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kdm4A在斑马鱼细胞低温胁迫过程中的作用 被引量:2
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作者 刘玮 罗军涛 +3 位作者 谢婷婷 燕晓霞 张俊芳 韩兵社 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期4467-4474,共8页
赖氨酸特异性去甲基化酶4A基因(lysine demethylase 4A,kdm4A)编码的蛋白具有去甲基化酶活性,并且在基因表达调控中起重要作用。该基因在斑马鱼中有两种类型kdm4aa和kdm4ab。本实验室前期对18℃低温胁迫下斑马鱼(Danio rerio)胚胎成纤... 赖氨酸特异性去甲基化酶4A基因(lysine demethylase 4A,kdm4A)编码的蛋白具有去甲基化酶活性,并且在基因表达调控中起重要作用。该基因在斑马鱼中有两种类型kdm4aa和kdm4ab。本实验室前期对18℃低温胁迫下斑马鱼(Danio rerio)胚胎成纤维样细胞(zebrafish embryos fibroblast like cell line,ZF4)的转录组数据分析发现kdm4aa表达量显著降低,但是该基因在鱼类低温胁迫下的作用仍不清楚。为了研究这两种基因在鱼类低温胁迫下的功能,本研究用EcoRⅠ和AgeⅠ酶切构建了pLKO.1-kdm4aa-shRNA、pLKO.1-kdm4ab-shRNA和pLKO.1-negative control(nc)三种重组质粒,并分别与慢病毒包装质粒pCMV-DR8.9.1、pCMV-VSVG共同转染至293T细胞中,经293T细胞包装的病毒,感染斑马鱼ZF4细胞,RT-qPCR检测表明ZF4细胞中kdm4aa和kdm4ab均成功被敲降。随后将细胞于28℃培养(Control)或经18℃低温处理1 d,使用台盼蓝染色法检测ZF4细胞存活率,并进一步检测了细胞内自噬相关基因beclin1和LC3的表达情况。结果显示:在18℃条件下,敲降kdm4aa的细胞与nc组细胞相比存活率显著上升(p<0.05),而敲降kdm4ab的细胞存活率与nc组相比无明显变化,证明敲降kdm4aa在低温胁迫下保护细胞。进一步的研究发现,敲降kdm4aa的细胞内自噬相关基因beclin1及LC3的表达量均显著上调,而敲降kdm4ab的细胞变化不显著,提示敲降kdm4aa在低温胁迫下对斑马鱼细胞的保护作用可能是通过上调自噬水平引起的。该研究为后期斑马鱼低温胁迫分子机制的研究提供新的思路。 展开更多
关键词 kdm4aa kdm4ab 存活率 ZF4 细胞 低温胁迫 自噬
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KDM4A在儿童和成人甲状腺乳头状癌中的表达及诊断价值 被引量:1
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作者 金雅琼 冯林 +11 位作者 初平 张杰 邰隽 韩阳 王生才 耿江桥 洪恩宇 韩书婧 于永波 鲁洁 倪鑫 郭永丽 《肿瘤学杂志》 CAS 2016年第10期838-843,共6页
[目的]探讨KDM4A在儿童和成人甲状腺乳头状癌中的表达及诊断价值。[方法]采用实时荧光定量PCR的方法进行组织KDM4A表达检测,其中甲状腺乳头状癌组织样本22例,癌旁组织样本13例(配对样本共13对)。其中,儿童甲状腺乳头状癌样本10例,癌旁组... [目的]探讨KDM4A在儿童和成人甲状腺乳头状癌中的表达及诊断价值。[方法]采用实时荧光定量PCR的方法进行组织KDM4A表达检测,其中甲状腺乳头状癌组织样本22例,癌旁组织样本13例(配对样本共13对)。其中,儿童甲状腺乳头状癌样本10例,癌旁组织3例(配对样本3对);成人甲状腺乳头状癌标本12例,癌旁组织10例(配对样本10对)。并采用受试者工作特征(ROC)曲线对其诊断价值进行评估。[结果]甲状腺乳头状癌组织较配对癌旁组织中KDM4A表达显著增高(P=0.011),非配对比较甲状腺乳头状癌组织较癌旁组织中KDM4A表达显著增高(P=0.027);KDM4A诊断PTC的ROC曲线下面积指数为0.794(P=0.004)(Youden指数0.538);儿童甲状腺乳头状癌中KDM4A表达略高于成人(P>0.05),且儿童甲状腺乳头状癌标本中KDM4A的ROC曲线下面积指数为0.831(P=0.007)(Youden指数0.615),高于成人标本的0.763,P=0.026(Youden指数0.538)。[结论 ]KDM4A表达在甲状腺乳头状癌中显著高于癌旁组织,并明确了KDM4A具有诊断价值。此外,本研究还明确了KDM4A作为分子标志物在儿童甲状腺乳头状癌中的诊断价值高于成人。 展开更多
关键词 kdm4a 甲状腺肿瘤 受试者工作特征曲线
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KDM4A调控肝癌细胞增殖机制 被引量:1
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作者 孙黎 戴宇翃 +1 位作者 邹曼 邱红 《医药导报》 CAS 北大核心 2019年第7期856-859,共4页
