目的:对收集的1个湖北Van der Woude综合征(VWS)家系进行临床和遗传特点分析,并进行IRF6基因的突变检测。方法:通过先证者及现场家系调查、临床检查和系谱分析收集VWS家系。在IRF6基因的外显子-内含子接头及9个外显子编码区分别设计引物...目的:对收集的1个湖北Van der Woude综合征(VWS)家系进行临床和遗传特点分析,并进行IRF6基因的突变检测。方法:通过先证者及现场家系调查、临床检查和系谱分析收集VWS家系。在IRF6基因的外显子-内含子接头及9个外显子编码区分别设计引物,经聚合酶链式反应扩增并纯化后直接测序。结果:收集的VWS家系符合常染色体显性遗传特征,家系受累患者共3名(1名男性和2名女性),患者表现为典型的下唇瘘管或凹陷,且合并有唇腭裂和先天缺牙。患者表型在同一家系内有明显差异,且呈逐代加重趋势。在所有患者IRF6基因第412位密码子发现与表型一致的CGA>TGA(c.1234C>T)改变,经查证为一个已知的无义突变。结论:该VWS家系疾病表现度极不一致,是由IRF6基因的1个已知无义突变导致,IRF6是参与颌面部发育的重要基因。展开更多
目的分析邯郸地区非综合征唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)患儿发生率及其与环境因素和IRF6基因多态性的相关性。方法对2016年3月-2018年4月产科新生儿22460例临床资料进行回顾性分析,统计唇腭裂...目的分析邯郸地区非综合征唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)患儿发生率及其与环境因素和IRF6基因多态性的相关性。方法对2016年3月-2018年4月产科新生儿22460例临床资料进行回顾性分析,统计唇腭裂发生情况。并采用单因素分析和多因素Logistic回归分析影响新生儿发生唇腭裂的影响因素。结果①在22460例新生儿中,NSCL/P有48例,占比2.13‰,其中,单纯性唇裂15例,占比31.25%,腭裂12例,占比25.00%,唇腭裂21例,占比33.33%。;②所有患儿及其父母与健康组基因型频率分布经检验均符合HW平衡,NSCL/P组中单纯性唇裂与唇腭裂rs642961位点的AA基因频率明显高于健康组,数据间差异具有统计学意义(P<0.05);③父亲吸烟、母亲吸烟、母亲被动吸烟、母亲孕期具有疾病史与服药史、未补充维生素与叶酸等环境因素中新生儿NSCL/P的发病率明显增高(P<0.05);④母亲吸烟、母亲被动吸烟、母亲孕期具有疾病史与服药史、未补充维生素与叶酸等环境因素是影响新生儿发生NSCL/P的独立危险因素(P<0.05)。结论 IRF6基因rs642961位点的变异可诱发NSCL/P的发生,同时,母亲吸烟与被动吸烟、母亲孕期具有疾病史与服药史、未补充维生素与叶酸等环境因素可增加NSCL/P发病的风险。展开更多
目的探讨广东地区口面裂患者干扰素调节因子6(Interferon regulatory factor 6,IRF6)基因编码区序列的特点。方法收集广东籍口面裂患者及部分双亲血样共47例,包括1个Van der Woude综合征(van der Woude syndrome,VWS)患者核心家庭,NSCL/...目的探讨广东地区口面裂患者干扰素调节因子6(Interferon regulatory factor 6,IRF6)基因编码区序列的特点。方法收集广东籍口面裂患者及部分双亲血样共47例,包括1个Van der Woude综合征(van der Woude syndrome,VWS)患者核心家庭,NSCL/P患者40例,面横裂3例,正中裂3例;同时采取13例正常人血液样本做为对照,所有样本提取DNA后扩增IRF6基因的编码区,并进行序列测定和分析。结果共检测到3个突变位点。其中459G>T和820G>A两种突变在正常对照及未患病双亲中均被检出,NSCL/P组与正常对照组之间无差异(P>0.05)。1234C>T仅在VWS综合征患者中检出,与国际已报道的致病性突变一致。结论广东地区口面裂患者IRF6基因编码区存在三个突变,其中IRF6基因外显子9的1234C>T突变可能是广东地区VWS患者的一个致病因素。展开更多
目的用meta分析的方法定量评价IRF6基因rs2235371位点单核苷酸多态性(SNPs)与中国非综合征型唇腭裂患者的相关性。方法利用计算机检索PubMed、VIP、CNKI和WanFang Date数据库自建库以来至2016年2月公开发表的文献。两位研究者独立按照...目的用meta分析的方法定量评价IRF6基因rs2235371位点单核苷酸多态性(SNPs)与中国非综合征型唇腭裂患者的相关性。方法利用计算机检索PubMed、VIP、CNKI和WanFang Date数据库自建库以来至2016年2月公开发表的文献。两位研究者独立按照纳入和排除标准筛选文献、提取资料。并且用Stata12.0软件对提取的数据进行meta分析。结果共有7个病例-对照研究符合纳入标准,包括969例患者和783例对照。meta分析结果显示:GA vs GG:P=0.000,OR=0.629(95%CI:0.519～0.762);GA+AA vs GG:P=0.000,OR=0.615(95%CI:0.512～0.738),有统计学意义,提示GA和GA+AA型可降低罹患非综合征型唇腭裂的风险。AA vs GG:P=0.063,OR=0.598(95%CI:0.349～1.025);GA+GG vs AA:P=0.304,OR=1.355(95%CI:0.794～2.312),无统计学意义。结论 IRF6基因rs2235371位点SNPs与非综合征型唇腭裂存在相关性,GA和GA+AA型可降低中国人罹患非综合征型唇腭裂的风险。展开更多
