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连翘居群遗传多样性的ISSR分析
1
作者 汤正辉 代子闻 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2025年第5期132-140,153,共10页
【目的】分析连翘Forsythia suspensa自然居群的遗传多样性,为野生连翘种质资源收集、保存和良种选育等研究提供理论依据。【方法】应用ISSR分子标记对分布广泛的9个连翘自然居群138个野生单株进行遗传多样性分析。【结果】12条引物共得... 【目的】分析连翘Forsythia suspensa自然居群的遗传多样性,为野生连翘种质资源收集、保存和良种选育等研究提供理论依据。【方法】应用ISSR分子标记对分布广泛的9个连翘自然居群138个野生单株进行遗传多样性分析。【结果】12条引物共得到4485个重复性好的位点,平均每条引物扩增条带的数目为373.8条,使用POPGENE 32软件进行分析,在物种水平上,多态位点百分率为100%;总遗传多样性指数(Nei’s基因多样性指数H)为0.1091,Shannon信息多样性指数(I)为0.2010;居群间遗传分化系数(Gst)为0.1255,居群间的遗传变异占了总遗传变异的12.55%,87.45%的遗传变异来自居群内部;9个自然居群间的遗传距离为0.0018~0.0214,连翘居群间的遗传距离非常小,遗传相似度很高。使用NTSYS-pc 2.10e软件,根据遗传一致度进行样本间亲缘关系的UPGMA聚类分析,138个样本可划分为5个组,各山系的样本基本能够聚为一组,各组样本又存在连翘居群彼此交叉的情形,但地理位置近的样本因遗传距离较近会分入同一个组。【结论】连翘种质资源具有很高的遗传多样性,群体间存在高度的遗传分化,遗传变异主要来源于居群内的个体。人为因素干扰会造成居群规模变小、遗传多样性降低的情况。居群间遗传距离与地理距离在大区域尺度上具有相关性,而较小区域的居群间二者无相关性。 展开更多
关键词 连翘 遗传多样性 issr 聚类分析
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基于ISSR和ITS分子标记的海南砂仁种质资源遗传多样性评价 被引量：1
2
作者 罗凡 瞿云苹 +3 位作者 陈振夏 杨涛 范宇光 潘坤 《核农学报》 北大核心 2025年第5期886-896,I0001,共12页
为了对海南砂仁资源进行保护和管理,利用简单序列重复区间(ISSR)和核糖体RNA基因转录间隔区(ITS)技术,使用NTSYS、POPGENE、BioEdit和Clustalx等软件,分析了12个海南砂仁地理居群,共118份种质材料的遗传多样性和遗传分化程度。结果发现,... 为了对海南砂仁资源进行保护和管理,利用简单序列重复区间(ISSR)和核糖体RNA基因转录间隔区(ITS)技术,使用NTSYS、POPGENE、BioEdit和Clustalx等软件,分析了12个海南砂仁地理居群,共118份种质材料的遗传多样性和遗传分化程度。结果发现,ISSR引物筛选共获得25条多态性较高的引物,扩增获得132个位点,其中多态性位点93个,多态性比率达70.45%。通过对观测到的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、居群内Nei’s基因多样性(H)、Shannon多样性信息指数(I)和基因流(Nm)统计,其平均值分别为1.164、1.103、0.059、0.087和0.271。基于海南砂ITS序列比对信息,检测出了11个单倍型,但在不同的居群中这些单倍型的分布不均匀,多个居群中仅检测出一种单倍型。上述结果表明,居群内的遗传多样性较低,不同地理居群的海南砂基因交流较少、遗传分化明显,居群间的遗传变异是其总遗传多样性的来源,由于居群间基因交流匮乏,已经导致海南砂居群内出现近交衰退。本研究可为海南砂种质资源的保护、利用和可持续开发提供科学依据。 展开更多
关键词 海南砂仁 遗传多样性 遗传分化 issr ITS 单倍型
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SRAP和ISSR分子标记技术在久星系列韭菜遗传多样性的应用
3
作者 孙楠 王宇欣 +4 位作者 王平智 林聪 马金海 张明 胡彬 《分子植物育种》 北大核心 2025年第13期4391-4399,共9页
