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KDM6B通过表观遗传调节巨噬细胞功能的研究进展
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作者 王海燕 徐婧雯 贾立周 《南京医科大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第2期289-298,共10页
赖氨酸特异性去甲基化酶6B(lysine-specific demethylase 6B,KDM6B)是含Jumonji C结构域蛋白家族(Jumonji C domain-containing protein family,JmjC)中的一种重要表观遗传因子,不仅在细胞分化、炎症反应、组织稳态和神经性疾病中发挥... 赖氨酸特异性去甲基化酶6B(lysine-specific demethylase 6B,KDM6B)是含Jumonji C结构域蛋白家族(Jumonji C domain-containing protein family,JmjC)中的一种重要表观遗传因子,不仅在细胞分化、炎症反应、组织稳态和神经性疾病中发挥表观遗传调控作用,还对巨噬细胞的功能、免疫反应等具有关键调控意义。作为JmjC家族中唯一能响应类Toll受体(Toll-like receptor,TLR)信号的成员,KDM6B可在TLR信号刺激下被激活从而发挥功能。研究发现,KDM6B可以通过调节巨噬细胞的极化、影响细胞因子的表达水平以及参与肿瘤微环境调控等方式影响巨噬细胞,因此,KDM6B在免疫反应、炎症反应以及肿瘤等病理生理过程中发挥重要作用。KDM6B作为关键的表观遗传因子对巨噬细胞的功能具有调控作用,包括调节巨噬细胞的极化、炎症反应以及促纤维化等,有望成为研究免疫、炎症及肿瘤等相关疾病的潜在靶点。 展开更多
关键词 kdm6B 巨噬细胞 表观遗传因子
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KDM6A在恶性肿瘤中作用的研究进展
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作者 李湘云 王剑松 《医学研究杂志》 2026年第1期5-9,共5页
赖氨酸脱甲基酶6A(lysine demethylase 6A,简称KDM6A)是一种组蛋白去甲基化酶,主要作用于组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3),在调控染色质状态和基因表达中扮演重要角色。KDM6A在多种恶性肿瘤高频突变或低表达,并参与调控... 赖氨酸脱甲基酶6A(lysine demethylase 6A,简称KDM6A)是一种组蛋白去甲基化酶,主要作用于组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3),在调控染色质状态和基因表达中扮演重要角色。KDM6A在多种恶性肿瘤高频突变或低表达,并参与调控恶性肿瘤细胞的增殖、侵袭与迁移过程,并在肿瘤免疫微环境的重塑扮演重要的角色。这表明KDM6A有潜力成为恶性肿瘤治疗的新靶点。本文就KDM6A的结构、功能及其在多种恶性肿瘤中的研究进展进行综述,旨在为恶性肿瘤的精准治疗提供理论依据。 展开更多
关键词 恶性肿瘤 kdm6A 作用机制
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基于生物信息学分析KDM1A在肝癌中表达和下游分子调控机制
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作者 郑昆明 武广海 +2 位作者 王娟 谢宜芳 徐靖 《解剖科学进展》 2025年第6期836-839,共4页
目的 分析KDM1A对于肝癌预后的意义及其潜在调控机制。方法 利用GEPIA、HPA网站进行KDM1A的表达分析和生存分析;使用linkedomics网站对KDM1A的相关性基因进行分析以及富集分析,RT-qPCR以及蛋白印迹实验检测肝癌细胞中KDM1A的表达情况,... 目的 分析KDM1A对于肝癌预后的意义及其潜在调控机制。方法 利用GEPIA、HPA网站进行KDM1A的表达分析和生存分析;使用linkedomics网站对KDM1A的相关性基因进行分析以及富集分析,RT-qPCR以及蛋白印迹实验检测肝癌细胞中KDM1A的表达情况,慢病毒转染构建KDM1A敲低细胞系,RT-qPCR实验验证敲低细胞系的成功构建,使用RT-qPCR实验检测细胞中MRTO4以及CCPG1的表达情况。结果 KDM1A在肝癌组织和肝癌细胞中呈现高表达,并与更短的总生存时间以及无病生存时间相关;KDM1A相关性基因主要在细胞代谢以及基因转录等过程富集,其中正相关基因以MRTO4为主,负相关基因以及CCPG4为主;肝癌细胞中敲低KDM1A后MRTO4表达下降,CCPG1表达增加。结论 KDM1A在肝癌中高表达,与预后不良相关;KDM1A正向调控MRTO4表达,负向调控CCPG1表达。 展开更多
关键词 生物信息学 kdm1A MRTO4 CCPG1 肝癌
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KDM2A and KDM2B protect a subset of CpG islands from DNA methylation
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作者 Yuan Liu Ying Liu +7 位作者 Yunji Zhu Di Hu Hu Nie Yali Xie Rongrong Sun Jin He Honglian Zhang Falong Lu 《Journal of Genetics and Genomics》 2025年第1期39-50,共12页
