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基于Kaplan-Meier plotter数据库分析CD_(44)基因表达状态对卵巢癌生存结局的影响 被引量:3
1
作者 郑建清 黄碧芬 《吉林医学》 CAS 2022年第1期5-7,共3页
目的:探讨不同CD_(44)基因表达状态与卵巢癌生存结局的关系。方法:通过Kaplan-Meier plotter数据库检索CD_(44)基因的表达结果与生存数据,分析CD_(44)基因在卵巢癌组织和正常卵巢组织中的表达差异,同时分析不同CD_(44)基因表达分组的总... 目的:探讨不同CD_(44)基因表达状态与卵巢癌生存结局的关系。方法:通过Kaplan-Meier plotter数据库检索CD_(44)基因的表达结果与生存数据,分析CD_(44)基因在卵巢癌组织和正常卵巢组织中的表达差异,同时分析不同CD_(44)基因表达分组的总生存差别。结果:Kaplan-Meier plotter数据库包含了1653个样本,其中5个样本为正常卵巢组织,1648个样本是卵巢癌组织。正常卵巢组织CD_(44)基因表达量为174(91-276),而卵巢癌组织为231(4-4204),但差异无统计学意义(P=0.262)。数据库共记录了655例卵巢癌患者的总生存数据,以表达量172为阈值,低表达组卵巢癌中位总生存时间为35.0个月,而高表达组为47.8个月;差异具有显著统计学意义[风险比HR=0.76,95%CI(0.61-0.93),P=0.0089]。结论:卵巢癌组织中CD_(44)基因的表达与正常卵巢组织相当,但卵巢癌CD_(44)基因高表达提示预后良好,可以提高患者总生存率。 展开更多
关键词 卵巢癌 kaplan-meier plotter数据库 CD_(44)基因 基因表达 预后因素
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应用Kaplan-Meier Plotter数据库探索EGFR表达在非小细胞肺癌中的预后意义
2
作者 赵中华 王振波 +1 位作者 郭琛 贾瑞 《中国继续医学教育》 2020年第20期182-184,共3页
Kaplan-Meier Plotter数据库是一个恶性肿瘤预后相关的在线分析数据库,可以评估54 000多个基因表达对21种癌症类型预后的影响。在医学教学及科研中,可应用此数据库探索目标基因表达同相关肿瘤预后的关系,应用方便、高效。非小细胞肺癌(n... Kaplan-Meier Plotter数据库是一个恶性肿瘤预后相关的在线分析数据库,可以评估54 000多个基因表达对21种癌症类型预后的影响。在医学教学及科研中,可应用此数据库探索目标基因表达同相关肿瘤预后的关系,应用方便、高效。非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)治疗已进入精准治疗时代,根据驱动基因突变或扩增情况选择相应的靶向治疗药物是晚期肺腺癌患者的标准一线治疗。表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)是一种跨膜受体酪氨酸激酶,该区域的激活对细胞增殖、生长的相关信号传递具有重要意义。文章以表皮生长因子受体在非小细胞肺癌中的预后意义探索为例,应用Kaplan-Meier Plotter数据库,探索肿瘤组织中EGFR mRNA表达高低在非小细胞肺癌中的预后意义。 展开更多
关键词 kaplan-meier plotter数据库 医学教学 科学研究 EGFR 非小细胞肺癌 预后
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基于Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库分析GPX2在非小细胞肺癌组织中的表达和临床意义 被引量:1
3
作者 高华 张贝贝 +1 位作者 庞俊芳 王黎 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2021年第19期3390-3395,共6页
目的:探讨谷胱甘肽过氧化物酶2(glutathione peroxidase 2,GPX2)在非小细胞肺癌组织中的表达及预后意义。方法:基于Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库,收集关于GPX2表达的相关数据集,深入挖掘GPX2在非小细胞肺癌组织与正常组织中的... 目的:探讨谷胱甘肽过氧化物酶2(glutathione peroxidase 2,GPX2)在非小细胞肺癌组织中的表达及预后意义。方法:基于Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库,收集关于GPX2表达的相关数据集,深入挖掘GPX2在非小细胞肺癌组织与正常组织中的差异表达情况。采用Kaplan-Meier法进行预后分析,并绘制生存曲线。此外,通过单/多因素COX回归进一步评估GPX2在不同临床特征中的预后评估价值。结果:与正常组织相比,GPX2在非小细胞肺癌组织中高表达(P<0.001)。GPX2高表达非小细胞肺癌患者的总体生存率(HR=1.42,95%CI:1.25~1.61,P=5.6E-08)和肺腺癌患者的总体生存率(HR=1.35,95%CI:1.07~1.71,P=0.011)均差于低表达组。但GPX2表达水平对鳞癌患者预后无显著影响(HR=1.06,95%CI:0.84~1.35,P=0.61)。此外,本研究也发现GPX2的表达对同一临床特征(如男性、临床分期、吸烟/不吸烟、经化疗方式治疗)的患者的预后有预测评估价值。多因素分析结果显示临床分期和GPX2的表达是非小细胞肺癌患者预后的独立影响因素。结论:检测非小细胞肺癌组织中GPX2的表达有助于患者预后评估。 展开更多
