期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到61篇文章
< 1 2 … 4 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
甘薯KNOX基因家族成员鉴定及其在干旱胁迫下的表达分析
1
作者 薛薇 张会永 +1 位作者 周玶吉 徐豪峰 《西南农业学报》 北大核心 2025年第5期976-986,共11页
【目的】挖掘甘薯KNOX基因家族并探究其在干旱胁迫条件下的功能。【方法】采用生物信息学方法研究甘薯KNOX基因家族的蛋白理化性质、系统进化、保守结构、顺势作用元件、蛋白互作等,并通过转录组数据分析KNOX基因在甘薯不同组织部位的... 【目的】挖掘甘薯KNOX基因家族并探究其在干旱胁迫条件下的功能。【方法】采用生物信息学方法研究甘薯KNOX基因家族的蛋白理化性质、系统进化、保守结构、顺势作用元件、蛋白互作等,并通过转录组数据分析KNOX基因在甘薯不同组织部位的表达模式,同时使用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)研究甘薯IbKNOXs基因在干旱胁迫下的响应程度。【结果】从甘薯基因组中鉴定出16个KNOX基因,IbKNOX蛋白均含有4个典型的保守结构域,但在Motif类型和数量上呈现差异。IbKNOX蛋白主要以酸性、亲水不稳定核蛋白为主。甘薯KNOX基因在染色体上分布较为均匀,除3号染色体外,其余染色体均只含有1个KNOX基因,且与水稻和拟南芥存在多对共线基因对。启动子分析显示,甘薯IbKNOX基因存在多种顺式作用元件,涉及光、激素、生长及胁迫响应元件,其中光响应元件的数量最多。IbKNOX基因在甘薯不同组织部位具有典型的组织表达特异性,甘薯IbKNOX6与IbKNOX14和IbKNOX3蛋白存在相互作用;qRT-PCR结果显示,干旱胁迫后甘薯IbKNOX基因的表达水平发生变化,大多数基因表达上调。【结论】甘薯IbKNOX基因具有响应干旱胁迫的功能,为其在干旱胁迫中的响应机制提供理论基础。 展开更多
关键词 knox转录因子 甘薯 干旱胁迫 表达水平
在线阅读 下载PDF
香椿KNOX家族基因鉴定及其在干旱和盐胁迫下的表达分析
2
作者 陈舒鑫 樊俐娇 +6 位作者 贾瑜涵 刘军 华克达 邱勇斌 张能军 卓仁英 韩小娇 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第5期141-150,共10页
KNOX基因家族在植物生长发育及非生物胁迫响应中发挥着关键作用。本研究旨在鉴定香椿KNOX基因家族成员,并分析其在干旱和盐胁迫条件下的表达模式,为探究KNOX基因功能及培育抗逆性更强的香椿新种质提供理论依据。对香椿KNOX基因家族进行... KNOX基因家族在植物生长发育及非生物胁迫响应中发挥着关键作用。本研究旨在鉴定香椿KNOX基因家族成员,并分析其在干旱和盐胁迫条件下的表达模式,为探究KNOX基因功能及培育抗逆性更强的香椿新种质提供理论依据。对香椿KNOX基因家族进行全基因组鉴定和分析,其中包括系统发育关系、基因结构、保守基序、染色体定位、顺式作用元件和共线性。通过组织培养获得4周龄生根香椿幼苗后,分别使用15%PEG 6000和100 mmol/L NaCl进行水培处理,并在处理后6、24和96 h分别采集根、茎和叶片样本。此外,另取5年生香椿的叶柄、顶芽、根、茎、叶、木质部和韧皮部,用于RNA提取,利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)测定TsKNOX基因家族成员的表达水平。在香椿中共鉴定到12个KNOX家族成员,根据其进化关系分析可分为2大亚类。顺式作用元件分析表明,G-Box、Box4和ABRE元件在TsKNOX家族基因的启动子区域高度富集。12个TsKNOX基因分布在11条染色体上。共线性分析表明,10个TsKNOX基因对均是由片段复制产生,证明片段复制是该家族扩张的主要驱动力。qRT-PCR结果表明,KNOXs基因主要在韧皮部和根中高表达;大部分的TsKNOX家族基因在茎中受干旱和盐胁迫显著诱导。该研究通过对香椿KNOX基因家族鉴定和表达模式分析,初步发现TsKNOX基因在香椿响应干旱和盐胁迫中的作用,为进一步解析该家族的基因功能和作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 香椿 knox基因家族 生物信息学 非生物胁迫
在线阅读 下载PDF
蕈树KNOX基因家族鉴定及组织表达分析 被引量：1
3
作者 王安邦 叶兴状 +4 位作者 赵金涛 陈志云 翁慧莹 林茂 张国防 《亚热带植物科学》 2025年第1期1-10,共10页
