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基于TCGA数据库研究预后生物标志物IPCEF1与膀胱癌免疫浸润的关系
1
作者
李韦杰
李蒙蒙
+1 位作者
沈从乐
王雅杰
《标记免疫分析与临床》
2025年第3期574-578,共5页
目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,本研究旨在分析细胞黏附素交换因子互作蛋白1(IPCEF1)基因在膀胱癌患者和正常组织中的表达差异,进一步探究其与病患临床特征和预后的相关性,以及其对膀胱癌调节信号通路和膀胱癌免疫细胞浸润的影响...
目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,本研究旨在分析细胞黏附素交换因子互作蛋白1(IPCEF1)基因在膀胱癌患者和正常组织中的表达差异,进一步探究其与病患临床特征和预后的相关性,以及其对膀胱癌调节信号通路和膀胱癌免疫细胞浸润的影响。方法从TCGA数据库下载膀胱癌相关的表达与临床特征资料。然后,比较膀胱癌患者组与正常组两组间IPCEF1的表达差异及其与临床特征的关系。使用Kaplan-Meier法进行生存分析并采用在线数据库进行验证。利用STRING工具构建IPCEF1 PPI网络图,同时借助基因富集分析(GO和KEGG)预测IPCEF1在膀胱癌中参与的信号通路。使用TIMER数据库分析IPCEF1基因与免疫细胞浸润的相关性。结果膀胱癌组IPCEF1的表达量显著低于正常组,差异有统计学意义(P<0.05)。低表达的IPCEF1会降低总生存率,与高表达组比较,差异有统计学意义(P<0.05)。富集分析指出,IPCEF1主要参与ARF蛋白信号转导和细胞连接等通路,并与免疫细胞浸润有关。IPCEF1表达与B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞、中性粒细胞和树突状细胞的水平呈正相关。结论在膀胱癌患者中,IPCEF1的低表达可能是预后不良的危险因素,并且它可能通过影响多种信号途径,影响膀胱癌的发生和发展。
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关键词
ipcef1
膀胱癌
TCGA
预后
免疫浸润
暂未订购
题名
基于TCGA数据库研究预后生物标志物IPCEF1与膀胱癌免疫浸润的关系
1
作者
李韦杰
李蒙蒙
沈从乐
王雅杰
机构
首都医科大学附属北京地坛医院检验科
青岛大学附属青岛市海慈医院(青岛市中医医院)消化中心
出处
《标记免疫分析与临床》
2025年第3期574-578,共5页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(编号:82102378)。
文摘
目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,本研究旨在分析细胞黏附素交换因子互作蛋白1(IPCEF1)基因在膀胱癌患者和正常组织中的表达差异,进一步探究其与病患临床特征和预后的相关性,以及其对膀胱癌调节信号通路和膀胱癌免疫细胞浸润的影响。方法从TCGA数据库下载膀胱癌相关的表达与临床特征资料。然后,比较膀胱癌患者组与正常组两组间IPCEF1的表达差异及其与临床特征的关系。使用Kaplan-Meier法进行生存分析并采用在线数据库进行验证。利用STRING工具构建IPCEF1 PPI网络图,同时借助基因富集分析(GO和KEGG)预测IPCEF1在膀胱癌中参与的信号通路。使用TIMER数据库分析IPCEF1基因与免疫细胞浸润的相关性。结果膀胱癌组IPCEF1的表达量显著低于正常组,差异有统计学意义(P<0.05)。低表达的IPCEF1会降低总生存率,与高表达组比较,差异有统计学意义(P<0.05)。富集分析指出,IPCEF1主要参与ARF蛋白信号转导和细胞连接等通路,并与免疫细胞浸润有关。IPCEF1表达与B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞、中性粒细胞和树突状细胞的水平呈正相关。结论在膀胱癌患者中,IPCEF1的低表达可能是预后不良的危险因素,并且它可能通过影响多种信号途径,影响膀胱癌的发生和发展。
关键词
ipcef1
膀胱癌
TCGA
预后
免疫浸润
Keywords
ipcef1
Bladder cancer
TCGA
Prognosis
Immune infiltration
分类号
R737.14 [医药卫生—肿瘤]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于TCGA数据库研究预后生物标志物IPCEF1与膀胱癌免疫浸润的关系
李韦杰
李蒙蒙
沈从乐
王雅杰
《标记免疫分析与临床》
2025
0
暂未订购
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