为深化韭菜品种资源遗传多样性研究,本研究应用ISSR和SRAP分子标记方法,以24份具有高抗耐寒的久星系列韭菜栽培品种为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果显示:(1)从24个ISSR引物中筛选出6个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,... 为深化韭菜品种资源遗传多样性研究,本研究应用ISSR和SRAP分子标记方法,以24份具有高抗耐寒的久星系列韭菜栽培品种为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果显示:(1)从24个ISSR引物中筛选出6个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得84条稳定的条带,其中多态性条带52条(占61.90%);从24个SRAP引物中筛选出16个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得293条稳定的条带,其中多态性条带141条(占48.12%)。(2)应用Nei-Li相似系数法估算了两分子标记技术关于24份材料间的遗传相似性系数(genetic similarity coefficient,GS),通过ISSR分析得到,其GS在0.70~0.98之间,品种间相似度高;通过SRAP分析得到,其GS在0.75~0.99之间,与ISSR分析结果一致;(3)对24份韭菜栽培品种的系统聚类分析表明:育种顺序接近的部分品种有相对聚合现象或少部分品种和类型出现交叉聚类,与其亲缘关系较近有关;‘久星28号’自成一类,与其特异的遗传基础差异较大有关。说明SRAP和ISSR是两种较稳定和可靠的进行韭菜遗传多样性分析的分子标记。通过24个韭菜品种样品的分析可知,久星系列韭菜品种的亲缘关系较近,在日后的韭菜育种工作中,可以通过加强与其他地区不同品种之间的合作育种、拓宽亲本的地域来源,以提升久星系列品种的遗传多样性,完善韭菜品种的结构。 展开更多
关键词 韭菜 issr SRAP 遗传多样性 亲缘关系
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基于农艺性状及ISSR标记的铁皮石斛种质资源遗传多样性分析
4
作者 董蓉娇 李桂琳 +4 位作者 周侯光 贾敏 姚志军 茶文彪 李泽生 《种子》 北大核心 2025年第6期130-138,共9页
为探索铁皮石斛种质遗传多样性,以云南地区70份铁皮石斛种质资源为试验材料,对15个农艺性状进行测量统计,并用6条ISSR引物进行PCR扩增。结果表明,铁皮石斛种质资源农艺性状变异丰富,变异系数为14.18%~53.16%,遗传多样性指数为1.83~2.29... 为探索铁皮石斛种质遗传多样性,以云南地区70份铁皮石斛种质资源为试验材料,对15个农艺性状进行测量统计,并用6条ISSR引物进行PCR扩增。结果表明,铁皮石斛种质资源农艺性状变异丰富,变异系数为14.18%~53.16%,遗传多样性指数为1.83~2.29;主成分分析结果表明,6个主成分因子累积贡献率为72.44%,能反映铁皮石斛资源的大部分遗传信息;70份材料在遗传距离60.0处时被分为5个亚类群;6个ISSR引物在70份铁皮石斛材料中共检测到50个多态性位点,ISSR引物扩增DNA条带数为2~12,多态性比率100%,平均有效等位基因数目为1.45个,群体多态性信息指数范围为0.08~0.54,群体多样性指数范围为0.03~0.37;在遗传距离为0.30处时,将铁皮石斛资源划分为2个类群,第一类群66份材料,第二类群4份材料。研究表明,铁皮石斛种质资源具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 铁皮石斛 种质资源 农艺性状 issr标记 遗传多样性
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月季黑斑病菌ISSR遗传多样性分析
5
作者 郭加启 陈锋 +6 位作者 吕博 杨园园 过聪 宋居荣 杨捷 向发云 林建国 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期496-507,共12页
【目的】探讨我国月季黑斑病病原菌的种类、遗传多样性及其亲缘关系,为月季种质黑斑病抗性鉴定及病害防控提供理论依据。【方法】分离来自全国7个大区15个省(区)27个市(县)的月季黑斑病病原菌,扩增菌株ITS序列确定病原菌种类,并经柯赫... 【目的】探讨我国月季黑斑病病原菌的种类、遗传多样性及其亲缘关系,为月季种质黑斑病抗性鉴定及病害防控提供理论依据。【方法】分离来自全国7个大区15个省(区)27个市(县)的月季黑斑病病原菌,扩增菌株ITS序列确定病原菌种类,并经柯赫氏法则验证其致病性。采用ISSR分子标记技术研究病原菌的遗传多样性;将扩增的条带数据记为0-1矩阵,并使用PopGene 32.0计算遗传多样性指数和遗传距离等指标;利用NTsys-pc 2.1进行非加权平均法(UPGMA)聚类分析。【结果】分离得到107株病原菌,按不同市(县)可划分为27个居群;经鉴定107株菌株均为蔷薇盘二孢(Marssonina rosae)。