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Roles of polysaccharide from Branchiostoma belcheri in anti-DNA oxidation and anti-tumor activity in S180 mice 被引量:3
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作者 梁惠 张士璀 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2009年第4期845-850,共6页
In this study, we isolated a polysaccharide from Branchiostoma belcheri (PBB) by enzymatic protein hydrolysis and alcohol precipitation. We investigated the effects of PBB supplementation on DNA oxidation and growth... In this study, we isolated a polysaccharide from Branchiostoma belcheri (PBB) by enzymatic protein hydrolysis and alcohol precipitation. We investigated the effects of PBB supplementation on DNA oxidation and growth of the transplanted tumor cells Sarcoma (S180) in mice. Sixty healthy Kunming mice weighing between 18 and 25 g were randomly assigned to 6 groups, each consisting of 10 animals. All the mice, except for the blank control group, were inoculated with S180 sarcoma cells into the axilla of the left foreleg. PBB was given to mice by gavage at doses of 0 (model control), 25, 50, or 100 mg/kg b.w. in 0.2 ml saline for 30 days. The fifth group of S180-mice was given cytoxan (50 mg/kg) by peritoneal injection as a positive control group. The animals had free access to food and water. The mice were sacrificed after the final treatment and blood was quickly collected. Spontaneous and oxidized DNA damage of peripheral lymphocytes induced by H2O2 were analyzed by SCGE. O6-methyl-guanine (O6-MeG) was measured by high-performance capillary zone electrophoresis. The average tumor weights (0.856-1.118 g) of the three PBB groups were significantly lower than that of the model control group (1.836 g) (p〈0.05). The tumor inhibition ratios of the PBB groups were 39.1%-53.4% and similar to the cytoxan positive group (57.5%). There were no significant differences in spontaneous DNA damage in peripheral lymphocytes among the groups. The oxidative DNA damage induced by 10 μmol/L H2O2 in the 50 and 100 mg/kg b.w. groups were 246.1 AU and 221.7 AU, respectively, both of which were significantly lower than that in the model group (289.0 AU; p〈0.05). The plasma concentrations of O6-MeG in the 25, 50, and 100 mg/kg supplemented groups were 2.09 μmol/L, 1.86 μmol/L, and 1.63 lamol/L, respectively, all of which were significantly lower than that of the model group (2.67 μmol/L; p〈0.05). These results indicated that PBB may have antioxidative activity and thus reduce oxidation-induced DNA damage. 展开更多
