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甘薯CLE多肽家族的全基因组鉴定和IbCLE12的克隆及抗旱性表达分析
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作者 周媛媛 赵春玲 +4 位作者 侯夫云 李爱贤 秦桢 王庆美 董顺旭 《山东农业科学》 北大核心 2023年第5期1-7,共7页
CLAVATA3/Embryo surrounding region-related(CLE)多肽作为植物体内小分子信号激素,在植物的生长发育和抗逆性中发挥重要的调控作用。本研究从甘薯近缘野生种Ipomoea trifida的基因组数据库中筛选出12个ItfCLE基因,并对其结构、蛋白理... CLAVATA3/Embryo surrounding region-related(CLE)多肽作为植物体内小分子信号激素,在植物的生长发育和抗逆性中发挥重要的调控作用。本研究从甘薯近缘野生种Ipomoea trifida的基因组数据库中筛选出12个ItfCLE基因,并对其结构、蛋白理化性质、进化关系以及转录水平的表达进行了分析。结果表明,12个ItfCLE蛋白的长度和分子量分别为81~154 aa和9.0~17.5 kDa;均具有C末端保守基序(VSKRKVPSGPBPJHN);除了ItfCLE2和ItfCLE6,均为不稳定蛋白;除了ItfCLE5,均为亲水性脂溶蛋白;亚细胞定位表明均为胞外分泌型小肽。进化分析表明这12个CLE多肽属于5个不同的亚组。表达模式分析表明,各ItfCLE基因在不同组织中的表达不同,ItfCLE9和ItfCLE10在花中表达较高,ItfCLE4和ItfCLE12在根中表达较高,ItfCLE2、ItfCLE6和ItfCLE8在茎中表达较高;ItfCLE12基因受干旱诱导表达最高,ItfCLE8受干旱和盐胁迫诱导上调表达。进一步从甘薯栽培种济薯25中克隆ItfCLE12的同源基因IbCLE12,实时荧光定量结果表明IbCLE12受PEG6000干旱和ABA处理诱导显著上调表达,推测IbCLE12在甘薯抗旱性中发挥重要的调控作用。本研究结果可为进一步解析甘薯CLE多肽家族功能及IbCLE12基因在甘薯抗旱性中的分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 甘薯 CLE多肽 生物信息学分析 ibcle12 基因表达 抗旱性
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