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1项初诊中国慢性淋巴细胞白血病患者的IGHV基因使用特征的单中心回顾性研究
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作者 陈睿泽 夏奕 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期382-386,共5页
目的:探索不同免疫球蛋白重链可变区基因(immunoglobulin heavy-chain variable region gene,IGHV)片段在中国慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)患者中的分布及其预后价值。方法:本研究回顾性分析了291例于南京医... 目的:探索不同免疫球蛋白重链可变区基因(immunoglobulin heavy-chain variable region gene,IGHV)片段在中国慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)患者中的分布及其预后价值。方法:本研究回顾性分析了291例于南京医科大学第一附属医院血液科就诊的初诊CLL患者的IGHV基因特征,利用IMGT数据库和IMGT/V-QUEST工具进行序列分析比对。结果:本研究发现中国CLL患者在IGHV基因片段的使用上与西方CLL患者显著不同:中国CLL患者IGHV3-7、IGHV4-39使用率更高,IGHV1-69使用率更低。在使用率更高的2个基因片段中,IGHV4-39与较短的至首次治疗时间相关,并与晚期疾病、细胞遗传学12号染色体三体、NOTCH1基因突变和黏附因子CD49d高表达等预后不良因素相关。结论:IGHV基因使用对判断CLL预后具有重要价值,中国CLL患者中IGHV4-39的高频使用可能导致预后不良,值得进一步研究和关注。 展开更多
关键词 慢性淋巴细胞白血病 ighv基因使用 ighv4-39 预后
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使用Leader引物和FR1引物检测IGHV突变的结果比较
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作者 周茉 陈艳 +2 位作者 姚利 王谦 曹杨琳 《中国血液流变学杂志》 CAS 2022年第4期516-520,608,共6页
目的比较Leader引物和FR1引物检测免疫球蛋白重链基因可变区(IGHV)体细胞高频突变的差别,优化IGHV突变检测流程。方法收集2021年9月—2022年8月苏州大学附属第一医院血液科就诊的187例患者的IGHV突变标本,分别使用Leader引物和FR1引物进... 目的比较Leader引物和FR1引物检测免疫球蛋白重链基因可变区(IGHV)体细胞高频突变的差别,优化IGHV突变检测流程。方法收集2021年9月—2022年8月苏州大学附属第一医院血液科就诊的187例患者的IGHV突变标本,分别使用Leader引物和FR1引物进行PCR扩增、基因测序(单克隆峰使用Sanger测序,双克隆峰使用TA克隆测序),将序列与免疫球蛋白数据库中已知的胚系基因标准序列进行比较,以确定IGHV突变状态,比较不同引物扩增后结果的一致性。结果送检的187例标本中单克隆166例,双克隆21例。统计结果显示,使用Leader引物的阳性率(89.76%)高于使用FR1引物的阳性率(84.94%),两者差异无统计学意义(P>0.05)。两种扩增后的PCR产物中位长度分别为295 bp和252 bp,使用Leader引物扩增的V区完整性(100%)高于使用FR1引物扩增的V区完整性(85.62%),两种引物的使用差异有统计学意义(P<0.0001)。准确性方面,使用Leader引物和FR1引物对结果判读整体上差异无统计学意义(P=0.106),而当同源性百分比处于判读的阈值以上范围≥98%和临界范围97%~99%时,两者差异有统计学意义(P=0.003、P=0.008),表明使用Leader引物的结果准确性要高于使用FR1引物的结果准确性。结论IGHV突变检测时,建议优先使用Leader引物,这样的检测体系准确、快速,能显著提高报告单时效。 展开更多
关键词 ighv突变 Leader引物 FR1引物
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荧光标记IgHV_1抗原九肽及其分离纯化
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作者 张燕玲 陈中举 +1 位作者 刘雪平 黄金瑛 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 2004年第9期78-81,共4页
目的 :建立IgHV1抗原九肽荧光标记及分离纯化的方法。方法 :利用硫代磷酸化的原理以荧光试剂标记IgHV1抗原九肽 ,用葡聚糖凝胶 (Sephadex)G 1 5层析柱及聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对荧光标记的IgHV1抗原九肽进行分离纯化并以毛细管电泳... 目的 :建立IgHV1抗原九肽荧光标记及分离纯化的方法。方法 :利用硫代磷酸化的原理以荧光试剂标记IgHV1抗原九肽 ,用葡聚糖凝胶 (Sephadex)G 1 5层析柱及聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对荧光标记的IgHV1抗原九肽进行分离纯化并以毛细管电泳技术进行鉴定。结果 :用毛细管电泳技术对纯化后样品进行鉴定 ,其电泳图谱只出现单一峰。结论 展开更多
