45~H47茎环结构参数和结构序列及L-rRNA结构序列对双翅目13科的系统发育关系进行了初步分析。结果表明:双翅目昆虫具有保守的L-rRNA二级结构;不同结构区碱基组成和分布不均匀,Ⅳ区和Ⅴ区的完全保守碱基含量最高,GC含量最高,绝大部分科Ⅵ区的AT斜率均小于0;科内特有碱基和科间少数保守碱基大部分为G或C。瘿蚊科与双翅目其他科具有较远的系统发育关系,而丽蝇科、寄蝇科和食蚜蝇科有相近的系统发育关系;虻科与网翅虻科同在一个小分支;蠓科与蚊科同在一个大的系统发育分支。利用单方面参数不易得到理想的进化结果,准确系统发育分析需要结合多方面的参数。 展开更多
关键词 双翅目 番石榴实蝇 瓜实蝇 l-rrna基因 测序 二级结构 结构特征 系统发育
原文传递
伊氏锥虫和布氏锥虫L-rRNA 5′端序列的测定及D2高变区的比较分析
2
作者 屈良鹄 余小强 伦照荣 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 1990年第14期1096-1098,共3页
伊氏锥虫(Trypanosoma evansi)是所有致病锥虫中地理分布最广泛的一种,也是我国南方地区一种重要的家畜寄生虫病病原体。但是,对伊氏锥虫的研究却远远不及对流行于非洲由采采蝇传播的布氏锥虫(T.brucei)研究得深入。这两种锥虫在形态上... 伊氏锥虫(Trypanosoma evansi)是所有致病锥虫中地理分布最广泛的一种,也是我国南方地区一种重要的家畜寄生虫病病原体。但是,对伊氏锥虫的研究却远远不及对流行于非洲由采采蝇传播的布氏锥虫(T.brucei)研究得深入。这两种锥虫在形态上几乎不能区别,所以对它们进行比较分子生物学研究是非常必要的。最近。 展开更多
关键词 锥虫 l-rrna DNA探针 系统演化
原文传递
NUCLEOTIDE SEQUENCES OF THE 5′ TERMINAL REGIONS OF L-rRNA FROM Trypanosoma evansi AND T. brucei AND COMPARATIVE ANALYSIS OF D2 DOMAINS 被引量:1
3
作者 屈良鹄 余小强 伦照荣 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1991年第1期61-65,共5页
Ⅰ. INTRODUCTIONTrypanosoma evansi has the widest geographic range of all the pathogenic trypanosomes and is an important etiological agent of disease in the domestic animals, especially in buffalo and horse in China.... Ⅰ. INTRODUCTIONTrypanosoma evansi has the widest geographic range of all the pathogenic trypanosomes and is an important etiological agent of disease in the domestic animals, especially in buffalo and horse in China. However, we have much less knowledge about T. evansi than T. brucei which is spread by tsetse fly in Africa. T. evansi and T. brucei are closely related to and morphologically indistinguishable from each other, so it is necessary to study them by com- 展开更多
关键词 TRYPANOSOMA l-rrna1) NUCLEOTIDE sequence PHYLOGENY DNA probe.