KNOX基因家族在植物叶形生长发育方面具有重要调节功能。为鉴定并分析蕈树Altingia chinensis的KNOX基因家族,探寻其组织表达模式,借助生物信息学方法,在蕈树全基因组水平鉴定KNOX基因家族,并对其基因位置、基因结构、系统进化关系、基... KNOX基因家族在植物叶形生长发育方面具有重要调节功能。为鉴定并分析蕈树Altingia chinensis的KNOX基因家族,探寻其组织表达模式,借助生物信息学方法,在蕈树全基因组水平鉴定KNOX基因家族,并对其基因位置、基因结构、系统进化关系、基因共线性以及转录组表达进行分析。从蕈树基因组中8条染色体上得到11个AcKNOXs,其中AcKNOX6和AcKNOX9无ELK和Homeobox KN结构域,AcKNOX7无ELK结构域,其余均有完整结构域。蕈树AcKNOXs分为ClassⅠ(AcKNOX1、AcKNOX2、AcKNOX5、AcKNOX8、AcKNOX10、AcKNOX11)、ClassⅡ(AcKNOX3、AcKNOX4、AcKNOX7)和Class M(AcKNOX6、AcKNOX9)三类。AcKNOXs蛋白包含144~444个氨基酸,亚细胞定位均位于细胞核,均为酸性不稳定亲水蛋白。表达模式分析表明,AcKNOXs基因存在组织特异性,但同一亚家族大部分成员的表达模式相似。鉴定的11个AcKNOX成员扩增方式为片段复制,无串联重复。AcKNOX3/AcKNOX4、KNOX2/AcKNOX8、AcKNOX6/AcKNOX9、AcKNOX5/AcKNOX10共4对基因间存在共线性关系。该研究结果为进一步研究蕈树KNOX基因家族基因组特性提供科学依据。 展开更多
关键词 蕈树 knox基因家族 生物信息学 系统发育分析 表达分析
在线阅读 下载PDF
基于转录组测序的酢浆草KNOX基因家族成员的鉴定与分析
4
作者 杨远帆 贺亮亮 +2 位作者 刘野 刘宇 陈江华 《分子植物育种》 北大核心 2025年第13期4320-4329,共10页
典型的KNOX基因编码同源异形盒蛋白,在植物的生长、发育、器官形态建成等过程中发挥着重要的调控作用。为了寻找酢浆草中与复叶发育相关的KNOX基因,本研究对酢浆草不同组织部位进行转录组测序,组装拼接后得到329721条转录本和174913条... 典型的KNOX基因编码同源异形盒蛋白,在植物的生长、发育、器官形态建成等过程中发挥着重要的调控作用。为了寻找酢浆草中与复叶发育相关的KNOX基因,本研究对酢浆草不同组织部位进行转录组测序,组装拼接后得到329721条转录本和174913条单基因簇。对所得数据进行同源性搜索,鉴定出酢浆草中的KNOX基因家族,并对其蛋白质理化性质、亚细胞定位、保守结构域和进化关系进行分析。结果表明,在酢浆草转录组中一共有10个KNOX基因家族成员,其蛋白均由酸性、不稳定亲水性蛋白构成,并定位于细胞核中;系统进化树分析将酢浆草KNOX蛋白家族分为3个亚家族,包括典型的KNOXⅠ亚家族5个成员和KNOXⅡ亚家族3个成员,以及非典型的不具有同源异形盒结构域的KNOX-M亚家族2个成员。酢浆草KNOX家族成员所包含的主要结构域和基序具有一定的保守性,大部分都具有KNOX1和KNOX2结构域,而在不同亚家族间保守基序的种类和数目均存在一定差异。蛋白进化分析显示,酢浆草KNOX家族与拟南芥和蒺藜苜蓿KNOX家族相比,KNOXⅠ和KNOX-M亚家族在进化树上的分布较均匀,且具有较高同源性,为后期研究复叶发育相关基因提供重要支持;而KNOXⅡ亚家族不同物种成员聚类关系较为分散,可能该亚家族在不同物种中的进化历程有较大差异。本研究为进一步解析酢浆草KNOX基因的功能提供了基础。 展开更多
关键词 酢浆草 转录组测序 knox基因家族 生物信息学分析
原文传递
睡莲KNOX基因家族鉴定及生物信息学分析
5
作者 许慧娴 黎洁 +5 位作者 李梅儿 张汝鑫 王童欣 李霆格 赵莹 王健 《热带生物学报(中英文)》 2025年第6期842-854,共13页
KNOX基因家族是编码同源异型盒蛋白的转录因子,在植物生长发育过程中起着重要的调控作用。为了解KNOX基因家族的生物信息特征及其在睡莲(Nymphaea)胎生苗发生过程中可能发挥的作用,本研究通过生物信息学方法从睡莲基因组中鉴定到15个KNO... KNOX基因家族是编码同源异型盒蛋白的转录因子,在植物生长发育过程中起着重要的调控作用。为了解KNOX基因家族的生物信息特征及其在睡莲(Nymphaea)胎生苗发生过程中可能发挥的作用,本研究通过生物信息学方法从睡莲基因组中鉴定到15个KNOX基因,发现其分布于1、2、3、4、5、6、7、8、9、11、13号染色体上,并对其理化性质、顺式作用元件及物种共线性等进行了分析。理化性质分析结果表明,睡莲KNOX编码249~2270个氨基酸,预测均为亲水性蛋白,分子质量在2.84~24.95 kDa之间,其成员基因主要位于细胞核。大多数睡莲KNOX基因含有典型KNOX1、KNOX2、ELK、Homeobox_KN 4种蛋白保守结构域;根据睡莲KNOX基因家族的结构特征和系统发育分析,将其分为ClassⅠ和ClassⅡ2类,其中,ClassⅡ-B可能是睡莲特有的类别。种间共线性分析发现,睡莲KNOX基因家族成员中有13个与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、番茄(Solanum lycopersicum)、水稻(Oryza sativa)和玉米(Zea mays)的KNOX基因均存在共线性关系,且与番茄的同源性最高。启动子顺式作用元件分析发现,睡莲KNOX基因家族含有较多与生长发育、激素和胁迫响应相关的顺式作用元件。通过不同时期叶片的表达模式分析发现,Ⅰ类NcKNOX基因极有可能对睡莲叶片胎生芽的产生和发育起到关键作用。 展开更多