关键词 NSCLC GPX2 Oncomine数据库 kaplan-meier plotter数据库
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Analysis of the expression and prognostic value of ENO1 in ovarian cancer based on Oncomine database
4
作者 Tao-Hong Zhang Li-Li Xiong +3 位作者 Xiao-Wei Wang Wei-Hong Wang Ying Liu Rui-Fang An 《Journal of Hainan Medical University》 2019年第18期45-48,共4页
Objective:Ovarian cancer is one of the leading causes of death in women,because of late diagnosis,recurrence and resistance to chemotherapy.Therefore,it's necessary to design a novel sensitive and specific maker t... Objective:Ovarian cancer is one of the leading causes of death in women,because of late diagnosis,recurrence and resistance to chemotherapy.Therefore,it's necessary to design a novel sensitive and specific maker to diagnose and treat patients of ovarian cancer.However,this study intends to explore the expression and prognostic value of ENO1 in ovarian cancer.Method:ENO1 data were collected from Oncomine database,and then were performed subgroup analysis and systematic analysis.Meanwhile,the prognostic significance of ENO1 was analyzed by an online survival analysis tool"Kaplan-Meier Plotter"(KM plotter)database.Results:In Oncomine database,a total of 14 studies were involved ENO1 in ovarian cancer tissues and normal tissues,including a total of 1001 samples.Comparing with normal tissues,ENO1 expression is higher(P<0.05).Moreover,the overall survival of ENO1 high expression in ovarian cancer is closely related with high survival(P<0.05).Further study indicated that ENO1 expression showed negative relation to the prognosis of serous ovarian cancer patients while ENO1 expression showed no effects on the prognosis of endometrioid ovarian cancer patients.Conclusion:Through exploration of tumor gene information in Oncomine database,ENO1 was found highly expressed in ovarian cancer and related to the prognosis of ovarian cancer,which might be a new marker for ovarian cancer prognosis and alternative drug therapy. 展开更多
关键词 OVARIAN CANCER Oncomine databaseαdenolase(ENO1) Overall SURVIVAL kaplan-meier plotter database
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FOXP3和FOXO4基因在口腔鳞状细胞癌中的预后分析
5
作者 毛家奇 赵力如 +5 位作者 杨冬茹 魏梓轩 齐霞 李雅 梁向阳 李淑娟 《现代口腔医学杂志》 2025年第2期125-129,共5页
