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青稞NBS-LRR类基因HvtRGA的克隆与条纹病胁迫表达分析
被引量:
9
1
作者
杨雪
姚晓华
+3 位作者
安立昆
姚有华
白羿雄
吴昆仑
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期1655-1662,共8页
为探索青稞(Hordeum vulgare L.var.nudum)NBS-LRR类基因在青稞抗条纹病中的分子作用机制,该研究以抗条纹病青稞品种‘昆仑14号’和感病品种‘Z1141’为材料,从叶片中克隆了HvtRGA基因。HvtRGA基因长3544 bp,包含一个3306 bp开放阅读框...
为探索青稞(Hordeum vulgare L.var.nudum)NBS-LRR类基因在青稞抗条纹病中的分子作用机制,该研究以抗条纹病青稞品种‘昆仑14号’和感病品种‘Z1141’为材料,从叶片中克隆了HvtRGA基因。HvtRGA基因长3544 bp,包含一个3306 bp开放阅读框,编码1101个氨基酸。序列测序后比对发现,‘昆仑14号’与‘Z1141’的碱基序列相似性为99.89%,‘Z1141’的碱基在1196和1945位置处由G替换成A,但氨基酸序列相似性为100%。蛋白质序列分析表明,HvtRGA为亲水性的不稳定酸性蛋白,具有NB-ARC保守结构域和5个LRR结构域,属于NBS-LRR家族。HvtRGA蛋白与大麦的rgaS-9217、rgaS-226编码的NBS-LRR氨基酸序列相似性分别为96.55%和88.72%。进化树分析表明,青稞与小麦族的大麦、硬粒小麦和二穗短柄草NBS-LRR聚为一个分支,且与大麦rgaS-9217编码的蛋白亲缘关系最近,其次是大麦rgaS-226编码的蛋白,而与狗尾草和栗的亲缘关系最远。qRT-PCR结果表明,条纹病胁迫下,抗病品种和感病品种的HvtRGA基因的表达量极显著升高,且抗病品种‘昆仑14号’感病后基因表达量显著高于感病品种‘Z1141’。研究推测,HvtRGA基因在青稞抗条纹病的调控过程中可能发挥着重要作用。
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关键词
青稞
条纹病
NBS-LRR
hvtrga
基因
基因表达
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职称材料
题名
青稞NBS-LRR类基因HvtRGA的克隆与条纹病胁迫表达分析
被引量:
9
1
作者
杨雪
姚晓华
安立昆
姚有华
白羿雄
吴昆仑
机构
青海大学农林科学院
青海省青稞遗传育种重点实验室
国家麦类改良中心青海青稞分中心
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期1655-1662,共8页
基金
国家自然科学基金(31660388,31960427)
青海省科技厅应用基础研究项目(2019-ZJ-7075)
+2 种基金
国家大麦(青稞)产业技术体系(CARS-05)
青海省科技厅重点研发与转化计划项目(2020-NK-119)
国家重点研发计划项目子课题(2019YFD1001701-4)。
文摘
为探索青稞(Hordeum vulgare L.var.nudum)NBS-LRR类基因在青稞抗条纹病中的分子作用机制,该研究以抗条纹病青稞品种‘昆仑14号’和感病品种‘Z1141’为材料,从叶片中克隆了HvtRGA基因。HvtRGA基因长3544 bp,包含一个3306 bp开放阅读框,编码1101个氨基酸。序列测序后比对发现,‘昆仑14号’与‘Z1141’的碱基序列相似性为99.89%,‘Z1141’的碱基在1196和1945位置处由G替换成A,但氨基酸序列相似性为100%。蛋白质序列分析表明,HvtRGA为亲水性的不稳定酸性蛋白,具有NB-ARC保守结构域和5个LRR结构域,属于NBS-LRR家族。HvtRGA蛋白与大麦的rgaS-9217、rgaS-226编码的NBS-LRR氨基酸序列相似性分别为96.55%和88.72%。进化树分析表明,青稞与小麦族的大麦、硬粒小麦和二穗短柄草NBS-LRR聚为一个分支,且与大麦rgaS-9217编码的蛋白亲缘关系最近,其次是大麦rgaS-226编码的蛋白,而与狗尾草和栗的亲缘关系最远。qRT-PCR结果表明,条纹病胁迫下,抗病品种和感病品种的HvtRGA基因的表达量极显著升高,且抗病品种‘昆仑14号’感病后基因表达量显著高于感病品种‘Z1141’。研究推测,HvtRGA基因在青稞抗条纹病的调控过程中可能发挥着重要作用。
关键词
青稞
条纹病
NBS-LRR
hvtrga
基因
基因表达
Keywords
hulless barley
barley leaf stripe
NBS-LRR
hvtrga
expression level
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
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1
青稞NBS-LRR类基因HvtRGA的克隆与条纹病胁迫表达分析
杨雪
姚晓华
安立昆
姚有华
白羿雄
吴昆仑
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
9
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