关键词 睡莲 knox基因家族 叶片胎生
在线阅读 下载PDF
甘蔗KNOX基因(Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析 被引量：53
6
作者 李旭娟 刘洪博 +3 位作者 林秀琴 吴转娣 徐超华 刘新龙 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期136-142,共7页
KNOX基因对植物顶端分生组织的形成和维持有至关重要的作用。本文选择功能已知的水稻KNOX基因(OSH1,Oskn1)为参考序列,采用电子克隆技术克隆到甘蔗中与OSH1同源的一个KNOX基因Sckn1,并通过生物信息学分析预测该基因的结构、功能。结果表... KNOX基因对植物顶端分生组织的形成和维持有至关重要的作用。本文选择功能已知的水稻KNOX基因(OSH1,Oskn1)为参考序列,采用电子克隆技术克隆到甘蔗中与OSH1同源的一个KNOX基因Sckn1,并通过生物信息学分析预测该基因的结构、功能。结果表明:该基因包含一个1 071 bp的开放阅读框,编码356个氨基酸,分子量为39.36 kD,理论等电点为6.47。该基因很可能定位于细胞核,起转录调控作用,序列比对发现该基因编码蛋白与高粱、玉米、小米草等KN1蛋白高度相似。以上分析结果为进一步研究Sckn1基因的功能奠定了坚实的基础。 展开更多
关键词 甘蔗 knox基因 电子克隆 生物信息学分析
原文传递
番茄KNOX基因家族鉴定及茄科作物KNOX基因进化关系分析 被引量：12
7
作者 叶曙光 宰文珊 +2 位作者 熊自力 张海利 马彦如 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期1263-1271,共9页
为了探明番茄KNOX基因家族特征及茄科作物中KNOX的进化关系,利用生物信息学方法,在全基因组水平上对番茄及其它茄科作物KNOX基因家族成员进行鉴定和分析。结果表明,番茄基因组中共含有8个KNOX基因(Sl KNOX1~Sl KNOX8),分别分布在番茄8... 为了探明番茄KNOX基因家族特征及茄科作物中KNOX的进化关系,利用生物信息学方法,在全基因组水平上对番茄及其它茄科作物KNOX基因家族成员进行鉴定和分析。结果表明,番茄基因组中共含有8个KNOX基因(Sl KNOX1~Sl KNOX8),分别分布在番茄8条染色体上;多序列比对发现,除Sl KNOX5外,所有基因均含有同源异型盒蛋白特有的4种结构域,即KNOX1、KNOX2、ELK和Homeobox KN。利用系统发育树将茄科作物KNOX基因分为2类:ClassⅠ和ClassⅡ。茄科作物KNOX基因与拟南芥同源基因可能经历了不同的进化历程,在茄科作物中,特有的进化分支(Class I C)已经出现。qRTPCR分析发现,番茄Sl KNOX1在花蕾和花中具有较高表达,在果实生长发育过程中表达量逐渐降低,Sl KNOX2~Sl KNOX4在果实生长发育过程中几乎不表达,Sl KNOX6和Sl KNOX7在所测组织中均有表达,Sl KNOX8在果实成熟过程中表达量逐渐增加,且在根中表达量最大。本研究在全基因组水平上揭示了番茄中KNOX基因家族特征以及茄科作物中KNOX基因的系统发育关系,为进一步揭示KNOX基因家族在番茄组织器官中的功能及进化模式奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 knox基因家族 基因结构 表达分析 进化
在线阅读 下载PDF
Knox时空交互检验空间阈值确定方法 被引量：5
8
作者 岳瀚 朱欣焰 +2 位作者 呙维 佘冰 高超 《武汉大学学报（信息科学版）》 EI CSCD 北大核心 2018年第11期1719-1724,共6页