目的探索FOXP3和FOX04基因在口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)中的预后分析。方法通过UALCAN、Kaplan-MeierPlotter和cBioPortal在线数据库,分析FOXP3和FOXO4在OSCC患者中的mRNA表达差异、癌症分期、病理分级及预后... 目的探索FOXP3和FOX04基因在口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)中的预后分析。方法通过UALCAN、Kaplan-MeierPlotter和cBioPortal在线数据库,分析FOXP3和FOXO4在OSCC患者中的mRNA表达差异、癌症分期、病理分级及预后分析。real-timePCR检测人口腔角质细胞(HumanOral Keratinocytes,HOK)和CAL27人舌鳞状细胞癌细胞(CAL27 Human Tongue Squamous Cell Carcinoma,CAL27)中FOXP3和FOXO4的mRNA表达。结果①FOXP3和FOXO4在OSCC患者中的mRNA表达均出现明显差异性变化。②FOXP3和FOXO4的mRNA表达与OSCC患者的癌症分期、肿瘤分级和预后显著相关。③FOXP3和FOXO4的基因改变可能会显著影响OSCC患者的预后。④与HOK细胞相比,CAL27细胞中FOXP3和FOXO4的mRNA表达明显降低(P<0.05)。结论①FOXP3和FOXO4是口腔鳞状细胞癌OS的独立生存因素。②FOXP3和FOXO4可以作为口腔鳞状细胞癌患者生存的预后标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 FOXP3 FOXO4 口腔鳞状细胞癌 UALCAN kaplan-meier plotter
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CEACAM8与胃癌患者生存关系的生物信息学分析
6
作者 孙烨煜 姜艳芳 +2 位作者 李娜 李浩 贺延新 《临床医学进展》 2025年第1期49-54,共6页
胃癌在世界范围内直接影响着人类的生活质量,癌胚抗原相关细胞粘附分子(CEACAM)亚家族的一些成员在肿瘤中不受调控。对于CEACAM8在胃癌中的功能知之甚少。为了解决这一问题,本研究使用UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、metascape数据库研... 胃癌在世界范围内直接影响着人类的生活质量,癌胚抗原相关细胞粘附分子(CEACAM)亚家族的一些成员在肿瘤中不受调控。对于CEACAM8在胃癌中的功能知之甚少。为了解决这一问题,本研究使用UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、metascape数据库研究了CEACAM8在胃癌预后中的作用。发现CEACAM8的过表达与胃癌患者的临床肿瘤分期和病理肿瘤分级显著相关。此外,CEACAM8 mRNA的高表达与胃癌患者较短的总生存期(OS)显著相关。总的来说,CEACAM8可能是胃癌患者生存的预后生物标志物。Gastric cancer directly affects human quality of life worldwide, and some members of the carcinoembryonic antigen-associated cell adhesion molecule (CEACAM) subfamily are not regulated in tumors. Little is known about the function of CEACAM8 in gastric cancer. In order to solve this problem, this study used UALCAN, Kaplan-Meier Plotter and metascape databases to study the role of CEACAM8 in the prognosis of gastric cancer. It was found that the overexpression of CEACAM8 was significantly correlated with the clinical tumor stage and pathological tumor grade of gastric cancer patients. In addition, high expression of CEACAM8 mRNA was significantly associated with shorter overall survival (OS) in patients with gastric cancer. Overall, CEACAM8 may be a prognostic biomarker for survival in patients with gastric cancer. 展开更多
关键词 胃癌 CEACAM8 预后 UALCAN kaplan-meier plotter
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联合生物信息学分析S1PR1在肺癌组织中的表达及临床意义 被引量:1
7
作者 徐鑫鑫 蔡花 +1 位作者 彭静静 褚福营 《标记免疫分析与临床》 CAS 2020年第6期1006-1010,共5页
目的探讨肺癌组织中1-磷酸神经鞘氨醇受体1 (S1PR1)的表达及临床意义。方法收集南通市肿瘤医院52例肺癌患者组织标本,采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)法检测肺癌组织及癌旁组织中S1PR1的表达水平,通过Oncomine数据库对S1PR1表达结果进行佐... 目的探讨肺癌组织中1-磷酸神经鞘氨醇受体1 (S1PR1)的表达及临床意义。方法收集南通市肿瘤医院52例肺癌患者组织标本,采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)法检测肺癌组织及癌旁组织中S1PR1的表达水平,通过Oncomine数据库对S1PR1表达结果进行佐证,并分析其与临床病理参数之间的关系;利用ROC曲线,评价其表达水平对肺癌的诊断价值;Kaplan-Meier Plotter数据库分析其与肺癌预后的关系。结果肺癌组织中S1PR1的表达水平明显低于癌旁组织(P<0.01),Oncomine数据库共检索出9项符合筛选条件的研究,S1PR1在所有研究中都呈低表达(P<0.01)。S1PR1的表达与肿瘤大小和淋巴结转移有关(P<0.05),而与性别、年龄、吸烟情况、病理类型及TNM分期无明显相关性(P>0.05)。根据S1PR1表达水平绘制ROC曲线,曲线下面积(AUC)为0.711(95%CI:0.610~0.813),临界值取1.127时,S1PR1诊断肺癌的灵敏度和特异性均为71.2%。Kaplan-Meier生存分析发现低表达S1PR1的患者5年总生存期显著低于高表达患者(P<0.01)。结论肺癌组织中S1PR1表达水平下调,且低表达S1PR1的患者预后较差,S1PR1有望成为肺癌诊断和预后的分子标志物。 展开更多