经筛选确定了ISSR-PCR扩增的3条引物,分别为UBC884、UBC885和UBC886,3条引物共扩增出84条条带,多态性条带数为84条,多态性比率为100%,显示出高多态性,可用于蔷薇盘二孢菌株的扩增。107株菌株群体的遗传多样性分析结果显示,菌株居群间的平均观测等位基因数(Na)为1.3369、平均有效等位基因数(Ne)为1.2431,平均Nei’s多样性指数(H)为0.1367,平均Shannon’s信息指数(I)为0.1993,平均总基因多样性(Ht)为0.2827,平均居群内基因多样性(Hs)为0.1368,平均遗传分化系数(Gst)为0.5163,平均基因流(Nm)为0.4684。基于UPGMA聚类分析,107株蔷薇盘二孢菌株在遗传相似性系数为0.57时划分为8个类群,类群Ⅰ~Ⅶ中来自各个地区的菌株相互混杂,Ⅷ中的部分菌株大致根据市(县)的地理位置聚在一起。【结论】107株来自不同地理区域的蔷薇盘二孢菌株表现出丰富的遗传多样性,居群间基因流动水平较低,遗传分化程度较高,且菌株遗传多样性与地理来源之间关联性不强。 展开更多
关键词 月季黑斑病 蔷薇盘二孢 issr分子标记 遗传多样性
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基于SRAP和ISSR标记的花椒种质资源遗传多样性及群体结构分析
6
作者 李晋华 汪志燚 +4 位作者 王少铭 冷家归 侯颖辉 罗莉斯 李德文 《种子》 北大核心 2025年第1期10-18,30,共10页
为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87... 为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87.73%、88.89%;48份花椒种质材料的平均Nei's遗传多样性指数为0.4372,平均Shannon's信息指数为0.6217。根据不同来源地,对8个花椒群体进行遗传多样性分析,遗传多样性排序表现为贵州省合肥市群体>陕西省群体>四川省群体>贵州省黔西南州群体>江西省群体>贵州省铜仁市群体>贵州省黔东南州群体>贵州省贵阳市群体;分子遗传变异分析表明,在花椒种质资源总遗传变异中,92%的变异发生在种源内,只有8%的变异发生在种源间;Structure群体遗传结构和UPGMA聚类结果表明,种源间存在中等程度的基因交流现象。利用SRAP和ISSR标记可以对花椒种质资源进行较高效的多态性检出,花椒种质资源的种间遗传分化明显,而同一种类不同来源地资源的遗传分化较小。 展开更多
关键词 花椒 SRAP分子标记 issr分子标记 遗传多样性 群体结构分析
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EMS诱导皂荚突变体的筛选及ISSR分析
7
作者 秦佳乐 宋立君 +3 位作者 张芹 郑建伟 马国栋 李保会 《北方园艺》 北大核心 2025年第11期32-39,共8页
以皂荚萌动种子为试材,采用不同浓度的EMS溶液和不同的处理时间进行诱变处理,通过形态学、ISSR分子鉴定筛选皂荚突变体,以期为进一步挖掘皂荚基因功能和表型之间的关系及品种遗传改良提供参考依据。结果表明:随着EMS处理浓度和时间的增... 以皂荚萌动种子为试材,采用不同浓度的EMS溶液和不同的处理时间进行诱变处理,通过形态学、ISSR分子鉴定筛选皂荚突变体,以期为进一步挖掘皂荚基因功能和表型之间的关系及品种遗传改良提供参考依据。结果表明:随着EMS处理浓度和时间的增加,皂荚萌动种子的发芽率、发芽势、成苗率受到抑制,0.6%EMS处理12 h为皂荚种子最佳诱变处理,在该处理组合下,变异率为47.33%,主要为叶色、叶型、植株高矮等3种变异类型。12 h处理下的半致死剂量为0.5817%。ISSR分析结果表明,19条引物共扩增出173个等位基因位点,多态性位点171个,多态性比率为99.42%。7个表型变异植株和对照的遗传相似系数变化范围为0.0971~1.0000。 展开更多
关键词 甲基磺酸乙酯诱变 皂荚 突变体库 issr分子标记
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珍稀树种望天树ISSR-PCR反应体系的建立和优化
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作者 黎婷演 李婷 +3 位作者 谢乐 梁小春 徐圆圆 杨梅 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第4期127-135,146,共10页