关键词 抗原 荧光标记 分离纯化 磷酸化 鉴定 葡聚糖凝胶 电泳图谱 毛细管电泳技术 荧光试剂 聚丙烯酰胺凝胶电泳
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ighv3-21基因、SOX11与P53蛋白表达对套细胞淋巴瘤诊断、治疗及预后的价值 被引量:1
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作者 姜玲 贾荣飞 +4 位作者 侯安继 李斌 贾小力 倪响 杨晓燕 《上海医药》 CAS 2023年第7期46-50,共5页
目的:探讨ighv3-21基因、SOX11与P53蛋白表达对套细胞淋巴瘤诊断、治疗及预后的价值。方法:通过检测23例套细胞淋巴瘤和10例良性淋巴结增生的ighv3-21基因和SOX11与P53蛋白表达及相关数据的回顾性分析,探讨他们的表达对于套细胞淋巴瘤... 目的:探讨ighv3-21基因、SOX11与P53蛋白表达对套细胞淋巴瘤诊断、治疗及预后的价值。方法:通过检测23例套细胞淋巴瘤和10例良性淋巴结增生的ighv3-21基因和SOX11与P53蛋白表达及相关数据的回顾性分析,探讨他们的表达对于套细胞淋巴瘤的诊断、治疗和预后的价值。结果:套细胞淋巴瘤组和良性淋巴结肿大组之间SOX11免疫组化检测的差异有统计学意义,套细胞淋巴瘤多以阳性率低于25%为主。SOX11染色强度≥2的患者,靶向治疗的有效率更高。结论:SOX11免疫组化检测阳性率在套细胞淋巴瘤组中更高。B症状与治疗的有效率有关。全程管理中推荐积极加用靶向药物的应用。 展开更多
关键词 套细胞淋巴瘤 ighv3-21 基因 P53 蛋白 SOX11 蛋白 预后
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高通量测序分析B细胞非霍奇金淋巴瘤IGH基因克隆性重排特点及临床应用价值
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作者 马强 邹东梅 +4 位作者 郭轶先 赵弘 常晓丽 胡蓉华 孙婉玲 《肿瘤防治研究》 CAS 2024年第5期368-372,共5页
目的探讨B细胞非霍奇金淋巴瘤(B-NHL)IGH基因克隆性重排特点及临床应用价值。方法收集接受NGS检测,且存在IGH基因存在克隆性重排的55例B-NHL患者的人口学资料、临床资料及IGH基因NGS检测结果,分析IGH基因克隆性重排特点、IGHV基因取用频... 目的探讨B细胞非霍奇金淋巴瘤(B-NHL)IGH基因克隆性重排特点及临床应用价值。方法收集接受NGS检测,且存在IGH基因存在克隆性重排的55例B-NHL患者的人口学资料、临床资料及IGH基因NGS检测结果,分析IGH基因克隆性重排特点、IGHV基因取用频率,以及NGS检测IGH基因重排在临床中的应用价值。结果55例患者中,以单个优势克隆为主(85.45%,47/55),少数患者可检测到2个(12.73%,7/55)和3个优势克隆(1.82%,1/55);在IGHV基因取用偏好方面,IGHV3基因在B-NHL中取用频率最高,其次为IGHV4基因;在IGHV亚型中,IGHV3-23在慢性淋巴细胞白血病/小淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)中出现频率最高,IGHV4-34在原发中枢神经系统弥漫大B细胞淋巴瘤(PCNSL-DLBCL)及弥漫大B细胞淋巴瘤非特指型(DLBCL-NOS)中出现频率最高。结论不同病理类型的B-NHL患者IGH基因克隆性重排中IGHV基因片段取用频率存在偏好,使用NGS检测IGH重排可以识别亚克隆,鉴定克隆相关性,辅助疾病诊断。 展开更多
关键词 ighv 非霍奇金淋巴瘤 二代测序 克隆性重排
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培土清心颗粒治疗特应性皮炎的蛋白质组学研究 被引量:2
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作者 刘俊峰 张凯 +7 位作者 莫秀梅 王赛娅 晏烽根 叶思琪 贾金靖 张瑜 陈达灿 于晓波 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期191-199,共9页
目的采用血清蛋白质组学方法探讨培土清心颗粒(白术、连翘、白茅根、太子参等)治疗特应性皮炎的作用靶点。方法选择特应性皮炎患者5例,以培土清心颗粒治疗12周,并以健康志愿者5例作为对照。对特应性皮炎患者治疗后的临床核心评价指标包... 目的采用血清蛋白质组学方法探讨培土清心颗粒(白术、连翘、白茅根、太子参等)治疗特应性皮炎的作用靶点。方法选择特应性皮炎患者5例,以培土清心颗粒治疗12周,并以健康志愿者5例作为对照。对特应性皮炎患者治疗后的临床核心评价指标包括病情严重程度评分(EASI、SCORAD)、瘙痒程度评分、患者自评(POEM)、生活质量指数等进行评估。采用数据非依赖采集质谱(DIA-MS)技术检测血清样本,并根据P<0.05、变化倍数(Fold Change)>1.2筛选出特应性皮炎患者与健康人群的血清差异蛋白,以及培土清心颗粒治疗前后特应性皮炎患者的血清差异蛋白。对差异蛋白进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果(1)与治疗前比较,特应性皮炎患者治疗后的临床核心评价指标包括病情严重程度评分(EASI、SCORAD)、瘙痒程度评分、患者自评(POEM)、生活质量指数等均得到明显改善,差异均有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。