关键词 S1PR1 肺癌 Oncomine数据库 kaplan-meier plotter数据库
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FN1在胃癌组织和细胞中的表达及意义 被引量:6
8
作者 姚远 李胜昔 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第16期2831-2835,共5页
目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin-1,FN1)在胃癌组织和细胞中的表达,探讨其与预后的关系。方法:利用Oncomine数据库挖掘FN1在胃癌组织中的表达;实时荧光定量聚合酶链反应检测FN1在人胃癌细胞系中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析... 目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin-1,FN1)在胃癌组织和细胞中的表达,探讨其与预后的关系。方法:利用Oncomine数据库挖掘FN1在胃癌组织中的表达;实时荧光定量聚合酶链反应检测FN1在人胃癌细胞系中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析FN1表达水平与胃癌预后的关系。结果:Oncomine数据库分析FN1在多种肿瘤组织中表达增加,与胃正常组织相比,FN1在胃癌组织中表达增加,并具有统计学差异(P=1.41E-5)。FN1 mRNA在人胃癌细胞系SGC7901中表达水平增高,在胃癌组织中FN1蛋白表达增加。KM Plotter数据库分析结果显示FN1表达量与胃癌患者总体生存率存在相关性,即高表达FN1的患者总体生存率较差。结论:FN1在胃癌组织和细胞中的表达高于正常组织和细胞,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 Oncomine数据库 KMplotter数据库 纤维连接蛋白1 预后
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胃癌相关基因COL1A2、FN1、COL6A3预后分析 被引量:6
9
作者 姚远 李胜昔 《解剖科学进展》 2019年第5期525-527,531,共4页
目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采... 目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采用GEO在线分析工具GEO2R分析数据,选取TOP250,输出差异表达基因,并通过在线生物信息学绘制韦恩图,获得共有差异基因;通过KM plotter数据库的应用分析COL1A2、FN1、 COL6A3与预后的关系。结果通过分析GSE2685、GSE19826、GSE79973芯片数据,共获得6个共表达基因,利用差异倍数作图,选取差异倍数在2倍以上的基因COL1A2、FN1、COL6A3进行分析,KM plotter数据库的分析显示COL1A2、FN1、COL6A3与胃癌的总生存期成负相关。结论 COL1A2、FN1、COL6A3在胃癌组织中表达高于癌旁组织,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 预后 KM plotter数据库 COL1A2 FN1 COL6A3
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MMPs基因家族在肺腺癌中的表达及临床意义 被引量:2
10
作者 李珂 王娴 王小琦 《现代医药卫生》 2020年第16期2512-2517,共6页
目的研究基质金属蛋白酶(MMPs)基因家族在肺腺癌中的表达及临床意义。方法检索Oncomine,GEPIA及cBioPortal数据库中有关肺腺癌MMPs(MMP-1/9/11/12/14)的数据集,对数据集进行挖掘并结合文献资料进行荟萃分析。结果Oncomine数据库收集9项... 目的研究基质金属蛋白酶(MMPs)基因家族在肺腺癌中的表达及临床意义。方法检索Oncomine,GEPIA及cBioPortal数据库中有关肺腺癌MMPs(MMP-1/9/11/12/14)的数据集,对数据集进行挖掘并结合文献资料进行荟萃分析。结果Oncomine数据库收集9项研究,943例样本;GEPIA数据库收集830例样本。综合分析发现,肺腺癌组织中MMPs的表达显著高于正常肺组织,差异有统计学意义(P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter生存分析表明,MMPs高表达的肺腺癌患者总体病死率高,预后较差,差异有统计学意义(P<0.05)。cBioPortal数据库显示,MMPs在肺腺癌中的突变发生率达39%,且互为正相关。结论MMPs在肺腺癌组织中呈高表达,并与肺腺癌的预后密切相关,有望成为肺腺癌治疗的重要靶点。 展开更多
关键词 肺腺癌 MMPs基因 Oncomine数据库 GEPIA数据库 cBioPortal数据库 kaplan-meier plotter数据库
