期刊文献+
共找到9篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
鸡IFIT5基因编码区多态性及生物信息学分析 被引量:1
1
作者 张贝 孟婕 +5 位作者 任一帆 杨晴 巩静 张传生 耿立英 李祥龙 《中国家禽》 北大核心 2021年第10期17-24,共8页
为探究鸡IFIT5基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR技术对IFIT5的CDS进行扩增,并结合多种生物信息学等方法对蛋白的理化性质及蛋白结构功能进行系统性预测分析。结果显示:通过PCR成功克隆了IFIT5外显子2的CDS区域,测... 为探究鸡IFIT5基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR技术对IFIT5的CDS进行扩增,并结合多种生物信息学等方法对蛋白的理化性质及蛋白结构功能进行系统性预测分析。结果显示:通过PCR成功克隆了IFIT5外显子2的CDS区域,测序结果为1 411 bp;经分析得到完整的IFIT5 CDS区为1 440 bp,共编码479个氨基酸,测序比对结果准确。IFIT5蛋白为不稳定的、小分子的、非分泌型的亲水蛋白,且具有磷酸化和糖基化位点;二级结构主要以α-螺旋为主,结构域以TPR结构域为主。研究发现了12个SNP,其中SNP1(g.405 G>A)和SNP9(g.1 124 G>A)在原鸡为A,在家鸡中已固定为G;只有SNP8(g.110 8 A>G)和SNP12(g.1 273 A>G)位点具有中度多态性,其他位点是低度。12个SNP位点中存在4个nsSNP位点(D370N、Y375C、N402K和G425R)。其中D370N、Y375C和N402K位点被预测为有害性位点;并且D370N和N402K突变可能改变相关氨基酸的氢键数目和蛋白的高级结构,进而影响蛋白的结构和功能。这些nsSNP位点,特别是D370N和N402K可尝试作为鸡先天免疫的候选分子标记,为遗传资源的保护及抗病性分子育种提供理论依据。 展开更多
关键词 ifit5基因 多态性 蛋白质结构 生物信息学分析
原文传递
IFIT5在肝细胞癌中表达上调并促进肝癌细胞侵袭和迁移 被引量:3
2
作者 杨楠 陈天翔 +4 位作者 刘润坤 牛永申 王亮 姚博文 刘志奎 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第21期2093-2099,共7页
目的探讨干扰素诱导蛋白5(interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5,IFIT5)在肝癌组织中的表达、临床意义及可能的分子机制。方法收集2013年在西安交通大学第一附属医院确诊的97例肝癌患者的肿瘤组织和癌旁组织。... 目的探讨干扰素诱导蛋白5(interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5,IFIT5)在肝癌组织中的表达、临床意义及可能的分子机制。方法收集2013年在西安交通大学第一附属医院确诊的97例肝癌患者的肿瘤组织和癌旁组织。实时定量PCR、Western blot及免疫组化检测IFIT5在肝癌及癌旁组织中的表达水平,并分析IFIT5表达水平与临床病理指标的关系及生存率。Transwell实验检测IFIT5对HCC细胞的侵袭及迁移作用,Western blot法检测IFIT5对HCC细胞EMT的影响。结果IFIT5在肝癌组织中表达水平显著高于相应癌旁组织(P<0.05);肝癌组织IFIT5高表达与TNM分期(P=0.018)及血管侵犯(P=0.009)显著相关;高表达IFIT5患者5年生存率明显高于低表达组(P<0.05);IFIT5可显著促进HCC细胞的侵袭及迁移(P<0.05);IFIT5促进HCC细胞EMT的发生(P<0.05)。结论IFIT5在肝癌组织中表达升高,其高表达与肝癌恶性临床病理特征有关,IFIT5能够通过调控HCC细胞EMT促进其侵袭和迁移。 展开更多
关键词 ifit5 肝细胞癌 侵袭 迁移 上皮间质转化
原文传递
鸡IFIT5基因单核苷酸多态性的生物信息学分析 被引量:6
3
作者 张贝 郝文文 +3 位作者 耿立英 彭永东 张传生 李祥龙 《河北科技师范学院学报》 CAS 2019年第1期33-38,47,共7页