Objective： Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate（NSCL/P） is a common birth defect with unclear etiology. Both genetic and environmental factors may contribute to NSCL/P. Many genes have been identifie...Objective： Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate（NSCL/P） is a common birth defect with unclear etiology. Both genetic and environmental factors may contribute to NSCL/P. Many genes have been identified as candidate genes associated with this disease. Interferon regulatory factor 6（IRF6） gene and transforming growth factor-a（TGFA） gene seem to be crucial in the predisposition of NSCL/ P. Here we evaluated some single nucleotide polymorphisms（SNPs） loci of TGFA and IRF6 genes in Chinese nuclear families consisting of fathers, mothers and affected offspring with NSCL/P. Methods：Fifty patients of NSCL/P were confirmed by the plastic surgeons. They and their parents were included in the study, all with the informed consents. SNPs loci of TGFA and IRF6 genes were analyzed by microarray technology. Some PCR products were randomly chosen and sequenced to check microarray results. The distribution of gene type and allele frequency between patient group and parents group were compared. Then a Haplotype Relative Risk（HRR） and Transmission Disequilibrium Test（TDT） were performed. Results：The sequences of randomly selected PCR products were all consistent with the microarray results. All loci were in Hardy-Weinberg equilibrium. There were no significant differences in the distribution of genotypes and alleles between patients and their parents. Using HRR and TDT analyses the V274I of IRF6 was associated with NSCL/P, while another SNP locus oflRF6 was not. Strong evidence of linkage disequilibrium was found between the 2 SNP loci of TGFA and disease with the HRR analysis, but not with the TDT analysis. Conclusion：Our study confirms the contribution of IRF6 in the etiology of NSCL/P in populations of Asian ancestry. The association of TGFA with NSCL/P requires further research.展开更多
目的探讨1个van der Woude综合征(VWS)家系的遗传学特征,并为其提供生育指导。方法选取2020年5月因"2次唇腭裂儿妊娠史"在南京鼓楼医院就诊的1例先证者及其家系成员为研究对象。应用家系全外显子组测序(trio-WES)对先证者及...目的探讨1个van der Woude综合征(VWS)家系的遗传学特征,并为其提供生育指导。方法选取2020年5月因"2次唇腭裂儿妊娠史"在南京鼓楼医院就诊的1例先证者及其家系成员为研究对象。应用家系全外显子组测序(trio-WES)对先证者及其父母进行致病变异筛选,针对候选致病变异进行Sanger测序家系验证(4代共8人)和生物信息学分析。对该家系中的胎儿进行染色体微阵列分析(CMA)以排除拷贝数变异。结果Trio-WES发现先证者及其父亲携带IRF6: c.742G>T(p.G248C)杂合变异,其母亲该位点为野生型。该变异为错义变异,位于重要的蛋白质功能结构区,在正常参考人群基因数据库中未见报道,多种软件预测该变异影响蛋白质结构/功能的可能性较大,与该家系中患者特异性表型高度相关,且Sanger测序结果显示家系中8名成员(包括3名患者)的基因型与表型共分离。依据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关指南,评估为可能致病性变异(PM1+PM2_Supporting+PP1+PP3+PP4)。据此结果对先证者进行植入前遗传学诊断,生育表型正常后代,位点检测及CMA均未见异常。结论本研究明确了IRF6 c.742G>T(p.G248C)杂合变异为该家系的遗传学病因,并为先证者提供了生育指导。展开更多
