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稻瘟病菌MYB转录因子MoIsw2调控基因的鉴定和功能分析 被引量：1
1
作者 裴梦甜 王鑫潇 +2 位作者 余庆 鲁国东 李亚 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期598-609,共12页
【目的】MYB(V-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子MoIsw2对稻瘟病菌的生长发育和致病性至关重要。为了深入理解MoIsw2对稻瘟病菌的作用机制,对其调控的基因进行鉴定和功能分析。【方法】对野生型稻瘟病菌菌株K... 【目的】MYB(V-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子MoIsw2对稻瘟病菌的生长发育和致病性至关重要。为了深入理解MoIsw2对稻瘟病菌的作用机制,对其调控的基因进行鉴定和功能分析。【方法】对野生型稻瘟病菌菌株Ku80和突变体ΔMoisw2进行RNA-seq分析,选择突变体中表达发生明显变化的7个基因(MoEGH16L1、MoEGH16L2、MoSTA-RT1、MoGH61A、MoCTR1、MoFRO1和MoGH31A)作为MoIsw2的候选调控基因,通过基因敲除对其表型和致病性进行分析。【结果】RNA-seq分析表明,突变体ΔMoisw2中差异表达的基因主要涉及氧化还原、细胞膜合成、氨基酸代谢和基因组DNA修复等过程。7个候选调控基因的敲除试验结果表明,这些基因在稻瘟病菌的营养生长、孢子发育和致病等过程中发挥重要作用,各基因突变体表型与突变体ΔMoisw2均具有相似之处。【结论】MoIsw2通过调控多个靶基因参与稻瘟病菌的生长发育和致病过程。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 MYB转录因子 isw2 转录组测序 基因功能
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ISW2缺失下基因功能对核小体定位影响的研究
2
作者 胡焕 丰继华 +2 位作者 魏恨恨 周晓雯 李泽华 《生物物理学》 2015年第4期67-76,共10页
为研究染色质重塑因子对核小体定位的影响以及ISW2缺失情况下基因功能对核小体形成的作用,本文分别对ISW2敲除、野生型(WT)及富营养培养条件下(YPD)三种酵母核小体占位率数据进行聚类、比较、分析后发现,在ISW2缺失情况下核小体的位置远... 为研究染色质重塑因子对核小体定位的影响以及ISW2缺失情况下基因功能对核小体形成的作用,本文分别对ISW2敲除、野生型(WT)及富营养培养条件下(YPD)三种酵母核小体占位率数据进行聚类、比较、分析后发现,在ISW2缺失情况下核小体的位置远离TSS,同时发现11种基因功能对核小体的定位产生了显著影响。 展开更多
关键词 核小体定位 基因功能(GO) isw2 野生型 富营养培养
暂未订购
3种条件下基因功能对核小体定位影响的研究
3
作者 周晓雯 胡焕 +3 位作者 丰继华 李泽华 陈静 于华峥 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期5143-5150,共8页
为研究基因功能对核小体定位的影响,本研究对ISW2敲除型、野生型(WT)和富营养培养条件下(YPD)的酵母核小体占位率的实验数据进行聚类、比较、分析后,发现有9种基因功能对核小体的定位产生了显著影响,为今后进一步了解基因功能与核小体... 为研究基因功能对核小体定位的影响,本研究对ISW2敲除型、野生型(WT)和富营养培养条件下(YPD)的酵母核小体占位率的实验数据进行聚类、比较、分析后,发现有9种基因功能对核小体的定位产生了显著影响,为今后进一步了解基因功能与核小体定位的关系提供了一定的参考价值。 展开更多
关键词 核小体定位 基因功能(GO) isw2 野生型 富营养培养
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