关键词 POLYSACCHARIDE Branchiostoma belcheri SCGE O6-methylguanine DNA damage ANTITUMOR
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猫Ⅰ型疱疹病毒DAN疫苗的构建及免疫效果的评估
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作者 李立鹏 林委卫 +5 位作者 冯可昕 陈梦茹 康洪涛 姜骞 刘家森 赵鹏 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第7期751-756,共6页
猫Ⅰ型疱疹病毒(FHV-1)表面糖蛋白gB、gD是病毒感染侵入和复制过程所必须的糖蛋白,均具有免疫原性。为评价FHV-1 gB和gD基因DNA疫苗的免疫效果,本研究设计并优化基因编码序列后合成FHV-1 gB和gD基因,分别连接至pVAX1载体构建真核表达载... 猫Ⅰ型疱疹病毒(FHV-1)表面糖蛋白gB、gD是病毒感染侵入和复制过程所必须的糖蛋白,均具有免疫原性。为评价FHV-1 gB和gD基因DNA疫苗的免疫效果,本研究设计并优化基因编码序列后合成FHV-1 gB和gD基因,分别连接至pVAX1载体构建真核表达载体pVAX1-gB、pVAX1-gD,经PCR和测序鉴定结果显示二者插入位置及基因序列均与预期一致。将重组质粒pVAX1-gB、pVAX1-gD分别转染猫肾细胞(CRFK),经间接免疫荧光试验(IFA)检测gB和gD蛋白在细胞中是否表达。结果显示gB、gD蛋白在细胞中均获得了表达。分别取重组质粒pVAX1-gB、pVAX1-gD各50μg,经肌肉注射6周龄~7周龄雌性BALB/c小鼠,4次免疫后采用IFA检测小鼠抗体水平,结果显示小鼠体内产生的抗体效价在1:64~1:256。将50μg pVAX1-gB和50μg pVAX1-gD重组质粒混合后,分别经肌肉注射45日龄~90日龄中华田园猫,二免后不同时间采血分离血清,经固定病毒稀释血清法检测猫血清的中和抗体效价,结果显示其中和抗体效价达1:141左右。二免后21 d的猫经FHV-1(10^(6)TCID50/mL)滴鼻攻毒(0.5 mL/只),结果显示,对照组猫全部发病,免疫组猫仅产生轻微临床症状,表明本实验制备的含FHV-1 gD和gB重组质粒的混合物免疫后可诱导猫产生良好的免疫保护效果。本实验首次证实FHV-1 gB基因和gD基因的DNA疫苗具有良好的免疫原性,为FHV-1 DNA疫苗的研究提供了实验依据。 展开更多
关键词 猫Ⅰ型疱疹病毒 gB蛋白 gD蛋白 DNA疫苗 免疫原性
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大头金蝇的形态及分子鉴定方法
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作者 杜青青 付凤洋 +1 位作者 贾丰繁 陈斌 《西南大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第9期89-99,共11页
鉴于大头金蝇(Chrysomya megacephala)及其幼虫在法医昆虫学领域的关键应用价值,构建该物种各发育阶段的形态学及分子生物学鉴定体系具有重要意义。通过采集样本、实验室人工繁殖、持续观察记录,并结合DNA条形码技术进行物种鉴定。利用... 鉴于大头金蝇(Chrysomya megacephala)及其幼虫在法医昆虫学领域的关键应用价值,构建该物种各发育阶段的形态学及分子生物学鉴定体系具有重要意义。通过采集样本、实验室人工繁殖、持续观察记录,并结合DNA条形码技术进行物种鉴定。利用显微成像技术详细记录卵、幼虫、蛹、成虫各阶段的形态学特征并完成形态鉴定。从单头雌性成虫个体中提取全基因组DNA,采用蝇类特异性引物扩增线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因以及16S核糖体脱氧核糖核酸(ribosomal deoxyribonucleic acid,rDNA)基因片段进行测序,将所得序列提交至NCBI数据库进行BLAST同源比对,筛选高匹配度序列构建系统发育树并计算遗传距离,完成分子层面的物种鉴定。经形态学特征与分子生物学特征的综合鉴定分析,确认目标物种为大头金蝇(Chrysomya megacephala)。结果表明:COI和16S rDNA基因序列均能有效区分该物种与其他近缘蝇类,具备显著的种属鉴别能力。 展开更多
关键词 大头金蝇 细胞色素c氧化酶亚基I 16S核糖体脱氧核糖核酸 形态鉴定 分子鉴定
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^(125)I的俄歇电子和氚的β射线细胞S值及DNA损伤模拟研究
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作者 沈江燕 朱坤 +3 位作者 李清 张德颂 李君利 闫聪冲 《原子能科学技术》 北大核心 2025年第2期478-486,共9页
