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KDELR2在胶质瘤中的表达及临床意义:基于组织芯片技术分析 被引量:2
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作者 张娇 黄纯海 毛辉 《中国临床神经外科杂志》 2024年第3期151-156,176,共7页
目的探讨KDELR2在脑胶质瘤中的表达及其与胶质瘤病人临床特征、病理特征和预后的关系。方法选择组织芯片HBraG180Su01作为实验标本,收集并整理完整的临床资料。免疫组化染色检查胶质瘤组织KDELR2的表达,分析KDELR2的表达水平与胶质瘤病... 目的探讨KDELR2在脑胶质瘤中的表达及其与胶质瘤病人临床特征、病理特征和预后的关系。方法选择组织芯片HBraG180Su01作为实验标本,收集并整理完整的临床资料。免疫组化染色检查胶质瘤组织KDELR2的表达,分析KDELR2的表达水平与胶质瘤病人临床特征、病理特征以及预后的关系。结果最终纳入165例胶质瘤。免疫组化染色显示,KDELR2主要表达于胶质瘤细胞的细胞质。胶质瘤KDELR2表达阳性率高达98.18%;KDELR2表达水平与胶质瘤WHO分级、复发状态、PDL1表达及病人年龄、生存状态呈显著相关(P<0.05),与胶质瘤Ki-67、EGFR表达及病人性别无明显关系(P>0.05)。Cox比例回归风险模型分析显示,KDELR2高表达是胶质瘤病人生存预后不良的独立危险因素(P<0.05);生存曲线分析显示,KDELR2高表达组总体生存期和无进展生存期较KDELR2低表达组明显缩短(P<0.05)。结论胶质瘤KDELR2呈高表达,与胶质瘤WHO分级、复发显著相关,并与胶质瘤病人的生存预后显著相关。这提示KDELR2可作为胶质瘤靶向治疗的一个潜在靶点。 展开更多
关键词 脑胶质瘤 kdelr2 组织芯片 预后 基因表达
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KDELR2 promotes breast cancer proliferation via HDAC3-mediated cell cycle progression 被引量:5
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作者 Haoran Wei Wenhao Ma +12 位作者 Xiaofei Lu Haiying Liu Kashuai Lin Yinghui Wang Zijian Ye Linchong Sun Zhitong Huang Tingting Pan Zilong Zhou Eric Y.Cheng Huafeng Zhang Ping Gao Xiuying Zhong 《Cancer Communications》 SCIE 2021年第9期904-920,共17页
Background:Histone deacetylases(HDACs)engage in the regulation of various cellular processes by controlling global gene expression.The dysregulation of HDACs leads to carcinogenesis,making HDACs ideal targets for canc... Background:Histone deacetylases(HDACs)engage in the regulation of various cellular processes by controlling global gene expression.The dysregulation of HDACs leads to carcinogenesis,making HDACs ideal targets for cancer therapy.However,the use of HDAC inhibitors(HDACi)as single agents has been shown to have limited success in treating solid tumors in clinical studies.This study aimed to identify a novel downstream effector of HDACs to provide a potential target for combination therapy.Methods:Transcriptome sequencing and bioinformatics analysis were performed to screen for genes responsive toHDACi in breast cancer cells.The effects of HDACi on cell viability were detected using the MTT assay.The mRNA and protein levels of genes were determined by quantitative reverse transcription-PCR(qRT-PCR)andWestern blotting.Cell cycle distribution and apoptosis were analyzed by flow cytometry.The binding of CREB1(cAMP-response element binding protein 1)to the promoter of the KDELR(The KDEL(Lys-Asp-Glu-Leu)receptor)gene was validated by the ChIP(chromatin immunoprecipitation assay).The association between KDELR2 and protein of centriole 5(POC5)was detected by immunoprecipitation.A breast cancer-bearing mouse model was employed to analyze the effect of the HDAC3-KDELR2 axis on tumor growth.Results:KDELR2 was identified as a novel target of HDAC3,and its aberrant expression indicated the poor prognosis of breast cancer patients.We found a strong correlation between the protein expression patterns of HADC3 and KDELR2 in tumor tissues from breast cancer patients.The results of the ChIP assay and qRT-PCR analysis validated that HDAC3 transactivated KDELR2 via CREB1.The HDAC3-KDELR2 axis accelerated the cell cycle progression of cancer cells by protecting the centrosomal protein POC5 from proteasomal degradation.Moreover,the HDAC3-KDELR2 axis promoted breast cancer cell proliferation and tumorigenesis in vitro and in vivo.Conclusion:Our results uncovered a previously unappreciated function of KDELR2 in tumorigenesis,linking a critical Golgi-the endoplasmic reticulum traffic transport protein to HDAC-controlled cell cycle progression on the path of cancer development and thus revealing a potential therapeutical target for breast cancer. 展开更多