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基于Oncomine数据库探讨TMC5基因在胰腺癌中的表达及预后分析 被引量:2
11
作者 李萍 《生物技术》 CAS 2021年第1期65-70,9,共7页
[目的]揭示TMC5基因在胰腺癌中的表达及预后相关性。[方法]收集Oncomine和CCLE数据库中TMC5相关资料,对其表达情况进行二次分析,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析预后。[结果]Oncomine数据库有关TMC5在不同类型肿瘤中的研究共362项(... [目的]揭示TMC5基因在胰腺癌中的表达及预后相关性。[方法]收集Oncomine和CCLE数据库中TMC5相关资料,对其表达情况进行二次分析,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析预后。[结果]Oncomine数据库有关TMC5在不同类型肿瘤中的研究共362项(高表达16项、低表达8项)。胰腺癌相关研究7项,共计187例样本。TMC5在胰腺癌组织中的表达明显高于正常组织(P <0.05)。分析CCLE数据库发现,与多种癌细胞系相比,胰腺癌细胞系中TMC5高表达,其mRNA表达水平排名第一。Kaplan-Meier Plotter数据库阐明胰腺癌患者的总生存与TMC5表达水平无关(HR=1.56,95%CI:0.93~2.61,P=0.09),但低表达组患者的无复发生存(RFS)明显优于高表达组(HR=5.37,95%CI:1.26~22.99,P=0.011)。[结论]通过Oncomine和CCLE数据库我们发现胰腺癌中TMC5表达水平升高,高表达患者RFS缩短,因此,检测TMC5表达及靶向该基因的药物有望成为胰腺癌诊疗的重要手段之一。 展开更多
关键词 胰腺癌 TMC5 Oncomine数据库 CCLE数据库 kaplan-meier plotter数据库
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CCNE1基因表达状态在卵巢癌中的预后价值 被引量:1
12
作者 黄春珍 郑建清 黄碧芬 《中外医学研究》 2019年第6期1-2,共2页
目的:探讨CCNE1基因表达状态对卵巢癌总生存结果的影响及预后价值。方法:利用The Kaplan Meier plotter数据库中的卵巢癌患者生存资料及CCNE1基因表达资料,分析不同CCNE1基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索CCNE1基因表达的预后价值... 目的:探讨CCNE1基因表达状态对卵巢癌总生存结果的影响及预后价值。方法:利用The Kaplan Meier plotter数据库中的卵巢癌患者生存资料及CCNE1基因表达资料,分析不同CCNE1基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索CCNE1基因表达的预后价值。结果:共检出1 656例卵巢癌患者用于最终的生存分析,根据CCNE1基因表达状态,分为低表达组(1 171例)和高表达组(485例),低表达组卵巢癌中位总生存时间为48.0个月,高表达组为37.4个月,差异有统计学意义(P=0.001),风险比HR=1.26,95%CI(1.10,1.44)。结论:CCNE1基因高表达降低卵巢癌总生存,是不良预后因子。 展开更多
关键词 CCNE1 生存分析 预后因素 The KAPLAN Meier plotter数据库
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基于Oncomine数据库探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及意义 被引量:1
13
作者 李萍 《生物技术》 CAS 2022年第6期715-720,736,共7页
[目的]探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及临床意义。[方法]收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL1A1的信息,对目前数据库中资料再次进行分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,使用Kaplan-Meier Plotte... [目的]探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及临床意义。[方法]收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL1A1的信息,对目前数据库中资料再次进行分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,使用Kaplan-Meier Plotter在线数据库分析该基因是否与胰腺癌患者的预后相关。[结果]Oncomine数据库中共收集了400项不同类型的研究。其中COL1A1高表达有86项研究,低表达有6项研究。共有8项研究涉及COL1A1在胰腺癌组织与正常组织中的表达,包括209例样本,与正常组织相比,COL1A1在胰腺癌组织中高表达(P<0.05)。NCBI/GEO Profiles数据库分析发现TGF-β处理48 h后COL1A1表达升高。Kaplan-Meier Plotter数据库分析表明COL1A1高、低表达组胰腺癌患者的总体生存率(OS)无统计学差异(HR=1.4,95%CI:0.92~2.12,P=0.11),但高表达组胰腺癌患者的无复发生存(RFS)明显差于低表达组(HR=5.05,95%CI:1.48~17.24,P=0.0044)。[结论]COL1A1基因在胰腺癌组织中的表达明显高于正常组织,低表达患者的RFS延长。可见靶向COL1A1的药物有望改善胰腺癌患者的预后。 展开更多