氚的辐射生物效应一直是研究热点,特别是在福岛核电站排放核废水后成为公众关注的焦点。氚极易进入人体并参与机体代谢活动,衰变放出的β射线对人体具有极大的危害,而靶向放射治疗则利用摄入的俄歇电子发射体能够进入癌细胞,并放出俄歇... 氚的辐射生物效应一直是研究热点,特别是在福岛核电站排放核废水后成为公众关注的焦点。氚极易进入人体并参与机体代谢活动,衰变放出的β射线对人体具有极大的危害,而靶向放射治疗则利用摄入的俄歇电子发射体能够进入癌细胞,并放出俄歇电子造成DNA严重损伤这一特性,达到有效杀死癌细胞的目的。为探究β射线在微纳米尺度的辐射生物效应,本研究利用清华大学研发的纳剂量学程序NASIC模拟计算了^(125)I和氚在不同尺度细胞内的细胞S值以及造成的DNA双链断裂(DSB)产额,深入探讨了其DNA损伤机制。结果表明,由于研究方法和粒子截面的不同,细胞S值的计算结果存在偏差,尤其对于S(N←Cy),相对偏差可达26.35%。此外,相较于^(125)I或氚均匀分布在细胞核内,与DNA结合时造成的DSB产额显著增加:^(125)I结合到DNA时的DSB产额是均匀分布时的2倍;而氚结合到DNA中使得DSB产额从1.31×10^(-11)Gy^(-1)·Da^(-1)增加至1.46×10^(-11)Gy^(-1)·Da^(-1)。本研究深入探究了微纳米尺度下放射性核素的损伤作用效应,为精确医疗和环境放射性污染风险评估提供重要的理论基础。 展开更多
关键词 放射性核素 ^(125)I 俄歇电子 氚β射线 细胞S值 DNA损伤 蒙特卡罗方法
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i-Motif DNA在纳米生物技术与疾病诊疗方面的应用
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作者 高安琪 罗腾硕 程明攀 《广东化工》 2025年第3期69-72,共4页
DNA除了具有典型的右手双螺旋结构外,还具有多种多样的二级结构。i-Motif DNA是富含胞嘧啶碱基(C)的序列,以半质子化的C·C^(+)碱基对为基础形成的特殊二级结构。其广泛存在于染色体端粒末端和基因启动子区域,并与多种癌症的发生相... DNA除了具有典型的右手双螺旋结构外,还具有多种多样的二级结构。i-Motif DNA是富含胞嘧啶碱基(C)的序列,以半质子化的C·C^(+)碱基对为基础形成的特殊二级结构。其广泛存在于染色体端粒末端和基因启动子区域,并与多种癌症的发生相关,成为新型的癌症治疗靶点。此外,因i-motif结构具有独特的pH敏感性,可作为功能核酸的基本结构单元,在纳米生物技术与疾病诊疗方面具有重要应用。本文首先就i-motif的结构性质和稳定性,以及小分子配体进行总结,随后就i-motif在生物传感以及药物释放方面应用进行阐述。 展开更多
关键词 i-Motif DNA 癌症治疗 生物分析 药物释放
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基于底栖动物完整性指数的京津冀河流水生态健康评价 被引量:1
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作者 孙梓橦 黄适尔 +2 位作者 唐清文 曹晓峰 李艳红 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第4期208-217,共10页
为评估京津冀地区河流水生态健康状况,采用环境DNA宏条形码技术于2020年9、10、12月对该地区主要河流开展底栖动物监测,并构建底栖动物完整性指数(B-IBI)对水生态健康状况开展综合评价。研究区域涵盖滦河、潮白河、永定河、大清河、子... 为评估京津冀地区河流水生态健康状况,采用环境DNA宏条形码技术于2020年9、10、12月对该地区主要河流开展底栖动物监测,并构建底栖动物完整性指数(B-IBI)对水生态健康状况开展综合评价。研究区域涵盖滦河、潮白河、永定河、大清河、子牙河五大流域,共设置36个监测点位。通过环境DNA技术,监测到京津冀地区河流底栖动物隶属于3门6纲14目30科53属,主要门类为节肢动物、软体动物和环节动物,其中以节肢动物门的昆虫纲检出最多。通过箱线图比较和相关性分析,筛选出总分类单元数、双翅目分类单元数与前二优势分类单元相对丰度总和作为核心指标,形成底栖动物生物完整性(B-IBI)评价指标体系。评价结果显示,京津冀地区河流有11.1%的点位处于健康状态,主要分布在西部和北部山区;58.3%的点位处于较差和差状态,主要分布在东部与南部平原。筛选的3个核心指标可较好地对参照点及受损点进行区分,在京津冀地区有较好的适用性。IBI指数与水体中氨氮浓度呈显著负相关,表明氨氮是影响底栖动物完整性的关键环境因子。研究结果可为京津冀地区河流水环境治理与生态修复提供参考。 展开更多
关键词 环境DNA宏条形码技术 生物完整性指数 底栖动物 水生态健康评价 京津冀地区
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双咪唑硝基衍生物银(Ⅰ)配合物的合成及抗厌氧菌活性
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作者 杨莉宁 范涛 +4 位作者 姜箴一 姚琳 胡娅琪 王荣 余丽丽 《贵州师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第6期35-43,66,共10页
