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基于SSR和InDel标记的海南荔枝种质资源遗传多样性分析
被引量：
10
1
作者
李焕苓
田婉莹
+5 位作者
孙进华
张新春
张蕾
王果
王树军
王家保
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期1343-1356,共14页
为了解232份主要来自海南的栽培荔枝、半野生荔枝和野生荔枝的遗传多样性及其演化地位,摸清荔枝品种中存在的同名异物和同物异名问题;本研究依据获得的荔枝EST序列和基因组序列开发了一批SSR和InDel标记,利用这些标记对232份荔枝种质资...
为了解232份主要来自海南的栽培荔枝、半野生荔枝和野生荔枝的遗传多样性及其演化地位,摸清荔枝品种中存在的同名异物和同物异名问题;本研究依据获得的荔枝EST序列和基因组序列开发了一批SSR和InDel标记,利用这些标记对232份荔枝种质资源进行了遗传多样性研究;取6个荔枝品种DNA为模板,筛选出18对SSR引物和12对InDel引物应用于遗传多样性研究,检测到基因位点141个,等位基因变异数范围为2~11个,平均4.70个,多态性位点为139个,多态性位点比率是98.58%。UPGMA聚类分析发现,232份荔枝种质资源的遗传相似系数是0.66~1.00;发现SSR引物的多态性大于InDel引物;在遗传相似系数为0.76处,供试材料分为15类,多数来自海南的荔枝资源能一起聚类,海南11份野生荔枝资源分别聚类在5个类群中,说明海南野生荔枝资源的遗传多样性较丰富。研究将为进一步开展荔枝遗传改良和育种提供依据。
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关键词
荔枝
SSR
inde1
遗传多样性
原文传递
玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析
被引量：
6
2
作者
谭贤杰
宋燕春
+4 位作者
石云素
程伟东
吴子恺
王天宇
黎裕
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期58-66,共9页
Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95...
Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95份自交系的ZmRCA1进行测序,获得长约1 680 bp的基因组序列。多态分析表明,在1 680 bp的区间内共发现22个SNP和8个InDel,其中5个SNP和1个InDel变异产生氨基酸序列改变;频率在0.1以上的13个多态性位点共形成27种单倍型,利用6个多态性位点就可以分辨约90%的单倍型。ZmRCA1基因具有高度序列保守性,基因DNA序列相似性为97.9%,而氨基酸序列的相似性则达99.8%;中性检验表明,ZmRCA1基因符合中性进化模型假设,没有发生纯化选择。
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关键词
Rubisco活化酶(RCA)
单核苷酸多态性(SNP)
inde1
连锁不平衡(LD)
单倍犁
单倍犁标签SNP
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职称材料
多馈入直流系统换相失败免疫水平快速确定方法研究
被引量：
47
3
作者
肖浩
朱佳
+1 位作者
李银红
李明
《中国电机工程学报》
EI
CSCD
北大核心
2015年第11期2711-2717,共7页
针对目前多馈入直流输电系统中换相失败研究主要采用仿真手段的情况,基于最小熄弧角判断标准,推导多馈入直流系统中当地换相失败免疫因子和同时换相失败免疫因子的解析表达式。通过表达式可快速而有效地确定系统参数对多馈入直流系统中...