Knox检验是一种常用的城市犯罪时空交互模式分析方法,但其阈值需要人为指定,这种主观的阈值确定方法存在一定随意性,因此需探索更为合理的阈值确定方法。提出利用点对平均最邻近距离作为Knox检验空间阈值的确定方法,并通过城市入室盗窃... Knox检验是一种常用的城市犯罪时空交互模式分析方法,但其阈值需要人为指定,这种主观的阈值确定方法存在一定随意性,因此需探索更为合理的阈值确定方法。提出利用点对平均最邻近距离作为Knox检验空间阈值的确定方法,并通过城市入室盗窃、盗窃电动车和扒窃3类事件进行实验验证。结果表明,与常见的几种阈值确定方法相比,所提方法检测出了最大数量的显著性交互事件对数,能更加充分地了解事件的真实时空交互模式,为基于Knox检验的事件时空聚集模式分析提供了一种有效的空间阈值确定手段。 展开更多
关键词 knox检验 时空交互 空间阈值 时空聚类 城市犯罪
原文传递
KNOX1基因在植物复叶发育过程中的调控作用 被引量：6
9
作者 张旸 赵月明 +2 位作者 丁兵 齐学军 解莉楠 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1780-1786,共7页
在高等植物中,KNOX1(Class I KNOTTED-like homeobox)基因维持植物顶端分生组织的功能,并在植物叶片发育过程中起到关键作用。近年来研究发现,KNOX1基因在单叶植物和复叶植物的发育过程中表达模式有所差别,叶原基形成后KNOX1基因是否重... 在高等植物中,KNOX1(Class I KNOTTED-like homeobox)基因维持植物顶端分生组织的功能,并在植物叶片发育过程中起到关键作用。近年来研究发现,KNOX1基因在单叶植物和复叶植物的发育过程中表达模式有所差别,叶原基形成后KNOX1基因是否重新上调表达,成为区别单叶植物和复叶植物发育模式的关键。KNOX1基因在豆科IRLC(inverted repeat-lacking clade)分支物种中存在特殊表达模式,LEAFY的同源基因取代了KNOX1基因的功能来控制复叶发生。本文主要介绍近年来KNOX1基因在植物复叶发育过程中的作用,以及在豆科IRLC分支物种中复叶发育的特殊模式。 展开更多
关键词 knox1基因 复叶发育 IRLC 豆科作物
原文传递
瓠瓜KNOX基因家族全基因组鉴定及组织表达分析 被引量：2
10
作者 徐晓燕 黄小忠 +1 位作者 刘万仙 张曼 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2024年第3期113-122,共10页
【目的】探明瓠瓜KNOX基因家族特征,在瓠瓜全基因组水平上对KNOX基因家族成员进行鉴定和分析,研究其组织表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对瓠瓜KNOX家族基因成员进行鉴定、编码蛋白理化性质分析及家族成员结构域和保守基序分析,... 【目的】探明瓠瓜KNOX基因家族特征,在瓠瓜全基因组水平上对KNOX基因家族成员进行鉴定和分析,研究其组织表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对瓠瓜KNOX家族基因成员进行鉴定、编码蛋白理化性质分析及家族成员结构域和保守基序分析,利用MEGA 5.05软件构建系统进化树,采用实时荧光定量PCR技术,分析KNOX基因在瓠瓜不同组织(根、茎、叶、花、果实)中的表达情况。【结果】鉴定到12个瓠瓜KNOX家族基因,这些基因分布在6条染色体上,且均定位于细胞核。大多数瓠瓜KNOX家族蛋白含有同源异型盒蛋白特有的4种结构域KNOX1、KNOX2、ELK和Homeobox_KN。系统进化分析将瓠瓜KNOX基因分为KNOX ClassⅠ和KNOX ClassⅡ2大类群,2个类群又可进一步分为5个分支,其中ClassⅠ-C为瓠瓜特有的进化分支。KNOX基因启动子区有多个激素响应元件和植物生长相关元件。组织表达分析发现,瓠瓜KNOX基因具有不同的表达模式,KNOX ClassⅠ类基因表达具有组织特异性,在根、茎和果实中表达量较高,在其余组织中表达量较低或不表达,其中Lsi04G014450在根和茎中表达量最高,Lsi11G006380在果实中表达量最高;KNOX ClassⅡ类基因在所有组织中均有较高表达。【结论】瓠瓜KNOX基因家族有12个成员,分布于6条染色体上,在进化关系上可分为5组,具有瓠瓜特有的进化分支,在不同组织中的表达具有特异性。 展开更多
关键词 瓠瓜 knox 生物信息学 组织表达
在线阅读 下载PDF
亚洲棉全基因组KNOX基因家族鉴定及组织表达分析 被引量：5
11
作者 孙润润 王园园 +5 位作者 郭新磊 秦腾飞 张金宝 金翠萍 董涛 王清连 《中国棉花》 2019年第12期15-22,共8页
