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绵羊KIAA2012与UTP20多态、胴体品质性状关联与生物信息学分析
被引量:
1
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作者
郭思武
储明星
刘玉芳
《畜牧与兽医》
北大核心
2022年第3期1-10,共10页
为探究KIAA2012和UTP20多态性与胸椎数间的关联性,筛选胸椎数相关重要分子标记,利用Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊中与胸椎数相关候选基因KIAA2012和UTP20的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与...
为探究KIAA2012和UTP20多态性与胸椎数间的关联性,筛选胸椎数相关重要分子标记,利用Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊中与胸椎数相关候选基因KIAA2012和UTP20的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与胸椎数进行关联分析;利用生物信息学分析工具对KIAA2012和UTP20的遗传特征进行分析。结果表明,UTP20 g.170058254G>A位点在苏尼特羊群体中突变型(GA)胸椎数显著(P<0.05)高于野生型(GG),g.170053888G>A和g.170072471G>A在小尾寒羊和苏尼特羊中均与胸椎数没有显著相关;KIAA2012 g.203440537A>G、g.203424302A>G、g.203440384A>T在小尾寒羊和苏尼特羊中与胸椎数均没有显著相关(P>0.05)。SNPs与胴体长度分析结果表明,在小尾寒羊KIAA2012 g.203440537A>G中,突变型(GA)胴体长度显著(P<0.05)高于野生型(GG)。生物信息学分析表明,KIAA2012为亲水蛋白,UTP20为疏水蛋白,两者蛋白结构均不稳定,无跨膜结构域。综上所述,UTP20 g.170058254G>A位点与苏尼特羊胸椎数性状显著相关,KIAA2012 g.203440537A>G与小尾寒羊胴体长度性状显著相关,可作为调控绵羊胸椎数变异潜在的分子辅助标记。
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关键词
kiaa2012
UTP20
SNPS
胸椎数
绵羊
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职称材料
题名
绵羊KIAA2012与UTP20多态、胴体品质性状关联与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
郭思武
储明星
刘玉芳
机构
河北工程大学生命科学与食品工程学院
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/农业农村部动物遗传育种与繁殖重点实验室
出处
《畜牧与兽医》
北大核心
2022年第3期1-10,共10页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2017ywf-zd-13)
河北省自然科学基金青年项目(C2019402261)
+1 种基金
国家肉羊产业技术体系专项(CARS-38)
中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ZDRW202106和ASTIP-IAS13)。
文摘
为探究KIAA2012和UTP20多态性与胸椎数间的关联性,筛选胸椎数相关重要分子标记,利用Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊中与胸椎数相关候选基因KIAA2012和UTP20的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与胸椎数进行关联分析;利用生物信息学分析工具对KIAA2012和UTP20的遗传特征进行分析。结果表明,UTP20 g.170058254G>A位点在苏尼特羊群体中突变型(GA)胸椎数显著(P<0.05)高于野生型(GG),g.170053888G>A和g.170072471G>A在小尾寒羊和苏尼特羊中均与胸椎数没有显著相关;KIAA2012 g.203440537A>G、g.203424302A>G、g.203440384A>T在小尾寒羊和苏尼特羊中与胸椎数均没有显著相关(P>0.05)。SNPs与胴体长度分析结果表明,在小尾寒羊KIAA2012 g.203440537A>G中,突变型(GA)胴体长度显著(P<0.05)高于野生型(GG)。生物信息学分析表明,KIAA2012为亲水蛋白,UTP20为疏水蛋白,两者蛋白结构均不稳定,无跨膜结构域。综上所述,UTP20 g.170058254G>A位点与苏尼特羊胸椎数性状显著相关,KIAA2012 g.203440537A>G与小尾寒羊胴体长度性状显著相关,可作为调控绵羊胸椎数变异潜在的分子辅助标记。
关键词
kiaa2012
UTP20
SNPS
胸椎数
绵羊
Keywords
kiaa2012
UTP20
SNPs
thoracic vertebrae number
sheep
分类号
S826 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
绵羊KIAA2012与UTP20多态、胴体品质性状关联与生物信息学分析
郭思武
储明星
刘玉芳
《畜牧与兽医》
北大核心
2022
1
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