目的探讨组蛋白赖氨酸去甲基化酶KDM4A(JMJD2A)调控肝癌细胞增殖的作用及机制。方法293T细胞中包装慢病毒(Lenti-shKDM4A#1,Lenti-shKDM4A#2,Lenti-shctr,Lenti-HA-Myr-AKT,Lenti-HA-vector)。在肝癌细胞系Hep3B中建立KDM4A稳定低表达... 目的探讨组蛋白赖氨酸去甲基化酶KDM4A(JMJD2A)调控肝癌细胞增殖的作用及机制。方法293T细胞中包装慢病毒(Lenti-shKDM4A#1,Lenti-shKDM4A#2,Lenti-shctr,Lenti-HA-Myr-AKT,Lenti-HA-vector)。在肝癌细胞系Hep3B中建立KDM4A稳定低表达细胞系及对照细胞系。克隆形成实验检测KDM4A低表达之后细胞增殖状况变化。WesternBlot分析KDM4A对AKT通路激活的影响;通过在KDM4A低表达细胞中稳定表达Myr-AKT,观察AKT信号"Rescue"后细胞生长状态,确定KDM4A依赖于Akt调节肝癌细胞增殖。结果两个KDM4A低表达Hep3B细胞系shKDM4A#1(P<0.01)和shKDM4A#2(P<0.001)克隆形成数目较对照组明显减少。KDM4A低表达后AKT磷酸化水平降低,AKT下游信号P-GSK-3b(ser9)蛋白表达水平显著下降。而在shKDM4A低表达细胞中表达Myr-AKT能够逆转KDM4A对Hep3B细胞增殖的影响。结论KDM4A能够通过激活AKT调控肝癌细胞增殖。 展开更多
关键词 kdm4a(JMJD2A) 肝癌 AKT GSK-3b
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牦牛KDM4A基因克隆、组织表达谱及其在卵母细胞和颗粒细胞中的表达 被引量:6
4
作者 韩杰 熊显荣 +4 位作者 蔡雯祎 杨显英 阿果约达 张燕红 李键 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期291-299,共9页
本研究旨在阐明牦牛KDM4A基因的表达特性及其在牦牛卵母细胞和颗粒细胞中的作用。采集牦牛心、肝、脾、卵巢、肺、肾、睾丸、小肠、子宫、胃、大脑组织,以GenBank上已发布的黄牛KDM4A基因序列设计引物,利用RT-PCR方法扩增克隆牦牛KDM4A... 本研究旨在阐明牦牛KDM4A基因的表达特性及其在牦牛卵母细胞和颗粒细胞中的作用。采集牦牛心、肝、脾、卵巢、肺、肾、睾丸、小肠、子宫、胃、大脑组织,以GenBank上已发布的黄牛KDM4A基因序列设计引物,利用RT-PCR方法扩增克隆牦牛KDM4A基因及检测其在牦牛各组织中的表达谱,并使用在线软件ExPASY分析KDM4A基因的结构和功能。采用实时荧光定量PCR法检测牦牛不同时期卵母细胞和颗粒细胞中KDM4A基因的表达水平。结果表明,本研究克隆得到牦牛KDM4A基因3 289bp的cDNA序列。牦牛KDM4A核苷酸序列与其它哺乳动物的遗传距离较近,表明KDM4A基因在进化中较为保守。牦牛KDM4A基因CDs区为3 201bp,编码1 066个氨基酸残基,相对分子质量122.48ku。KDM4A蛋白为亲水不稳定的酸性蛋白,无跨膜区和信号肽,二级结构主要包含α-螺旋和无规卷曲,与三级结构分析结果一致。KDM4A基因在所选牦牛组织样本中均有表达,其中在卵巢、脾和睾丸中表达量最高。牦牛KDM4A mRNA在MII期颗粒细胞中表达量显著高于在MI期和GV期颗粒细胞中的表达量(P<0.05),GV期卵母细胞中,KDM4A mRNA的表达水平显著高于在MI期和MII期卵母细胞中的表达量(P<0.05)。综上表明,本研究成功克隆了KDM4A基因及其在牦牛卵母细胞和颗粒细胞成熟过程中mRNA表达水平的差异,表明KDM4A基因在卵母细胞及颗粒细胞成熟过程中发挥一定作用。 展开更多
关键词 牦牛 kdm4a 生物信息学 卵母细胞 颗粒细胞
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KDM4A的结构、功能及其在肿瘤中作用的研究进展 被引量:2
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作者 季涛 燕晓霞 +1 位作者 韩兵社 张俊芳 《生命科学》 CSCD 北大核心 2021年第6期742-751,共10页
组蛋白甲基化是一种重要的表观遗传修饰,而赖氨酸特异性去甲基化酶4A(KDM4A,也称JMJD2A)能特异性催化组蛋白赖氨酸残基的去甲基化过程,从而调节染色质的结构和基因转录。近年来研究发现,KDM4A参与调控了细胞增殖、分化、发育、代谢等多... 组蛋白甲基化是一种重要的表观遗传修饰,而赖氨酸特异性去甲基化酶4A(KDM4A,也称JMJD2A)能特异性催化组蛋白赖氨酸残基的去甲基化过程,从而调节染色质的结构和基因转录。近年来研究发现,KDM4A参与调控了细胞增殖、分化、发育、代谢等多种重要的生物学进程,其功能异常也和肿瘤等疾病的发生发展密切相关,成为未来肿瘤治疗的重要靶点。KDM4A在肿瘤中的作用是目前的研究热点,该文就KDM4A的结构、作用机制、生物学功能、在肿瘤中作用及抑制剂开发的最新研究进展作一综述。 展开更多
关键词 组蛋白去甲基化 kdm4a 发育 肿瘤
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沼泽型水牛KDM4A(JMJD2A)基因克隆分析与表达模式
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作者 许洁 赵鑫 +7 位作者 俸云 史鹏飞 邓凯 沈朋雷 文冬梅 王露露 石德顺 陆凤花 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2386-2391,共6页
旨在克隆并分析水牛赖氨酸特异性去甲基化酶4A(lysine-specific demethylase 4A,KDM4A)基因,并检测其在水牛不同组织中的表达情况,探讨KDM4A在水牛胚胎发育过程中的功能。提取卵巢组织的RNA,获得水牛KDM4A基因CDS区的全长序列。结果显示... 旨在克隆并分析水牛赖氨酸特异性去甲基化酶4A(lysine-specific demethylase 4A,KDM4A)基因,并检测其在水牛不同组织中的表达情况,探讨KDM4A在水牛胚胎发育过程中的功能。提取卵巢组织的RNA,获得水牛KDM4A基因CDS区的全长序列。结果显示,水牛KDM4A基因编码区全长3151bp,编码1067个氨基酸。水牛KDM4A基因与黄牛、绵羊、骆驼和家犬的同源性分别为99%,97%,92%,91%;且在不同物种间高度保守,符合生物的进化规律。KDM4A蛋白包含369个α-螺旋,85个β-转角,409个无规卷曲和204个延伸链,为亲水不稳定的酸性蛋白。qRT-PCR结果显示,KDM4A在水牛肌肉、肺脏、卵巢、大脑、皮肤、心脏、脾脏、肾脏和肝脏组织中均有表达,其中肌肉、肺脏、卵巢中表达量较高,肝脏和肾脏中表达量较低。本研究克隆得到了沼泽型水牛KDM4A基因,并对不同组织内KDM4A进行了基础的生物信息学分析,为阐明KDM4A在水牛胚胎发育过程中的功能,提高水牛胚胎发育水平提供理论基础。 展开更多