In the mammalian genome,most CpGs are methylated.However,CpGs within the CpG islands(CGIs)are largely unmethylated,which are important for gene expression regulation.The mechanism underlying the low methylation levels... In the mammalian genome,most CpGs are methylated.However,CpGs within the CpG islands(CGIs)are largely unmethylated,which are important for gene expression regulation.The mechanism underlying the low methylation levels at CGIs remains largely elusive.KDM2 proteins(KDM2A and KDM2B)are H3K36me2 demethylases known to bind specifically at CGIs.Here,we report that depletion of each or both KDM2 proteins,or mutation of all their JmjC domains that harbor the H3K36me2 demethylation activity,leads to an increase in DNA methylation at selective CGIs.The Kdm2a/2b double knockout shows a stronger increase in DNA methylation compared with the single mutant of Kdm2a or Kdm2b,indicating that KDM2A and KDM2B redundantly regulate DNA methylation at CGIs.In addition,the increase of CGI DNA methylation upon mutations of KDM2 proteins is associated with the chromatin environment.Our findings reveal that KDM2A and KDM2B function redundantly in regulating DNA methylation at a subset of CGIs in an H3K36me2 demethylation-dependent manner. 展开更多
关键词 kdm2A kdm2B CpG island DNA methylation H3K36me2 DEMETHYLATION Embryonic stem cell
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组蛋白赖氨酸去甲基化酶KDM7在骨重建过程的研究进展 被引量:1
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作者 石全 丁子毅 +5 位作者 李苇航 王栋 张世磊 高博 刘志斌 闫铭 《空军军医大学学报》 2025年第1期134-137,共4页
骨质疏松症(OP)是一种常见的全身骨退行性疾病,骨重建的失衡是导致OP以及脆性骨折的重要发病机制。表观遗传学是指在不改变DNA序列的情况下,其他调控机制引起基因表达和功能发生改变,例如组蛋白的翻译后修饰、DNA甲基化、非编码RNA和染... 骨质疏松症(OP)是一种常见的全身骨退行性疾病,骨重建的失衡是导致OP以及脆性骨折的重要发病机制。表观遗传学是指在不改变DNA序列的情况下,其他调控机制引起基因表达和功能发生改变,例如组蛋白的翻译后修饰、DNA甲基化、非编码RNA和染色质重塑等。组蛋白去甲基化修饰是目前表观遗传学机制研究热点之一,并受到组蛋白去甲基化酶严格调控,已被证实组蛋白赖氨酸去甲基化酶(KDMs)参与了骨重建过程,包括成骨与破骨细胞之间的动态平衡。而KDM7作为近年来新发现的KDMs家族中的一员,包括KDM7A、KDM7B、KDM7C,在骨重建过程中的作用相关报道较为少见。本文主要从表观遗传学调控、组蛋白去甲基化修饰以及KDM7在骨重建过程中的最新研究进展作一综述,为OP的防治及干预提供新思路。 展开更多
关键词 骨质疏松症 骨重建 表观遗传学 组蛋白翻译后修饰 组蛋白赖氨酸去甲基化酶 kdm7
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miR-30a-5p靶向KDM3A缓解缺氧诱导H9c2细胞凋亡
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作者 罗梦圆 张辛颖 +2 位作者 张彬 邵明学 田乃亮 《中国分子心脏病学杂志》 2025年第1期6637-6645,共9页
目的探讨miR-30a-5p通过靶向KDM3A调节心肌细胞在低氧条件下的凋亡机制。方法构建急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)小鼠模型并模拟缺氧环境于小鼠心肌原代细胞中,采用qPCR技术定量分析miR-30a-5p的表达水平。同时,结合生... 目的探讨miR-30a-5p通过靶向KDM3A调节心肌细胞在低氧条件下的凋亡机制。方法构建急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)小鼠模型并模拟缺氧环境于小鼠心肌原代细胞中,采用qPCR技术定量分析miR-30a-5p的表达水平。同时,结合生物信息学分析预测miR-30a-5p与KDM3A 3′UTR的结合位点,并通过双荧光素酶报告实验验证二者的结合关系。在H9c2心肌细胞株中模拟低氧环境,建立缺氧诱导的细胞凋亡模型,采用qPCR分析miR-30a-5p的表达变化,并通过Western blot检测凋亡相关蛋白(Bax、Bcl-2、c-PARP1)的表达水平。