在线阅读 下载PDF
盐胁迫对不同品种水稻根际土壤细菌多样性与结构的影响
4
作者 周玉杰 贺治洲 +4 位作者 胡伟 林秋云 林越辉 龙开意 谢振宇 《热带作物学报》 北大核心 2025年第3期754-763,共10页
盐分是制约沿海滩涂盐渍化土地利用的主要因素之一,水稻(Oryza sativa L.)是盐渍化土地利用的首选粮食作物,而某些根际微生物可以提高水稻的抗盐能力。本研究选取不同品种水稻在NaCl胁迫下进行全生育期培育,采用Illumina Miseq测序技术... 盐分是制约沿海滩涂盐渍化土地利用的主要因素之一,水稻(Oryza sativa L.)是盐渍化土地利用的首选粮食作物,而某些根际微生物可以提高水稻的抗盐能力。本研究选取不同品种水稻在NaCl胁迫下进行全生育期培育,采用Illumina Miseq测序技术,测定并分析不同品种水稻根际土壤细菌群落多样性和结构,旨在筛选适宜盐渍化土地种植的水稻品种。结果表明:就根际土壤细菌群落多样性而言,0.6%NaCl处理下,B3和B6品种的物种丰富度显著高于B1品种。根际土壤细菌群落结构方面,不同浓度NaCl处理下,B1、B3和B6品种的相对丰度大于10%的优势细菌门均为绿弯菌门(Chloroflexi)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteriota);不同品种水稻根际土壤细菌群落结构存在差异,富集的物种数量和种类也不同,0.6%NaCl处理下B6品种富集了14个细菌类群分支,如酸杆菌门(Acidobacteriae)、念珠藻科(Nostocaceae)、Vicinamibacterales、热微菌目(Thermomicrobiales)、KD4-96等。因此,沿海滩涂盐渍化土地种植B6品种水稻有利于根际土壤优势细菌群落的形成。 展开更多
关键词 水稻 盐胁迫 根际土壤 细菌群落 16S rRNA
在线阅读 下载PDF
银杏与其它裸子植物之间的关系——分子生物学的证据 被引量:3
5
作者 施苏华 张宏达 +1 位作者 余小强 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1992年第4期63-67,共5页
银杏Ginkgo biloba L.Ls-rRNA 5'末端188个核苷酸序列已被准确测定。与苏铁Cycas revoluta Thunb.,水松Glyptostrobus pensilis(Staunt.)Koch,南方红豆杉Tax-us mairei(Lemee et Levl.)S.Y.Hu和5种被子植物及1种绿藻的同源序列比较分析... 银杏Ginkgo biloba L.Ls-rRNA 5'末端188个核苷酸序列已被准确测定。与苏铁Cycas revoluta Thunb.,水松Glyptostrobus pensilis(Staunt.)Koch,南方红豆杉Tax-us mairei(Lemee et Levl.)S.Y.Hu和5种被子植物及1种绿藻的同源序列比较分析,其所构建的rRNA系统树图表明,银杏与苏铁的关系较为密切,与其它裸子植物的关系相对较远。 展开更多
关键词 银杏 Ls-sRNA 系统树 裸子植物
在线阅读 下载PDF
福建华溪蟹线粒体DNA COI和16S rRNA基因序列的遗传多样性 被引量:6
6
作者 石林波 张小燕 +3 位作者 汪雁 王云龙 周宪民 邹节新 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期671-675,共5页
目的探讨福建华溪蟹(Sinopotamon fukienense)的遗传多样性。方法采用PCR结合DNA测序技术,测定S.fukienense的线粒体COI和16SrRNA基因序列的组成。经比对获得639bp长度的COI基因序列和526bp的16SrRNA基因序列,以对比分析S.fukienense的... 目的探讨福建华溪蟹(Sinopotamon fukienense)的遗传多样性。方法采用PCR结合DNA测序技术,测定S.fukienense的线粒体COI和16SrRNA基因序列的组成。经比对获得639bp长度的COI基因序列和526bp的16SrRNA基因序列,以对比分析S.fukienense的遗传多样性。结果 S.fukienense基于COI基因核苷酸多样性(Pi)为0.048 4,高于其基于16SrRNA基因核苷酸多样性(Pi)为0.021 6。同时,S.fukienense基于COI基因单倍型间的平均遗传距离(P)为0.048,大于其基于16SrRNA基因单倍型间的平均遗传距离(P)0.026。结论 COI序列在分析S.fukienense遗传异变时的作用更优于16SrRNA基因序列。 展开更多