关键词 水牛 kdm4a 组蛋白修饰 克隆分析 胚胎发育
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斑马鱼中kdm4aa基因对低温耐受能力的影响
7
作者 张瑶 罗军涛 +3 位作者 张梦冉 韩丽洁 韩兵社 张俊芳 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期91-99,共9页
为了研究赖氨酸特异性去甲基化酶4aa(lysine demethylase 4aa,kdm4aa)在斑马鱼(Danio rerio)低温耐受能力中的作用,本研究通过实时定量PCR检测kdm4aa^(-/-)斑马鱼中kdm4其他家族成员的表达水平和低温处理后野生型(wild type,WT)斑马鱼中... 为了研究赖氨酸特异性去甲基化酶4aa(lysine demethylase 4aa,kdm4aa)在斑马鱼(Danio rerio)低温耐受能力中的作用,本研究通过实时定量PCR检测kdm4aa^(-/-)斑马鱼中kdm4其他家族成员的表达水平和低温处理后野生型(wild type,WT)斑马鱼中kdm4aa基因的表达水平;通过斑马鱼行为轨迹跟踪系统检测低温下kdm4aa^(-/-)幼鱼的运动能力;采用逐级降温方法检测kdm4aa^(-/-)斑马鱼低温耐受能力;通过DCFH-DA荧光探针、ATP检测试剂盒、Western blot检测低温下kdm4aa^(-/-)斑马鱼中活性氧(reactive oxygen species,ROS)、腺苷三磷酸(adenosine triphosphate,ATP)、磷酸化组蛋白H2A.X(gamma histone H2A.X,γH2A.X)和微管相关蛋白1轻链3(microtubule-associated protein 1 light chain 3,LC3)水平。实时定量PCR结果显示,kdm4aa^(-/-)斑马鱼中kdm4ab、kdm4b基因的mRNA水平补偿性增加,kdm4c基因的mRNA水平与野生型斑马鱼的相比无显著性差异。斑马鱼行为轨迹跟踪系统检测发现,在18℃低温下,kdm4aa基因失活后斑马鱼幼鱼的移动距离显著增加。8℃低温下,野生型斑马鱼中kdm4aa基因的mRNA水平显著升高。与野生型斑马鱼相比,低温处理后kdm4aa^(-/-)斑马鱼的半数致死时间LT50显著降低(P<0.0001);ROS水平显著升高(P<0.0001);ATP含量显著降低(P<0.01);γH2A.X蛋白水平上升;LC3蛋白水平下降。结果表明:在低温环境下,kdm4aa^(-/-)斑马鱼的ROS积累导致ATP合成能力降低和DNA损伤增加,同时kdm4aa^(-/-)斑马鱼自噬能力降低,从而使斑马鱼的低温耐受能力降低。 展开更多
关键词 kdm4aa基因 斑马鱼 低温耐受 DNA损伤
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敲除kdm4ab对斑马鱼低温耐受能力的影响
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作者 张梦冉 罗军涛 +2 位作者 张瑶 韩兵社 张俊芳 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期67-73,共7页
为深入研究kdm4ab基因在鱼类低温胁迫下的作用,以斑马鱼(Danio rerio)为模式生物,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建kdm4ab^(-/-)斑马鱼品系。RT-qPCR结果显示,与WT斑马鱼相比,kdm4ab^(-/-)斑马鱼的kdm4ab mRNA表达量显著下调(P<0.000... 为深入研究kdm4ab基因在鱼类低温胁迫下的作用,以斑马鱼(Danio rerio)为模式生物,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建kdm4ab^(-/-)斑马鱼品系。RT-qPCR结果显示,与WT斑马鱼相比,kdm4ab^(-/-)斑马鱼的kdm4ab mRNA表达量显著下调(P<0.000 1),而kdm4c的mRNA表达量补偿性增加(P<0.05)。斑马鱼行为轨迹跟踪系统检测发现,18℃低温下kdm4ab^(-/-)斑马鱼幼鱼的最大加速度显著降低(P<0.05)。8℃低温下kdm4ab^(-/-)斑马鱼的半数致死时间(LT50)显著低于WT斑马鱼(P<0.000 1);低温处理后kdm4ab^(-/-)斑马鱼的γH2A.X表达量明显增加,ROS水平升高,即DNA损伤增强。研究表明,敲除kdm4ab基因降低了低温下斑马鱼的耐受能力及运动能力,这为鱼类的低温耐受机制研究提供新思路。 展开更多
关键词 kdm4ab 斑马鱼 CRISPR/Cas9 低温
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口腔鳞癌组织中KDM4A表达与患者临床病理参数和预后的关系 被引量:2
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作者 何海蕾 严俊峰 +1 位作者 王羽 刘建伟 《山东医药》 CAS 2018年第29期8-11,共4页