利用TUNEL染色法评估低氧诱导的细胞凋亡程度。低氧处理前,分别转染H9c2细胞miR-30a-5p模拟物/抑制剂和KDM3A siRNA,以评估其对心肌细胞凋亡的影响。结果在小鼠AMI模型、缺氧诱导的小鼠心肌原代细胞及H9c2心肌细胞中,miR-30a-5p的表达显著下降。双荧光素酶实验验证了miR-30a-5p可与KDM3A 3′UTR结合。进一步分析显示,在低氧条件下,KDM3A蛋白的表达水平显著升高。Bax/Bcl-2比值的增加以及c-PARP1蛋白的升高与细胞凋亡率的增加密切相关。过表达miR-30a-5p能够显著逆转低氧诱导的心肌细胞凋亡相关蛋白的变化,而抑制miR-30a-5p则加剧了这些效应。敲低KDM3A亦能减轻低氧诱导的心肌细胞凋亡。结论miR-30a-5p通过靶向KDM3A调控心肌细胞在低氧条件下的凋亡过程,为AMI的治疗提供了新的分子靶点。 展开更多
关键词 急性心肌梗死 缺氧 miR-30a-5p kdm3A 细胞凋亡
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扰动流调控内皮细胞组蛋白去甲基化酶KDM5B和H3K4me3对颈动脉斑块形成的影响
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作者 吴丽丽 沈宇 《中国动脉硬化杂志》 2025年第2期117-124,共8页
[目的]探讨扰动流是否通过调控组蛋白去甲基化酶KDM5B和表观遗传修饰影响内皮细胞功能和动脉粥样硬化斑块形成。[方法]通过部分颈动脉结扎术(PCL),利用单细胞数据分析和免疫荧光染色观察扰动流作用下野生型小鼠颈动脉内皮细胞组蛋白甲... [目的]探讨扰动流是否通过调控组蛋白去甲基化酶KDM5B和表观遗传修饰影响内皮细胞功能和动脉粥样硬化斑块形成。[方法]通过部分颈动脉结扎术(PCL),利用单细胞数据分析和免疫荧光染色观察扰动流作用下野生型小鼠颈动脉内皮细胞组蛋白甲基化水平和组蛋白去甲基化酶的表达变化;利用qPCR和Western blot检测暴露于扰动流诱导的内皮细胞KDM5B和H3K4me3的表达;利用普通转录组测序分析KDM5B敲降对内皮细胞功能的影响;内皮细胞成环实验验证KDM5B对血管生成的影响;PCL结合高脂饲料喂食2周构建颈动脉斑块模型分析KDM5B敲降对斑块形成的影响。[结果]血管内皮细胞上存在大量H3K4me3甲基化修饰。扰动流使内皮细胞H3K4me3水平下降(P<0.01),并上调组蛋白去甲基化酶KDM5B表达(P<0.05)。与对照组相比,抑制KDM5B活性或敲降KDM5B表达后可以提高内皮细胞H3K4me3水平(P<0.05)。与Con313对照组相比,KDM5B敲降可以抑制内皮细胞血管生成,并使ApoE^(-/-)小鼠颈动脉斑块面积减少41.45%(Con313对照组:42.17%±1.90%,shKDM5B敲降组:24.69%±1.60%,P<0.01)。[结论]血液扰动流通过促进KDM5B表达,降低H3K4me3修饰,促进血管生成和动脉粥样硬化斑块形成,靶向KDM5B-H3K4me3轴可作为心血管疾病相关的候选治疗靶点。 展开更多
关键词 扰动流 H3K4me3 kdm5B 内皮细胞 颈动脉斑块形成
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KDM5C基因c.26T>A突变致Claes-Jensen综合征的临床研究
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作者 王石凡 惠玲 +3 位作者 张钏 孙慧慧 杨兴红 丁娟 《宁夏医科大学学报》 2025年第10期1001-1008,共8页
目的探讨KDM5C基因c.26T>A突变在Claes-Jensen综合征中的作用。方法采用全外显子测序筛查突变,Sanger测序验证变异,毛细管电泳分析X染色体失活状态。通过Pymol构建蛋白结构模型,VarCards评估突变有害性,并结合分子动力学模拟分析蛋... 目的探讨KDM5C基因c.26T>A突变在Claes-Jensen综合征中的作用。方法采用全外显子测序筛查突变,Sanger测序验证变异,毛细管电泳分析X染色体失活状态。通过Pymol构建蛋白结构模型,VarCards评估突变有害性,并结合分子动力学模拟分析蛋白稳定性。通过瞬时转染慢病毒包装的KDM5C突变型(mt)、野生型(wt)及空载质粒至N2a细胞,设正常细胞对照组(ctrl)和空载阴性对照组(mock)。采用荧光显微镜观察诱导分化后神经细胞突起的长度,并利用蛋白免疫印迹检测KDM5C、Tuj-1及PSD-95蛋白表达水平。结果先证者在KDM5C基因中存在错义突变c.26T>A(p.L9Q),经Sanger测序验证为母源遗传。该突变引入额外共价键,改变蛋白结构,VarCards及分子动力学模拟均提示其可能为功能缺失性突变,且影响蛋白稳定性。细胞实验显示,与正常对照组相比,突变组神经突起长度减小(P<0.05),KDM5C蛋白表达降低(P<0.01),PSD-95蛋白表达也下降(P<0.01),而Tuj-1蛋白表达无变化;过表达组KDM5C蛋白表达升高(P<0.05),但神经突起长度差异无统计学意义(P>0.05)。结论本研究明确了KDM5C基因p.L9Q突变为致病原因,该突变可损害神经突起生长,且拓展了KDM5C基因相关疾病的突变谱系,并提示该基因在神经发育中的关键作用。 展开更多
关键词 Claes-Jensen综合征 kdm5C基因 错义突变 全外显子测序技术 分子动力学模拟 智力发育迟缓
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组蛋白去甲基化酶KDM3B在肿瘤中的作用研究进展
9
作者 张珍珍 张俊丽 +2 位作者 陈卓静 张小帅 吕卫琴 《肿瘤学杂志》 2025年第8期732-739,共8页