针对目前多馈入直流输电系统中换相失败研究主要采用仿真手段的情况,基于最小熄弧角判断标准,推导多馈入直流系统中当地换相失败免疫因子和同时换相失败免疫因子的解析表达式。通过表达式可快速而有效地确定系统参数对多馈入直流系统中逆变站换相失败免疫水平的影响:当地换相失败免疫因子与故障交流系统有效短路比具有近似的线性关系;在临界多馈入交互作用因子不变时,同时换相失败免疫因子与故障交流系统有效短路比成正比关系,与多馈入交互作用因子成反相关。基于CIGRE直流输电标准模型搭建了双馈入直流输电系统,仿真结果验证了表达式的有效性和准确性。
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关键词
多馈入直流输电系统
换相失败
换相失败免疫因
子
有效短路比
多馈入交互作用因子
原文传递
题名
基于SSR和InDel标记的海南荔枝种质资源遗传多样性分析
被引量：
10
1
作者
李焕苓
田婉莹
孙进华
张新春
张蕾
王果
王树军
王家保
机构
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期1343-1356,共14页
基金
本研究由国家荔枝龙眼产业技术体系项目(CARS-33-03)和“十二五”农村领域国家科技计划项目(2013BAD02802-5)共同资助
文摘
为了解232份主要来自海南的栽培荔枝、半野生荔枝和野生荔枝的遗传多样性及其演化地位,摸清荔枝品种中存在的同名异物和同物异名问题;本研究依据获得的荔枝EST序列和基因组序列开发了一批SSR和InDel标记,利用这些标记对232份荔枝种质资源进行了遗传多样性研究;取6个荔枝品种DNA为模板,筛选出18对SSR引物和12对InDel引物应用于遗传多样性研究,检测到基因位点141个,等位基因变异数范围为2~11个,平均4.70个,多态性位点为139个,多态性位点比率是98.58%。UPGMA聚类分析发现,232份荔枝种质资源的遗传相似系数是0.66~1.00;发现SSR引物的多态性大于InDel引物;在遗传相似系数为0.76处,供试材料分为15类,多数来自海南的荔枝资源能一起聚类,海南11份野生荔枝资源分别聚类在5个类群中,说明海南野生荔枝资源的遗传多样性较丰富。研究将为进一步开展荔枝遗传改良和育种提供依据。
关键词
荔枝
SSR
inde1
遗传多样性
Keywords
Litchi, SSR, InDel, Genetic diversity
分类号
S667.1 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析
被引量：
6
2
作者
谭贤杰
宋燕春
石云素
程伟东
吴子恺
王天宇
黎裕
机构
广西大学农学院
广西农业科学院玉米研究所
中国农业科学院作物科学研究所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期58-66,共9页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2011CB100100
2009CB118401)
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10Z188)资助
文摘
Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95份自交系的ZmRCA1进行测序,获得长约1 680 bp的基因组序列。多态分析表明,在1 680 bp的区间内共发现22个SNP和8个InDel,其中5个SNP和1个InDel变异产生氨基酸序列改变;频率在0.1以上的13个多态性位点共形成27种单倍型,利用6个多态性位点就可以分辨约90%的单倍型。ZmRCA1基因具有高度序列保守性,基因DNA序列相似性为97.9%,而氨基酸序列的相似性则达99.8%;中性检验表明,ZmRCA1基因符合中性进化模型假设,没有发生纯化选择。
关键词
Rubisco活化酶(RCA)
单核苷酸多态性(SNP)
inde1
连锁不平衡(LD)
单倍犁
单倍犁标签SNP
Keywords
Rubisco activase（RCA）
SNP
InDel
LD
Haplotype
htSNP
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
多馈入直流系统换相失败免疫水平快速确定方法研究
被引量：
47
3
作者
肖浩
朱佳
李银红
李明
机构
强电磁工程与新技术国家重点实验室(华中科技大学)
南方电网科学研究院
出处
《中国电机工程学报》
EI
CSCD
北大核心
2015年第11期2711-2717,共7页
文摘
针对目前多馈入直流输电系统中换相失败研究主要采用仿真手段的情况,基于最小熄弧角判断标准,推导多馈入直流系统中当地换相失败免疫因子和同时换相失败免疫因子的解析表达式。通过表达式可快速而有效地确定系统参数对多馈入直流系统中逆变站换相失败免疫水平的影响:当地换相失败免疫因子与故障交流系统有效短路比具有近似的线性关系;在临界多馈入交互作用因子不变时,同时换相失败免疫因子与故障交流系统有效短路比成正比关系,与多馈入交互作用因子成反相关。基于CIGRE直流输电标准模型搭建了双馈入直流输电系统,仿真结果验证了表达式的有效性和准确性。
关键词
多馈入直流输电系统
换相失败
换相失败免疫因
子
有效短路比
多馈入交互作用因子
Keywords
multi-infeed HVDC transmission system[commutation failure
commutation failure immunity
inde1
（CFII）
effective short circuit ratio （ESCR）
multi-infee1interaction factor （MIIF） /
分类号
TM726 [电气工程—电力系统及自动化]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SSR和InDel标记的海南荔枝种质资源遗传多样性分析
李焕苓
田婉莹
孙进华
张新春
张蕾
王果
王树军
王家保
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018
10
原文传递
2
玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析
谭贤杰
宋燕春
石云素
程伟东
吴子恺
王天宇
黎裕
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
多馈入直流系统换相失败免疫水平快速确定方法研究
肖浩
朱佳
李银红
李明
《中国电机工程学报》
EI
CSCD
北大核心
2015
47
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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