为建立适合望天树的ISSR-PCR反应体系,以望天树嫩叶为试验材料,采用L_(16)(4^(5))正交试验设计对ISSR-PCR反应的5个因素即模板DNA浓度、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶含量及引物浓度进行优化,建立适用于望天树的最佳ISSR-PCR... 为建立适合望天树的ISSR-PCR反应体系,以望天树嫩叶为试验材料,采用L_(16)(4^(5))正交试验设计对ISSR-PCR反应的5个因素即模板DNA浓度、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶含量及引物浓度进行优化,建立适用于望天树的最佳ISSR-PCR反应体系,且在此基础上筛选出适合该反应体系的引物和最佳退火温度,最终以望天树5个家系为材料验证反应体系的稳定性。结果表明,望天树ISSR-PCR最佳反应体系(20μL)各组分终浓度为:模板DNA 90 ng,引物浓度0.3μmol/L,dNTPs浓度0.2 mmol/L,Mg^(2+)浓度2.5 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U;筛选出3条重复性好、条带清晰、多态性高的ISSR引物,且最佳引物(UBC864)的最适退火温度为56.9℃。采用优化后的反应体系及引物对5个望天树种源样品进行ISSR-PCR条带检测,结果表明上述反应体系稳定可靠。该ISSR-PCR优化体系和候选引物适用于望天树遗传多样性分析,可为望天树种质资源保护与利用研究工作奠定基础。 展开更多
关键词 望天树 issr-PCR 正交试验设计 体系优化 引物筛选
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48份绿豆种质资源表型性状及ISSR遗传多样性分析
9
作者 白重阳 朱凯波 +5 位作者 鲍红春 宗海龙 柳凇尹 薛瑞雯 赵子荣 李小雷 《种子》 北大核心 2025年第5期174-180,共7页
为分析绿豆种质资源的遗传多样性,利用株高、主茎粗、主茎节数等10个表型性状及ISSR分子标记技术对48份绿豆种质资源进行变异系数、聚类分析和遗传多样性分析。结果表明,所有表型性状变异系数均大于8%,变异系数最大的表型性状为单株荚数... 为分析绿豆种质资源的遗传多样性,利用株高、主茎粗、主茎节数等10个表型性状及ISSR分子标记技术对48份绿豆种质资源进行变异系数、聚类分析和遗传多样性分析。结果表明,所有表型性状变异系数均大于8%,变异系数最大的表型性状为单株荚数(71.23%),其次为主茎茸毛密度(35.88%)和主茎茸毛颜色(35.20%)。表型性状聚类分析将供试材料分为五大类群。ISSR-PCR最终筛选出17条多态性有效引物,共检测274个位点,多态性位点百分率为83.57%,有效等位基因数为1.799,Nei's基因多样性指数(期望杂合度)为0.434,Shannon's信息指数为0.622,聚类分析将供试材料分为五大类群。供试材料表型性状分化程度高,具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 issr 绿豆 遗传多样性 聚类分析
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基于表型性状和ISSR分析的5个核桃品种亲缘关系鉴定
10
作者 吴雨桦 李丕军 +6 位作者 熊福博 李润 刘华 白斌 郑崇文 王静 冯春 《安徽农业科学》 2025年第2期117-123,共7页
[目的]选择四川省栽培面积最大、产量最多的核桃品种“盐源早”(Juglansregia“Yanyuanzao”),探索“盐源早”的亲缘关系。[方法]选择“盐源早”、“三台泡核桃”(Juglanssigillata‘Santai’)、“漾濞泡核桃”(Juglanssigillata“Yangb... [目的]选择四川省栽培面积最大、产量最多的核桃品种“盐源早”(Juglansregia“Yanyuanzao”),探索“盐源早”的亲缘关系。[方法]选择“盐源早”、“三台泡核桃”(Juglanssigillata‘Santai’)、“漾濞泡核桃”(Juglanssigillata“Yangbi”)、“温185”(Juglansregia“Wen185”)、“新新2”(Juglansregia“Xinxin2”)5个核桃品种为试验材料,测定单果重、果仁重、出仁率、坚果三径、果形指数、种壳厚以及果仁成分(粗蛋白、粗脂肪)等指标,通过方差、相关性、聚类与主成分分析等探索5个核桃品种的表型性状和果仁成分多样性;利用ISSR分子标记技术探究“盐源早”等5个核桃品种的遗传多样性和遗传关系。[结果]果实的表型性状与果仁成分多样性分析结果表明,5个核桃品种的单果重、果仁重、出仁率、侧径、横径、纵径、果形指数、种壳厚及果仁成分(粗脂肪、粗蛋白含量)之间差异极显著或显著(P<0.01或P<0.05)。