目的探讨口腔鳞癌组织中组蛋白赖氨酸去甲基化酶4A(KDM4A)的表达变化及其与患者临床病理参数和预后的关系。方法选取110例口腔鳞癌患者的癌组织,并取其中21例患者的癌旁正常口腔黏膜组织(距离癌组织>5 cm)作为对照,免疫组化法检测样... 目的探讨口腔鳞癌组织中组蛋白赖氨酸去甲基化酶4A(KDM4A)的表达变化及其与患者临床病理参数和预后的关系。方法选取110例口腔鳞癌患者的癌组织,并取其中21例患者的癌旁正常口腔黏膜组织(距离癌组织>5 cm)作为对照,免疫组化法检测样本组织中KDM4A蛋白表达。采用Kaplan-Meier生存曲线进行预后评估。分析口腔鳞癌组织中KDM4A表达与患者临床病理参数、预后的关系。结果口腔鳞癌组织中KDM4A表达水平较癌旁正常口腔黏膜组织升高(P<0.05)。口腔鳞癌组织中KDM4A表达与患者的性别、年龄、吸烟史、饮酒史和肿瘤组织分化程度均无关(P均>0.05),与TNM分期和是否发生淋巴结转移密切相关(P均<0.05)。与KDM4A表达阳性组比较,KDM4A表达阴性组患者生存率高、生存时间长(P均<0.05)。结论 KDM4A在口腔鳞癌组织中异常高表达,其与患者的TNM分期、淋巴结转移及预后有关。 展开更多
关键词 口腔鳞癌 组蛋白赖氨酸去甲基化酶4A 临床病理参数 预后
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kdm4aa is required for reproduction and development of zebrafish 被引量:2
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作者 Lijie Han Juntao Luo +3 位作者 Songya Qu Xueling Shi Junfang Zhang Bingshe Han 《Aquaculture and Fisheries》 CSCD 2023年第6期713-719,共7页
Lysine-specific demethylase 4A(KDM4A)catalyzes demethylation of histone lysine residues,which regulates chromatin state and transcription.In drosophila and mice,KDM4A plays an important role in multiple biological pro... Lysine-specific demethylase 4A(KDM4A)catalyzes demethylation of histone lysine residues,which regulates chromatin state and transcription.In drosophila and mice,KDM4A plays an important role in multiple biological processes including development,aging,metabolism,and immunity,however the functions of KDM4A in fish are still unclear.There are two copies of the kdm4a gene in zebrafish,namely kdm4aa and kdm4ab,kdm4aa was edited using CRISPR/Cas9 technology in the present study,then homozygous kdm4aa mutants(kdm4aa^(-/-)􀀀)were obtained,and loss of kdm4aa was confirmed by sequencing and increased H3K9me3.Whole-mount in situ hybridization showed that kdm4aa is widely expressed during the embryonic development of zebrafish.Compared with WT zebrafish,kdm4aa^(-/-)􀀀zebrafish showed no significant difference in gamete formation and fertilization,but the survival rate of kdm4aa^(-/-)􀀀embryos dramatically reduced to 21%at 26 hpf.Further observation showed that about 80%of survived kdm4aa^(-/-)􀀀zebrafish experienced disruption in stripe formation,and 10%of survived kdm4aa^(-/-)􀀀zebrafish underwent vertebral malformation.Alizarin red S staining demonstrated the abnormal spinal development in kdm4aa^(-/-)􀀀zebrafish.These results indicated that kdm4aa is required for normal embryonic development of zebrafish,loss of kdm4aa function leads to decreased survival during the early stages of zebrafish development and morphological variation in adult zebrafish. 展开更多
关键词 kdm4aa CRISPR/Cas9 ZEBRAFISH DEVELOPMENT
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脲基琥珀酸缓解小鼠肥胖引起非酒精脂肪肝的作用机制