为探究亚洲棉KNOX基因家族特征及进化关系,本研究在石系亚1号中鉴定到23个KNOX基因(GaKNOX1-GaKNOX23)。23个基因定位于11条染色体上。除GaKNOX6、GaKNOX13、GaKNOX15、GaKNOX20和GaKNOX23外,其他GaKNOX蛋白均含有KNOX1、KNOX2、ELK和HO... 为探究亚洲棉KNOX基因家族特征及进化关系,本研究在石系亚1号中鉴定到23个KNOX基因(GaKNOX1-GaKNOX23)。23个基因定位于11条染色体上。除GaKNOX6、GaKNOX13、GaKNOX15、GaKNOX20和GaKNOX23外,其他GaKNOX蛋白均含有KNOX1、KNOX2、ELK和HOX 4个典型结构域。GaKNOX基因进化聚类形成两大分支:ClassⅠ和ClassⅡ。转录组数据分析显示,GaKNOX12在开花后20 d的纤维和胚珠中的表达量最高,说明它可能参与调控棉纤维次生壁形成过程。本研究在亚洲棉全基因组水平上鉴定KNOX基因家族并进行生物信息学分析,为进一步研究KNOX基因在棉花中的调控作用奠定基础。 展开更多
关键词 亚洲棉 knox基因 进化分析 基因结构 组织表达
暂未订购
KNOX Ⅰ类基因在雌蕊发育中的作用 被引量：2
12
作者 孙海龙 侍婷 +1 位作者 章镇 高志红 《江苏林业科技》 2012年第5期39-44,共6页
雌蕊由心皮和花柱组成并最终发育成果实,其发育对作物的产量、质量都有决定性的影响。因此,对雌蕊败育相关基因的研究是植物生物学研究领域的热点,KNOX家族是植物中的5个同源异型盒基因家族之一,分为Ⅰ类和Ⅱ类KNOX亚家族,主要在植物茎... 雌蕊由心皮和花柱组成并最终发育成果实,其发育对作物的产量、质量都有决定性的影响。因此,对雌蕊败育相关基因的研究是植物生物学研究领域的热点,KNOX家族是植物中的5个同源异型盒基因家族之一,分为Ⅰ类和Ⅱ类KNOX亚家族,主要在植物茎顶端分生组织中特异表达,是分生组织发生与维持所必需的关键基因,调控与器官发生相关的细胞分化,最终影响侧生器官的形态建成、该文综述了与雌蕊发育相关的KNOX家族基因功能,重点对KNOX家族中的KNOX Ⅰ类基因进行了阐述。 展开更多
关键词 雌蕊发育 相关基因 knox Ⅰ
在线阅读 下载PDF
杨树中Ⅰ类KNOX基因结构、表达与功能分析 被引量：3
13
作者 赵岩秋 周厚君 +3 位作者 魏凯丽 江成 宋学勤 卢孟柱 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2018年第4期118-125,共8页
[目的]分生组织对器官发生和形态建成起到至关重要的作用,其活性受多种转录因子的调控。KNOTTEDlike homeobox(KNOX)基因家族由2个亚类即Ⅰ类和Ⅱ类KNOX组成,在模式植物拟南芥中I类KNOX成员主要在茎的顶端分生组织区域表达,对维持顶端... [目的]分生组织对器官发生和形态建成起到至关重要的作用,其活性受多种转录因子的调控。KNOTTEDlike homeobox(KNOX)基因家族由2个亚类即Ⅰ类和Ⅱ类KNOX组成,在模式植物拟南芥中I类KNOX成员主要在茎的顶端分生组织区域表达,对维持顶端分生组织分化及侧生器官的形态建成过程起关键作用。木本植物生长发育过程主要包含以顶端分生组织(Shoot apical meristem,SAM)为中心的初生生长与以形成层为中心的次生生长过程,本研究通过分析杨树I类KNOX基因在SAM、根顶端分生组织(Root apical meristem,RAM)的形成过程及形成层相关区域的表达,探讨I类KNOX基因在杨树分生组织形成与分化过程中的功能。[方法]以拟南芥I类KNOX基因STM的蛋白序列在毛果杨基因组中进行同源比对分析,获取杨树I类KNOX成员的核酸和氨基酸序列。根据核酸及氨基酸序列信息构建系统发育树,并绘制基因结构与蛋白质结构图谱。利用84K杨(Populus alba×P.glandulosa)不定芽与不定根诱导实验体系模拟顶端分生组织发育过程,通过实时定量PCR(RT-PCR)技术,对杨树I类KNOX成员在不定芽与不定根形成过程及形成层相关区域中的表达进行分析。[结果]本研究通过同源比对分析鉴定出10个杨树I类KNOX成员,根据进化关系与基因结构差异将其分为三组:组1、组2、组3,其中,组1为拟南芥KNAT2和KNAT6同源基因,组2为STM和BP同源基因,组3为杨树所特有的I类KNOX基因。杨树I类KNOX基因在不定芽与不定根发生过程中表达量均发生较大的变化,在不定芽发生过程中,组1基因在芽原基分化产生不定芽的关键期上调表达,而组2与组3基因多在分生组织分化产生芽原基阶段高表达;在不定根发生过程中,组1成员多在根原基分化产生不定根的过渡期上调表达,组2与组3基因则多在发育后期不定根形态建成阶段高表达。杨树I类KNOX成员在形成层相关区域均表达,组1中KNAT2/6与组2中STM、BP同源基因的表达量明显高于其他成员。[结论]以上结果说明,杨树I类KNOX除了与拟南芥同源的2个组外,还进化产生新的组别,分别参与分生组织形成和分化过程中不同阶段的调控,且Pt KNAT2/6b、ARK1与ARK2在形成层区域高表达,提示以上3个基因可在形成层功能维持以及木质部分化中发挥主要作用。 展开更多
关键词 Ⅰ类knox 分生组织 形成层 表达分析 杨树
在线阅读 下载PDF