为了筛选鸡IFIT5基因潜在的、具有生物学功能的nsSNPs(nonsense Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点和UTR-SNPs(untranslated regions-SNPs)位点。利用5种SNPs在线工具对nsSNPs进行分析预测有害位点;使用SWISS-MODEL,Pymol,Cons... 为了筛选鸡IFIT5基因潜在的、具有生物学功能的nsSNPs(nonsense Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点和UTR-SNPs(untranslated regions-SNPs)位点。利用5种SNPs在线工具对nsSNPs进行分析预测有害位点;使用SWISS-MODEL,Pymol,Consurf server等软件对有害nsSNPs位点进行蛋白质的空间结构,氨基酸的氢键变化,及保守型等进行相关分析。此外,对UTR-SNPs位点使用UTRScan分析预测其结合模式元件是否改变。结果表明:从IFIT5基因的nsSNPs位点筛选出来的6个有害nsSNPs位点(L220I,L223M,L223V,Y375C,E391G和Y414D)都为潜在性功能位点,其中E391G位点最可能影响蛋白的结构和功能。从UTR-SNPs筛选出9个位于uORF的位点可能影响IFIT5基因的转录模式。 展开更多
关键词 ifit5基因 非同义SNPs(nsSNPs) UTR-SNPs 同源建模 保守性分析
在线阅读 下载PDF
鸡IFIT5对J亚群禽白血病病毒在DF-1细胞内复制的影响
4
作者 朱丽霖 王后坤 +4 位作者 陈雪阳 刘晶 梁雄燕 方春 杨玉莹 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期310-316,共7页
【目的】制备鸡干扰素诱导蛋白含三角形四肽重复5(IFIT5)多克隆抗体,以探究IFIT5对J型禽白血病病毒(ALV-J)在鸡胚成纤维细胞(DF-1)内复制的影响。【方法】以感染ALV-J的鸡脾脏组织细胞提取的RNA反转录获得的cDNA作为模板,对IFIT5基因进... 【目的】制备鸡干扰素诱导蛋白含三角形四肽重复5(IFIT5)多克隆抗体,以探究IFIT5对J型禽白血病病毒(ALV-J)在鸡胚成纤维细胞(DF-1)内复制的影响。【方法】以感染ALV-J的鸡脾脏组织细胞提取的RNA反转录获得的cDNA作为模板,对IFIT5基因进行PCR扩增,利用重组酶将纯化后的PCR产物和线性化载体进行连接,构建重组质粒pET-28a-IFIT5和pcDNA5-flag-IFIT5并测序。将测序正确的重组质粒pET-28a-IFIT5转化大肠杆菌BL21感受态细胞进行诱导表达,表达的融合蛋白His-IFIT5纯化后免疫6周龄BALB/c雌鼠制备多克隆抗体,通过Western blotting鉴定抗体的特异性,利用间接ELISA测定抗体的效价。将测序正确的重组质粒pcDNA5-flag-IFIT5转染DF-1细胞,24 h后接种ALV-J,通过Western blotting检测DF-1细胞中过表达IFIT5对ALV-J复制的影响。【结果】试验成功扩增到大小为1 440 bp的IFIT5基因,并成功构建重组质粒pET-28a-IFIT5和pcDNA5-flag-IFIT5。pET-28a-IFIT5可以表达约56 ku的可溶性蛋白His-IFIT5,Western blotting结果显示,制备的鼠抗IFIT5蛋白多克隆抗体能特异性识别DF-1细胞中过表达的IFIT5蛋白,效价为1∶32 000。pcDNA5-flag-IFIT5能在DF-1细胞中高效表达,且在DF-1细胞中过表达IFIT5可以促进ALV-J复制。【结论】本研究制备的鼠抗IFIT5蛋白多克隆抗体具有较高的反应性和特异性;在DF-1细胞中过表达IFIT5可以促进ALV-J复制。本试验结果为深入研究IFIT5蛋白的生物学功能提供参考。 展开更多
关键词 ifit5基因 J型禽白血病病毒(ALV-J) 原核表达 多克隆抗体
在线阅读 下载PDF
鸭IFIT5基因(544G>A)多态性与部分免疫指标的关联分析 被引量:2
5
作者 刘然 苏燕辉 +2 位作者 王苗苗 徐琪 陈国宏 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2016年第5期19-22,共4页