聚类分析和主成分分析结果表明,可将5个核桃品种聚为三大类群,第Ⅰ类为“温185”,第Ⅱ类为“新新2”“盐源早”“漾濞泡核桃”,第Ⅲ类为“三台泡核桃”。利用ISSR分子标记筛选出10条图谱条带清晰,背景明亮,重复性强,多态性较好,稳定性强的引物。通过对扩增图谱进行多态性分析结果表明,5个核桃品种的有效等位基因数均值为1.3370,Nei’s基因多样性指数均值为0.1935,Shannon信息指数均值为0.2858。聚类分析和主成分分析表明,“盐源早”和“漾濞泡核桃”聚为一类,表明亲缘关系表现较近,且相同地区的“温185”和“新新2”聚为一类,“三台泡核桃”聚为一类。[结论]通过对5个核桃品种的果实表型性状、果仁成分及ISSR分子标记的聚类分析得出,“盐源早”与“漾濞泡核桃”亲缘关系较近。 展开更多
关键词 核桃品种 表型性状 果仁成分 issr分子标记
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青海地区藏茴香种质资源遗传多样性的ISSR分析
11
作者 郑铭贤 杨莉娜 +1 位作者 沈宁东 朱惠琴 《安徽农业科学》 2025年第7期150-155,164,共7页
[目的]研究青海地区15个藏茴香种质的遗传多样性和亲缘关系,为藏茴香人工培育良种提供理论支撑。[方法]以改良的CTAB法提取149个藏茴香个体鲜叶中的DNA,并用筛选的10个高效ISSR引物进行分子标记。[结果]得到多态性条带8412个,总多态性比... [目的]研究青海地区15个藏茴香种质的遗传多样性和亲缘关系,为藏茴香人工培育良种提供理论支撑。[方法]以改良的CTAB法提取149个藏茴香个体鲜叶中的DNA,并用筛选的10个高效ISSR引物进行分子标记。[结果]得到多态性条带8412个,总多态性比率90.21%,Nei’s基因多样性指数(H′)平均值为0.50,Shannon’s信息指数(I)平均值为0.75,藏茴香种质间的遗传相似度为0.84~0.97;遗传多样性指数(H_(t))、居群内遗传多样性指数(H_(s))、基因分化系数(G_(st))、基因流(N_(m))分别为0.23、0.17、0.26、1.42。种质间聚类分析将15个种质划分为3大类;个体间聚类将149个藏茴香个体划为6大类。[结论]青海地区野生藏茴香种质具有丰富的遗传多样性,而种质间存在广泛的基因交流,这种基因交流在地域上呈现出一定的同向逐步扩散规律,青海地区野生藏茴香丰富的遗传多样性来自个体间的差异。 展开更多
关键词 藏茴香 种质资源 issr分子标记 遗传多样性
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基于ISSR分子标记的新疆西天山栒子属种质资源遗传多样性分析
12
作者 阿克居力得孜·努尔改里得 李茹雪 +2 位作者 杨禧雨 陆彪 周龙 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第5期905-915,共11页
为探究新疆西天山栒子属各居群之间的遗传多样性水平及亲缘关系,利用ISSR分子标记对新疆西天山15个野生居群112份栒子属植物进行遗传多样性分析。研究发现,15条ISSR引物共扩增出166个条带,其中多态性条带143个,平均多态性条带比例为86.2... 为探究新疆西天山栒子属各居群之间的遗传多样性水平及亲缘关系,利用ISSR分子标记对新疆西天山15个野生居群112份栒子属植物进行遗传多样性分析。研究发现,15条ISSR引物共扩增出166个条带,其中多态性条带143个,平均多态性条带比例为86.29%,新疆西天山15个野生居群112份栒子属植物的Nei′s基因多样性指数和香农信息指数分别为0.2124和0.3254,各居群间遗传分化系数为0.4259,基因流为0.6740,表明栒子属野生居群水平的遗传分化程度极大且各居群间存在一定的基因交流。新疆西天山栒子属植物在整体水平上的遗传差异明显,遗传多样性较高。在居群水平上,特克斯县北山毛溜沟居群的遗传多样性最为丰富。聚类结果显示,绝大部分地理位置相近的居群聚为一类,但也有部分地理位置相近的居群并没有聚在一起。本研究结果可为新疆西天山栒子属种质资源的有效保护及开发利用提供重要参考依据。 展开更多
关键词 新疆西天山 栒子属 遗传多样性 issr分子标记
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基于ISSR-SCoT标记结合欧式距离聚类分析24份黄精种质遗传多样性
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作者 叶夏雯 曹书禹 +2 位作者 吴延青 陈铌铍 金波 《广东农业科学》 2025年第3期25-34,共10页