组蛋白甲基化和去甲基化修饰是表观遗传学广泛且重要的调控机制之一。其中,组蛋白赖氨酸甲基化和去甲基化与染色质抑制和激活密切相关,其甲基化活性不仅取决于赖氨酸残基被靶向的位点及甲基化程度,而且与赖氨酸甲基化发生的基因区域有... 组蛋白甲基化和去甲基化修饰是表观遗传学广泛且重要的调控机制之一。其中,组蛋白赖氨酸甲基化和去甲基化与染色质抑制和激活密切相关,其甲基化活性不仅取决于赖氨酸残基被靶向的位点及甲基化程度,而且与赖氨酸甲基化发生的基因区域有关。目前,组蛋白H3的第9位赖氨酸(histone H3 lysine 9,H3K9)甲基化和去甲基化是研究最深入的组蛋白修饰之一,它被认为是转录沉默异染色质的表观遗传标志物。组蛋白去甲基化酶KDM3B是一种重要的表观遗传调控因子,它通过特异性去除H3K9的单甲基化和二甲基化(H3K9me1/2)修饰直接或间接招募转录因子形成相关复合体影响染色质结构和紧密度来调控基因的转录和表达。KDM3B可直接或间接抑制或促进肿瘤的发生。全文分析KDM3B的功能及在肿瘤发生与进展中作用及潜在治疗靶点,以期为开发新型表观遗传药物提供信息。 展开更多
关键词 组蛋白 甲基化 kdm3B 表观遗传学 恶性肿瘤 治疗靶点
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Mandible-derived extracellular vesicles regulate early tooth development in miniature swine via targeting KDM2B 被引量:1
10
作者 Ye Li Meng Sun +1 位作者 Yi Ding Ang Li 《International Journal of Oral Science》 2025年第3期396-405,共10页
Tissue interactions play a crucial role in tooth development.Notably,extracellular vesicle-mediated interactions between the mandible and tooth germ are considered essential.Here,we revealed that mandible extracellula... Tissue interactions play a crucial role in tooth development.Notably,extracellular vesicle-mediated interactions between the mandible and tooth germ are considered essential.Here,we revealed that mandible extracellular vesicles could modulate the proliferation and differentiation of dental mesenchymal cells by regulating the histone demethylase KDM2B.Further investigation showed that mandible derived extracellular vesicles could deliver miR-206 to KDM2B,thereby regulating tooth development.An animal study demonstrated that the miR-206/KDM2B pathway affected tooth morphogenesis and mineralization after eight weeks of subcutaneous transplantation in nude mice.In conclusion,this study suggested that the mandible played a critical role in tooth morphogenesis and mineralization,which could be a potential therapeutic target for abnormal tooth development and an alternative model for tooth regeneration. 展开更多
关键词 tooth germ histone demethylase kdm bfurther extracellular vesicles mandible derived extracellular vesicles animal study tissue interactions tooth development dental mesenchymal cells
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布托啡诺调节miR-212-3p/KDM5B轴对胃癌细胞增殖和凋亡的影响
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作者 仲伟荣 周阳 《中国细胞生物学学报》 2025年第10期2514-2525,共12页
该研究旨在探讨布托啡诺调节微小RNA-212-3p(miR-212-3p)/组蛋白去甲基化酶5B(KDM5B)轴对胃癌细胞增殖和凋亡的影响。将MKN-45细胞分为对照组(Control组)、布托啡诺低浓度组(B-L,1μmol/L)、中浓度组(B-M,2μmol/L)、高浓度组(B-H,4μmo... 该研究旨在探讨布托啡诺调节微小RNA-212-3p(miR-212-3p)/组蛋白去甲基化酶5B(KDM5B)轴对胃癌细胞增殖和凋亡的影响。