关键词 福建华溪蟹 COI基因序列 16S RRNA基因序列 遗传多样性
暂未订购
三疣梭子蟹病原副溶血弧菌的分离与鉴定 被引量:23
7
作者 阎斌伦 秦国民 +3 位作者 暴增海 张晓君 毕可然 秦蕾 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期560-566,共7页
从养殖病死三疣梭子蟹肝胰脏及心脏血淋巴液中分离到大量优势生长的细菌,人工感染试验证明分离菌对三疣梭子蟹有较强的致病性;对分离菌进行了形态特征、理化特性、胞外酶及溶血素活性等表型生物学性状及16S rRNA和gyrB两种基因的分子鉴... 从养殖病死三疣梭子蟹肝胰脏及心脏血淋巴液中分离到大量优势生长的细菌,人工感染试验证明分离菌对三疣梭子蟹有较强的致病性;对分离菌进行了形态特征、理化特性、胞外酶及溶血素活性等表型生物学性状及16S rRNA和gyrB两种基因的分子鉴定。菌株(JGX080708-1)所扩增的16S rRNA基因序列长度为1453bp(GenBank登录号:FJ824663),所扩增的gyrB基因序列长度为1191bp(GenBank登录号:GQ372985);两种基因序列在NCBI通过blast检索,结果均与弧菌属细菌的基因序列自然聚类;根据分离菌的表型及分子特征,判定分离菌为弧菌属(Vibrio Pacini1954)的副溶血弧菌[Vibrio parahaemolyticus(Fujino et al1951)Sakazaki Nakamura and Takizawa1963]。分离菌的药敏试验结果显示,对供试49种抗菌药物中的安曲南等42种药物高度敏感,对林可霉素敏感,对青霉素G等6种药物耐药。 展开更多
关键词 三疣梭子蟹 副溶血弧菌 16SRRNA基因 gyrB基因
在线阅读 下载PDF
西洋参根腐病发生与根际土壤细菌群落结构变化关系研究 被引量:25
8
作者 蒋景龙 余妙 +4 位作者 李丽 焦成瑾 徐皓 任绪明 杨玲娟 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第18期4399-4407,共9页
目的研究健康西洋参和患根腐病西洋参的根际土壤细菌群落结构变化,为查明西洋参根腐病发生机制提供线索。方法以未种过西洋参的土壤(C组)、4年生健康参根际土壤(N组)和4年生根腐病参根际土壤(R组)为研究对象,采用Illumina Miseq高通量... 目的研究健康西洋参和患根腐病西洋参的根际土壤细菌群落结构变化,为查明西洋参根腐病发生机制提供线索。方法以未种过西洋参的土壤(C组)、4年生健康参根际土壤(N组)和4年生根腐病参根际土壤(R组)为研究对象,采用Illumina Miseq高通量测序技术分析了土壤细菌群落结构的变化。结果 9个土壤样品基因组经16 S测序共获得有效序列636 654条,用于物种分类的OTUs 8 422个,涵盖了42门、106纲、180目、158科、246属。在门的水平上,3组细菌主要类群基本一致,主要有变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)和绿弯菌门(Chloroflexi)等,但不同组中各类群相对丰度存在明显差异;在属的水平上,3组细菌群落组成及相对丰度差别很大,其中红游动菌属Rhodoplanes、Kaistobacter属、鞘脂菌属Sphingobium等可能是引起西洋参根腐病发生的关键菌群,后续研究应重点关注。结论西洋参根腐病株和健株根际土壤微生物组成具有显著性差异,对于探究西洋参根腐病发生的微生态机制和改良种植西洋参土壤微生物具有理论指导作用。 展开更多
关键词 西洋参 16 S RRNA基因 连作障碍 微生物群落 高通量测序
原文传递
基于高通量测序的西洋参根际土壤细菌群落分析 被引量:16
9
作者 李丽 蒋景龙 《中药材》 CAS 北大核心 2019年第1期7-12,共6页