小麦KNOX基因家族鉴定与生物信息学分析 被引量：9
14
作者 宋宁宁 梁慧慧 +7 位作者 安义伟 柏胜龙 麻菲菲 张震 李浩 周云 郭光辉 宋纯鹏 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第7期2105-2117,共13页
KNOX基因家族是编码同源异型盒蛋白的转录因子,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。然而,关于小麦KNOX基因家族的研究很少。本研究利用生物信息学手段从小麦基因组中鉴定到分布于18条染色体上的36个KNOX基因,所有鉴定... KNOX基因家族是编码同源异型盒蛋白的转录因子,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。然而,关于小麦KNOX基因家族的研究很少。本研究利用生物信息学手段从小麦基因组中鉴定到分布于18条染色体上的36个KNOX基因,所有鉴定到的家族成员均含有KNOX1或KNOX2结构域。本研究对KNOX基因家族的系统进化、基因结构、蛋白结构域、顺式作用元件和基因表达模式进行了分析。根据其系统发育关系,将小麦KNOX基因分为ClassⅠ和ClassⅡ两大亚类,两亚类又进一步分为5个进化分支。大多数小麦KNOX基因含有典型KNOX1、KNOX2、ELK、HOX四个蛋白保守结构域。小麦KNOX基因的启动子分析发现了一些与激素、生长发育和胁迫响应相关的顺式作用调控元件。不同组织器官转录组数据分析显示,ClassⅠ类KNOX基因具有明显的组织特异性,ClassⅡ类KNOX基因的表达部位更广泛。本研究为进一步分析小麦KNOX基因家族的功能和调控机制提供了重要信息。 展开更多
关键词 小麦 knox基因家族 基因结构 基因表达
原文传递
甘蓝型油菜BnKNOX基因家族的鉴定与分析 被引量：4
15
作者 陈吴钧 刘江栋 +2 位作者 蒋凯旋 王幼平 蒋金金 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2991-3006,共16页
植物特异的KNOTTED-LIKE HOMEOBOX(KNOX)蛋白属于转录调控因子家族,该家族在植物生长发育过程和各种胁迫应答中发挥着重要的作用。KNOX蛋白中存在4个保守的结构域:TALE(three amino acid loop extension)类型的HD(homeodomain)、ELK结构... 植物特异的KNOTTED-LIKE HOMEOBOX(KNOX)蛋白属于转录调控因子家族,该家族在植物生长发育过程和各种胁迫应答中发挥着重要的作用。KNOX蛋白中存在4个保守的结构域:TALE(three amino acid loop extension)类型的HD(homeodomain)、ELK结构域,以及2个亚结构域KNOX1和KNOX2。目前,甘蓝型油菜的BnKNOX基因家族还未有系统的研究报道。本研究通过生物信息学分析鉴定获得甘蓝型油菜的36个BnKNOX家族成员。通过序列比对和系统发育树分析,将其分为3个亚家族(Ⅰ、Ⅱ和M类)。进化分析表明,全基因组复制(whole genome duplication,WGD)和片段复制(segmental duplication)是BnKNOX基因家族扩张的主要动力。基于甘蓝型油菜不同发育时期组织/器官的RNA-seq分析发现,该基因家族的BnKNAT25/26/29/30在胚乳和种子发育过程中特异表达,而BnKNAT31/32/34在成熟种子中高表达。通过BnKNOX家族的顺式作用元件分析和非生物胁迫条件下的表达模式分析,本文鉴定获得17个响应干旱和渗透胁迫的BnKNOX成员。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 knox 基因家族 表达模式 非生物胁迫
在线阅读 下载PDF
过表达烟草NtabKNOX8导致烟叶发育异常 被引量：1
16
作者 徐方正 史素娟 +4 位作者 毛静静 安璐璐 刘贯山 刘好宝 王倩 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2020年第2期86-92,共7页
为探究KNOX(KNOTTED1-like homeobox)家族基因在烟草叶片发育中的功能,从普通烟草(Nicotiana tobacum)红花大金元中克隆获得KNOX家族基因NtabKNOX8,对其进行了生物信息学分析,并通过转基因技术获得了NtabKNOX8过表达材料,对转生长素报... 为探究KNOX(KNOTTED1-like homeobox)家族基因在烟草叶片发育中的功能,从普通烟草(Nicotiana tobacum)红花大金元中克隆获得KNOX家族基因NtabKNOX8,对其进行了生物信息学分析,并通过转基因技术获得了NtabKNOX8过表达材料,对转生长素报告基因DR5::GUS材料与NtabKNOX8过表达材料的杂交F1代叶片进行了GUS染色。结果表明,NtabKNOX8属于KNOX基因家族亚家族Ⅰ;过表达NtabKNOX8导致叶片变宽圆,对称性丧失,叶面皱缩并向叶背面弯曲,主脉明显缩短且脉序发生明显改变,类似掌状网脉,叶形指数变小,叶面积减小,比叶鲜重增大;NtabKNOX8过量表达的烟叶中生长素含量明显增加,且分布更加广泛。推测NtabKNOX8可能通过影响生长素的含量及分布,影响叶片生长发育过程,从而导致了烟叶形态的多重变化。 展开更多