将MKN-45细胞分为对照组(Control组)、布托啡诺低浓度组(B-L,1μmol/L)、中浓度组(B-M,2μmol/L)、高浓度组(B-H,4μmol/L)、B-H+anti-miRNC组、B-H+anti-miR-212-3p组、miR-NC组、miR-212-3p组;RT-qPCR检测miR-212-3p、KDM5B mRNA的表达情况;双荧光素酶报告实验检测mi R-212-3p与KDM5B的靶向关系;Edu法检测细胞增殖情况;Trawesll法检测细胞侵袭;划痕愈合实验检测细胞迁移;流式细胞术检测细胞凋亡情况;蛋白免疫印迹法检测Ki-67、MMP-2、MMP-9、Bax、Bcl-2、KDM5B、Caspase 3、Caspase 7、Cleaved Caspase 3、Cleaved Caspase 7蛋白水平。双荧光素酶检测表明,miR-212-3p与KDM5B存在靶向关系;与Control组比,B-L、B-M、B-H组Edu阳性数,侵袭数,划痕愈合率,Ki-67、MMP-2、MMP-9、KDM5B蛋白水平下降,细胞凋亡率,Bax/Bcl-2、Cleaved Caspase 3/Caspase 3、Cleaved Caspase 7/Caspase 7、miR-212-3p、KDM5B mRNA表达水平升高(P<0.05);转染miR-212-3p mimics对MKN-45细胞的影响与布托啡诺相同;与B-H+anti-miR-NC组比,B-H+anti-miR-212-3p组细胞Edu阳性数,侵袭数,划痕愈合率,Ki-67、MMP-2、MMP-9、KDM5B蛋白水平升高,细胞凋亡率,Bax/Bcl-2、Cleaved Caspase 3/Caspase 3、Cleaved Caspase 7/Caspase 7、miR-212-3p、KDM5B mRNA表达水平下降(P<0.05)。布托啡诺可以通过上调miR-212-3P的表达,抑制KDM5B表达,从而抑制MKN-45细胞的增殖、迁移与侵袭,促进细胞发生凋亡。 展开更多
关键词 布托啡诺 miR-212-3p/kdm5B信号通路 胃癌 增殖 凋亡
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防风草内酯介导KDM5B调节FBLN7/FAK/Akt信号通路改善心肌梗死大鼠心脏重塑
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作者 唐金华 张超 +1 位作者 石蕾 熊忠林 《解剖科学进展》 2025年第3期355-359,共5页
目的探究防风草内酯对心肌梗死大鼠心脏重塑的治疗作用及其机制。方法SD大鼠随机分为假手术组(Sham组)、心肌梗死组(MI组)、防风草内酯低剂量组(OVA-L组)、防风草内酯中剂量组(OVA-M组)、防风草内酯高剂量组(OVA-H组)、防风草内酯高剂量... 目的探究防风草内酯对心肌梗死大鼠心脏重塑的治疗作用及其机制。方法SD大鼠随机分为假手术组(Sham组)、心肌梗死组(MI组)、防风草内酯低剂量组(OVA-L组)、防风草内酯中剂量组(OVA-M组)、防风草内酯高剂量组(OVA-H组)、防风草内酯高剂量+过表达对照组(OVA-H+ov-NC组)和防风草内酯高剂量+过表达KDM5B组(OVA-H+ov-KDM5B组),每组10只。采用结扎左冠状动脉前降支建立心肌梗死模型;超声心动图用于评价心功能;HE染色和Masson染色依次用于评价心肌病理损伤和纤维化;RT-qPCR和Western blot方法检测心肌组织中KDM5B表达;Western blot方法检测心肌组织中FBLN7/FAK/Akt信号通路蛋白表达。结果防风草内酯治疗后,心肌梗死大鼠LVEF和LVFS明显升高,LVIDd和LVIDs明显降低,大鼠心肌梗死灶缩小,细胞排列较整齐,间质浸润的炎性细胞较少,肌组织蓝染的胶原纤维减少。防风草内酯治疗降低心肌梗死大鼠心肌组织中KDM5B、FBLN7、p-FAK和p-Akt表达。过表达KDM5B逆转防风草内酯对心肌梗死大鼠心功能、心肌损伤和心肌纤维化的治疗作用以及心肌组织中FBLN7、p-FAK和p-Akt表达的下调作用。结论防风草内酯通过下调KDM5B表达改善心肌梗死诱导的心脏重塑,其机制可能与抑制FBLN7/FAK/Akt信号通路激活有关。 展开更多
关键词 心肌梗死 防风草内酯 心脏重塑 kdm5B FBLN7/FAK/Akt信号通路
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维生素C促进根尖牙乳头间充质干细胞组蛋白去甲基化酶KDM2B和KDM5C表达的研究 被引量:7
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作者 王月君 刘大勇 +1 位作者 范志朋 贾智 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期466-469,474,共5页
目的:研究维生素C是否具有调节根尖牙乳头间充质干细胞组蛋白去甲基化酶相关基因表达的功能。方法:利用不同剂量的维生素C刺激人根尖牙乳头间充质干细胞;采用qRT-PCR(real time reverse transcriptionpolymerase chain reaction,实时定... 目的:研究维生素C是否具有调节根尖牙乳头间充质干细胞组蛋白去甲基化酶相关基因表达的功能。方法:利用不同剂量的维生素C刺激人根尖牙乳头间充质干细胞;采用qRT-PCR(real time reverse transcriptionpolymerase chain reaction,实时定量RT-PCR)在mRNA水平检测组蛋白去甲基化酶相关基因的表达。结果:qRT-PCR结果显示组蛋白去甲基化酶KDM2B(Lysine(K)-specific demethylase 2B)和KDM5C(Lysine(K)-specific demethylase 5C)在10μmol/L维生素C刺激后2、4和8h表达明显升高,其表达升高程度与维生素C的作用具有时依赖性;qRT-PCR结果显示与未刺激组相比,5、10和20μmol/L维生素C在作用8h后都能促进KDM2B和KDM5C的表达,其表达升高程度与维生素C的作用具有剂量依赖性的关系。结论:在根尖牙乳头间充质干细胞中维生素C可以促进组蛋白去甲基化酶KDM2B和KDM5C的表达。 展开更多
关键词 维生素C 组蛋白去甲基化酶 根尖牙乳头间充质干细胞 kdm2B kdm5C