文摘目的:对收集的1个湖北Van der Woude综合征(VWS)家系进行临床和遗传特点分析,并进行IRF6基因的突变检测。方法:通过先证者及现场家系调查、临床检查和系谱分析收集VWS家系。在IRF6基因的外显子-内含子接头及9个外显子编码区分别设计引物,经聚合酶链式反应扩增并纯化后直接测序。结果:收集的VWS家系符合常染色体显性遗传特征,家系受累患者共3名(1名男性和2名女性),患者表现为典型的下唇瘘管或凹陷,且合并有唇腭裂和先天缺牙。患者表型在同一家系内有明显差异,且呈逐代加重趋势。在所有患者IRF6基因第412位密码子发现与表型一致的CGA>TGA(c.1234C>T)改变,经查证为一个已知的无义突变。结论:该VWS家系疾病表现度极不一致,是由IRF6基因的1个已知无义突变导致,IRF6是参与颌面部发育的重要基因。
文摘目的分析邯郸地区非综合征唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)患儿发生率及其与环境因素和IRF6基因多态性的相关性。方法对2016年3月-2018年4月产科新生儿22460例临床资料进行回顾性分析,统计唇腭裂发生情况。并采用单因素分析和多因素Logistic回归分析影响新生儿发生唇腭裂的影响因素。结果①在22460例新生儿中,NSCL/P有48例,占比2.13‰,其中,单纯性唇裂15例,占比31.25%,腭裂12例,占比25.00%,唇腭裂21例,占比33.33%。;②所有患儿及其父母与健康组基因型频率分布经检验均符合HW平衡,NSCL/P组中单纯性唇裂与唇腭裂rs642961位点的AA基因频率明显高于健康组,数据间差异具有统计学意义(P<0.05);③父亲吸烟、母亲吸烟、母亲被动吸烟、母亲孕期具有疾病史与服药史、未补充维生素与叶酸等环境因素中新生儿NSCL/P的发病率明显增高(P<0.05);④母亲吸烟、母亲被动吸烟、母亲孕期具有疾病史与服药史、未补充维生素与叶酸等环境因素是影响新生儿发生NSCL/P的独立危险因素(P<0.05)。结论 IRF6基因rs642961位点的变异可诱发NSCL/P的发生,同时,母亲吸烟与被动吸烟、母亲孕期具有疾病史与服药史、未补充维生素与叶酸等环境因素可增加NSCL/P发病的风险。
文摘目的探讨广东地区口面裂患者干扰素调节因子6(Interferon regulatory factor 6,IRF6)基因编码区序列的特点。方法收集广东籍口面裂患者及部分双亲血样共47例,包括1个Van der Woude综合征(van der Woude syndrome,VWS)患者核心家庭,NSCL/P患者40例,面横裂3例,正中裂3例;同时采取13例正常人血液样本做为对照,所有样本提取DNA后扩增IRF6基因的编码区,并进行序列测定和分析。结果共检测到3个突变位点。其中459G>T和820G>A两种突变在正常对照及未患病双亲中均被检出,NSCL/P组与正常对照组之间无差异(P>0.05)。1234C>T仅在VWS综合征患者中检出,与国际已报道的致病性突变一致。结论广东地区口面裂患者IRF6基因编码区存在三个突变,其中IRF6基因外显子9的1234C>T突变可能是广东地区VWS患者的一个致病因素。
文摘目的用meta分析的方法定量评价IRF6基因rs2235371位点单核苷酸多态性(SNPs)与中国非综合征型唇腭裂患者的相关性。方法利用计算机检索PubMed、VIP、CNKI和WanFang Date数据库自建库以来至2016年2月公开发表的文献。两位研究者独立按照纳入和排除标准筛选文献、提取资料。并且用Stata12.0软件对提取的数据进行meta分析。结果共有7个病例-对照研究符合纳入标准,包括969例患者和783例对照。meta分析结果显示:GA vs GG:P=0.000,OR=0.629(95%CI:0.519～0.762);GA+AA vs GG:P=0.000,OR=0.615(95%CI:0.512～0.738),有统计学意义,提示GA和GA+AA型可降低罹患非综合征型唇腭裂的风险。AA vs GG:P=0.063,OR=0.598(95%CI:0.349～1.025);GA+GG vs AA:P=0.304,OR=1.355(95%CI:0.794～2.312),无统计学意义。结论 IRF6基因rs2235371位点SNPs与非综合征型唇腭裂存在相关性,GA和GA+AA型可降低中国人罹患非综合征型唇腭裂的风险。
基金supported by the Medical Technology Development Foundation of Jiangsu Provincial Health Bureau of China (H200513)Changjiang Scholars and Innovative Research Team in University (IRT0631) and National 973 Program(2006CB944005)