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作者 孙畅 王雨薇 +4 位作者 齐心语 张若馨 李一凡 孙武平 周磊 《南方农业学报》 北大核心 2025年第4期1268-1279,共12页
【目的】探究脲基琥珀酸在体外与生物体内调节脂质及能量代谢的功效,明确其对非酒精脂肪肝的影响及潜在机制,为脲基琥珀酸在防治非酒精脂肪肝方面的应用提供理论依据。【方法】使用油酸/棕榈酸(OA/PA)诱导的HepG2细胞为细胞模型,从细胞... 【目的】探究脲基琥珀酸在体外与生物体内调节脂质及能量代谢的功效,明确其对非酒精脂肪肝的影响及潜在机制,为脲基琥珀酸在防治非酒精脂肪肝方面的应用提供理论依据。【方法】使用油酸/棕榈酸(OA/PA)诱导的HepG2细胞为细胞模型,从细胞氧化应激、线粒体ATP含量和线粒体荧光强度3个层面验证脲基琥珀酸在细胞水平缓解非酒精脂肪肝的作用;以高脂饮食(HFD)饲喂的C57BL/6雄性小鼠为生物模型,通过测量小鼠体重、肝脏重量、甘油三酯(TG)含量、总胆固醇(TC)含量,制作肝脏组织切片,以及实时荧光定量PCR检测脂肪肝相关基因表达变化,进一步验证脲基琥珀酸在生物体内缓解非酒精脂肪肝的功效;同时采用反向找靶和分子对接技术筛选脲基琥珀酸缓解脂肪肝的潜在靶点。【结果】100μmol/L脲基琥珀酸能有效降低诱导HepG2细胞内的TG积累,极显著抑制脂肪沉积基因Pparγ基因表达(P<0.01,下同),极显著降低细胞内的ROS水平,同时极显著提高CAT活性,显著提高GSH水平及SOD活性(P<0.05,下同),以及显著提高细胞线粒体DNA(mtDNA)转录水平和ATP含量。在小鼠试验中,100 mg/kg脲基琥珀酸能降低高脂饮食饲喂小鼠的肝脏重量和体重,显著抑制TG和TC在肝脏中的积累,并显著下调Pparγ表达及显著上调促进线粒体生物合成基因Pgc1α表达。组蛋白赖氨酸去甲基化酶4B(KDM4B)可能是脲基琥珀酸缓解非酒精脂肪肝的潜在靶点,其结合能为-78.2345 kJ/mol,结合相互作用能为-77.9353 kJ/mol。【结论】脲基琥珀酸通过减轻与肥胖有关的氧化应激,促进脂质的分解与代谢及改善能量代谢,还可能通过与KDM4B蛋白相互作用,而改善高脂饮食诱导的小鼠非酒精脂肪肝。 展开更多
关键词 小鼠 非酒精脂肪肝 脲基琥珀酸 氧化应激 能量代谢 KDM4B
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Snail基因甲基化与TGFβ1诱导前列腺癌细胞发生EMT的相关性研究 被引量:7
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作者 杜彦丹 牛艺卿 +8 位作者 郑海军 王晓艳 姜玉海 陈海秋 李寅雁 孙刚 李春雨 陆德生 孙辉 《分子诊断与治疗杂志》 2019年第6期451-456,共6页
目的探讨Snail基因甲基化与转化生长因子β1(TGFβ1)诱导前列腺癌细胞上皮间质转化(EMT)过程的相关性。方法TGFβ1诱导前列腺癌PC3、DU145细胞,通过细胞形态、划痕及侵袭实验筛选EMT明显的细胞系;利用Westernblot、RT PCR技术检测该细胞... 目的探讨Snail基因甲基化与转化生长因子β1(TGFβ1)诱导前列腺癌细胞上皮间质转化(EMT)过程的相关性。方法TGFβ1诱导前列腺癌PC3、DU145细胞,通过细胞形态、划痕及侵袭实验筛选EMT明显的细胞系;利用Westernblot、RT PCR技术检测该细胞系EMT时相关Marker表达的变化,确定EMT过程中的决定性转录因子;沉默组蛋白去甲基化酶KDM4A的表达,观察前列腺癌细胞形态学及转录因子Snail表达的变化;收集前列腺良性增生组织(对照组)及Gleason分级四级以上的前列腺癌组织(实验组)各60例,检测Snail、E cadherin和Vimentin的表达。结果细胞形态学变化、划痕及侵袭实验证明TGFβ1诱导后前列腺癌细胞PC3具有明显的迁移及侵袭能力;Westernblot、RT PCR实验表明PC3细胞EMT时E cadherin表达下调,Snail1和Vimentin表达上调,其中Snail1变化最为明显。免疫组化结果显示对照组E cadherin细胞膜表达强阳性,Vimentin、Snail细胞质表达弱阳性;实验组E cadherin细胞膜表达弱阳性,Vimentin、Snail细胞质表达强阳性。沉默KDM4A表达,PC3细胞由间质转变为上皮形态,Snail1表达上调。结论Snail1甲基化富集程度改变与TGFβ1诱导前列腺癌细胞上皮间质转化相关。 展开更多
关键词 前列腺癌 TGFΒ1 上皮间质转化 SNAIL1 kdm4a
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组蛋白去甲基化酶KDM4B促进根尖牙乳头干细胞中成骨和成牙本质分化 被引量:14
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作者 姚睿 范志朋 《北京口腔医学》 CAS 2013年第4期181-184,共4页
目的研究组蛋白去甲基化酶KDM4B对根尖牙乳头干细胞定向分化能力的影响。方法人重组骨形成蛋白4(BMP4)刺激根尖牙乳头干细胞后检测KDM4B的表达;利用慢病毒转染过表达或者基因敲除KDM4B进行获得性或丧失性功能研究。通过检测碱性磷酸酶(A... 目的研究组蛋白去甲基化酶KDM4B对根尖牙乳头干细胞定向分化能力的影响。方法人重组骨形成蛋白4(BMP4)刺激根尖牙乳头干细胞后检测KDM4B的表达;利用慢病毒转染过表达或者基因敲除KDM4B进行获得性或丧失性功能研究。通过检测碱性磷酸酶(ALP)活性、茜素红染色、钙离子定量分析研究根尖牙乳头干细胞体外成骨和成牙本质分化能力。结果 BMP4促进根尖牙乳头干细胞KDM4B的表达。基因敲除KDM4B抑制根尖牙乳头干细胞ALP活性及体外矿化能力、促进转录因子PPAR-gamma的表达。过表达KDM4B增强根尖牙乳头干细胞ALP活性和体外矿化能力。结论组蛋白去甲基化酶KDM4B具有促进根尖牙乳头干细胞成骨和成牙本质分化的潜能。 展开更多