(2)健康对照组及特应性皮炎组共分析出28个差异性蛋白,其中12个蛋白表达水平上升,16个蛋白表达水平下降,包括ALAD(δ-氨基乙酰丙酸脱水酶)、LTA4H(白三烯A-4水解酶)、CA1(碳酸酐酶1)、F11(凝血因子XI)、LCP1(淋巴细胞胞浆蛋白1)等。主要涉及PI3K-AKT信号通路、脂质与动脉粥样硬化、ECM-受体相互作用、血小板活化、NF-κB信号通路、中性粒细胞外陷阱形成等信号通路。(3)特应性皮炎患者经培土清心颗粒治疗前后共分析出12个差异蛋白,其中8个蛋白表达水平上升,4个蛋白表达水平下降,包括ALAD、FGA(纤维蛋白原α链)、IGHV3-64D及IGHV3-38等。主要涉及脂质与动脉粥样硬化、补体途径、金黄色葡萄球菌感染、NF-κB信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化等信号通路。(4)ALAD、FGA、IGHV3-64D等3个蛋白靶点在特应性皮炎患者中的表达显著下调,而在培土清心颗粒治疗后显著上调。结论差异表达蛋白ALAD、FGA、IGHV3-64D可能是培土清心颗粒治疗特应性皮炎的作用靶点,为进一步实验验证奠定了基础。 展开更多
关键词 特应性皮炎 培土清心颗粒 蛋白质组学 数据非依赖采集质谱 Δ-氨基乙酰丙酸脱水酶 纤维蛋白原α链 ighv3-64D
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牛抗体中超长CDR H3结构的研究进展
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作者 赵绮欢 高敏 +2 位作者 付山 昭日格图 包福祥 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第18期28-32,134,135,共7页
牛体内具有超长CDR H3结构的抗体占总抗体的10%,长度约为70个氨基酸,包含特殊的β-带状柄结构和富含二硫键的旋钮结构,其形成与IGHV1-7区域的短核苷酸复制及IGHD8-2基因有关。牛超长CDR H3结构的抗原结合活性高且具有多样性,其中旋钮结... 牛体内具有超长CDR H3结构的抗体占总抗体的10%,长度约为70个氨基酸,包含特殊的β-带状柄结构和富含二硫键的旋钮结构,其形成与IGHV1-7区域的短核苷酸复制及IGHD8-2基因有关。牛超长CDR H3结构的抗原结合活性高且具有多样性,其中旋钮结构与抗体结合活性有关,抗体结构、二硫键位置和数量、半胱氨酸数量、体细胞突变等与超长CDR H3结构多样性有关。牛独特的超长CDR H3结构为其免疫应答、免疫治疗和新型疫苗制备等方面提供了新的研究思路。笔者概述了牛超长CDR H3结构的形成机制、特性、抗原结合特性,并总结了其应用前景,以期为新型抗体的研发和应用提供参考。 展开更多
关键词 抗体 超长CDR H3结构 β-带状柄结构 旋钮结构 半胱氨酸 ighv1-7 IGHD8-2
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<i>SEPT10</i>Expression in Chronic Lymphocytic Leukemia. Correlation with Clinical and Biological Prognostic Factors
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作者 Ana Travella Julieta Panero +2 位作者 Carmen Stanganelli Raimundo Bezares Irma Slavutsky 《Open Journal of Blood Diseases》 2013年第3期11-16,共6页
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is characterized by a highly variable clinical course. Microarray studies allowed highlight genes differentially expressed in this pathology. In this study, we have evaluated the pro... Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is characterized by a highly variable clinical course. Microarray studies allowed highlight genes differentially expressed in this pathology. In this study, we have evaluated the prognostic significance of SEPT10 expression in CLL patients. Results were correlated with immunoglobulin heavy-chain variable (IGHV) genes mutational status, genomic rearrangements and clinical parameters. SEPT10 mRNA levels were determined by quantitative real-time PCR in 70 newly diagnosed CLL patients consecutively referred to our Institution. A wide heterogeneity for SEPT10 expression was