以柔性双咪唑硝基衍生物1,3-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)]丙烷(L1)和1,4-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)丁烷(L2)分别与硝酸银发生反应,得到配合物{[Ag(L1)NO_(3)]·H_(2)O}_n(1)和[Ag(L2)_(2)NO_(3)]·2H_(2)O(2)。采用元素分析、摩... 以柔性双咪唑硝基衍生物1,3-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)]丙烷(L1)和1,4-二[1-(2-甲基-4-硝基咪唑)丁烷(L2)分别与硝酸银发生反应,得到配合物{[Ag(L1)NO_(3)]·H_(2)O}_n(1)和[Ag(L2)_(2)NO_(3)]·2H_(2)O(2)。采用元素分析、摩尔电导率、紫外光谱、红外光谱、固体荧光光谱、电喷雾质谱及热重分析等方法对配合物(1)、配合物(2)的组成和化学结构进行了表征与确认。通过光谱法研究了配合物与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用,并测试了配合物对ct-DNA黏度的影响。结果表明配合物(1)、配合物(2)分别以插入、部分插入模式与DNA作用。抗厌氧菌活性实验发现,配合物(1)对厌氧菌变形链球菌(Streptococcus mutans,UA 159)和伴放线放线杆菌(Aggregatibacter actinomycetemcomitans,ATCC 29523)的抗菌活性较强,最小抑菌浓度MIC为20~40μg/mL,推测银(Ⅰ)配合物的抗菌机理有可能部分靶向细菌的DNA。固体荧光光谱实验表明配合物(1)的荧光发射光谱强度远远高于其有机配体,几乎达到其有机配体发射强度的20倍,在光致发光领域具有潜在的应用前景。 展开更多
关键词 双咪唑硝基衍生物 银(Ⅰ)配合物 与DNA相互作用 抗厌氧菌活性 荧光性质
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基于巢式PCR的紫草鉴别引物筛选 被引量:1
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作者 刘杰 谷海媛 +4 位作者 戴胜云 乔菲 连超杰 郑健 加沙尔·斯哈克 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期756-765,共10页
目的:基于巢式聚合酶链式反应(PCR)理念设计并筛选出可用于高效扩增与鉴别紫草市场样品真伪的特异性引物。方法:针对新疆紫草的ITS序列和紫草非《中华人民共和国药典》品ITS2序列,利用Primer Premier 5软件进行巢式引物设计;比较ITS2通... 目的:基于巢式聚合酶链式反应(PCR)理念设计并筛选出可用于高效扩增与鉴别紫草市场样品真伪的特异性引物。方法:针对新疆紫草的ITS序列和紫草非《中华人民共和国药典》品ITS2序列,利用Primer Premier 5软件进行巢式引物设计;比较ITS2通用引物PCR和巢式PCR对紫草药材基因组DNA的扩增效率;基于巢式引物直接扩增紫草基因组DNA,并进行琼脂糖凝胶电泳检测;基于扩增产物片段长度、变异位点覆盖情况对设计的紫草药材特异性引物进行评价。结果:经过Primer Premier 5软件进行引物设计共选出11对引物进行合成;巢式PCR对紫草药材基因组DNA的扩增效率明显优于ITS2通用引物PCR;基于巢式引物直接扩增紫草基因组DNA琼脂糖凝胶电泳检测的结果明显优于ITS2引物直接扩增紫草基因组DNA,且呈单一条带;确定AE-9S/AE-2A、AE-4S/AE-10A、AE-12S/10A、AE-29S/AE-29A共4对引物适用于紫草正伪品鉴定。结论:在DNA条形码鉴定和巢式PCR技术的基础上,确定了4对可以用于有效区分药材市场中主流的新疆紫草和紫草非《中华人民共和国药典》品的特异性引物,为后续紫草药材及其他中药民族药品种的鉴定方法研究与开发提供了可参考的依据。 展开更多
关键词 紫草 聚合酶链式反应(PCR) 内部转录间隔区2(ITS2) DNA条形码 巢式PCR(nPCR)
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基于COⅠ基因构建西北太平洋常见鱼类DNA条形码参考数据库 被引量:3
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作者 徐颖琪 梁绪虹 +3 位作者 陈新军 宋成辉 彭祖焜 王丛丛 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期823-835,共13页
西北太平洋以其独特的地理位置和复杂的海洋环境,孕育了极为丰富的渔业资源,成为全球海洋生物多样性保护和渔业资源管理的热点区域。为了更有效地进行鱼类种类识别和多样性的调查,本研究建立了西北太平洋常见鱼类DNA条形码本地数据库。... 西北太平洋以其独特的地理位置和复杂的海洋环境,孕育了极为丰富的渔业资源,成为全球海洋生物多样性保护和渔业资源管理的热点区域。为了更有效地进行鱼类种类识别和多样性的调查,本研究建立了西北太平洋常见鱼类DNA条形码本地数据库。基于线粒体COⅠ基因,对2023年6—8月在西北太平洋海域所采集的307份样品进行扩增和测序,共获得7目13科20属25种鱼类的COⅠ基因序列。77.96%的COⅠ序列在公共数据库中都能比对到高相似度序列。种间平均遗传距离为0.233,种内平均遗传距离为0.003,种间遗传距离是种内遗传距离的77.67倍,且能够形成明显的条形码间隙,不存在物种区分困难的现象。基于COⅠ基因序列构建的系统发育树显示,同一属的鱼类首先聚为一支,随后与同一科的鱼类聚为一支,最后,同目不同科的鱼类聚为一支。综上所述,COⅠ基因具有物种特异性,能够有效地区分西北太平洋常见鱼类物种,本数据库的初步建立,有利于后期利用环境DNA技术进行西北太平洋鱼类多样性的监测和调查,为西北太平洋海域生物多样性保护、资源管理和种群动态监测提供了技术支持。 展开更多