目的:研究健康西洋参和患根腐病西洋参的根际土壤细菌群落结构变化,为研究西洋参根腐病的发生机制及其调控技术提供依据。方法:以未种过西洋参的土壤(C组)、新茬地4年生健康参根际土壤(N组)、新茬地4年生根腐病参根际土壤(R组)和轮作地... 目的:研究健康西洋参和患根腐病西洋参的根际土壤细菌群落结构变化,为研究西洋参根腐病的发生机制及其调控技术提供依据。方法:以未种过西洋参的土壤(C组)、新茬地4年生健康参根际土壤(N组)、新茬地4年生根腐病参根际土壤(R组)和轮作地4年生健康参根际土壤(LN组)为研究对象,采用Illumina Miseq高通量测序技术分析了土壤细菌群落结构的变化。结果:12个土壤样品基因组经16S测序共获得有效序列695 263条,用于物种分类的OTUs 8 081个,涵盖了30门、86纲、115目、256科、464属。在属的水平上,4个组细菌群落组成及相对丰度差别很大,其中芽胞杆菌属(Bacillus)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)和芽单胞菌属(Gemmatimonas)可能是西洋参生长的有益菌,而假单胞菌属(Pseudomonas)和鞘脂菌属(Sphingobium)可能是引起西洋参根腐病发生的关键菌群,后续研究应重点关注。结论:健康西洋参和根腐病西洋参根际土壤及新茬地和轮作地西洋参根际土壤中微生物组成和结构均具有显著性差异,本结果对于探究西洋参根腐病发生的微生态机制和改良种植西洋参土壤微生物具有理论指导作用,为建立西洋参与主要农作物的合理轮作制度提供实验数据。 展开更多
关键词 西洋参 16S RRNA基因 连作障碍 微生物群落 高通量测序
原文传递
泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)病原温和气单胞菌(Aeromonas sobria)分子鉴定及耐药性研究 被引量:13
10
作者 姚东瑞 邴旭文 +3 位作者 朱明 毕可然 陈丽 张晓君 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期756-762,共7页
采用常规生理生化特性测定及16SrRNA、gyrB及rpoD基因同源性检索与系统发育学分析等分子生物学方法,对引起养殖泥鳅大量死亡的病原细菌进行了综合鉴定。生理生化特性结果表明,分离菌株NQ090701与气单胞菌属的温和气单胞菌相近;16SrRNA、... 采用常规生理生化特性测定及16SrRNA、gyrB及rpoD基因同源性检索与系统发育学分析等分子生物学方法,对引起养殖泥鳅大量死亡的病原细菌进行了综合鉴定。生理生化特性结果表明,分离菌株NQ090701与气单胞菌属的温和气单胞菌相近;16SrRNA、gyrB及rpoD基因Blast序列同源性检索与系统发育学分析均与温和气单胞菌相似性最高;综合形态与生理生化特征及16SrRNA、gyrB与rpoD基因的分子特征,确认分离菌株NQ090701为温和气单胞菌(Aeromonas sobria)。同时,采用试管稀释法测定了养殖生产中常用的10种抗菌药物对病原温和气单胞菌的体外最小杀菌浓度(Minimal Bactericidal Concentration,MBC),结果表明氟哌酸杀菌作用最好,其次为盐酸沙拉沙星;甲砜霉素和复方磺胺甲恶唑在所试验的药物浓度范围对温和气单胞菌无杀菌效果。 展开更多
关键词 泥鳅 温和气单胞菌 16SRRNA基因 gyrB基因 rpoD基因 耐药性
在线阅读 下载PDF
连作对再植枸杞根际细菌群落多样性和群落结构的影响 被引量:48
11
作者 纳小凡 郑国旗 +4 位作者 邢正操 马金平 李占辉 卢俊辉 马飞 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期1280-1292,共13页