found. Gene upregulation was observed in 18.5% of cases. The univariate analysis showed a positive association between gen expression and platelet count (p 0.0001) and a negative correlation with hemoglobin levels (p = 0.0094). Although no significant differences were observed, mean treatment free survival was shorter in patients with high expression (31 months) with respect to those with low mRNA levels (72 months). Cases with abnormal karyotypes had increased expression compared to those with normal karyotypes and no association between gene expression and FISH (fluorescence in situ hybridization) risk groups and IGHV mutational status was found. Cases using IGHV3-23 gene rearrangement had low SEPT10 expression. Our results showed an association between SEPT10 expression and features of adverse outcome but without independent prognostic value. The study of SEPT10 expression may be important for a better understanding of disease heterogeneity, adding further information to those provided by established prognostic factors. 展开更多
关键词 Chronic LYMPHOCYTIC Leukemia SEPT10 EXPRESSION FISH CYTOGENETICS ighv Mutational Status
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毛细胞白血病和毛细胞白血病变异型患者免疫球蛋白重链可变区基因分子特征分析 被引量:1
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作者 王轶 王婷玉 +5 位作者 王君 阎禹廷 吕瑞 熊文婕 邱录贵 易树华 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2022年第20期1073-1078,共6页
目的:本研究归纳毛细胞白血病(hairy cell leukemia,HCL)和毛细胞白血病变异型(hairy cell leukemia-variant,HCL-v)患者免疫球蛋白重链可变区(immunoglobulin heavy chain variable region,IGHV)基因分子特征,并探讨其与临床特征及预... 目的:本研究归纳毛细胞白血病(hairy cell leukemia,HCL)和毛细胞白血病变异型(hairy cell leukemia-variant,HCL-v)患者免疫球蛋白重链可变区(immunoglobulin heavy chain variable region,IGHV)基因分子特征,并探讨其与临床特征及预后的相关性。方法:回顾性分析2004年12月至2020年1月在中国医学科学院血液病医院完善IGHV检测的29例HCL患者和15例HCL-v患者临床和生存资料。结果:44例患者共检测出23种重排片段,VH4和VH4-34分别是两种疾病最常见的V区基因家族和重排片段。HCL和HCL-v患者中IGHV为突变状态的比例分别为72.4%和66.7%,发生VH4-34重排(VH4-34 rearrangement,VH4-34+)的患者IGHV突变率更低(P<0.001)。在HCL中,使用VH1基因家族患者脾大发生率更低(P=0.041);而VH4-34+或IGHV未突变状态(IGHV-unmutated,IGHV-UM)的患者具有更高的乳酸脱氢酶(VH4-34+P=0.049,IGHV-UM P=0.022)和β2微球蛋白(VH4-34+P=0.039,IGHV-UM P=0.036)水平,且VH4-34+患者BRAF V600E突变率更低(20%vs.85%,P=0.012)。单因素预后分析显示,VH4-34+是HCL患者无进展生存(progression-free survival,PFS)(P=0.001)和总生存(P=0.004)的不良预后因素,IGHV-UM则为HCL-v患者PFS(P=0.038)的危险因素。结论:HCL和HCL-v患者对VH4基因家族及VH4-34存在偏向性使用,VH4-34+和IGHV-UM间存在明显共现性。在HCL中,VH4-34+与高肿瘤负荷及更差生存相关,而IGHV-UM是HCL-v患者PFS的危险因素。 展开更多
关键词 毛细胞白血病 毛细胞白血病变异型 免疫球蛋白重链可变区基因 疾病特征 预后
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