关键词 胰腺癌 COL1A1 Oncomine数据库 NCBI/GEO Profiles数据库 kaplan-meier plotter数据库
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干扰素刺激基因15在原发性肝癌中的表达及与患者预后的关系 被引量:1
14
作者 汪蔷华 李祥 《内科》 2020年第6期676-679,共4页
目的通过对肿瘤芯片数据库(Oncomine)和生存分析数据库(Kaplan-Meier Plotter)和蛋白-蛋白相互作用数据库(STRING)进行数据挖掘,探讨干扰素刺激基因15(ISG15)在原发性肝癌中的表达情况及其与患者预后的关系。方法分别对Oncomine数据库、... 目的通过对肿瘤芯片数据库(Oncomine)和生存分析数据库(Kaplan-Meier Plotter)和蛋白-蛋白相互作用数据库(STRING)进行数据挖掘,探讨干扰素刺激基因15(ISG15)在原发性肝癌中的表达情况及其与患者预后的关系。方法分别对Oncomine数据库、Kaplan-Meier Plotter数据库和STRING数据库进行肝癌中ISG15基因表达的相关研究检索,探讨ISG15基因在肝癌组织和对应正常组织中的表达情况,绘制ISG15基因表达与肝癌患者总体生存时间的生存曲线。构建ISG15相互作用蛋白网络树状图,并对ISG15及其相关蛋白基因进行功能富集分析。结果通过检索Oncomine数据库发现,有5个研究结果显示肝癌组织中ISG15呈高表达(包括细胞系),有2项研究结果显示ISG15在肝癌组织中的表达水平显著高于正常肝组织(P<0.05)。通过对Kaplan-Meier Plotter数据库进行检索分析发现,在病毒性肝炎、饮酒的肝癌患者中,ISG15高表达患者的总体生存时间明显短于ISG15低表达患者(P<0.05)。通过STRING数据库搜索ISG15基因相关蛋白发现,ISG15基因相互作用蛋白有10种;生物过程富集分析结果显示,上述蛋白主要富集在病毒防御和病毒基因组复制的负调控通路。结论ISG15在肝癌组织中高表达,且可能与病毒性肝炎、酒精性肝癌患者的预后密切相关。 展开更多
关键词 原发性肝癌 干扰素刺激基因15 Oncomine kaplan-meier plotter STRING
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ESPL1基因在卵巢癌中的表达及意义 被引量:1
15
作者 饶玉梅 《医药论坛杂志》 2023年第9期25-30,共6页
目的 探讨分离酶(ESPL1)基因在卵巢癌中的表达及意义。方法 利用GEPIA数据库,对比相应正常组织,分析ESPL1在泛癌及卵巢癌中的表达。运用The Human Protein Atlas数据库,分析ESPL1蛋白在卵巢及卵巢癌组织中表达及定位;应用String数据库绘... 目的 探讨分离酶(ESPL1)基因在卵巢癌中的表达及意义。方法 利用GEPIA数据库,对比相应正常组织,分析ESPL1在泛癌及卵巢癌中的表达。运用The Human Protein Atlas数据库,分析ESPL1蛋白在卵巢及卵巢癌组织中表达及定位;应用String数据库绘制ESPL1基因的相关蛋白网络图,并进行基因功能富集分析。使用Kaplan-Meier Plotter网站,对ESPL1表达影响不同临床特征患者预后指标及化疗药物疗效进行分析。结果 ESPL1在14种恶性肿瘤中表达明显上调,而在食管癌中表达量下调;与正常卵巢组织相比,在卵巢癌中ESPL1基因在mRNA及蛋白质水平的表达显著升高,在卵巢癌中表达定位于细胞膜或浆及核中。与ESPL1基因相互作用蛋白有SMC3、KIF11、PTTG1等10个,主要富集在细胞周期、卵母细胞减数分裂等信号通路。Kaplan-Meier生存分析显示,ESPL1高表达的卵巢癌患者总生存时间明显短于ESPL1低表达者,且临床I+II期患者总生存期较短(P<0.05),其它期别及病理分级的患者预后无差异;应用多西他赛单药组中,ESPL1高表达组较低表达组总生存期下降,有显著差异(P<0.05),而在铂类、紫杉醇、泰素、吉西他滨、拓扑替康单药治疗的患者中,两组间无显著性差异。结论 ESPL1基因在多种肿瘤组织及卵巢癌组织中高表达;其相互作用的网络蛋白主要富集在细胞周期信号通路;高表达ESPL1基因的卵巢癌患者预后差,特别是早期卵巢癌患者,化疗药物不宜选择多西他赛。该基因也许可作为卵巢癌预后及一线化疗药物选择潜在参考指标。 展开更多
关键词 ESPL1 卵巢癌 GEPIA kaplan-meier plotter
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CDH1受幽门螺杆菌感染调控及其在胃癌组织中表达分析 被引量:7
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作者 陈定宇 何小凤 +6 位作者 程薇 全欣莹 张瑜 赵艳 王琴容 周建奖 谢渊 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2022年第3期412-417,共6页