【目的】联合使用ISSR和SCoT分子标记技术,基于UPGMA和欧式距离法聚类分析,从分子水平综合分析不同产地的24份黄精种质的遗传多样性,为促进黄精属种质资源的保护、开发与利用提供参考。【方法】采用ISSR和SCoT两种分子标记技术,对来自我... 【目的】联合使用ISSR和SCoT分子标记技术,基于UPGMA和欧式距离法聚类分析,从分子水平综合分析不同产地的24份黄精种质的遗传多样性,为促进黄精属种质资源的保护、开发与利用提供参考。【方法】采用ISSR和SCoT两种分子标记技术,对来自我国11个省份的24份黄精属植物种质进行遗传多样性分析。【结果】分别从ISSR通用引物和SCoT通用引物中筛选出效果较好的15条引物,扩增后分别获得229条和210条清晰条带的标记,平均多态性百分比分别为98.40%和98.10%。与SCoT标记结果相比,ISSR分子标记技术可获得更多的黄精遗传多态性位点。24份黄精Nei's基因分化系数(G_(st))为0.0474,表明95.26%的遗传变异是在种内进行,基因流N_(m)>1表明种内存在明显的基因流动。其中15份P.sibiricum Red.黄精种质的G_(st)为0.0471,表明95.29%的遗传变异在种内进行,N_(m)>1表明种内基因交流较多。对于ISSR、SCoT和ISSR-SCoT组合数据经UPGMA分析表明,三类数据的聚类结果各有异同。进一步将ISSR-SCoT组合数据运用欧式距离算法进行聚类分析,与UPGMA聚类算法结果一致的是,ZJ6和HN4具有最近的遗传距离,并且将24份黄精遗传系数进行聚类热图可视化后的结果与欧式距离算法聚类结果基本一致。【结论】联合使用ISSR和SCoT分子标记,并综合运用UPGMA和欧式距离算法,可以获得更全面的黄精遗传多样性信息。不同产地的24份黄精种质资源具有丰富的遗传多样性,且与地理位置基本相关。 展开更多
关键词 黄精 issr SCoT 遗传多样性 聚类分析 遗传距离
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基于ISSR-PCR技术鉴别半夏与虎掌南星
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作者 孙一帆 白华 +4 位作者 张娣 闫岩 牛倩 程翔 王孟虎 《山西中医药大学学报》 2025年第6期623-630,共8页
目的:利用简单序列间重复序列-聚合酶链式反应(ISSR-PCR)技术对半夏及其常见混伪品虎掌南星进行鉴别。方法:采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取半夏及虎掌南星的DNA,并对50种ISSR引物进行扩增、电泳,优化退火温度、模板量、引物量、... 目的:利用简单序列间重复序列-聚合酶链式反应(ISSR-PCR)技术对半夏及其常见混伪品虎掌南星进行鉴别。方法:采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取半夏及虎掌南星的DNA,并对50种ISSR引物进行扩增、电泳,优化退火温度、模板量、引物量、循环次数及琼脂糖凝胶浓度,确定最佳引物及PCR反应体系和条件。从市场上收集半夏、虎掌南星各10个批次进行适应性考察。结果:引物ISSR-1为最佳引物,最佳退火温度、引物量、模板量、循环次数、琼脂糖凝胶浓度分别是48℃,1.5μl,1.5μl,35个循环,2.0%;市售10批次半夏中有2批次检测为虎掌南星,市售10批次虎掌南星中有1批次检测为半夏,这与性状鉴定保持一致。结论:基于引物ISSR-1能够准确鉴别半夏及其混伪品虎掌南星。 展开更多
关键词 半夏 虎掌南星 issr-PCR 混伪品 鉴别
暂未订购
金莲花ISSR-PCR反应体系优化及引物筛选
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作者 董梦涵 马蒙璐 +1 位作者 王瑞康 张芹 《北方园艺》 北大核心 2025年第17期10-18,共9页
以金莲花为试材,采用单因素水平筛选和正交实验方法,组合出最佳反应体系,系统分析了4个关键因素对体系的影响,包括DNA浓度、Mix酶用量、引物浓度、反应循环次数,并进行引物及其退火温度的确定,建立金莲花的ISSR-PCR反应体系,以期为金莲... 以金莲花为试材,采用单因素水平筛选和正交实验方法,组合出最佳反应体系,系统分析了4个关键因素对体系的影响,包括DNA浓度、Mix酶用量、引物浓度、反应循环次数,并进行引物及其退火温度的确定,建立金莲花的ISSR-PCR反应体系,以期为金莲花种质资源创新和遗传多样性分析提供参考依据。结果表明:四因素对反应体系的影响依次为PCR循环次数>DNA浓度>Mix酶用量>引物浓度。最佳反应体系为DNA浓度35 ng·μL^(-1),引物浓度9μmol·L^(-1),Mix酶用量9μL。反应程序为94℃预变性5 min,94℃变性30 s,退火时间45 s,72℃延伸45 s,33个循环,72℃终延伸7 min,4℃保存。建立了金莲花ISSR分子标记最佳反应体系并筛选出26条ISSR引物,可应用于后续的种质资源研究工作。 展开更多