关键词 鱼类 COⅠ基因 DNA条形码数据库 西北太平洋
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基于DNA条形码的河南省部分地区常见白蛉种群遗传多态性分析 被引量:3
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作者 王丹 贺志权 +6 位作者 杨成运 鲁德岭 孙毅莹 寇元静 钱丹 张红卫 刘颖 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期352-360,392,共10页
目的应用以细胞色素C氧化酶亚基(I cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因为分子标记的DNA条形码技术鉴定河南省常见白蛉蛉种,分析其种群遗传多态性,为该省内脏利什曼病防控提供科学依据。方法2021—2023年,在河南省有内脏利什曼病... 目的应用以细胞色素C氧化酶亚基(I cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因为分子标记的DNA条形码技术鉴定河南省常见白蛉蛉种,分析其种群遗传多态性,为该省内脏利什曼病防控提供科学依据。方法2021—2023年,在河南省有内脏利什曼病病例报告的安阳片区,郑州、洛阳、许昌(郑洛许)片区和无病例报告的焦作、新乡(焦新)片区的13个白蛉监测点采集白蛉样本,提取单只白蛉基因组DNA并扩增其COI基因。对扩增产物进行双向测序,拼接序列经BLAST比对鉴定蛉种。采用Mega 11软件计算不同片区白蛉种内与种间遗传距离,并构建系统发育树。采用DnaSP软件计算白蛉COI基因核苷酸序列多态性,采用Arlequin软件计算不同地理种群间的遗传分化指数(F_(ST)),采用基因流值(Nm)衡量群体中基因流动,采用STRUCTURE软件对中华白蛉不同地理种群进行群体遗传结构分析。结果2021—2023年,自河南省郑洛许片区、焦新片区以及安阳片区13个白蛉监测点累计采集978只白蛉,随机选择其中475只进行检测。基于COI基因的分子生物学检测鉴定出中华白蛉304只、鳞喙司蛉162只、贝氏司蛉9只,其中贝氏司蛉为河南省首次发现。各蛉种种内遗传距离为0.000~0.040,种间遗传距离为0.133~0.161。系统发育树分析显示,3种蛉种各自形成一个进化支。各片区中华白蛉种群遗传多态性水平存在较大差异,其中郑洛许片区单倍型多样性(0.966±0.007)和核酸多样性(0.011)均最高,安阳片区单倍型多样性(0.720±0.091)和核酸多样性(0.004)均最低。安阳片区、焦新片区中华白蛉种群优势单倍型均为Pch_Hap_2,2个片区种群间存在中度遗传分化(0.05<FST<0.15)和较频繁的基因交流(Nm值>1)。种群遗传结构分析显示,安阳片区、焦新片区中华白蛉种群优势组分均为K5。郑洛许片区中华白蛉种群无明显优势单倍型,与另2个片区中华白蛉种群之间均存在极高遗传分化(FST>0.25)和极少基因交流(Nm值<1),其种群优势组分为K3。3个片区鳞喙司蛉种群遗传多态性水平差异不大。结论河南省存在中华白蛉、鳞喙司蛉、贝氏司蛉3种白蛉,其中贝氏司蛉为该省首次通过分子生物学方法鉴定发现。省内不同片区中华白蛉种群存在不同程度的遗传分化和基因交流。 展开更多
关键词 白蛉 中华白蛉 鳞喙司蛉 贝氏司蛉 内脏利什曼病 细胞色素C氧化酶亚基I DNA条形码 遗传多态性 河南省
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3例Ⅰ型神经纤维瘤病NF1基因突变分析
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作者 林艳艳 董姝言 +2 位作者 王怀玉 林立航 肖学敏 《皮肤性病诊疗学杂志》 2024年第12期818-824,共7页
目的对3例Ⅰ型神经纤维瘤病(NF1)患儿进行致病基因突变检测,探索NF1的致病基因变异及表型。方法应用遗传性皮肤病目标基因外显子测序对3例先证者进行测序。患儿检测出可疑突变类型后,应用高通量测序及Sanger测序技术对患儿及其父母进行... 目的对3例Ⅰ型神经纤维瘤病(NF1)患儿进行致病基因突变检测,探索NF1的致病基因变异及表型。方法应用遗传性皮肤病目标基因外显子测序对3例先证者进行测序。患儿检测出可疑突变类型后,应用高通量测序及Sanger测序技术对患儿及其父母进行突变位点验证。结果3例患儿中男2例、女1例,均因出生后多发牛奶咖啡斑就诊,均出现腋窝或腹股沟雀斑,其中1例伴发神经纤维瘤,均确诊为NF1。3例均检测到1个NF1基因变异位点,分别为:c.3921delT、c.5206-2A>C、c.893T>G。c.3921delT和c.893T>G未见文献报道,为新发突变。1例患儿的NF1变异遗传自父亲,其余患儿的变异为自发变异。结论本研究发现2个NF1基因的新发突变,扩充了NF1基因突变致病位点。 展开更多
关键词 Ⅰ型神经纤维瘤病 DNA突变分析 NF1基因
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基于荧光共轭聚合物和氧化石墨烯的核酸外切酶I检测