关键词 breast cancer histone deacetylase inhibitor kdelr2 HADC3 CREB1 protein of centriole 5
原文传递
基于生物信息学方法筛选影响胶质母细胞瘤的诊断及治疗的关键基因
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作者 肖珂 代兴亮 +3 位作者 茆翔 高鹏 周律 程宏伟 《临床医学进展》 2021年第3期1250-1260,共11页
目的:通过生物信息学方法对胶质母细胞瘤公共数据库进行信息挖掘以筛选胶质母细胞瘤的关键差异表达基因,预测胶质母细胞瘤的可能潜在治疗靶点基因。方法:从基因表达数据库(GEO)中下载脑胶质母细胞瘤数据,通过在线分析软件GEO2R筛选正常... 目的:通过生物信息学方法对胶质母细胞瘤公共数据库进行信息挖掘以筛选胶质母细胞瘤的关键差异表达基因,预测胶质母细胞瘤的可能潜在治疗靶点基因。方法:从基因表达数据库(GEO)中下载脑胶质母细胞瘤数据,通过在线分析软件GEO2R筛选正常组织与胶质母细胞瘤组织差异表达基因。通过Venn图取三个差异基因集交集。共筛选出632个共有差异基因。再通过STRING网站里的在线分析软件绘制PPI (protein-protein interaction network,蛋白互作网络),并导入Cytoscape软件利用MCODE插件筛选关键基因。通过R软件的Goplot包对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析。再通过UCSC网站的癌症基因浏览器获得各关键基因在脑胶质母细胞瘤中的表达。通过GEPIA2网站绘制各关键基因的生存曲线。通过Oncomine网站获得关键预后基因KDELR2、CDKN3及RELN基因在不同级别胶质瘤中的表达。结果:从GEO数据库中下载GSE104291、GSE15824、GSE66354的数据集,通过GEO2R分析出差异表达基因,再通过Venn图共筛选出632个共有差异表达基因。通过STRING网站构建蛋白互作网络,并导入Cytoscape软件筛选出关键基因。获得差异表达基因的GO及KEGG功能富集分析图。通过GEPIA2网站获得关键基因的总生存率及无病生存率,结果发现KDELR2、CDKN3及RELN基因的表达差异与总生存率(OS)和无病生存率(RFS)相关性具有统计学意义(KDELR2、CDKN3和RELN这三个基因的总生存率生存曲线Logrank P值分别为−10;KDELR2、CDKN3和RELN这三个基因的无病生存率生存曲线Logrank P值分别为【0.001,【0.001以及0.00032)。KDELR2及CDKN3在正常组织中低表达,在胶质瘤组织表达与级别成正相关;RELN在在正常组织中高表达,在胶质瘤组织表达与级别成负相关。结论:通过本研究发现胶质瘤OS和RFS与KDELR2及CDKN3基因呈负相关,与RELN基因呈正相关。结合这些基因的表达差异,由此推测KDELR2基因及CDKN3基因可能是脑胶质母细胞瘤的发生及进展的癌基因,而RELN基因可能是一个抑癌基因。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 生物信息分析 kdelr2 CDKN3 RELN
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内质网蛋白驻留受体2蛋白对胰腺癌恶性生长的影响及机制研究
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作者 王书航 吴晓阳 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2024年第2期118-131,共14页
目的:探讨赖氨酸-天冬氨酸-谷氨酸-亮氨酸(KDEL)内质网蛋白驻留受体2(endoplasmic reticulum protein retention receptor 2,KDELR2)对胰腺癌细胞恶性生长的影响,并初步探究相关作用分子机制。方法:通过癌症基因组学数据分析平台(UCSC X... 目的:探讨赖氨酸-天冬氨酸-谷氨酸-亮氨酸(KDEL)内质网蛋白驻留受体2(endoplasmic reticulum protein retention receptor 2,KDELR2)对胰腺癌细胞恶性生长的影响,并初步探究相关作用分子机制。方法:通过癌症基因组学数据分析平台(UCSC XENA)分析KDELR2 mRNA在泛癌和人胰腺癌组织中的表达水平;通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)分析其表达水平与胰腺癌患者临床病理特征及生存预后的关系;采用基因本体功能富集分析(Gene Ontology, GO)、京都基因和基因组数据库富集分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)探索KDELR2相关差异表达基因参与调节的信号通路;通过ssGSEA算法分析KDELR2免疫浸润情况。应用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和蛋白质印迹实验检测不同胰腺癌细胞系(BXPC-3、MIA PaCa-2、PANC-1、PaTu 8988-T)以及正常人胰腺导管上皮细胞(HPNE)中KDELR2的mRNA和蛋白表达水平,并检测人胰腺癌组织及对应癌旁组织中KDELR2的蛋白表达水平。通过慢病毒转染构建KDELR2过表达和敲减的稳转细胞株(PaTu 8988-T和PANC-1)及其对照空载体细胞株(“KDELR2-OE”和“Vec”、“shKDELR2-S1/S2”和“shNC”),利用CCK8、EdU、Transwell、细胞克隆形成实验观察KDELR2过表达及敲低后稳转细胞株的生物学行为变化;使用JC-1、MitoSOX和DCFH-DA染色实验以及检测ATP水平观察PaTu 8988-T和PANC-1细胞KDELR2敲低后的线粒体功能。通过构建裸鼠皮下荷瘤模型观察KDELR2敲低对胰腺癌PANC-1细胞在体生长的影响。结果:KDELR2在人胰腺癌组织及细胞中显著高表达,其高表达水平与胰腺癌患者的病理特征及不良预后密切相关。GO功能和KEGG富集分析表明,KDELR2可能通过调控细胞能量代谢调节胰腺癌细胞生长。敲低KDELR2显著抑制胰腺癌细胞的增殖和迁移能力,过表达KDELR2显著促进胰腺癌细胞的增殖和迁移能力;KDELR2敲低后,胰腺癌细胞线粒体膜电位明显下降,活性氧水平明显升高,ATP水平明显降低(P均<0.05)。裸鼠皮下荷瘤模型证实KDELR2敲低显著抑制胰腺癌细胞的在体生长。结论:KDELR2在胰腺癌中显著高表达且与患者不良预后密切相关,KDELR2可能参与调控线粒体的功能影响癌细胞能量代谢。 展开更多
关键词 胰腺癌 内质网蛋白驻留受体2 治疗靶点 增殖 迁移
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