受枸杞道地产区土地资源等因素限制,连作障碍已成为影响枸杞产业发展的重要原因之一,导致严重的经济损失。研究连作条件下枸杞农田土壤生态系统微生物群落的演替规律对枸杞产业的可持续发展具有重要的理论意义。以宁夏银川市南梁农场连... 受枸杞道地产区土地资源等因素限制,连作障碍已成为影响枸杞产业发展的重要原因之一,导致严重的经济损失。研究连作条件下枸杞农田土壤生态系统微生物群落的演替规律对枸杞产业的可持续发展具有重要的理论意义。以宁夏银川市南梁农场连作多年的枸杞地为研究对象,利用Illumina MiSeq测序技术分析了连作对再植枸杞根际/非根际细菌群落的影响。结果表明,连作地显著抑制再植枸杞苗地径的增加,且其土壤pH较对照样地显著降低(p<0.05)。测序结果证实,与对照样地相比,连作地再植枸杞根际土壤细菌物种数显著降低(p<0.05),细菌群落α多样性下降(p>0.05)。主坐标分析表明,连作和对照样地间枸杞非根际细菌群落结构无明显差异,但连作显著改变再植枸杞根际细菌的群落结构。对细菌群落丰度的统计分析发现,连作地枸杞根际浮霉菌门、非根际假单胞菌门的相对丰度较对照样地显著降低(p<0.05)。此外,冗余分析结果表明:枸杞园土壤pH和有效磷含量是影响枸杞非根际土壤细菌群落结构变化的主要因素,分别解释了41.8%和35.4%的群落结构变化(p<0.05),其他土壤因子无统计学意义,但土壤理化因子对再植枸杞根际细菌群落结构变化的影响均未达显著水平。这些结果证实连作能够显著抑制再植枸杞生长、影响再植枸杞根际细菌群落结构和多样性,干扰枸杞与土壤细菌群落间的互作关系。这些研究结果将为解析枸杞连作障碍机制提供理论基础。 展开更多
关键词 枸杞 连作 根际 细菌群落 16S RRNA
在线阅读 下载PDF
泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)病原霍乱弧菌(Vibrio cholerae)的表型与分子鉴定 被引量:26
12
作者 邴旭文 阎斌伦 +2 位作者 张晓君 秦蕾 毕可然 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期692-698,共7页
从江苏连云港某养殖场养殖死亡的泥鳅肝脏、血液及腹水中分离出大量优势生长的细菌,人工感染试验证明其对泥鳅具有很强的致病性。采用表观分类学及分子生物学方法,对分离菌进行了形态特征、理化特性、胞外酶活性及溶血活性等生物学性状... 从江苏连云港某养殖场养殖死亡的泥鳅肝脏、血液及腹水中分离出大量优势生长的细菌,人工感染试验证明其对泥鳅具有很强的致病性。采用表观分类学及分子生物学方法,对分离菌进行了形态特征、理化特性、胞外酶活性及溶血活性等生物学性状检验;用PCR方法同时扩增其16SrRNA和gyrB基因,分析了16SrRNA和gyrB两种基因序列的同源性,并构建了系统发生树,通过基因序列分析,比较了两种基因在相似细菌的检测和鉴定能力;基于16SrRNA和gyrB基因的系统发育学分析表明分离菌(LD081008B-1)所扩增的16SrRNA和gyrB基因序列均与GenBank数据库中霍乱弧菌具有较高的相似性,且gyrB基因用于细菌种间鉴定更具优越性;16SrRNA基因序列长度为1446bp(GenBank登录号:GQ205447),gyrB基因序列长度为1207bp(GenBank登录号:GQ205452);根据分离菌的表型特征及分子特征,判定病原菌为弧菌属(VibrioPacini1854)的霍乱弧菌(Vibriocholerae)。胞外酶活性及溶血活性检测表明分离菌均具有蛋白酶、卵磷脂酶、淀粉酶、明胶酶及DNA酶活性,在含7%家兔脱纤血液营养琼脂培养基上呈β型溶血。分离菌的耐药谱测定结果显示,除对供试49种抗菌药物中的杆菌肽耐药外,对其它48种药物敏感或高度敏感。 展开更多
关键词 泥鳅 霍乱弧菌 生物学特性 16S RRNA基因 gyrB基因
在线阅读 下载PDF
中药三七根核糖体18S rRNA基因的序列分析 被引量:13
13
作者 吴耀生 Steve Slocombe 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2001年第12期1116-1119,共4页