关键词 金莲花 issr-PCR 引物筛选 反应体系
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金花菌ISSR-PCR反应体系的建立与优化
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作者 吴凤 张莉娟 +5 位作者 李冬桂 秦玉燕 罗义灿 陈羽烨 李鸿 吕丽兰 《农业研究与应用》 2025年第1期9-18,共10页
【目的】金花菌是黑茶中的一类潜在益生真菌,能赋予茶叶独特的味道,并具备补充人体所需维生素和矿物质、生津止渴、分解油腻、降脂减肥等多种保健作用,是评价茯砖茶和六堡茶品质的重要指标之一。本研究分析了金花菌的遗传多样性及遗传结... 【目的】金花菌是黑茶中的一类潜在益生真菌,能赋予茶叶独特的味道,并具备补充人体所需维生素和矿物质、生津止渴、分解油腻、降脂减肥等多种保健作用,是评价茯砖茶和六堡茶品质的重要指标之一。本研究分析了金花菌的遗传多样性及遗传结构,建立并优化金花菌ISSR-PCR反应体系,旨在为进一步利用ISSR分子标记技术系统研究金花菌遗传多样性及其种内种间亲缘关系提供方法。【方法】以冠突曲霉(Aspergillus cristatum)的DNA作为模板,采用单因素实验对影响ISSR-PCR反应体系的模板DNA用量、引物用量、PCR Mix用量以及ISSR-PCR循环次数等4个因素进行优化,结果用4个金花菌种A.cristatum、谢瓦氏曲霉(Aspergillus chevalieri)、假灰绿曲霉(Aspergillus pseudoglaucus)、Aspergillus cibarius的菌株对反应体系进行稳定性验证。【结果】建立了金花菌ISSR-PCR最优反应体系,其组成包括50 ng/μL的模板DNA 0.3μL、10μmol/μL的引物0.8μL、2×SanTaq PCR Mix用量9.0μL,ddH_(2)O 9.9μL,总体积20μL。ISSR-PCR反应条件:94.0℃预变性5 min;94.0℃变性30 s,退火30 s,72.0℃延伸2 min,循环次数为35次;72.0℃终延伸10 min。使用4株不同的金花菌对所获ISSR-PCR最优反应体系进行稳定性验证,表明其具有高多态性和可重复性。采用此最优反应体系筛选出11条多态性和重复性高可适用于金花菌遗传多样性分析的ISSR引物并确定其退火温度。【结论】本研究建立并优化了金花菌的ISSR-PCR反应体系,结果具有高多态性和可重复性,为后续金花菌遗传多样性分析提供了新方法。 展开更多
关键词 金花菌 issr-PCR 单因素实验 反应体系
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藜蒿ISSR分子标记遗传多样性评价
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作者 陈美珠 董笑笑 +2 位作者 夏忙 王宇航 曾长立 《江汉大学学报(自然科学版)》 2025年第2期26-33,共8页
藜蒿是多年生草本植物,分布广泛,遗传背景复杂,系统分类模糊。为了解不同种群藜蒿亲缘关系和遗传多样性,利用ISSR分子标记技术对我国9个省份不同地区的117份藜蒿种质资源进行全面分析。通过9条ISSR引物检测到87个多态性位点数,多态性百... 藜蒿是多年生草本植物,分布广泛,遗传背景复杂,系统分类模糊。为了解不同种群藜蒿亲缘关系和遗传多样性,利用ISSR分子标记技术对我国9个省份不同地区的117份藜蒿种质资源进行全面分析。通过9条ISSR引物检测到87个多态性位点数,多态性百分比为98.86%。不同群体之间的Nei′s遗传多样性指数(H)平均值为0.0996,Shannon遗传多样性指数平均值为0.1522。利用UPGMA聚类分析117份藜蒿种质,遗传系数为0.35时分为3个主要类群。其中,编号为41~44、110的5个样本归为第一类;其余的大多数样本归为第二类;编号47单独归为第三类。表明不同藜蒿种质资源亲缘关系密切,遗传相似指数高。 展开更多
关键词 藜蒿 issr 分子标记 遗传多样性 聚类分析
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基于ISSR分子标记的钻天柳遗传多样性分析
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作者 张煜 高金辉 +4 位作者 薛永辉 江振 张国财 张和阳 张厚良 《林业科技》 2025年第4期33-39,共7页