关键词 组蛋白去甲基化酶 根尖牙乳头干细胞 成骨和成牙本质分化 KDM4B
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过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响 被引量:1
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作者 李亚楠 张贤君 +5 位作者 张宁 梁雅琳 张宇星 招华兴 李紫聪 黄思秀 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期67-77,共11页
组蛋白异常修饰是克隆胚胎发育的重要制约因素,组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4家族的过表达可以有效提高克隆胚胎的发育效率。为探究过表达H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响,本研究在猪克隆胚胎1-细胞期和2-细胞期分别注射KDM4A m... 组蛋白异常修饰是克隆胚胎发育的重要制约因素,组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4家族的过表达可以有效提高克隆胚胎的发育效率。为探究过表达H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响,本研究在猪克隆胚胎1-细胞期和2-细胞期分别注射KDM4A mRNA和KDM4D mRNA检测胚胎的囊胚率;收集1-细胞期注射KDM4A mRNA和胚胎注射水(对照组)的2-细胞期克隆胚胎检测H3K9me3表达水平;此外,收集1-细胞期注射KDM4A mRNA和胚胎注射水的4-细胞期克隆胚胎进行单细胞转录组测序,并对测序数据进行GO与KEGG富集分析。结果显示:在1-细胞期注射KDM4A mRNA的猪克隆胚胎囊胚率显著高于对照组(25.32±0.74%vs 14.78±0.87%),注射KDM4D mRNA对猪克隆胚胎囊胚率无明显作用(16.27±0.77%vs 14.78±0.87%);在2-细胞期注射KDM4A mRNA和KDM4D mRNA的克隆胚胎囊胚率与对照组相比均无显著差异(32.18±1.67%、30.04±0.91%vs 31.22±1.40%)。在1-细胞期注射KDM4A mRNA的克隆胚胎组蛋白H3K9me3表达水平低于对照组。通过测序,筛选出133个差异表达基因,其中上调基因52个、下调基因81个,GO分析主要富集到与蛋白质定位相关的通路,KEGG分析富集到细胞衰老和急性髓细胞白血病等相关通路。本研究结果表明,过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4A可以显著提高猪克隆胚胎的发育效率。 展开更多
关键词 克隆胚胎 H3K9me3 kdm4a KDM4D
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PHF20相互作用蛋白质组学分析及其在肿瘤中的作用研究 被引量:1
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作者 孙干成 侯永强 +1 位作者 高杰 邱熔芳 《天津医科大学学报》 2019年第6期563-566,共4页
目的:探究PHF20相互作用蛋白,初步揭示PHF20促进肿瘤发生发展的分子机制。方法:通过免疫亲和纯化联合银染质谱的方法检测PHF20的相互作用蛋白。免疫共沉淀方法对质谱的结果进行验证。在干扰PHF20及对照乳腺癌细胞系中,用EdU和转移小室... 目的:探究PHF20相互作用蛋白,初步揭示PHF20促进肿瘤发生发展的分子机制。方法:通过免疫亲和纯化联合银染质谱的方法检测PHF20的相互作用蛋白。免疫共沉淀方法对质谱的结果进行验证。在干扰PHF20及对照乳腺癌细胞系中,用EdU和转移小室的实验检测PHF20在乳腺癌发生发展中的作用。结果:质谱结果显示,PHF20可以结合KDM4A和PRC2等复合物,免疫共沉淀验证了PHF20与各个复合物之间相互作用的可信性。EdU和转移小室实验表明,干扰PHF20后与对照细胞相比,其增殖和侵袭能力显著降低。结论:PHF20在体内与多种表观遗传调控相关的复合物相互作用,并促进肿瘤细胞增殖和侵袭的能力。 展开更多
关键词 PHF20 kdm4a PRC2 恶性肿瘤
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循环机械牵张对骨髓间充质干细胞成纤维分化的促进作用 被引量:3
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作者 王肖帆 王莹莹 +10 位作者 王君敏 陈璐璐 徐锋 乔艳华 张志磊 任琛琛 胡孟彩 吴惠琰 王鲁文 崔世红 赵冰 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2019年第3期372-377,共6页
目的:研究循环机械牵张(CMS)对骨髓间充质干细胞(BMSCs)体外定向分化为成纤维细胞的作用及可能机制。方法:用0%(对照)、1%、2%、4%、10%的CMS刺激BMSCs,采用Western blot法检测BMSCs中组蛋白去甲基化酶KDM4B及成纤维细胞标志蛋白赖氨酰... 目的:研究循环机械牵张(CMS)对骨髓间充质干细胞(BMSCs)体外定向分化为成纤维细胞的作用及可能机制。方法:用0%(对照)、1%、2%、4%、10%的CMS刺激BMSCs,采用Western blot法检测BMSCs中组蛋白去甲基化酶KDM4B及成纤维细胞标志蛋白赖氨酰氧化酶(LOX)、弹性蛋白(Elastin)的表达。另取BMSCs分为5组,空白对照组、KDM4B-shRNA组及阴性对照shRNA(NC-shRNA)组、KDM4B过表达组及过表达对照组,采用Western blot检测沉默和过表达KDM4B后细胞中LOX及Elastin蛋白的表达。