探索IFIT5基因作为抗性性状的候选标记的可能性,为家禽抗病育种提供一些参考依据。以樱桃谷北京鸭、苏牧麻鸭(樱桃谷鸭×金定鸭)、金定鸭、白羽番鸭为试验材料,利用DNA直接测序技术扫描IFIT5基因单核苷酸多态性(SNP),并分析其与部... 探索IFIT5基因作为抗性性状的候选标记的可能性,为家禽抗病育种提供一些参考依据。以樱桃谷北京鸭、苏牧麻鸭(樱桃谷鸭×金定鸭)、金定鸭、白羽番鸭为试验材料,利用DNA直接测序技术扫描IFIT5基因单核苷酸多态性(SNP),并分析其与部分免疫指标的关联性。结果表明:仅在IFIT5基因外显子2上检测到一个错义突变(G544A),产生2种等位基因,2种基因型(GG、GA),未发现有AA基因型。经χ2检验,4个鸭群体只有金定鸭和苏牧麻鸭处于Hardy-Weinberg平衡状态。关联分析结果显示:樱桃谷鸭体内H5含量GG型显著高于GA型(P<0.05),而Ig M含量GG型显著低于GA型(P<0.05),其余免疫指标均无显著差异(P>0.05);苏牧麻鸭体内H5含量GG型极显著高于GA型(P<0.01),其余免疫指标均无显著差异(P>0.05);金定鸭不同基因型各免疫指标均无显著差异(P>0.05)。白羽番鸭在+544位点均为GG纯合基因型。由此可以看出,IFIT5(544G>A)可作为樱桃谷鸭体内H5含量的候选分子标记。 展开更多
关键词 ifit5基因 SNP 免疫指标
在线阅读 下载PDF
IFIT5在子宫内膜癌组织中的表达及其对内膜癌HEC-1-A细胞生物学行为的影响 被引量:1
6
作者 朱绣玉 陆思楚 +2 位作者 马成蕾 吴健亮 闫洪超 《医学研究杂志》 2022年第4期94-98,共5页
目的探究干扰素诱导蛋白(interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5,IFIT5)在子宫内膜癌组织中的表达及其对子宫内膜腺癌细胞HEC-1-A生物学行为的影响。方法采用免疫组织化学染色法检测IFIT5在30例正常内膜组织及6... 目的探究干扰素诱导蛋白(interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5,IFIT5)在子宫内膜癌组织中的表达及其对子宫内膜腺癌细胞HEC-1-A生物学行为的影响。方法采用免疫组织化学染色法检测IFIT5在30例正常内膜组织及60例子宫内膜癌组织中的表达,并分析其过表达与子宫内膜癌临床病理特征的相关性;采用脂质体转染法将订制的特异siRNA转染至内膜癌细胞内,靶向抑制IFIT5的表达,并通过CCK-8法、Transwell小室、划痕实验检测干扰前后HEC-1-A细胞增殖、侵袭、迁移能力变化。结果与正常子宫内膜组织比较,IFIT5在子宫内膜癌组织中表达较高(P<0.05),且IFIT5的高表达与子宫内膜癌的临床分期、肌层浸润深度、淋巴结转移情况等相关(P<0.05),但与年龄无关(P>0.05);siRNA抑制IFIT5表达后,CCK-8、Transwell小室及划痕实验显示,抑制组细胞的增殖、侵袭及迁移能力均较阴性对照组显著降低(P<0.05)。结论IFIT5在子宫内膜癌组织中呈现高表达,其高表达与子宫内膜癌的发生、发展相关;抑制IFIT5的表达可抑制子宫内膜癌细胞的增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 ifit5 子宫内膜癌 细胞增殖 细胞侵袭 细胞迁移
暂未订购
生物信息学揭示m7G甲基化修饰相关基因在腹主动脉瘤中的作用
7
作者 叶嘉民 杨馨悦 +5 位作者 刘继涛 马文韬 何彩云 杨帆 罗淞元 罗建方 《岭南心血管病杂志》 CAS 2023年第3期279-289,共11页
目的明确N7-甲基鸟苷(7-methylguanosine,m7G)相关基因对腹主动脉瘤(abdominal aortic aneurysm,AAA)的作用。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中获取人类AAA和正常组织中m7G相关基因的表达数据,并进行差异分析。通过LASSO回... 目的明确N7-甲基鸟苷(7-methylguanosine,m7G)相关基因对腹主动脉瘤(abdominal aortic aneurysm,AAA)的作用。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中获取人类AAA和正常组织中m7G相关基因的表达数据,并进行差异分析。通过LASSO回归筛选与发病相关的基因并进行免疫浸润分析,根据其表达模式对AAA患者进行共识聚类分型,对两种亚型的差异基因进行基因本体论(gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。