目的筛选和验证潜在的调控特发性肺纤维化(IPF)发生发展的基因,为IPF治疗提供新的靶点。方法通过使用转化生长因子β_(1)(TGF-β_(1))处理HFL1细胞诱导体外IPF模型(TGF-β_(1)处理组),同时以未处理细胞作为空白对照组,提取细胞RNA并进...目的筛选和验证潜在的调控特发性肺纤维化(IPF)发生发展的基因,为IPF治疗提供新的靶点。方法通过使用转化生长因子β_(1)(TGF-β_(1))处理HFL1细胞诱导体外IPF模型(TGF-β_(1)处理组),同时以未处理细胞作为空白对照组,提取细胞RNA并进行转录组测序。对转录组测序结果进行分析,筛选处理组与对照组间的差异表达基因。同时,进行了Gene Ontology(GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)和Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)功能富集分析。使用IPF疾病相关的GEO数据集GSE24206和GSE40839结合转录组测序数据筛选出关键基因。通过IPF体外模型的RTq PCR实验对这些关键基因进行验证,并筛选出核心基因。最后通过腹腔注射博来霉素构建小鼠IPF模型,通过RT-qPCR对等渗盐水对照组和博来霉素处理组样本进行检测,验证筛选出的核心基因表达变化。结果相较于空白对照组,TGF-β_(1)处理组中α-SMA、NOX4和PDGFA 3种因子的表达均显著上调,表明体外IPF诱导模型构建成功。转录组测序分析筛选出2345个差异表达基因。差异基因的GO和KEGG富集分析显示,显著富集的通路包括TGF-β响应及TGF-β信号通路等;GSEA分析则富集到RNA降解、氧化磷酸化等通路。通过GEO数据库和转录组测序数据相交筛选出26个与IPF密切相关的基因。经验证,确定SLC19A2和IFI44为影响IPF的核心基因。在小鼠IPF模型中,相较于等渗盐水对照组,博来霉素处理组肺组织中SLC19A2显著上调,IFI44显著下调,这与IPF体外模型中的结果相一致。结论SLC19A2基因和IFI44基因可能是治疗IPF疾病的新靶点,这为IPF的研究和治疗提供了新思路。展开更多
干扰素γ诱导蛋白30(interferon,gamma-inducible protein 30,IFI30)在MHC-Ⅱ限制性抗原加工递呈过程和MHC-Ⅰ限制性抗原交叉递呈过程中起关键性作用。利用3个不同浓度PRRSV感染猪肺支气管巨噬细胞(PAM),应用qPCR在不同时间点检测IFI30...干扰素γ诱导蛋白30(interferon,gamma-inducible protein 30,IFI30)在MHC-Ⅱ限制性抗原加工递呈过程和MHC-Ⅰ限制性抗原交叉递呈过程中起关键性作用。利用3个不同浓度PRRSV感染猪肺支气管巨噬细胞(PAM),应用qPCR在不同时间点检测IFI30基因表达水平。结果表明:0.08,0.10,0.12 MOI 3个剂量PRRSV感染PAM,IFI30基因表达差异不显著(P>0.05);PRRSV感染1.5 h IFI30表达量降低,但差异不显著(P>0.05),之后表达量上调;在感染后12,24,36 h IFI30基因表达量极显著提高(P<0.01),之后IFI30基因表达量有所下降(P<0.05)。IFI30基因在PRRSV感染PAM过程中表达量的变化,可能是PRRSV与宿主相互作用的机制之一。展开更多
目的研究干扰素诱导蛋白16(interferon inducible protein 16,IFI16)在银屑病中的表达及分布,探讨其在银屑病发病中的作用。方法采用RT-PCR、免疫组化的方法分别检测10例银屑病患者皮损和10例健康人皮肤组织真皮与表皮中IFI16的表达情况...目的研究干扰素诱导蛋白16(interferon inducible protein 16,IFI16)在银屑病中的表达及分布,探讨其在银屑病发病中的作用。方法采用RT-PCR、免疫组化的方法分别检测10例银屑病患者皮损和10例健康人皮肤组织真皮与表皮中IFI16的表达情况;采用RT-PCR、Western印记方法检测IFN-γ,TNF-α,IL-17刺激前后Ha Ca T细胞中IFI16的表达情况。结果银屑病患者皮损处IFI16的表达明显高于健康人皮肤,并且以表皮表达为主,免疫组化结果显示IFI16主要定位于银屑病患者的角质形成细胞中。银屑病相关细胞因子IFN-γ,TNF-α和IL-17可以上调角质形成细胞中IFI16的表达水平。结论IFI16在银屑病患者皮损处表达明显高于正常人皮肤,并且IFN-γ,TNF-α和IL-17可以诱导其表达上调,可能是银屑病角质形成细胞的活化机制之一。展开更多
