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甘薯响应蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f.sp batatas)侵染的IbERF1基因序列与表达分析
被引量:
2
1
作者
刘意
陈培茹
+7 位作者
雷剑
王连军
柴沙沙
靳晓杰
王晴芳
焦春海
张文英
杨新笋
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期175-184,共10页
为了阐明甘薯(Ipomoea batatas)IbERF基因在生物胁迫中的作用,以高抗蔓割病(fusarium wilt)的品种‘鄂薯11’为供试材料,克隆到IbERF1基因,并对其进行生物信息学分析,同时对蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f.sp batatas)侵染、外施茉...
为了阐明甘薯(Ipomoea batatas)IbERF基因在生物胁迫中的作用,以高抗蔓割病(fusarium wilt)的品种‘鄂薯11’为供试材料,克隆到IbERF1基因,并对其进行生物信息学分析,同时对蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f.sp batatas)侵染、外施茉莉酸甲酯和乙烯利的基因表达模式进行了分析。生物信息学分析结果显示,IbERF1的CDS序列全长为588 bp,编码195个氨基酸;推测其编码不稳定的亲水性蛋白,蛋白分子质量为21.97 ku,等电点为5.11。IbERF1启动子区存在多种类型的启动子顺式作用元件,如植物激素应答元件Myb和胁迫响应元件MYC、MYB。多序列比对及系统进化树分析结果表明,IbERF1蛋白与日本牵牛花InERF1B-like的亲缘关系最近。亚细胞定位预测以及实验显示IbERF1蛋白定位于细胞核。蛋白二级结构预测显示,IbERF1蛋白含无规则卷曲结构27.69%,α-螺旋结构53.85%,延伸链结构12.31%,β-转角结构6.15%。实时荧光定量PCR分析结果显示,蔓割病病原菌侵染2 h和侵染4 h后,‘鄂薯11’的IbERF1表达量显著提高(P<0.05);茉莉酸甲酯和乙烯利各处理2,4和12 h,其表达量也显著提高。综上,IbERF1受蔓割病病原菌、茉莉酸甲酯以及乙烯利诱导表达。
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关键词
甘薯
iberf1
蔓割病
茉莉酸甲酯
乙烯利
原文传递
题名
甘薯响应蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f.sp batatas)侵染的IbERF1基因序列与表达分析
被引量:
2
1
作者
刘意
陈培茹
雷剑
王连军
柴沙沙
靳晓杰
王晴芳
焦春海
张文英
杨新笋
机构
长江大学
湖北省农业科学院粮食作物研究所
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期175-184,共10页
基金
湖北省引进国外人才和智力项目(2020WY002)
国家重点研发计划项目(2019YFD1001300,2019YFD1001305)共同资助。
文摘
为了阐明甘薯(Ipomoea batatas)IbERF基因在生物胁迫中的作用,以高抗蔓割病(fusarium wilt)的品种‘鄂薯11’为供试材料,克隆到IbERF1基因,并对其进行生物信息学分析,同时对蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f.sp batatas)侵染、外施茉莉酸甲酯和乙烯利的基因表达模式进行了分析。生物信息学分析结果显示,IbERF1的CDS序列全长为588 bp,编码195个氨基酸;推测其编码不稳定的亲水性蛋白,蛋白分子质量为21.97 ku,等电点为5.11。IbERF1启动子区存在多种类型的启动子顺式作用元件,如植物激素应答元件Myb和胁迫响应元件MYC、MYB。多序列比对及系统进化树分析结果表明,IbERF1蛋白与日本牵牛花InERF1B-like的亲缘关系最近。亚细胞定位预测以及实验显示IbERF1蛋白定位于细胞核。蛋白二级结构预测显示,IbERF1蛋白含无规则卷曲结构27.69%,α-螺旋结构53.85%,延伸链结构12.31%,β-转角结构6.15%。实时荧光定量PCR分析结果显示,蔓割病病原菌侵染2 h和侵染4 h后,‘鄂薯11’的IbERF1表达量显著提高(P<0.05);茉莉酸甲酯和乙烯利各处理2,4和12 h,其表达量也显著提高。综上,IbERF1受蔓割病病原菌、茉莉酸甲酯以及乙烯利诱导表达。
关键词
甘薯
iberf1
蔓割病
茉莉酸甲酯
乙烯利
Keywords
Ipomoea batatas
iberf1
Fusarium wilt
MeJA
ETH
分类号
S435.31 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘薯响应蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f.sp batatas)侵染的IbERF1基因序列与表达分析
刘意
陈培茹
雷剑
王连军
柴沙沙
靳晓杰
王晴芳
焦春海
张文英
杨新笋
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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