分别用0%和10%CMS刺激BMSCs,用染色质免疫沉淀法结合qRT-PCR技术分析细胞中Elastin和LOX启动子区域组蛋白3第9位赖氨酸的三甲基化(H3K9me3)和KDM4B的表达。结果:CMS刺激后KDM4B、LOX、Elastin蛋白的表达均高于对照组,其中10%的CMS刺激下LOX和Elastin蛋白的表达最高,诱导分化效果最好(P <0. 05)。上调KDM4B的表达可以诱导BMSCs中Elastin和LOX蛋白的表达;反之,则抑制二者的表达(P <0. 05)。CMS通过调节Elastin和LOX启动子区域中KDM4B和H3K9me3的基因水平上调LOX和Elastin的表达(P <0. 05)。结论:CMS可能通过诱导KDM4B的分泌和抑制H3K9me3的修饰水平上调Elastin和LOX的表达,从而促进BMSCs向成纤维细胞分化。 展开更多
关键词 循环机械牵张 骨髓间充质干细胞 KDM4B 弹性蛋白 赖氨酰氧化酶
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水牛KDM4D基因克隆分析及其真核表达载体的构建 被引量:1
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作者 俸云 赵鑫 +6 位作者 许洁 余庆 沈朋雷 王露露 吴飞 石德顺 陆凤花 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期2067-2074,共8页
旨在克隆水牛组蛋白去甲基化酶KDM4D (lysine K-specific demethylase 4D)基因,对其进行生物信息学分析,并构建KDM4D基因的真核表达载体,为研究KDM4D基因在水牛体细胞核移植(somatic cell nuclear transfer,SCNT)胚胎发育中的作用奠定... 旨在克隆水牛组蛋白去甲基化酶KDM4D (lysine K-specific demethylase 4D)基因,对其进行生物信息学分析,并构建KDM4D基因的真核表达载体,为研究KDM4D基因在水牛体细胞核移植(somatic cell nuclear transfer,SCNT)胚胎发育中的作用奠定基础。试验从水牛睾丸组织中提取总RNA,反转录cDNA后, RT-PCR技术克隆KDM4D基因片段,并运用生物信息学软件对序列进行分析;随后将KDM4D基因片段连接至真核表达载体pEGFP-C1,再把重组质粒转染进HEK293T细胞。结果表明,克隆所得的水牛KDM4D基因片段编码区全长1 155 bp,共编码384个氨基酸。水牛KDM4D基因与黄牛、山羊、绵羊、犬、猫、猪、人、小鼠、大鼠的同源性分别为98.4%,96.6%,96.3%,84.9%,84.1%,81.4%,80.4%,77.4%,77.3%。多重比较和进化树分析结果显示,KDM4D基因在不同物种及生物进化中具有较高的保守性。蛋白结构域分析显示,克隆所得的KDM4D蛋白结构特殊,只具有1个JmjN (Jumonji N)和1个JmjC (jumonji C)结构域,与KDM4家族其他成员相比缺少PHD (plant homeodomain)和Tud (tudor)功能域。KDM4D蛋白质三级结构预测结果显示,水牛、黄牛和人3种物种间具有较高的相似性。转染结果显示,构建的重组质粒可以在HEK293T细胞中表达。本试验成功克隆水牛KDM4D基因,对其进行生物信息学分析,构建了真核表达载体pEGFP-C1-KDM4D,并在HEK293T细胞中成功表达。 展开更多
关键词 水牛 KDM4D基因 基因克隆 生物信息学分析 载体构建
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山羊EGR4、KDM4C和KDM6A多态性及其与繁殖性能关联分析 被引量:2
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作者 李昆谕 刘玉芳 +4 位作者 陶林 江炎庭 欧阳依娜 储明星 洪琼花 《特产研究》 2023年第1期6-13,共8页
本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的关联。利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传... 本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的关联。利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与繁殖性状表型(产羔数、初生窝重、断奶窝重)进行关联分析。群体遗传学结果表明,EGR4 g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在云上黑山羊中为中度多态(0.25 A位点在3种山羊群体中为低度多态(PIC<0.25);KDM4C g.37764228T>A位点在济宁青山羊中为中度多态(0.25 A和g.37768026C>G位点在3种山羊群体中为低度多态(PIC<0.25);KDM6A g.27177505C>A在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为中度多态(0.25 A、g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KDM4C g.37764228T>A、g.37767773T>A和g.37768026C>G在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KDM6A g.27102554T>A和g.27177505C>A位点分别在辽宁绒山羊中和济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),在云上黑山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,在云上黑山羊中EGR4 g.11029600T>A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05);KDM4C g.37764228T>A位点TT和TA型的产羔数、初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05);KDM6A g.27177505C>A位点CC型产羔数显著高于CA型和AA型(P<0.05),g.27102554T>A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05)。