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作者 程昆淇 高梦莹 +4 位作者 邢佳贝 赵一帆 卢宏飞 刘学国 邢小静 《分析试验室》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第4期541-546,共6页
核酸外切酶I(Exo I)作为一种重要的核酶参与了许多生物学过程,具有维持遗传信息稳定性的功能,因此建立有效检测Exo I活性的方法具有重要的研究价值。基于聚芴类荧光共轭聚合物-poly[(9,9-bis(6′-N,N,N-trimethyl-ammonium)hexyl)-fluor... 核酸外切酶I(Exo I)作为一种重要的核酶参与了许多生物学过程,具有维持遗传信息稳定性的功能,因此建立有效检测Exo I活性的方法具有重要的研究价值。基于聚芴类荧光共轭聚合物-poly[(9,9-bis(6′-N,N,N-trimethyl-ammonium)hexyl)-fluorenylene phenylene dibromide](PFP)不能与吸附在氧化石墨烯(GO)表面的单链DNA结合的实验发现,借助GO对单链DNA和双链DNA作用力强度大小的差异,构建了一个背景信号低、灵敏度高的Exo I检测新方法。GO和PFP的最适浓度分别为2.5和7.2 mg/L。在最佳条件下,Exo I浓度在0.5~4.0 U/mL范围内与体系的荧光强度呈良好的线性关系,线性方程为F=-0.11c+0.861,检出限为0.16 U/mL。该方法可用于血清模拟样品中Exo I活性的检测,加标回收率为103.6%~106.0%。 展开更多
关键词 荧光共轭聚合物 氧化石墨烯 DNA 低背景 核酸外切酶I
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基于eDNA技术的舟山近海中国团扇鳐定性与定量分析 被引量:1
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作者 高天翔 张浩博 +1 位作者 王晓艳 陈治 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期116-125,共10页
为探讨环境DNA (environmental DNA, eDNA)技术用于中国团扇鳐监测方面的可行性,同时开展基于eDNA技术的舟山近海中国团扇鳐定性与定量分析。本实验将中国团扇鳐与其同属汤氏团扇鳐COI基因片段序列进行比较分析,使用Primer Express 3.0... 为探讨环境DNA (environmental DNA, eDNA)技术用于中国团扇鳐监测方面的可行性,同时开展基于eDNA技术的舟山近海中国团扇鳐定性与定量分析。本实验将中国团扇鳐与其同属汤氏团扇鳐COI基因片段序列进行比较分析,使用Primer Express 3.0软件设计中国团扇鳐特异性引物与Taq Man探针。在舟山朱家尖近海设计了A、B、C共3个定置网调查站位,定期收集中国团扇鳐样品。于2017年12月19日、2018年4月13日和2018年7月14日分别采集水样(站位A、B1、B2、C1、C2、D),开展eDNA微滴式数字PCR(droplet digital PCR, ddPCR)检测,并将检测结果与水温和采样点进行差异显著性分析。结果显示,不同站位、不同时间的中国团扇鳐eDNA浓度不同,水样采集点对中国团扇鳐eDNA浓度的影响极显著,不同采样点eDNA在不同季节存在极显著差异。研究表明,eDNA检测技术灵敏度高,水温、底质和水深对中国团扇鳐的分布皆有影响。研究结果为其他海域的中国团扇鳐e DNA追踪监测奠定了基础。 展开更多
关键词 中国团扇鳐 环境DNA EDNA 细胞色素c氧化酶亚基I(COI)基因 TAQMAN 微滴式数字PCR
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新型喜树碱类抗癌药物的研究进展 被引量:9
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作者 刘丹 张龙 +3 位作者 达飞 尚沛津 张娟 姚琳 《现代生物医学进展》 CAS 2016年第5期990-992,共3页
喜树碱是1966年由喜树中分离而来的一种五环结构的生物碱,早期对其抗肿瘤活性的发现更是引发了科学家们对此类化合物极大的研究兴趣,现在已经证实喜树碱类化合物主要是通过抑制在DNA代谢过程中发挥重要作用的I型拓扑异构酶。但其自身因... 喜树碱是1966年由喜树中分离而来的一种五环结构的生物碱,早期对其抗肿瘤活性的发现更是引发了科学家们对此类化合物极大的研究兴趣,现在已经证实喜树碱类化合物主要是通过抑制在DNA代谢过程中发挥重要作用的I型拓扑异构酶。但其自身因水溶性差、毒副作用强,在临床应用上易出现不良反应。半个世纪以来,国内外研究者在对其作用机制及构效关系的研究基础上,开发出了数以百计的喜树碱类衍生物,很多已经进入临床或临床前研究。但目前仅有两种喜树碱类的化合物拓扑替康和依立替康被美国FDA批准应用于临床上肿瘤的治疗。本文就已上市的喜树碱类化合物以及喜树碱类抗肿瘤药物开发的挑战进行了综述。 展开更多
关键词 喜树碱 TOPO i-dna复合物 化学稳定性
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DNA条形码识别 Ⅲ.媒介蚊类DNA条形码芯片的初步研究 被引量:26