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kdm4A在斑马鱼细胞低温胁迫过程中的作用 被引量:2
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作者 刘玮 罗军涛 +3 位作者 谢婷婷 燕晓霞 张俊芳 韩兵社 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期4467-4474,共8页
赖氨酸特异性去甲基化酶4A基因(lysine demethylase 4A,kdm4A)编码的蛋白具有去甲基化酶活性,并且在基因表达调控中起重要作用。该基因在斑马鱼中有两种类型kdm4aa和kdm4ab。本实验室前期对18℃低温胁迫下斑马鱼(Danio rerio)胚胎成纤... 赖氨酸特异性去甲基化酶4A基因(lysine demethylase 4A,kdm4A)编码的蛋白具有去甲基化酶活性,并且在基因表达调控中起重要作用。该基因在斑马鱼中有两种类型kdm4aa和kdm4ab。本实验室前期对18℃低温胁迫下斑马鱼(Danio rerio)胚胎成纤维样细胞(zebrafish embryos fibroblast like cell line,ZF4)的转录组数据分析发现kdm4aa表达量显著降低,但是该基因在鱼类低温胁迫下的作用仍不清楚。为了研究这两种基因在鱼类低温胁迫下的功能,本研究用EcoRⅠ和AgeⅠ酶切构建了pLKO.1-kdm4aa-shRNA、pLKO.1-kdm4ab-shRNA和pLKO.1-negative control(nc)三种重组质粒,并分别与慢病毒包装质粒pCMV-DR8.9.1、pCMV-VSVG共同转染至293T细胞中,经293T细胞包装的病毒,感染斑马鱼ZF4细胞,RT-qPCR检测表明ZF4细胞中kdm4aa和kdm4ab均成功被敲降。随后将细胞于28℃培养(Control)或经18℃低温处理1 d,使用台盼蓝染色法检测ZF4细胞存活率,并进一步检测了细胞内自噬相关基因beclin1和LC3的表达情况。结果显示:在18℃条件下,敲降kdm4aa的细胞与nc组细胞相比存活率显著上升(p<0.05),而敲降kdm4ab的细胞存活率与nc组相比无明显变化,证明敲降kdm4aa在低温胁迫下保护细胞。进一步的研究发现,敲降kdm4aa的细胞内自噬相关基因beclin1及LC3的表达量均显著上调,而敲降kdm4ab的细胞变化不显著,提示敲降kdm4aa在低温胁迫下对斑马鱼细胞的保护作用可能是通过上调自噬水平引起的。该研究为后期斑马鱼低温胁迫分子机制的研究提供新的思路。 展开更多
关键词 kdm4aa kdm4ab 存活率 ZF4 细胞 低温胁迫 自噬
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标准模型下KDM安全的对称加密方案 被引量:3
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作者 来齐齐 陈原 +2 位作者 裴庆祺 谢敏 张安源 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2011年第6期1277-1281,共5页
KDM(Key-Dependent Message)安全是考虑当加密的明文消息是所用加密方案私钥的函数时的安全问题。该文利用通用哈希函数(universal hash function),在标准模型下基于一种变形的剩余哈希引理(left-over hash lemma)构造出一个信息论KDM... KDM(Key-Dependent Message)安全是考虑当加密的明文消息是所用加密方案私钥的函数时的安全问题。该文利用通用哈希函数(universal hash function),在标准模型下基于一种变形的剩余哈希引理(left-over hash lemma)构造出一个信息论KDM安全的无状态对称加密方案。该方案能够抵抗任意攻击者接近指数次边界的KDM加密询问攻击,并且攻击者询问的挑战函数可以是任意集合。最后通过合理选择参数,对比已有方案,证明该文所构造方案的安全性有所提高。 展开更多
关键词 依赖于密钥的明文(kdm) 对称加密 通用哈希函数 剩余哈希引理 标准模型
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KDM5B在宫颈癌中的表达意义及对宫颈癌干细胞的影响 被引量:4
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作者 杨宝娟 张庆 +2 位作者 王志红 王武亮 张珂 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第23期2879-2885,共7页
目的:研究组蛋白去甲基化转移酶(KDM5B)在宫颈癌组织中的表达,及其与患者临床病理特征和预后之间的关系,并探讨KDM5B对宫颈癌干细胞(CCSCs)的影响。方法:免疫组化检测KDM5B在70例宫颈癌组织和30例正常宫颈组织中的表达水平,并分析宫颈... 目的:研究组蛋白去甲基化转移酶(KDM5B)在宫颈癌组织中的表达,及其与患者临床病理特征和预后之间的关系,并探讨KDM5B对宫颈癌干细胞(CCSCs)的影响。方法:免疫组化检测KDM5B在70例宫颈癌组织和30例正常宫颈组织中的表达水平,并分析宫颈癌组织中KDM5B的表达与临床病理特征的关系及对患者预后的影响。流式细胞术分选Caski细胞系的肿瘤干细胞。Western blot检测KDM5B在CCSCs中的表达;经脂质体分别转染KDM5B siRNA(si-KDM5B)和对照(si-NC)48 h后,MTS检测各组CCSCs增殖能力,软琼脂克隆形成实验检测各组CCSCs肿瘤球形成能力,Transwell实验检测各组CCSCs转移能力,Western blot检测各组CCSCs中OCT4、Nanog、SOX2干性基因蛋白的表达;KDM5B干扰质粒及对照NC感染CCSCs,经1.0μg/ml遗传霉素G418筛选稳定敲减KDM5B的CCSCs细胞,注射到BALB/c裸鼠皮下,观察KDM5B对CCSCs体内致瘤性的影响。结果:免疫组化结果显示KDM5B在宫颈癌组织中的表达显著高于正常宫颈组织,其阳性表达与宫颈癌肿瘤大小及淋巴结转移显著相关(P<0.05),宫颈癌组织中KDM5B阳性表达患者生存期较短。KDM5B在CCSCs中的表达显著高于宫颈癌细胞Caski和人宫颈上皮永生化细胞H8(P<0.05);转染KDM5B siRNA后,CCSCs细胞增殖、软琼脂克隆形成及转移能力均下降,CCSCssh-KDM5B裸鼠成瘤体积显著小于CCSCsNC组(P<0.05)。结论:KDM5B在宫颈癌组织和CSCs中均高表达,且阳性表达与肿瘤大小、淋巴结转移及预后不良相关,同时干扰KDM5B的表达抑制CCSCs的干性,KDM5B可以作为治疗宫颈癌的潜在分子靶点。 展开更多