关键词 knox基因 叶片发育 叶形 叶脉 生长素
在线阅读 下载PDF
花生KNOX基因家族的全基因组鉴定及组织表达分析 被引量：2
17
作者 宋晓峰 鲁成凯 +3 位作者 董晓娜 高晓东 孙熙文 付春 《山东农业科学》 北大核心 2023年第8期1-10,共10页
为研究花生KNOX基因家族在生长发育以及非生物胁迫响应中的功能,本研究采用生物信息学手段在栽培种花生基因组水平上对KNOX基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、基因结构、蛋白质保守结构域、系统进化、启动子顺式作用元件以及组织与... 为研究花生KNOX基因家族在生长发育以及非生物胁迫响应中的功能,本研究采用生物信息学手段在栽培种花生基因组水平上对KNOX基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、基因结构、蛋白质保守结构域、系统进化、启动子顺式作用元件以及组织与逆境下的表达模式进行分析。结果显示:花生基因组中共有26个KNOX基因家族成员,分布在17条染色体上,绝大多数编码酸性蛋白,均为亲水性蛋白,并全部定位于细胞核。系统发育分析可将花生KNOX家族分为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚家族,并进一步分为4个亚组。启动子分析发现一些与生长发育、激素和胁迫响应相关的顺式作用调控元件。全生育期组织表达分析结果显示,ClassⅠ类基因表达组织特异性明显,主要在花、营养茎尖、生殖茎尖、果针等组织中高表达;ClassⅡ类基因时空表达更广泛。在7种非生物胁迫处理下,部分基因表达量变化较大,其中5个基因响应特定胁迫,RT-qPCR验证了2个特异性响应PEG胁迫的基因。本研究为进一步探究花生KNOX基因在生长发育、逆境响应中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 花生 knox基因家族 全基因组鉴定 生物信息学分析 表达分析
在线阅读 下载PDF
金鱼草KNOX基因家族鉴定及调控其雄蕊瓣化的候选基因挖掘 被引量：2
18
作者 顾伟卓 汪仲毅 +5 位作者 杨洁 赵永晶 赵晗茜 谯正林 杨楠 胡慧贞 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1329-1339,共11页
【目的】KNOX(KNOTTED1-like homeobox)转录因子家族在植物生长发育及花器官发育中发挥重要作用。文章旨在鉴定并分析金鱼草(Antirrhinum majus)KNOX转录因子,挖掘出调控金鱼草雄蕊瓣化的关键候选基因。【方法】采用生物信息学方法,在... 【目的】KNOX(KNOTTED1-like homeobox)转录因子家族在植物生长发育及花器官发育中发挥重要作用。文章旨在鉴定并分析金鱼草(Antirrhinum majus)KNOX转录因子,挖掘出调控金鱼草雄蕊瓣化的关键候选基因。【方法】采用生物信息学方法,在金鱼草全基因组水平鉴定AmKNOX基因,并对其基因结构、蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化关系、染色体定位、启动子顺式作用元件及转录因子结合位点等进行分析,并利用金鱼草雄蕊瓣化和非瓣化材料进行RNA-seq分析和qRT-PCR验证,挖掘出候选基因。【结果】从金鱼草中共鉴定出11个AmKNOX基因,都具有KNOXⅠ、KNOXⅡ、ELK和HOX 4个相对保守的区域,分为ClassⅠ(AmKNOX1、AmKNOX2、AmKNOX3、AmKNOX9和AmKNOX11)和ClassⅡ(AmKNOX5、AmKNOX4、AmKNOX7、AmKNOX10、AmKNOX6和AmKNOX8)2类。AmKNOXs蛋白包含282~406个氨基酸,均定位于细胞核中。启动子顺式作用元件分析结果显示,AmKNOXs家族成员可参与植物生长、激素和非生物胁迫响应,且AmKNOXs存在大量与植物生长发育、器官分化和逆境生理调节相关的转录因子结合位点。RNA-seq和qRT-PCR分析表明AmKNOX家族基因在金鱼草正常雄蕊和瓣化雄蕊中显著差异表达。【结论】本研究共鉴定出11个AmKNOX成员,最终挖掘出5个正向(AmKNOX5、AmKNOX10、AmKNOX6、AmKNOX4和AmKNOX9)以及1个负向(AmKNOX11)调控雄蕊瓣化的AmKNOX候选基因。其中AmKNOX5基因在瓣化雄蕊中的表达量比正常雄蕊中高2703%,推测其功能非常重要,该研究为后期深入解析金鱼草花型发育分子机制和遗传改良奠定了基础。 展开更多
