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甘薯响应蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f.sp batatas)侵染的IbERF1基因序列与表达分析 被引量:2
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作者 刘意 陈培茹 +7 位作者 雷剑 王连军 柴沙沙 靳晓杰 王晴芳 焦春海 张文英 杨新笋 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期175-184,共10页
为了阐明甘薯(Ipomoea batatas)IbERF基因在生物胁迫中的作用,以高抗蔓割病(fusarium wilt)的品种‘鄂薯11’为供试材料,克隆到IbERF1基因,并对其进行生物信息学分析,同时对蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f.sp batatas)侵染、外施茉... 为了阐明甘薯(Ipomoea batatas)IbERF基因在生物胁迫中的作用,以高抗蔓割病(fusarium wilt)的品种‘鄂薯11’为供试材料,克隆到IbERF1基因,并对其进行生物信息学分析,同时对蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f.sp batatas)侵染、外施茉莉酸甲酯和乙烯利的基因表达模式进行了分析。生物信息学分析结果显示,IbERF1的CDS序列全长为588 bp,编码195个氨基酸;推测其编码不稳定的亲水性蛋白,蛋白分子质量为21.97 ku,等电点为5.11。IbERF1启动子区存在多种类型的启动子顺式作用元件,如植物激素应答元件Myb和胁迫响应元件MYC、MYB。多序列比对及系统进化树分析结果表明,IbERF1蛋白与日本牵牛花InERF1B-like的亲缘关系最近。亚细胞定位预测以及实验显示IbERF1蛋白定位于细胞核。蛋白二级结构预测显示,IbERF1蛋白含无规则卷曲结构27.69%,α-螺旋结构53.85%,延伸链结构12.31%,β-转角结构6.15%。实时荧光定量PCR分析结果显示,蔓割病病原菌侵染2 h和侵染4 h后,‘鄂薯11’的IbERF1表达量显著提高(P<0.05);茉莉酸甲酯和乙烯利各处理2,4和12 h,其表达量也显著提高。综上,IbERF1受蔓割病病原菌、茉莉酸甲酯以及乙烯利诱导表达。 展开更多
关键词 甘薯 iberf1 蔓割病 茉莉酸甲酯 乙烯利
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