目的 研究中药三七根核糖体 18S r RNA基因的序列特征。方法 根据模式植物拟南芥的 18S r RNA的基因序列设计引物 ,对三七根的 18S r RNA 基因序列进行基因克隆、测序 ,并与模式植物拟南芥 Arabidopsis thaliana以及人参属植物喜马... 目的 研究中药三七根核糖体 18S r RNA基因的序列特征。方法 根据模式植物拟南芥的 18S r RNA的基因序列设计引物 ,对三七根的 18S r RNA 基因序列进行基因克隆、测序 ,并与模式植物拟南芥 Arabidopsis thaliana以及人参属植物喜马拉雅人参 Panax pseudoginseng Wall subsp.himalaicus var.angustifolius的相应序列进行比较。结果 通过对产于广西靖西的三七 Panax pseudoginseng Wall.var.notoginseng (Bukill) Hoo etTseng根的 18S r RNA基因进行克隆测序 ,获得了三七根的 18S r RNA基因的部分序列特征。结论 利用已完成全基因组序列测定的模式植物拟南芥的分子生物学信息来研究中药植物基源的基因组序列 ,将有助于加快中药植物基源的分子生物学研究进程。 展开更多
关键词 三七 拟南芥 18SrRNA基因 中药 三七根核糖体 序列分析
暂未订购
鲤病原鳗利斯顿氏菌的分离鉴定及生物学特性研究 被引量:6
14
作者 张晓君 阎斌伦 +3 位作者 邴旭文 毕可然 秦蕾 秦国民 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2009年第5期47-53,61,共8页
从患病鲤(Cyprinus carpio L.)体内分离到一株优势生长菌,人工感染试验证明该菌对鲤有较强的致病性。对分离菌进行了形态特征、理化特性等生物学性状检验;测定了分离菌的16S rRNA和gyrB基因的部分序列,并与相关细菌16S rRNA和gyrB基因... 从患病鲤(Cyprinus carpio L.)体内分离到一株优势生长菌,人工感染试验证明该菌对鲤有较强的致病性。对分离菌进行了形态特征、理化特性等生物学性状检验;测定了分离菌的16S rRNA和gyrB基因的部分序列,并与相关细菌16S rRNA和gyrB基因序列进行比对后,构建了基于两种基因的系统发生树。结果显示:分离菌所扩增的16S rRNA和gyrB基因序列与GenBank数据库中鳗利斯顿氏菌的16S rRNA和gyrB基因序列相似性均在97%以上,其16S rRNA基因序列长度为1449 bp(GenBank登录号:FJ824662),gyrB基因序列长度为1202 bp(Gen-Bank登录号:GQ452957);胞外酶活性及溶血活性检测表明分离菌具有淀粉酶、蛋白酶、明胶酶、卵磷脂酶活性,但不具有脂酶活性;在含7%家兔脱纤血液营养琼脂培养基上,呈β型溶血,分离菌均具有金属蛋白酶基因及溶血素基因。根据分离菌的表型特征及分子特征,判定分离菌为利斯顿氏菌属(Listonella MacDonell and Colwell1986)的鳗利斯顿氏菌(Listonella anguillarum)。分离菌的耐药谱测定结果显示,对供试49种抗菌药物中的青霉素G等12种药物耐药,对克林霉素等5种药物敏感,对恩诺沙星等32种药物高度敏感。 展开更多
关键词 鲤(Cyprinus carpio L.) 鳗利斯顿氏菌(Listonella anguillarum) 生物学特性 16S RRNA基因 gyrB基因
在线阅读 下载PDF
锦鲤嗜水气单胞菌的分离鉴定及生物学特性研究 被引量:25
15
作者 李梅 刘文利 +5 位作者 黄树涛 张风群 申大鹏 陈昶 罗清荣 沈志华 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期591-594,共4页
中山市某养殖场饲养的锦鲤于2007年突发传染病,为确诊该病并对其进行有效防制,本研究进行了病原分离及生物学特性鉴定。从发病锦鲤溃烂部位分离到2株细菌GDzs0824和GDzs0826。将2株菌人工感染锦鲤,5d后锦鲤全部死亡,而且临床症状与自然... 中山市某养殖场饲养的锦鲤于2007年突发传染病,为确诊该病并对其进行有效防制,本研究进行了病原分离及生物学特性鉴定。从发病锦鲤溃烂部位分离到2株细菌GDzs0824和GDzs0826。将2株菌人工感染锦鲤,5d后锦鲤全部死亡,而且临床症状与自然病例相似。2株菌均呈革兰氏阴性,短杆状;对葡萄糖、蔗糖、甘露醇、麦芽糖、MR、O/F、盐水和赖氨酸脱羧酶等的生化反应性与其它水生动物源的嗜水气单胞菌(Aeramonas hydrophila)相同;最适生长pH值为5~9;最适生长温度为33℃;16S rRNA基因序列分析结果显示:分离菌株在系统发育树上与A.hydrophila属同一分支,相似性达99.6%以上。综合2菌株形态学、人工感染、生理生化和16S rRNA基因分析结果,将其鉴定为A.hydrophila。药敏试验结果表明2菌株对盐酸环丙沙星、氯霉素、妥布霉素、呋喃唑酮和诺氟沙星等高度敏感。 展开更多