关键词 宫颈癌 kdm5B 肿瘤干细胞 干性
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KDM5B基因在卵巢癌中的表达及其对卵巢癌耐药能力的影响 被引量:8
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作者 张立伟 马骏 +3 位作者 金悦 胡秋博 李毓 王育 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2017年第3期161-164,共4页
目的:检测组蛋白去甲基化转移酶KDM5B(JARID1B/PLU-1)在正常卵巢、卵巢癌组织及细胞株中的表达,以及其对卵巢癌细胞株耐药能力的影响。方法:RT-q PCR法检测KDM5B在36例卵巢癌、15例正常卵巢、6例术后化疗耐药复发患者组织及卵巢上皮细胞... 目的:检测组蛋白去甲基化转移酶KDM5B(JARID1B/PLU-1)在正常卵巢、卵巢癌组织及细胞株中的表达,以及其对卵巢癌细胞株耐药能力的影响。方法:RT-q PCR法检测KDM5B在36例卵巢癌、15例正常卵巢、6例术后化疗耐药复发患者组织及卵巢上皮细胞株IOSE和5株卵巢癌细胞中的表达情况;构建p MSCVpuro-KDM5B过表达质粒和p GIPZ-sh1、p GIPZ-sh2干扰质粒,并筛选得到稳定过表达的SKOV3和稳定干扰的Caov3细胞株,RT-q PCR和Western blot法鉴定调控效果;用浓度梯度递增的顺铂处理SKOV3过表达和Caov3干扰细胞株,CCK-8法检测顺铂半抑制浓度(IC50)变化。结果:RTq PCR结果示,正常卵巢组织中KDM5B相对表达量(1.950±0.3003)低于卵巢癌组织(4.924±0.2989),差异有统计学意义(t=5.909,P<0.0001)。KDM5B表达量与卵巢癌患者的FIGO分期、病理分级、转移和耐药发生明显相关,与患者年龄、CA125水平不相关。6例复发患者中,5例KDM5B表达明显升高(P<0.001)。KDM5B的mRNA和蛋白水平在卵巢上皮性细胞株IOSE中最低,在卵巢癌细胞株SKOV3、HO-8910、ES-2、A2780、Caov3中表达逐渐增加。RT-q PCR结果示,SKOV3过表达组的KDM5B表达量为对照组的27.4倍,Caov3干扰sh1和sh2组分别为对照组的0.38和0.41倍,Western blot也显示过表达和干扰有效。用浓度梯度递增的顺铂处理Caov3细胞株,KDM5B表达量随顺铂浓度增加而逐渐升高;检测SKOV3细胞株KDM5B过表达组IC50为3.666(95%CI为3.067~4.382)μg/ml高于对照组[1.676(95%CI为1.553~1.810)μg/ml],Caov3细胞株干扰sh1组和sh2组分别为3.359(95%CI为2.875~3.925)μg/ml、2.881(95%CI为2.49~3.324)μg/ml,均低于对照组[6.972(95%CI为6.182~7.864)]。结论:组蛋白去甲基化转移酶KDM5B在卵巢癌中表达升高,并且具有促进卵巢癌细胞株耐药的作用。 展开更多
关键词 卵巢癌 组蛋白去甲基化转移酶kdm5B 耐药
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KDM2A对人卵巢癌顺铂耐药细胞株A2780增殖和凋亡的影响及机制研究 被引量:2
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作者 卢丹华 洪莉 +2 位作者 杨将 高利昆 曾婉玲 《现代生物医学进展》 CAS 2018年第16期3001-3006,3011,共7页
目的:探讨赖氨酸脱甲基酶2A(Lysine-specific demethylase 2A,KDM2A)对顺铂(cisplatin,DDP)耐药的人卵巢癌细胞A2780细胞增殖和凋亡的影响及其可能作用机制。方法:通过构建慢病毒载体转染A2780/DDP,分为A2780、A2780/DDP、A2780/DDP/KDM... 目的:探讨赖氨酸脱甲基酶2A(Lysine-specific demethylase 2A,KDM2A)对顺铂(cisplatin,DDP)耐药的人卵巢癌细胞A2780细胞增殖和凋亡的影响及其可能作用机制。方法:通过构建慢病毒载体转染A2780/DDP,分为A2780、A2780/DDP、A2780/DDP/KDM2A(转染KDM2A)、A2780/DDP/Jagged1(转染Jagged1)以及A2780/DDP/NC(转染病毒载体)组。采用Western blot检测3组KDM2A、Jagged1、Bcl2和BAX蛋白表达,CCK8和平板克隆形成实验检测细胞对顺铂的敏感性,流式细胞术检测细胞凋亡情况。结果:A2780/DDP细胞KDM2A和Jagged1的蛋白表达水平均显著高于A2780细胞(P<0.05),且A2780/DDP/KDM2A细胞中KDM2A和Jagged1的蛋白表达均低于A2780/DDP以及阴性对照组A2780/DDP/NC(P<0.05);A2780/DDP/Jagged1细胞的Jagged1蛋白表达低于A2780/DDP以及A2780/DDP/NC(P<0.05),而其KDM2A蛋白的表达比较差异无统计学意义(P>0.05)。