目的探究幽门螺杆菌(Hp)对E-钙黏蛋白(CDH1)表达的影响及CDH1在胃癌(GC)组织中的表达情况,为进一步探索CDH1在Hp引起胃癌中的作用提供理论基础。方法用Hp灌胃蒙古沙鼠,3、12、24个月后分别取其胃组织,进行免疫组化染色检测CDH1的表达;H... 目的探究幽门螺杆菌(Hp)对E-钙黏蛋白(CDH1)表达的影响及CDH1在胃癌(GC)组织中的表达情况,为进一步探索CDH1在Hp引起胃癌中的作用提供理论基础。方法用Hp灌胃蒙古沙鼠,3、12、24个月后分别取其胃组织,进行免疫组化染色检测CDH1的表达;Hp感染胃上皮细胞AGS,24 h后收集样本,Western blot检测各组CDH1的表达。通过TCGA和Kaplan-Meier Plotter数据库比较胃癌组织和癌旁组织中CDH1的表达差异及CDH1与胃癌的预后分析;通过R语言对CDH1基因进行KEGG富集分析;另收集胃癌组织和癌旁组织标本各10例,免疫组化染色检测CDH1的表达。结果Hp灌胃蒙古沙鼠胃组织免疫组化染色结果显示,Hp感染3、12、24个月胃组织CDH1阳性率分别为13.70%、13.20%、22.90%,对照组阳性率分别为0.04%、4.50%、4.77%,差异有统计学意义(P<0.05);与对照组比较,Hp感染AGS细胞组CDH1蛋白表达增高,差异有统计学意义(P<0.05);TCGA胃癌数据库中共收集449例具有临床病理参数的病例及其对应的CDH1 mRNA表达量,癌旁组织中CDH1 mRNA表达水平(76.36±0.48)显著低于胃癌组织中CDH1 mRNA的表达水平(147.59±0.11),差异有统计学意义(P<0.05);Kaplan-Meier Plotter数据库分析表明胃癌CDH1高表达时,生存率降低(P<0.05);KEGG富集显示CDH1表达与胃癌、甲状腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌、黑色素瘤等肿瘤相关,功能显著富集到细菌侵袭上皮细胞和黏附连接,通路显著富集到Apelin信号通路、Hippo信号通路和Rap1信号通路等;CDH1阳性率在人胃癌组织为76.27%,高于癌旁组织45.68%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论Hp感染引起CDH1表达水平升高,可能是Hp引起胃癌的原因之一。 展开更多
关键词 E-钙黏蛋白 幽门螺杆菌 TCGA kaplan-meier plotter KEGG 胃癌
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卵巢上皮性癌组织中长链非编码RNA PURPL的表达及其意义 被引量:2
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作者 何婷婷 张瑞涛 +4 位作者 史惠蓉 曹媛 冯巍 王文文 张微微 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2021年第19期979-982,共4页
目的:检测长链非编码RNA PURPL(p53 upregulated regulator of p53 levels)在卵巢上皮性癌(epithelial ovarian cancer,EOC)组织中的表达情况,探讨其在卵巢癌发生发展中的作用。方法:选用开放医学数据库lncRNASNP2、GEPIA和Kaplan-Meier... 目的:检测长链非编码RNA PURPL(p53 upregulated regulator of p53 levels)在卵巢上皮性癌(epithelial ovarian cancer,EOC)组织中的表达情况,探讨其在卵巢癌发生发展中的作用。方法:选用开放医学数据库lncRNASNP2、GEPIA和Kaplan-Meier Plotter检索PURPL在EOC组织中的表达及其与预后的关系。收集2012年10月至2015年10月郑州大学第一附属医院105例患者的临床病理资料,其中包括正常卵巢组织20例、良性卵巢上皮性肿瘤组织20例、EOC组织65例,采用实时荧光定量PCR检测上述不同卵巢组织中的PURPL表达情况,分析EOC组织中PURPL表达与EOC临床病理指标的关系,Kaplan-Meier法分析PURPL表达对EOC患者生存的影响。结果:数据库检索显示,EOC组织中PURPL的表达显著高于正常卵巢组织,PURPL表达升高与EOC患者的总生存(overall survival,OS)率和无复发生存期(recurrence-free survival,RFS)缩短相关。实时荧光定量PCR检测显示,晚期EOC组织中的PURPL表达为0.530±0.004,显著高于正常卵巢组织的0.029±0.001、良性卵巢上皮性肿瘤组织的0.135±0.001和早期EOC组织的0.488±0.006的表达(P<0.0001)。临床分期越晚(χ2=10.785,P=0.001)、有淋巴结转移(χ2=4.481,P=0.034)的EOC组织中的PURPL高表达。PURPL表达水平相对较高的EOC患者的OS和RFS,明显短于PURPL表达水平相对较低的患者(P<0.05)。结论:PURPL高表达提示EOC患者预后不良,可作为EOC预后监测的潜在标记物。 展开更多
关键词 卵巢上皮性癌 医学数据库lncRNASNP2 GEPIA数据 kaplan-meier plotter数据库 PURPL预后
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基于数据挖掘分析ONECUT2基因在胃癌的表达及与幽门螺杆菌感染的相关性 被引量:4
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作者 米阳 刘斌 +5 位作者 任飞飞 黄煌 梅璐 于泳 汤有才 郑鹏远 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2020年第5期527-532,共6页