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作者 赵明 谭玲 +3 位作者 莫帮辉 刘伟 王仕应 曾晓茂 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期99-103,共5页
目的利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的医学媒介蚊类鉴定方法。方法以蚊科5属15种,共30个样本为研究材料,获取其DNA条形码信息(COⅠ基因片段序列),采用基因块motif技术,搜索15个样本的同源保守基因序列,制作虚拟DNA条形码芯... 目的利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的医学媒介蚊类鉴定方法。方法以蚊科5属15种,共30个样本为研究材料,获取其DNA条形码信息(COⅠ基因片段序列),采用基因块motif技术,搜索15个样本的同源保守基因序列,制作虚拟DNA条形码芯片。虚拟电子杂交30个样本,应用软件Bio-Edit计算属、种及种内个体间的同一性,应用phylip3.66软件以最大简约法分别对杂交结果和原序列进行聚类分析比较。结果选择78个DNA片段制作一张虚拟DNA条形码芯片,计算属间的平均同一性为0.75,同一属内种间的平均同一性为0.84,种内个体间的平均同一性为0.98,聚类分析结果一致。结论研制的虚拟DNA芯片能够鉴定本研究中的15种蚊虫,利用DNA条形码信息,设计DNA芯片在理论上可行。 展开更多
关键词 CO I基因 DNA条形码 DNA芯片 蚊虫
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基于COI序列快速鉴定花蓟马的DNA条形码芯片初探 被引量:13
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作者 冯毅 王莉 +2 位作者 白云峰 王洁 冯纪年 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期169-173,共5页
利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的花蓟马鉴定方法。以3种花蓟马属,共9个样本的COI基因片段序列为研究材料,应用软件Primer Premier5搜索出9个样本的12种motif基因序列,应用这12种motif序列制作虚拟DNA条形码芯片。虚拟电子... 利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的花蓟马鉴定方法。以3种花蓟马属,共9个样本的COI基因片段序列为研究材料,应用软件Primer Premier5搜索出9个样本的12种motif基因序列,应用这12种motif序列制作虚拟DNA条形码芯片。虚拟电子杂交20个样本的COI基因片段序列。结果显示,设计的虚拟DNA芯片能够鉴定本研究中的3种花蓟马,利用DNACOI基因片段,设计DNA芯片在理论上可行。 展开更多
关键词 COI基因 DNA务形码 DNA芯片 花蓟马
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基于SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR建立生乳及乳制品沙门氏菌快速检测技术 被引量:11
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作者 张巧艳 陈亭亭 +2 位作者 陈笑芸 杨胜利 缪青梅 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第5期914-921,共8页
生乳易受沙门氏菌污染,并大量繁殖;经加工的乳制品细菌数大大减少,但仍存在沙门氏菌污染的风险。试验按生乳及乳制品沙门氏菌污染水平研究样品前处理方法,采用煮沸裂解法快速提取总DNA,针对沙门氏菌invA基因建立SYBR Green Ⅰ荧光定量PC... 生乳易受沙门氏菌污染,并大量繁殖;经加工的乳制品细菌数大大减少,但仍存在沙门氏菌污染的风险。试验按生乳及乳制品沙门氏菌污染水平研究样品前处理方法,采用煮沸裂解法快速提取总DNA,针对沙门氏菌invA基因建立SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR快速检测技术。建立的方法具有良好的特异性和较高的灵敏度,其中生乳沙门氏菌检出限为102cfu.mL-1,方法的检测线性范围为102~108cfu.mL-1,相关系数(R2)为0.999,扩增效率为103%;乳制品沙门氏菌经16 h增菌后检出限达到1 cfu.[25 g(mL)]-1。该技术可用于生乳中沙门氏菌的高效筛查及定量检测,检测一个样品仅需3 h;同时,可用于乳制品的准确定性检测,检测周期为1 d;且方法重复性好、准确度高、操作简单,为乳制品企业快速检测沙门氏菌提供了有效的技术手段。 展开更多
关键词 沙门氏菌 荧光定量PCR SYBR Green DNA提取 生乳 乳制品
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基于线粒体CO1基因的DNA条形码在石首鱼科(Sciaenidae)鱼类系统分类中的应用 被引量:76
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作者 柳淑芳 陈亮亮 +1 位作者 戴芳群 庄志猛 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期223-232,共10页
