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题名大麦BAC文库三维混合池的构建与HvGW2筛选
被引量：3
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作者
郭刚刚
董国清
周进
达瓦顿珠
袁兴淼
张京
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机构
中国农业科学院作物科学研究所/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室
武汉工业学院
西藏农牧科学院
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出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期9-17,共9页
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基金
国家“863”计划项目(2012AA101105-4)
国家“十二五”科技支撑计划(2012BAD03B01-2)
国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-05)
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文摘
【目的】从大麦BAC文库中快速筛选包含目的基因HvGW2的阳性BAC克隆。【方法】构建BAC文库三维混合池,设计2对HvGW2特异性引物,进行BAC文库筛选,对含有目的基因HvGW2的阳性BAC克隆进行测序,获得编码大麦GW2蛋白的基因组DNA序列,并与禾本科中的GW2进行同源进化分析。【结果】构建了大麦BAC文库的三维混合池160个,文库空载率为0.18%;筛选到含HvGW2的阳性BAC克隆3个,其中,BAC克隆196M02包含完整编码该基因的序列;HvGW2包含8个外显子和7个内含子,具有与其它植物GW2相似的结构特征和保守的功能结构域;同源进化分析结果显示,大麦与小麦的GW2蛋白同源性最高;序列分析发现,HvGW2第6内含子上包含2个不同类型的反转录转座子插入,从而使大麦比其它作物的GW2长度增加11.5 kb以上。【结论】通过构建三维混合池快速筛选包含目的基因的单个阳性BAC克隆,建立了大麦目标基因克隆的辅助平台;HvGW2基因组中位于内含子区的反转录转座子插入导致基因长度增加,可能是影响该基因转录水平的关键变异。
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关键词
大麦
BAC文库
三维混合池
hvgw2
粒重基因
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Keywords
barley
BAC library
three-dimensional pools
hvgw2
grain weight gene
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分类号
S512.3
[农业科学—作物学]
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