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整合素亚基alpha 2基因多态性与冠状动脉慢性闭塞病变易感性及疾病预测模型研究
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作者 吕桐巍 张竞予 +3 位作者 阚通 侯攀 李攀 郭志福 《中国心血管病研究》 2025年第6期490-496,共7页
目的探讨整合素亚基alpha 2(ITGA2)基因单核苷酸多态性(SNPs)与冠状动脉慢性闭塞病变(CTO)易感性之间的关联,并根据危险因素建立并优化CTO发生风险预测模型。方法本研究采用单中心回顾性病例对照设计,依据慢性冠状动脉完全闭塞性病变学... 目的探讨整合素亚基alpha 2(ITGA2)基因单核苷酸多态性(SNPs)与冠状动脉慢性闭塞病变(CTO)易感性之间的关联,并根据危险因素建立并优化CTO发生风险预测模型。方法本研究采用单中心回顾性病例对照设计,依据慢性冠状动脉完全闭塞性病变学术研究联合会共识(CTO-ARC)及日本CTO介入专家共识(J-CTO≥2分)于2024年8月1日至12月1日期间在中国人民解放军海军军医大学第一附属医院筛选病例组(n=264),对照组(n=236)经计算机辅助的定量分析法(QCA)严格排除动脉粥样硬化(狭窄<20%+钙化积分<100)。全队列排除活动性感染、恶性肿瘤、免疫疾病及急性血管病变。通过PCR和基因分型技术,对选定的ITGA2基因SNPs rs35235进行分析,并利用R语言4.2.2进行统计分析,评估不同基因型与CTO病变风险的相关性。并使用支持向量机(SVM),梯度提升机(GBM),随机森林(RF)等9种机器学习算法建立并优化CTO发生风险预测模型。结果ITGA2基因SNPs rs35235位点的TT基因型为罹患CTO病变的保护因素(OR=0.33,95%CI 0.16~0.66)。ROC曲线分析显示,SNPs基因型结合传统危险因素的预测效能(AUC1=0.84)与单独传统危险因素的预测效能(AUC2=0.826)相比有提高,差异具有统计学意义(P=0.028)。逻辑回归、SVM、GBM、神经网络(NN)、Xgboost、K-近邻(KNN)、LightGBM、Catboost、RF 9种机器学习算法建立的CTO风险预测模型AUC值分别为0.845、0.803、0.950、0.879、0.867、0.948、0.932、0.926、0.908,且在GBM算法预测模型中排名前七的危险因素依次为:性别、低密度脂蛋白、总胆固醇、纤维蛋白原、SNPs基因型、患糖尿病、空腹血糖。结论ITGA2基因的SNPs rs35235 TT基因型为罹患CTO病变的保护因素,为CTO病变的遗传学研究提供了新的视角。SNPs基因型作为遗传标记具有不受药物干预的影响的能力,为临床提供了一个更为稳定和可靠的风险预测指标,且GBM机器学习算法是最优拟合预测模型。 展开更多
关键词 整合素亚基alpha 2 单核苷酸多态性 冠状动脉慢性闭塞病变 风险预测模型
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红花口服液缓解神经病理性疼痛的分子机制 被引量：4
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作者 郭秋岩 赵明洪 +11 位作者 卢天明 夏斐 张迎 张红兵 翟晓茹 杨倩 李永东 李晋 李欣 沈硕 谷丽维 杜茂波 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期222-230,共9页
目的:考察红花口服液(HOL)缓解神经病理性疼痛(NP)的药效作用特点并探究其分子作用机制。方法:基于脊神经结扎(SNL)大鼠模型,将健康雄性SD大鼠随机分为假手术组,模型组,HOL低、中、高剂量组(0.5、1.0、2.0 mL·kg^(-1)·d^(-1)... 目的:考察红花口服液(HOL)缓解神经病理性疼痛(NP)的药效作用特点并探究其分子作用机制。方法:基于脊神经结扎(SNL)大鼠模型,将健康雄性SD大鼠随机分为假手术组,模型组,HOL低、中、高剂量组(0.5、1.0、2.0 mL·kg^(-1)·d^(-1))及阳性药普瑞巴林组(25 mg·kg^(-1)·d^(-1)),每组6只。在脊神经结扎手术恢复3 d后,连续灌胃给药14 d并采集样本。期间检测各组大鼠的机械痛阈值和冷痛阈值,考察HOL的镇痛作用特点。将假手术组、模型组、HOL高剂量组的海马组织样本进行转录组测序,获取不同组别之间的差异表达基因,并进行通路富集分析,进而,选择与NP密切相关的靶标进行验证,进一步通过分子对接寻找HOL关键活性成分与靶标分子的具体结合位点。此外,检测血清中肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素-10(IL-10)的表达水平,评价HOL对NP大鼠的影响。结果:与假手术组比较,模型组大鼠的机械痛阈值及冷痛阈值均明显降低(P<0.05)。与模型组比较,HOL组可有效升高其机械痛阈值及冷痛阈值(P<0.05);转录组分析发现,模型组与假手术组比较共有376个差异表达基因,其中上调基因124个、下调基因252个,模型组与HOL组比较共有194个差异表达基因,其中上调基因33个、下调基因161个。其中,类胰岛素一号生长因子(IGF1)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、基质金属蛋白酶-14(MMP-14)、酪氨酸激酶受体2(ERBB2)和整合素A5(ITGA5)与NP密切相关。实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)结果显示,与假手术组比较,模型组大鼠海马中上述各分子的mRNA表达量均显著升高(P<0.01)。与模型组比较,HOL组可有效降低其mRNA表达量(P<0.01)。分子对接结果显示,红花主要活性成分羟基红花黄色素A、山奈酚和槲皮素与上述靶标分子IGF1、MMP-2、MMP-14、ERBB2、ITGA5的氨基酸残基形成稳定的氢键作用力。酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测结果显示,与假手术组比较,模型组大鼠血清中TNF-α/IL-10表达失衡(P<0.01),与模型组比较,HOL组可显著减少促炎细胞因子TNF-α的含量(P<0.01),增加抗炎细胞因子IL-10的含量(P<0.05)。结论:HOL对SNL大鼠具有镇痛作用,其机制与抑制神经炎症密切相关。 展开更多
关键词 红花口服液 神经病理性疼痛 胰岛素样生长因子 基质金属蛋白酶 酪氨酸激酶受体2 整合素A5
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