关键词 锦鲤 嗜水气单胞菌 生化反应 药物敏感 16SRRNA基因
在线阅读 下载PDF
牙鲆(Paralichthys olivaceus)秦皇岛弧菌感染症及其病原细菌研究 被引量:3
16
作者 陈翠珍 张晓君 +2 位作者 房海 靳晓敏 王秀云 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期35-40,共6页
采用病原分离与鉴定、人工感染试验等方法,在对养殖牙鲆病例进行发病情况、病理变化特征检验的基础上,进行病原学检验。结果表明,此病例属于由弧菌属(VibrioPacini1854)细菌引起的败血感染症。经对12株纯培养菌(HQ010712-1—HQ010712-12... 采用病原分离与鉴定、人工感染试验等方法,在对养殖牙鲆病例进行发病情况、病理变化特征检验的基础上,进行病原学检验。结果表明,此病例属于由弧菌属(VibrioPacini1854)细菌引起的败血感染症。经对12株纯培养菌(HQ010712-1—HQ010712-12)进行形态特征、理化特性等表观分类学指征的检验,选择代表菌株(HQ010712-1株)进行16S rRNA基因的测定与系统发育学分析等,判定为弧菌属的一个新种。将HQ010712-1株送中国典型培养物保藏中心(CCTCC)进行了复核鉴定与分类定名,依据分离地定名为秦皇岛弧菌(Vibrioqinhuangdaorasp.nov.);参考菌株为HQ010712-1。 展开更多
关键词 牙鲆 细菌性败血症 病原细菌 系统发育学分析 16S RRNA
在线阅读 下载PDF
应用rRNA基因间隔区碱基测序对中药(大黄)进行鉴定 被引量:16
17
作者 姬可平 李啸红 +1 位作者 李应东 张西玲 《世界科学技术-中药现代化》 2002年第4期44-47,共4页
目的:对大黄种子中提取的DNA中rRNA基因内转录间隔区进行PCR扩增,对于PCR扩增,并对PCR扩增产物进行碱基序列测定,以期从分子水平建立对中草药的鉴定标准。方法:常规提取当归、大黄种子DNA,利用合成的特异性引物对其DNA中rRNA基因内转录... 目的:对大黄种子中提取的DNA中rRNA基因内转录间隔区进行PCR扩增,对于PCR扩增,并对PCR扩增产物进行碱基序列测定,以期从分子水平建立对中草药的鉴定标准。方法:常规提取当归、大黄种子DNA,利用合成的特异性引物对其DNA中rRNA基因内转录间隔区进行套式PCR扩增,将扩增产物以四色荧光标记的双脱氧末端终止循环法进行碱基序列测定。结果:经琼脂糖凝胶电泳证实大黄种子中rRNA基因内转录间隔区PRC基因内转录间隔区的完整碱基序列。RRNA基因内转录间隔区的碱基序列可作为分子水平鉴定植物中药材的又一有效途径。 展开更多
关键词 大黄 套式PRC DNA测序 RRNA基因 中药鉴定
暂未订购
石油污染盐碱土壤翅碱蓬根围的细菌多样性及耐盐石油烃降解菌筛选 被引量:20
18
作者 王新新 白志辉 +2 位作者 金德才 韩祯 庄国强 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1768-1777,共10页
为了更好地了解石油污染盐碱土壤翅碱蓬根围的细菌多样性,采用16S rRNA基因克隆文库方法对其进行分析,在此基础上采用富集培养方法从该生境中分离筛选耐盐石油烃降解菌。16S rRNA基因克隆文库分析结果表明,海杆菌属(Marinobacter)、食... 为了更好地了解石油污染盐碱土壤翅碱蓬根围的细菌多样性,采用16S rRNA基因克隆文库方法对其进行分析,在此基础上采用富集培养方法从该生境中分离筛选耐盐石油烃降解菌。16S rRNA基因克隆文库分析结果表明,海杆菌属(Marinobacter)、食烷菌属(Alcanivorax)和假单胞菌属(Pseudomonas)是该生境中的优势菌。他们可能在石油污染盐碱土壤翅碱蓬植物修复过程中起重要作用。进一步采用富集培养方法,从该生境中分离得到8株耐盐石油烃降解菌,可以耐受6%-10%浓度的NaCl,石油烃降解率在32.3%-57.0%之间。经16S rRNA基因序列分析,8株菌隶属于戈登氏菌属(Gordonia)、无色杆菌属(Achromobacter)、迪茨菌属(Dietzia)、芽胞杆菌属(Bacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas)。他们可能参与石油污染盐碱土壤翅碱蓬植物修复过程中的石油烃降解。 展开更多