综上所述,EGR4 g.11029600T>A、KDM4C g.37764228T>A和KDM6A g.27102554T>A位点可作为云上黑山羊窝重选择的潜在分子标记;KDM4Cg.37764228T>A和KDM6Ag.27177505C>A位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。 展开更多
关键词 山羊 繁殖性状 SNPS EGR4 KDM4C KDM6A
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过表达H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎体外发育效率的影响 被引量:4
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作者 吴霄 李果 +5 位作者 敖政 石俊松 蔡更元 刘德武 吴珍芳 李紫聪 《广东农业科学》 CAS 2017年第10期96-101,176,共7页
为了探索过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4B/KDM4D对猪克隆胚胎体外发育效率的影响,研究构建了鼠源KDM4B/KDM4D表达载体,通过体外转录获得KDM4B/KDM4D mRNA并将其分别显微注射至猪克隆胚胎。结果显示两组注射的克隆胚胎的H3K9me3水平... 为了探索过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4B/KDM4D对猪克隆胚胎体外发育效率的影响,研究构建了鼠源KDM4B/KDM4D表达载体,通过体外转录获得KDM4B/KDM4D mRNA并将其分别显微注射至猪克隆胚胎。结果显示两组注射的克隆胚胎的H3K9me3水平、卵裂率和囊胚率与对照克隆胚胎无显著差异,但两组注射的克隆胚胎的H3K9me3去甲基化酶表达水平显著高于无注射的对照克隆胚胎,且注射KDM4B mRNA的克隆胚胎的囊胚细胞数显著高于注射KDM4D mRNA的克隆胚胎及对照克隆胚胎,表明过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4B可以显著提高猪克隆胚胎的体外发育效率。 展开更多
关键词 克隆胚胎 H3K9me3 KDM4B KDM4D
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去甲基化酶KDM4B在牦牛卵泡发育过程中的表达 被引量:3
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作者 马鸿程 熊显荣 +3 位作者 海卓 闵星宇 郝振宇 李键 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1016-1022,共7页
采集牦牛卵巢组织,利用免疫组织化学法分析KDM4B在不同发育阶段牦牛卵泡中的表达与定位;根据牦牛卵泡直径大小,将卵泡分为大卵泡(≥7 mm)、中卵泡(3.0~6.9 mm)和小卵泡(≤2.9 mm)组,采用注射器抽取的方法分别收集各组别卵泡中卵丘卵母... 采集牦牛卵巢组织,利用免疫组织化学法分析KDM4B在不同发育阶段牦牛卵泡中的表达与定位;根据牦牛卵泡直径大小,将卵泡分为大卵泡(≥7 mm)、中卵泡(3.0~6.9 mm)和小卵泡(≤2.9 mm)组,采用注射器抽取的方法分别收集各组别卵泡中卵丘卵母细胞复合体(cumulus-oocyte complex, COCs)及壁层颗粒细胞,对COCs进行体外成熟培养并统计各组别卵母细胞成熟率;分别提取各组别卵泡卵母细胞、卵丘颗粒细胞及壁层颗粒细胞总RNA,采用RT-qPCR方法检测卵泡细胞中KDM4B mRNA的相对表达量。结果显示,KDM4B在各发育阶段的牦牛卵泡中均有表达,主要定位于卵母细胞及颗粒细胞,而在膜细胞中表达较少,且随着卵泡发育进程KDM4B表达信号增强。体外培养结果显示,卵母细胞成熟率随着卵泡的发育程度上升,其中大卵泡组(91.30%)、中卵泡组(85.77%)成熟率显著高于小卵泡组(63.51%,P<0.05);RT-qPCR结果显示,KDM4B mRNA在各组卵泡细胞中均有表达,其中卵母细胞中表达量随卵泡发育呈下降趋势,且大卵泡组、中卵泡组显著低于小卵泡组(P<0.05),大卵泡组、中卵泡组间差异不显著(P>0.05)。卵丘颗粒细胞与壁层颗粒细胞中KDM4B mRNA表达规律基本一致,即随卵泡发育进程其表达均呈上升趋势,大卵泡组、中卵泡组表达极显著高于小卵泡组(P<0.01);此外,各组别的卵丘颗粒细胞中KDM4B的表达量约为同组中壁层颗粒细胞的2倍(P<0.01)。结果表明,KDM4B在牦牛卵泡发育过程中呈动态变化,参与了牦牛卵泡发育过程,其具体调控机制有待进一步研究。本研究旨在分析组蛋白去甲基化酶4B(histone demethylase 4B,KDM4B/JMJD2B)基因在牦牛不同发育阶段卵泡中的表达规律,探究其对牦牛卵泡发育成熟的影响,为深入探讨KDM4B在卵巢卵泡发育中的调控机理提供依据。 展开更多
关键词 牦牛 KDM4B 卵泡发育 表达
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