2021-2022年在大、小兴安岭设置18个天然分布点及样地,采集50株钻天柳样本。利用改进的CTAB方法提取叶片的基因组DNA,通过ISSR-PCR扩增筛选引物并确定最佳退火温度。结果表明,提取的基因组DNA符合要求,确定了10条引物及相应退火温度。... 2021-2022年在大、小兴安岭设置18个天然分布点及样地,采集50株钻天柳样本。利用改进的CTAB方法提取叶片的基因组DNA,通过ISSR-PCR扩增筛选引物并确定最佳退火温度。结果表明,提取的基因组DNA符合要求,确定了10条引物及相应退火温度。钻天柳居群种群遗传多样性相对丰富,多态条带百分率平均值为91.91%,物种水平为92.22%,有一定遗传变异,且海拔548 m时Shannon信息指数、Nei's基因多样性指数达到最高值。种群间遗传分化系数GST=0.2303,遗传分化明显有基因流,5个天然居群亲缘关系较近,遗传相似度0.8867~0.9651,遗传距离0.0355~0.1203,29株个体分为4大组群。研究认为钻天柳遗传多样性源于遗传变异,其繁育系统和种子传播方式影响遗传结构,地理隔离影响不显著。 展开更多
关键词 钻天柳 issr分子标记 遗传多样性 遗传结构
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安徽多花黄精内生真菌优势种群的ISSR遗传多样性分析
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作者 张磊 蒲顺昌 +1 位作者 高懿 陈群 《武汉轻工大学学报》 2025年第5期56-62,I0004,共8页
为阐明多花黄精与内生真菌互作的生态模式,以安徽皖南池州、安庆、黄山3个地理居群的野生多花黄精为对象,分离根部内生真菌并聚焦优势属镰刀菌,采用ISSR分子标记技术分析其遗传多样性。从37条ISSR引物中筛选出5条高重复性、高多态性引物... 为阐明多花黄精与内生真菌互作的生态模式,以安徽皖南池州、安庆、黄山3个地理居群的野生多花黄精为对象,分离根部内生真菌并聚焦优势属镰刀菌,采用ISSR分子标记技术分析其遗传多样性。从37条ISSR引物中筛选出5条高重复性、高多态性引物,用于后续分析。结果表明,优势种群为镰刀菌属,三个不同采样地优势种群镰刀菌种群的等位基因数在1.96~2.0区间内,均值为1.982 8,有效等位基因数在1.46~1.51区间内,均值为1.483 5,Shannon多样性指数平均值为0.486 9,Nei's多样性指数平均值为0.243 9。PCoA及UPGMA聚类结果显示野生多花黄精内生真菌镰刀菌属具有丰富的遗传多样性,且3个居群中黄山居群表现出最高的遗传多样性水平。本研究为从分子水平理解多花黄精-内生真菌的互作关系提供了理论基础,所建立的方法体系也可为同类研究提供参考。 展开更多
关键词 多花黄精 内生真菌 issr 遗传多样性
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基于ISSR-PCR鉴别青葙子及其混伪品 被引量：1
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作者 王孟虎 马进进 +7 位作者 刘冉冉 程鹤 范啸天 孟祥松 左亚锋 汤建 栗进才 孙一帆 《山西中医药大学学报》 2025年第3期265-270,共6页
目的:采用ISSR-PCR分子标记技术鉴定青葙子、鸡冠花子、绿穗苋子。方法:采用CTAB法提取样品DNA,利用核酸蛋白测定仪检测样品DNA的浓度和质量,根据ITS2通用引物进行扩增以验证样品DNA的质量。根据文献选择30条ISSR引物并进行PCR扩增和电... 目的:采用ISSR-PCR分子标记技术鉴定青葙子、鸡冠花子、绿穗苋子。方法:采用CTAB法提取样品DNA,利用核酸蛋白测定仪检测样品DNA的浓度和质量,根据ITS2通用引物进行扩增以验证样品DNA的质量。根据文献选择30条ISSR引物并进行PCR扩增和电泳,对退火温度、引物量、模板量、循环次数进行考察,从而确定ISSR-PCR扩增的最佳反应体系及条件。结果:筛选确定ISSR-3引物为最佳引物,青葙子在400 bp、750 bp左右均有一特异性条带,其中在400 bp处条带较为明亮;鸡冠花分别在100~250 bp,250 bp左右及1000~2000 bp之间均有特异性条带,其中250 bp处条带较为明亮;绿穗苋在250~500 bp之间无条带产生。通过对PCR扩增体系及条件进行优化获得最佳退火温度、引物量、模板量、循环次数分别为50.8℃,2μl,1μl,35次,经过实验选出有差异性条带的ISSR-3引物可用于鉴别青葙子、鸡冠花子、绿穗苋子。结论:ISSR-3引物在优化后的PCR反应体系及条件下可以准确鉴别青葙子及其混伪品。 展开更多
关键词 青葙子 issr-PCR 鉴别 混伪品
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