采用CO1基因特异扩增测序及与GenBank已有序列联配分析的方法,进行了石首鱼科19属30种鱼类75个CO1基因片段的序列比较和系统进化研究,结果表明,石首鱼科鱼类该片段的平均GC含量为48.3%,其中第2密码子位点含量最高(51%-58.4%,平均56.6%),... 采用CO1基因特异扩增测序及与GenBank已有序列联配分析的方法,进行了石首鱼科19属30种鱼类75个CO1基因片段的序列比较和系统进化研究,结果表明,石首鱼科鱼类该片段的平均GC含量为48.3%,其中第2密码子位点含量最高(51%-58.4%,平均56.6%),第1密码子变化范围最大(27.6%-54.1%,平均44.9%),第3密码子差别较小(41.6%-43.6%,平均42.7%)。依据Kimura-2-parameter模型,30种石首鱼科鱼类种内遗传距离平均值为0.006,种间为0.210,种间遗传距离是种内的35倍;在分子系统树上,28个种(93.3%)可形成单系,18个属(94.7%)可聚为独立的分支;与形态学分类不同的是,由黑鳃梅童鱼(Collichthys lucidus)与棘头梅童鱼(C.niveatus)的遗传距离(0.004)推断二者遗传变异尚未达到种的分化水平,灰鳍彭纳石首鱼(Pennahia anea)与白姑鱼(Argyrosomus argentatus)的形态学特征相似性和条形码序列同源性都提示二者可能为同种异名,而红牙(Otolithes ruber)印度洋和南海两个地理群体间的遗传分化已经达到种的水平。本研究证明线粒体CO1基因可作为DNA条形码对石首鱼科鱼类进行有效的物种鉴定,亦可用于探讨石首鱼科的属、种分类单元系统发育问题。 展开更多
关键词 石首鱼科 CO1基因 DNA条形码 分子系统分类
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基于COⅠ的中国西施舌DNA条形码 被引量:8
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作者 孟学平 高如承 +4 位作者 申欣 郑雯雯 赵娜娜 程汉良 田美 《水产科学》 CAS 北大核心 2011年第10期626-630,共5页
以我国大连(DL)、日照(RZ)、启东(QD)、长乐(CL)、漳州(ZZ)和北海(BH)6个野生群体西施舌为研究对象,用引物LCO1490和HCO2198扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段序列,PCR产物双向测序,用ClustalX进行DNA序列比对,用MEGA4.1和... 以我国大连(DL)、日照(RZ)、启东(QD)、长乐(CL)、漳州(ZZ)和北海(BH)6个野生群体西施舌为研究对象,用引物LCO1490和HCO2198扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段序列,PCR产物双向测序,用ClustalX进行DNA序列比对,用MEGA4.1和PhyML软件构建NJ树和ML树,用Arlequin3.11软件进行分子方差分析,研究COⅠ这一特定基因区段作为DNA条形码在识别西施舌地理群体的可行性和有效性。结果获得658bp的COⅠ核苷酸片段,其T、C、A、G含量分别为42.4%、14.8%、21.8%、21.0%,A+T(64.2%)含量明显高于G+C含量。变异位点占15.3%(101/658),其中简约信息位点占14.1%。群体内遗传距离为0.0020~0.0043,群体间遗传距离为0.0024~0.0883。群体间氨基酸序列无变异。长乐、漳州群体(DH组)与其他群体(HB组)间有显著的遗传分化(FST=0.956~0.970)。NJ树和ML树显示长乐、漳州群体聚为一支,北方的大连、日照、启东群体和南方的北海群体聚为置信度较高的另一支(BPN=99),2支间的遗传距离为0.0837,是2支内群体间遗传距离的17.8~23.5倍。本研究结果表明,COⅠ基因片段序列作为鉴定福建西施舌条形码是可行的,但不能将其余群体区别开来。 展开更多
关键词 西施舌 线粒体 COⅠ DNA条形码
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DNA条形码识别Ⅰ.DNA条形码研究进展及应用前景 被引量:63
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作者 莫帮辉 屈莉 +3 位作者 韩松 何建伟 赵明 曾晓茂 《四川动物》 CSCD 北大核心 2008年第2期303-306,共4页
DNA条形码(DNA Barcoding)是近年来生物分类学中引人注目的发展热点。本文综述了DNA条形码的发展历史、识别原理以及公共数据库,并讨论了DNA条形码在检疫检验领域的应用前景。DNA条形码与DNA芯片技术的结合,将推动传统物种鉴定方法的更... DNA条形码(DNA Barcoding)是近年来生物分类学中引人注目的发展热点。本文综述了DNA条形码的发展历史、识别原理以及公共数据库,并讨论了DNA条形码在检疫检验领域的应用前景。DNA条形码与DNA芯片技术的结合,将推动传统物种鉴定方法的更新,可在检疫检验领域中实现非专家检定,这对进出口口岸生物监测具有重要的理论意义和应用价值。 展开更多
关键词 细胞色素C氧化酶亚单位I(CO I) DNA条形码 DNA芯片
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