期刊文献+
共找到6篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
新一代分子可视化软件Jmol及其教学应用简介 被引量:6
1
作者 白涛 马红艳 《化学教育》 CAS 北大核心 2012年第11期77-82,共6页
Jmol是一个用Java语言编写的免费的、开源的、跨平台的新一代分子可视化软件,我国化学教育工作者对其认识还较生疏。介绍Jmol的使用以及基于它开发的网络资源,并提供了在化学教学中的应用案例,以期对我国化学教育开展分子可视化教学... Jmol是一个用Java语言编写的免费的、开源的、跨平台的新一代分子可视化软件,我国化学教育工作者对其认识还较生疏。介绍Jmol的使用以及基于它开发的网络资源,并提供了在化学教学中的应用案例,以期对我国化学教育开展分子可视化教学提供参考。 展开更多
关键词 分子可视化 jmol 化学教学 电子云模型 晶体模型
在线阅读 下载PDF
Jmol:新一代分子结构查看软件 被引量:4
2
作者 李安邦 《中国医学教育技术》 2011年第3期293-296,共4页
Jmol是一个用Java语言编写的免费的、源代码开放、跨平台的分子结构查看软件,它既可以作为独立的程序安装在本地计算机上运行,也可以嵌入在网页中运行,近年来在大量的分子结构数据库网站和教学网站中得到了广泛应用。文章介绍了Jmol的... Jmol是一个用Java语言编写的免费的、源代码开放、跨平台的分子结构查看软件,它既可以作为独立的程序安装在本地计算机上运行,也可以嵌入在网页中运行,近年来在大量的分子结构数据库网站和教学网站中得到了广泛应用。文章介绍了Jmol的性能、安装及操作方法,尤其是右键菜单操作方法,以提高其查看效果。 展开更多
关键词 分子结构查看 jmol 三维结构
在线阅读 下载PDF
利用闪烁直观观察生物大分子三维结构片段 被引量:1
3
作者 王攀 何光源 杨广笑 《华中科技大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第10期128-132,共5页
为了克服Rasmol和Jmol等传统工具在局部片段观察方面的缺陷,开发了基于Web利用闪烁直观观察生物大分子三维结构片段的可视化系统.该系统基于Jmol,利用HTML,Javascript,PHP和MySQL等Web相关技术,拓展了闪烁片段设置与观察相关功能.拓展... 为了克服Rasmol和Jmol等传统工具在局部片段观察方面的缺陷,开发了基于Web利用闪烁直观观察生物大分子三维结构片段的可视化系统.该系统基于Jmol,利用HTML,Javascript,PHP和MySQL等Web相关技术,拓展了闪烁片段设置与观察相关功能.拓展功能主要包括:几乎所有的操作通过用户熟悉、使用方便的网页控件而不是传统工具主要采用的文本命令或顶层(或弹出)菜单来完成;同时显示分子序列文本以及单体编号信息,以便对局部片段定位;通过外观状态在隐藏与显示之间来回循环地切换实现片断闪烁效果;与Word或Phoposhop类似,历史操作状态可以通过列表进行撤销或重做,当前状态可以保存到服务器以便后续研究.该系统在实际应用中对专家和新用户都表现出较好效果. 展开更多
关键词 生物大分子 三维可视化 分子片段 闪烁 WEB jmol
原文传递
用序列文本动态参照协助生物分子3D结构观察
4
作者 王攀 何光源 杨广笑 《华中科技大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第4期128-132,共5页
为了克服Jmol等传统工具在序列信息参照方式方面存在的缺陷,提出并实现了一种利用序列文本动态参照协助生物分子3D结构观察的方法.该方法利用Javascript,Frame,DIV,CSS,PHP和MySQL等Web相关技术,在Jmol基础上进行功能拓展.首先,分子序... 为了克服Jmol等传统工具在序列信息参照方式方面存在的缺陷,提出并实现了一种利用序列文本动态参照协助生物分子3D结构观察的方法.该方法利用Javascript,Frame,DIV,CSS,PHP和MySQL等Web相关技术,在Jmol基础上进行功能拓展.首先,分子序列文本与3D结构同时显示,且随着各种针对局部片段的操作同步发生变化.通过对序列文本特定编排以方便对局部片段的查看和定位,且利用下划线、删除线、上划线等多种文本样式及其配色来直观地表示多种局部操作结果状态.此外,还提供了多个序列片段的集中显示、历史操作状态的切换、当前状态的服务器保存等辅助功能.该方法在实际应用中取得了较好效果,有助于提升生物分子序列和结构相关生物信息的整合、模拟和可视化水平. 展开更多
关键词 生物分子 3D可视化 序列文本 WEB jmol
原文传递
PDBlocal:A web-based tool for local inspectionof biological macromolecular 3D structures
5
作者 Pan Wang Guangxiao Yang Guangyuan He 《Journal of Innovative Optical Health Sciences》 SCIE EI CAS 2018年第2期39-50,共12页
Functional research on biological macromolecules must fcus on specific loca regions.PDBlocal is aweb-based tool developed to overcome the limitations of traditional molecular visualization tools forthre-dimensional(3D... Functional research on biological macromolecules must fcus on specific loca regions.PDBlocal is aweb-based tool developed to overcome the limitations of traditional molecular visualization tools forthre-dimensional(3D)inspection of local regions.PDBlocal provides an intuitive and easy-to-manipulate web page interface and some new useful functions.It can kep loca regions flashing,display sequence text that is dynamically consistent with the 3D structure in local appearance undermultiple local manipulations,use two scenes to help users inspect the same local region withdifferent statuses,list all historical manipulation statuses with a tree structure,llow users toannotate regions ofinterest,and save ll historical statuses and other data to a web server for futureresearch.PDBlocal has met expectations and shown satisfactory performance for both expert andnovice users.This tool is available at http:/labsystem.scuec.edu.cn/pdblocal/. 展开更多
关键词 Biological macromolecule 3D visualization molecular local structure web jmol.
原文传递
虚拟现实技术在化学分子结构教学上的应用简介 被引量:15
6
作者 李嘉 《化学教育(中英文)》 CAS 北大核心 2018年第3期49-54,共6页
利用开源免费的软件VESTA,Jmol以及Blender制作金刚石晶体结构和氨气分子空间结构的VR3D动画,通过简单的、交互式的网页设计和VR眼镜来体验虚拟现实技术所提供的沉浸式的体验感来激发学生的学习兴趣,为化学分子结构教学提供参考。
关键词 jmol VESTA Blender 虚拟现实 晶体模型 化学教学 交互式网页
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部