目的分析ONECUT2基因在胃癌中的表达及其与幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染的相关性。方法(1)利用Oncomine数据库、TCGA数据库分析ONECUT2基因在胃癌中的表达,R软件包进行基因的共聚类微阵列数据分析。(2)利用Kaplan-Meie... 目的分析ONECUT2基因在胃癌中的表达及其与幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染的相关性。方法(1)利用Oncomine数据库、TCGA数据库分析ONECUT2基因在胃癌中的表达,R软件包进行基因的共聚类微阵列数据分析。(2)利用Kaplan-Meier Plotter数据库和GEPIA数据库分析ONECUT2差异表达与胃癌患者预后的关系。(3)利用生物信息学功能注释数据平台DAVID对胃癌中与ONECUT2基因表达正相关的前200个基因进行功能富集分析。(4)利用GEO数据库中的数据分析H.pylori感染与ONECUT2表达的相关性。结果(1)Oncomine数据库中的数据在胃癌、膀胱癌等8种肿瘤中共有14项研究显示ONECUT2基因在肿瘤组织中的高表达;其中胃癌相关的有两项(t=6.064,P<0.0001;t=4.335,P<0.0001);TCGA数据库的数据也证实胃癌中ONECUT2高表达(t=6.680,P<0.001)。(2)胃癌中ONECUT2与EHF、FUT6、TNFRSF11A、RSAEF、EPCAM等20个基因有较高的共表达。(3)GO分析发现胃癌中ONECUT2富集在分子结构活性等相关的基因功能上;而KEGG富集分析发现ONECUT2富集于紧密连接功能等6个通路。(4)Kaplan-Meier Plotter数据库中207676-at芯片结果显示ONECUT2高表达组患者远期生存率下降(P<0.001);GEPIA数据库中的分析结果同样显示ONECUT2高表达组患者其总体生存率(P<0.05)和无病生存率(P<0.01)下降。GEO数据库中GSE74577(P=0.005)、GSE70394(P=0.034)和GSE25146(P=0.036)三个数据集均显示H.pylori感染AGS和GES-1细胞系后ONECUT2表达上调。结论ONECUT2在胃癌中高表达,且与胃癌一类致癌原H.pylori感染相关。ONECUT2高表达组患者远期生存率下降,表明其与胃癌发生发展密切相关,可能成为胃癌治疗的新靶点。 展开更多
关键词 ONECUT2 胃癌 Oncomine K-M plotter GEO数据库 幽门螺杆菌感染
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ATAD2在卵巢癌中表达及意义的现状分析 被引量:2
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作者 韩迎燕 王志 +3 位作者 孙书娟 吴娟子 吴鹏 刘佳 《中国妇幼保健》 CAS 2017年第19期4887-4889,共3页
目的研究ATAD2在卵巢癌中的表达及预后评判价值。方法首先,通过Oncomine数据库探索ATAD2在卵巢癌中的表达变化;其次,应用在线数据库及分析工具"the KaplanM eier plotter"(KM plotter)数据库探索ATAD2在卵巢癌中的预后评判价... 目的研究ATAD2在卵巢癌中的表达及预后评判价值。方法首先,通过Oncomine数据库探索ATAD2在卵巢癌中的表达变化;其次,应用在线数据库及分析工具"the KaplanM eier plotter"(KM plotter)数据库探索ATAD2在卵巢癌中的预后评判价值。结果 Oncomine数据库中共有391个涉及不同种类类型肿瘤的研究结果。其中有75个研究结果关于ATAD2表达差异有统计学意义(P<0.05),70个研究结果显示ATAD2的表达增高,5个研究结果显示ATAD2的表达降低。共有两个研究涉及ATAD2在卵巢癌和正常组织中的表达,共647个样本,显示ATAD2在卵巢癌中的表达较正常组织明显增高。另外,KM plotter数据库的分析显示ATAD2mRNA水平与卵巢癌患者的总生存期以及无进展生存期成负相关。结论 ATAD2 mRNA水平在卵巢癌组织中明显增高,并且是卵巢癌的危险因素,其水平越高预后越差。 展开更多
关键词 卵巢癌 预后 Oncomine数据库 KM plotter数据库 ATAD2
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Rho GTP酶结合蛋白2基因表达与卵巢癌的预后关系及机制分析 被引量:3
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作者 黄丹 周航 郑建清 《中外医学研究》 2019年第19期152-153,共2页
目的:探讨卵巢癌组织Rho GTP酶结合蛋白2(RHPN2)表达变化与卵巢癌预后的关系。方法:用Kaplan-Meier plotter数据库分析卵巢癌组织和正常组织中RHPN2基因表达的差异,并分析不同RHPN2基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索RHPN2基因表达... 目的:探讨卵巢癌组织Rho GTP酶结合蛋白2(RHPN2)表达变化与卵巢癌预后的关系。方法:用Kaplan-Meier plotter数据库分析卵巢癌组织和正常组织中RHPN2基因表达的差异,并分析不同RHPN2基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索RHPN2基因表达的预后价值。结果:Kaplan-Meier plotter数据库包含了1 653个病例样本。数据分析结果显示正常卵巢组织中RHPN2基因低表达,卵巢癌组织中RHPN2基因高表达。根据预设的截断值,308例为高表达组,347例患者为低表达。RHPN2基因低表达组卵巢癌中位总生存时间为52.03个月,高表达组为35.53个月,差异有统计学意义[风险比(HR)=1.47,95%CI(1.2,1.8),P=0.001]。结论:RHPN2基因高表达是降低卵巢癌总生存的不良预后因素。 展开更多
关键词 卵巢癌 RHPN2 KAPLAN Meier plotter数据库 生存分析 预后因素
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