文摘目的筛选和验证潜在的调控特发性肺纤维化(IPF)发生发展的基因,为IPF治疗提供新的靶点。方法通过使用转化生长因子β_(1)(TGF-β_(1))处理HFL1细胞诱导体外IPF模型(TGF-β_(1)处理组),同时以未处理细胞作为空白对照组,提取细胞RNA并进行转录组测序。对转录组测序结果进行分析,筛选处理组与对照组间的差异表达基因。同时,进行了Gene Ontology(GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)和Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)功能富集分析。使用IPF疾病相关的GEO数据集GSE24206和GSE40839结合转录组测序数据筛选出关键基因。通过IPF体外模型的RTq PCR实验对这些关键基因进行验证,并筛选出核心基因。最后通过腹腔注射博来霉素构建小鼠IPF模型,通过RT-qPCR对等渗盐水对照组和博来霉素处理组样本进行检测,验证筛选出的核心基因表达变化。结果相较于空白对照组,TGF-β_(1)处理组中α-SMA、NOX4和PDGFA 3种因子的表达均显著上调,表明体外IPF诱导模型构建成功。转录组测序分析筛选出2345个差异表达基因。差异基因的GO和KEGG富集分析显示,显著富集的通路包括TGF-β响应及TGF-β信号通路等;GSEA分析则富集到RNA降解、氧化磷酸化等通路。通过GEO数据库和转录组测序数据相交筛选出26个与IPF密切相关的基因。经验证,确定SLC19A2和IFI44为影响IPF的核心基因。在小鼠IPF模型中,相较于等渗盐水对照组,博来霉素处理组肺组织中SLC19A2显著上调,IFI44显著下调,这与IPF体外模型中的结果相一致。结论SLC19A2基因和IFI44基因可能是治疗IPF疾病的新靶点,这为IPF的研究和治疗提供了新思路。
文摘干扰素γ诱导蛋白30(interferon,gamma-inducible protein 30,IFI30)在MHC-Ⅱ限制性抗原加工递呈过程和MHC-Ⅰ限制性抗原交叉递呈过程中起关键性作用。利用3个不同浓度PRRSV感染猪肺支气管巨噬细胞(PAM),应用qPCR在不同时间点检测IFI30基因表达水平。结果表明:0.08,0.10,0.12 MOI 3个剂量PRRSV感染PAM,IFI30基因表达差异不显著(P>0.05);PRRSV感染1.5 h IFI30表达量降低,但差异不显著(P>0.05),之后表达量上调;在感染后12,24,36 h IFI30基因表达量极显著提高(P<0.01),之后IFI30基因表达量有所下降(P<0.05)。IFI30基因在PRRSV感染PAM过程中表达量的变化,可能是PRRSV与宿主相互作用的机制之一。
文摘目的研究干扰素诱导蛋白16(interferon inducible protein 16,IFI16)在银屑病中的表达及分布,探讨其在银屑病发病中的作用。方法采用RT-PCR、免疫组化的方法分别检测10例银屑病患者皮损和10例健康人皮肤组织真皮与表皮中IFI16的表达情况;采用RT-PCR、Western印记方法检测IFN-γ,TNF-α,IL-17刺激前后Ha Ca T细胞中IFI16的表达情况。结果银屑病患者皮损处IFI16的表达明显高于健康人皮肤,并且以表皮表达为主,免疫组化结果显示IFI16主要定位于银屑病患者的角质形成细胞中。银屑病相关细胞因子IFN-γ,TNF-α和IL-17可以上调角质形成细胞中IFI16的表达水平。结论IFI16在银屑病患者皮损处表达明显高于正常人皮肤,并且IFN-γ,TNF-α和IL-17可以诱导其表达上调,可能是银屑病角质形成细胞的活化机制之一。