关键词 石油污染盐碱土壤 翅碱蓬 细菌多样性 耐盐石油烃降解菌 16S rRNA基因克隆文库
原文传递
荣成天鹅湖大叶藻(Zostera marina)间2 种小型腹足类的分类学研究
19
作者 刘静 管洪在 +3 位作者 张素萍 郭小芳 杨学伶 王海艳 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期226-234,共9页
小型腹足类生物在我国种类繁多,但其相关研究在国内基本属于空白。本文对荣成天鹅湖大叶藻间的2种小型腹足类生物进行了形态学及分子生物学(16S和28SrRNA基因片段)研究。结果表明,根据形态学所鉴定的短剑螺属未定种Machae roplax sp.,... 小型腹足类生物在我国种类繁多,但其相关研究在国内基本属于空白。本文对荣成天鹅湖大叶藻间的2种小型腹足类生物进行了形态学及分子生物学(16S和28SrRNA基因片段)研究。结果表明,根据形态学所鉴定的短剑螺属未定种Machae roplax sp.,应为畦螺属未定种Lirularia sp.;分子生物学研究结果支持形态学对刺绣翼螺Alabapicta的鉴定。同时,与A.picta有一定形态学差异的其它4种相近形态的小型腹足类,在基因序列及遗传距离上与刺绣翼螺非常接近,亦应为刺绣翼螺Alaba picta。 展开更多
关键词 天鹅湖 大叶藻 刺绣翼螺Alabapicta 畦螺属未定种Lirularia SP 16S RRNA 28S RRNA
在线阅读 下载PDF
利用16S-23S rDNA RFLP及16S rRNA基因序列分析方法对湖北省饭豆(Vigna umbellata L.)根瘤菌系统发育的研究 被引量:7
20
作者 潘峰 王平 +2 位作者 胡正嘉 何绍江 冯新梅 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期78-82,共5页
采用16S-23S rDNA间隔区段(IGS)PCR-RFLP与16S rRNA基因部分序列分析的方法对饭豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析.由16S-23S rDNA IGS PCR-RFLP分析可知,所有菌株在52%的相似性水平上聚在一起,形成了慢生型菌群与快生型菌群这两... 采用16S-23S rDNA间隔区段(IGS)PCR-RFLP与16S rRNA基因部分序列分析的方法对饭豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析.由16S-23S rDNA IGS PCR-RFLP分析可知,所有菌株在52%的相似性水平上聚在一起,形成了慢生型菌群与快生型菌群这两大菌群.群Ⅰ中,在79%相似性的水平上分为ⅠA与ⅠB两个分支.群Ⅱ中,在62%相似性的水平上分为ⅡA与ⅡB两个分支,分支ⅡA在72%的相似性水平上进一步分为ⅡA1、ⅡA2和ⅡA3三簇;分支ⅡB中的饭豆根瘤菌与标准菌株USDA205T聚在一起,表现的差异并不大.由16SrRNA基因部分序列分析结果可知,供试的4个代表菌株分别位于不同的系统发育分支中.CYR4243与Sinorhizobium fredii的模式菌株USDA205T的序列相似性达到了99.87%.HCY1101与Rhizobium leguminosarum中的三叶草生物型(bv.trifolii)和豌豆生物型(bv.viceae)这两个生物型的参比菌株亲缘关系最近,序列相似性为100%.HCY5202与R.galegae亲缘关系最近,序列相似性为99.86%.CYY3302与Bradyrhizobium elkanii的参比菌株USDA86有最近的亲缘关系,序列相似性近似于100%. 展开更多
关键词 根瘤菌 16S-23S RDNA IGS PCR—RFLP 16S rRNA基因 系统发育 饭豆
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部