不同浓度DDP处理的A2780/DDP/KDM2A细胞的生长抑制率均显著高于A2780/DDP/NC和A2780/DDP细胞(P<0.05),A2780/DDP/KDM2A细胞克隆形成数量亦明显高于A2780/DDP/NC和A2780/DDP细胞(P<0.05)。A2780/DDP/KDM2A细胞凋亡率为(25.84±3.27)%,明显高于A2780/DDP细胞[(14.29±1.96)%](P<0.05)和A2780/DDP/NC细胞[(12.46±2.15)%](P<0.05)。A2780/DDP/KDM2A细胞中Bcl-2蛋白表达明显低于A2780/DDP细胞(P<0.05),而A2780/DDP/KDM2A细胞Bax的表达水平却高于A2780/DDP细胞(P<0.05)。结论:KDM2A可能通过上调Jagged1的表达,促进人卵巢癌细胞A2780的增殖并抑制其凋亡,进而降低人卵巢癌耐药细胞A2780的顺铂敏感性。 展开更多
关键词 卵巢癌 A2780细胞 kdm2A JAGGED1 顺铂 耐药
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水牛KDM1A/LSD1基因的克隆分析及真核表达载体的构建 被引量:2
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作者 赵鑫 俸云 +2 位作者 沈朋雷 石德顺 陆凤花 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2019年第7期14-20,25,共8页
本研究旨在对水牛组蛋白去甲基化酶KDM1A基因进行克隆,分析并构建真核表达载体,为研究其在水牛体细胞克隆胚胎中的作用提供基础。首先提取水牛卵巢总RNA,利用RT-PCR技术克隆得到水牛KDM1A基因并对其进行生物信息学分析。结果表明:水牛KD... 本研究旨在对水牛组蛋白去甲基化酶KDM1A基因进行克隆,分析并构建真核表达载体,为研究其在水牛体细胞克隆胚胎中的作用提供基础。首先提取水牛卵巢总RNA,利用RT-PCR技术克隆得到水牛KDM1A基因并对其进行生物信息学分析。结果表明:水牛KDM1A基因编码区全长2 625 bp,预测编码874个氨基酸;水牛KDM1A与其他物种同源性较高且与生物分类学保持一致;其所编码蛋白分子式为C2375H3855N805O776S24,理论分子质量为56 872.11;其二级结构由19个α螺旋,47个β折叠,25个T转角和无规则卷曲组成;其高级结构在水牛、黄牛、人之间具有较高的相似性;本实验构建了水牛pcDNA3.1(+)-KDM1A真核表达载体,转染pcDNA3.1(+)-KDM1A可以显著提高水牛耳部成纤维细胞(BFFs)中KDM1A的表达水平;还发现卵母细胞中KDM1A的表达水平显著高于BFFs。 展开更多
关键词 水牛 kdm1A基因 克隆分析 真核表达载体构建
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组蛋白去甲基化酶KDM3B在急性髓系白血病中的靶基因鉴定 被引量:2
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作者 宋磊 徐鑫 +2 位作者 赵瑶 王占聚 胡振波 《现代肿瘤医学》 CAS 2018年第8期1149-1154,共6页
目的:组蛋白H3赖氨酸9位(H3K9)的甲基化是造血和白血病发生中关键的表观遗传学修饰,由组蛋白甲基化酶和去甲基化酶精确调控。组蛋白H3K9去甲基化酶KDM3B则是一个潜在的白血病发生抑制基因。我们旨在探讨白血病中KDM3B的潜在靶基因。方法... 目的:组蛋白H3赖氨酸9位(H3K9)的甲基化是造血和白血病发生中关键的表观遗传学修饰,由组蛋白甲基化酶和去甲基化酶精确调控。组蛋白H3K9去甲基化酶KDM3B则是一个潜在的白血病发生抑制基因。我们旨在探讨白血病中KDM3B的潜在靶基因。方法:干涉多个急性髓系白血病细胞株中的KDM3B基因后进行微阵列芯片实验,采用基因集富集分析(GSEA)及Venn分析数据,筛选出若干KDM3B潜在的靶基因,并用实时定量PCR对CDKN1A基因的结果进行验证。结果:对比GSEA的分子标签数据库中标志基因集(H)和已建立的基因集(C2),在NB-4和PLB-985细胞中(分别影响),与KDM3 B正相关的基因分别有2 375和2 007个,其中P<0.05的基因分别有89和67个;与KDM3B负相关的基因分别有1 882和2 250个,其中P<0.05的基因分别有62和67个,包括FLT3、NRAS、EVI1和IL4等基因。对比GSEA的分子标签数据库中染色体位置(C1)、已建立的基因集(C2)、模序(C3)、肿瘤相关基因集(C4)、GO基因集(C5)、致瘤基因集(C6)、免疫学基因集(C7)和标志基因集(H),在NB-4和PLB-985细胞中(共同影响),与KDM3 B正相关的基因有4 815个,其中P<0.05的基因有130个;与KDM3B负相关的基因有4 400个,其中P<0.05的基因有97个,包括POU5F1和CDKN1A等基因。干扰NB-4和PLB-985细胞中KDM3B基因的表达,我们选取影响最强的600个探针用Venn分析,在两种细胞系中表达均下降的基因有16个,包括血液病相关基因CCDN3、TRIM24、MAPKI3、SOX6等;在NB-4细胞中表达降低但在PLB-985细胞中表达升高的基因有17个,包括RARRES3和CD58等基因。实时定量PCR结果显示干扰PLB-985细胞中KDM3B后CDKN1A的表达是对照组的1.18倍。结论:KDM3B调控急性髓系白血病相关基因,CDKN1A是一个潜在的KDM3B靶基因。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 表观遗传学 组蛋白去甲基化酶 kdm3B 微阵列芯片 基因集富集分析
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