最后通过数据库预测筛选出的m7G相关基因的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、微小RNA(microRNA,miRNA)。结果筛选出6个具有显著差异的m7G相关基因,其中IFIT5、NUDT10和NUDT4与AAA发病密切相关。这三者其可能影响CD4幼稚T细胞,自然杀伤(natural killer,NK)细胞,Tregs细胞的免疫浸润程度,根据其表达模式聚类的亚型与AAA的异质性密切相关,并构建了相关竞争性内源RNA(competing endogenouse RNA,ceRNA)网络。结论m7G相关基因IFIT5、NUDT10和NUDT4可能是治疗人类AAA的潜在靶点。 展开更多
关键词 腹主动脉瘤 N7-甲基鸟苷修饰 ifit5 NUDT10 NUDT4
暂未订购
鸭干扰素刺激基因的克隆、表达及其多克隆抗体的制备 被引量:1
8
作者 黄惠兰 李文俊 +4 位作者 谢梓民 杨惠湖 崔惠仪 黄淑坚 张雪莲 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第11期3713-3721,共9页
本研究旨在克隆、表达鸭干扰素刺激基因(interferon-induced proteins with tetratricopeptide repeats 5,IFIT5)并制备其多克隆抗体。根据GenBank公布的绿头鸭IFIT5(登录号:KF956064)序列设计特异性引物,PCR扩增获得鸭IFIT5基因,并构... 本研究旨在克隆、表达鸭干扰素刺激基因(interferon-induced proteins with tetratricopeptide repeats 5,IFIT5)并制备其多克隆抗体。根据GenBank公布的绿头鸭IFIT5(登录号:KF956064)序列设计特异性引物,PCR扩增获得鸭IFIT5基因,并构建原核表达重组质粒pET-30a-IFIT5和pET-32a-IFIT5及真核表达重组质粒pcDNA3.1-IFIT5。原核表达获得鸭IFIT5重组蛋白后,进行SDS-PAGE分析,并利用镍柱亲和层析方法对重组蛋白进行纯化。以纯化的鸭IFIT5重组蛋白为免疫原制备兔抗鸭IFIT5多克隆抗体。利用间接ELISA测定多克隆抗体效价、用Western blotting鉴定其特异性;将真核表达重组质粒pcDNA3.1-IFIT5转化BHK21细胞,通过间接免疫荧光法鉴定多克隆抗体的反应性。结果表明:目的蛋白主要以包涵体的形式存在;制备的兔抗鸭IFIT5多克隆抗体效价达1∶49600,可特异性识别鸭IFIT5重组蛋白,间接免疫荧光试验则表明纯化的多克隆抗体可特异性识别BHK21瞬时真核表达的鸭IFIT5蛋白。综上,成功克隆了鸭干扰素刺激基因IFIT5,制备的兔抗鸭IFIT5多克隆抗体可用于鸭IFIT5蛋白的检测,可为鸭IFIT5蛋白的后续研究提供材料支撑。 展开更多
关键词 干扰素刺激基因(ifit5) 基因克隆 蛋白表达及检测
在线阅读 下载PDF
EV71诱导has-miR-200b表达并促进自身复制的机制
9
作者 胡静平 王燕 傅煜轩 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期21-25,共5页
通过高通量测序检测、荧光素酶报告基因实验以及Western Blot探究miR-200b在EV71病毒复制过程中的作用。结果表明:高通量miRNA测序发现EV71感染后宿主细胞中has-miR-200b的表达显著上升,特异性抑制miR-200b的表达能够抑制EV71病毒复制;... 通过高通量测序检测、荧光素酶报告基因实验以及Western Blot探究miR-200b在EV71病毒复制过程中的作用。结果表明:高通量miRNA测序发现EV71感染后宿主细胞中has-miR-200b的表达显著上升,特异性抑制miR-200b的表达能够抑制EV71病毒复制;荧光素酶报告基因实验发现,miR-200b能够直接靶向结合干扰素刺激基因IFIT5的3′-UTR区域;进一步研究证实在EV71病毒感染过程中所诱导的miR-200b的表达增加能够抑制IFIT5表达进而抑制Ⅰ型干扰素应答。研究表明,EV71病毒感染能够诱导宿主细胞内miR-200b表达增加,进而抑制干扰素刺激基因IFIT5的表达,导致胞内干扰素应答抑制,从而有利EV71病毒复制。 展开更多
关键词 肠道病毒71型 手-足口病 miR-200b ifit5 干扰素应答 病毒复制
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部