关键词 金鱼草 knox基因家族 生物信息学 雄蕊瓣化
在线阅读 下载PDF
7个苹果KNOX转录因子基因克隆、表达和蛋白互作分析 被引量：1
19
作者 卢苗 李佩 +6 位作者 荣钰莹 张梦涵 贾鹏 栾好安 齐国辉 张雪梅 董庆龙 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期841-851,共11页
【目的】KNOTTED1likehomeobox(KNOX)蛋白在植物生长发育等多个生物学过程中发挥着重要作用。以紫弘富士为材料,分离了多个苹果(Malusdomestica)KONX基因,研究其结构域、进化分析、组织表达、非生物胁迫响应及其与MdOFP相互作用情况。... 【目的】KNOTTED1likehomeobox(KNOX)蛋白在植物生长发育等多个生物学过程中发挥着重要作用。以紫弘富士为材料,分离了多个苹果(Malusdomestica)KONX基因,研究其结构域、进化分析、组织表达、非生物胁迫响应及其与MdOFP相互作用情况。【方法】使用RT-PCR技术克隆获得7个MdKNOX基因并进行生物信息学分析。利用Array技术检测MdKNOX基因在苹果不同组织中的表达模式。使用RT-qPCR技术检测MdKNOX基因在盐胁迫和渗透胁迫下的表达模式。通过Y2H实验检测了MdKNOX蛋白与MdOFP蛋白的互作情况。【结果】测序结果表明,获得了7个KNOX转录因子cDNA:MdKNOX1、MdKNOX2、MdKNOX5、MdKNOX10、MdKNOX13、MdKNOX16和Md-KNOX22(GenBank登录号:MG021644~MG021650)。结构域分析表明,获得的7个MdKNOX蛋白序列均含有MEI-NOX、HD和ELK结构域。进化分析表明,MdKNOX1、MdKNOX2和MdKNOX5属于KNOXⅡ亚组;MdKNOX10、MdKNOX13、MdKNOX16和MdKNOX22属于KNOXⅠ亚组。启动子顺式作用元件分析结果表明,7个MdKNOX基因启动子上包含多个顺式作用元件。Array分析结果显示,MdKNOX基因具有不同的组织表达模式。实时荧光定量PCR分析结果表明,盐胁迫处理下,MdKNOX13的相对表达水平上调,而MdKNOX1、MdKNOX2和MdKNOX5的相对表达水平下调;渗透胁迫处理下,MdKNOX2的转录水平下调。酵母双杂交结果显示,MdKNOX1/22蛋白能与MdOFP6蛋白相互作用,MdKNOX5蛋白能与多个MdOFP蛋白相互作用,且MdKNOX5蛋白与MdOFP蛋白相互作用,HD区域是互作必需的。【结论】这些结果为苹果KNOX转录因子在生长、发育和逆境下生物学功能的解析、调控网络的构建提供了强有力的理论基础和参考。 展开更多
关键词 苹果 knox转录因子 基因克隆 表达分析 蛋白互作
在线阅读 下载PDF
大豆KNOX基因家族的结构和表达分析 被引量：16
20
作者 李方正 杨素欣 +3 位作者 吴春霞 魏海超 曲瑞莲 冯献忠 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期236-247,共12页
KNOX基因家族编码同源异型盒蛋白,在植物生长发育过程中起重要调控作用。利用生物信息学手段在全基因组水平上对大豆(Glycinemax)KNOX家族基因进行鉴定和分类,并分析其基因结构、蛋白同源结构域特征以及基因表达方式。研究结果表明:大... KNOX基因家族编码同源异型盒蛋白,在植物生长发育过程中起重要调控作用。利用生物信息学手段在全基因组水平上对大豆(Glycinemax)KNOX家族基因进行鉴定和分类,并分析其基因结构、蛋白同源结构域特征以及基因表达方式。研究结果表明:大豆中的27个GmKNOX基因可以分为GmKNOXI和GmKNOXII两个亚类,其中GmKNOXI类可分为3个主要的进化支,GmKNOXII类分为2个主要的进化支;26个GmKNOX基因不均匀地分布在16条染色体上,GmKNOX27尚无法定位。不同组织表达谱的分析表明:GmKNOXI类基因表达部位比较集中,以茎顶端分生组织中表达量最高;而GmKNOXII类基因的表达特异性较GmKNOXI类低,表达部位更广泛。 展开更多
关键词 基因家族 基因结构 表达分析 大豆 同源结构域 生长发育过程 顶端分生组织 基因表达
原文传递
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 2 … 4 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部