文摘Objective： Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate（NSCL/P） is a common birth defect with unclear etiology. Both genetic and environmental factors may contribute to NSCL/P. Many genes have been identified as candidate genes associated with this disease. Interferon regulatory factor 6（IRF6） gene and transforming growth factor-a（TGFA） gene seem to be crucial in the predisposition of NSCL/ P. Here we evaluated some single nucleotide polymorphisms（SNPs） loci of TGFA and IRF6 genes in Chinese nuclear families consisting of fathers, mothers and affected offspring with NSCL/P. Methods：Fifty patients of NSCL/P were confirmed by the plastic surgeons. They and their parents were included in the study, all with the informed consents. SNPs loci of TGFA and IRF6 genes were analyzed by microarray technology. Some PCR products were randomly chosen and sequenced to check microarray results. The distribution of gene type and allele frequency between patient group and parents group were compared. Then a Haplotype Relative Risk（HRR） and Transmission Disequilibrium Test（TDT） were performed. Results：The sequences of randomly selected PCR products were all consistent with the microarray results. All loci were in Hardy-Weinberg equilibrium. There were no significant differences in the distribution of genotypes and alleles between patients and their parents. Using HRR and TDT analyses the V274I of IRF6 was associated with NSCL/P, while another SNP locus oflRF6 was not. Strong evidence of linkage disequilibrium was found between the 2 SNP loci of TGFA and disease with the HRR analysis, but not with the TDT analysis. Conclusion：Our study confirms the contribution of IRF6 in the etiology of NSCL/P in populations of Asian ancestry. The association of TGFA with NSCL/P requires further research.
文摘目的探讨1个van der Woude综合征(VWS)家系的遗传学特征,并为其提供生育指导。方法选取2020年5月因"2次唇腭裂儿妊娠史"在南京鼓楼医院就诊的1例先证者及其家系成员为研究对象。应用家系全外显子组测序(trio-WES)对先证者及其父母进行致病变异筛选,针对候选致病变异进行Sanger测序家系验证(4代共8人)和生物信息学分析。对该家系中的胎儿进行染色体微阵列分析(CMA)以排除拷贝数变异。结果Trio-WES发现先证者及其父亲携带IRF6: c.742G>T(p.G248C)杂合变异,其母亲该位点为野生型。该变异为错义变异,位于重要的蛋白质功能结构区,在正常参考人群基因数据库中未见报道,多种软件预测该变异影响蛋白质结构/功能的可能性较大,与该家系中患者特异性表型高度相关,且Sanger测序结果显示家系中8名成员(包括3名患者)的基因型与表型共分离。依据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关指南,评估为可能致病性变异(PM1+PM2_Supporting+PP1+PP3+PP4)。据此结果对先证者进行植入前遗传学诊断,生育表型正常后代,位点检测及CMA均未见异常。结论本研究明确了IRF6 c.742G>T(p.G248C)杂合变异为该家系的遗传学病因,并为先证者提供了生育指导。
