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hsa-miR-421的靶基因预测及生物信息学分析
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作者 蔡林锐 蔡艺煌 +1 位作者 汪芝宇 张慧莲 《吉林医学》 2025年第8期1787-1793,共7页
目的:探讨hsa-miR-421的靶基因预测与相关生物信息学在肿瘤疾病中的生物学功能、信号传导通路及其所发挥的分子调控机制。方法:利用在线数据库分析hsa-miR-421的碱基序列、基因位点及序列保守性,研究其在人体不同疾病中的表达情况,并预... 目的:探讨hsa-miR-421的靶基因预测与相关生物信息学在肿瘤疾病中的生物学功能、信号传导通路及其所发挥的分子调控机制。方法:利用在线数据库分析hsa-miR-421的碱基序列、基因位点及序列保守性,研究其在人体不同疾病中的表达情况,并预测hsa-miR-421的靶向调控基因。随后进行GO功能注释分析、KEGG通路富集分析,并构建蛋白互作(PPI)网络及关键(hub)基因筛选。结果:hsa-miR-421成熟序列在多物种间高度保守。获得的508个靶基因存在于RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的调控、DNA模板转录的调控、蛋白质结合等分子功能,并富集于糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、神经营养因子信号通路、泛素介导的蛋白水解等信号通路。基于hsa-miR-421靶基因集合的PPI网络构建与度中心性(Degree Centrality)值筛选出排名前十位的hub基因(SRSF1、HNRNPA2B1、HNRNPA1、TRAF6、SMAD2、MAPK14、CDC42、MAPK9、PRKACB、NRAS)。结论:hsa-miR-421通过调控靶基因广泛参与到人类生命活动和疾病发生发展等过程。 展开更多
关键词 头颈部鳞状细胞癌 hsa-mir-421 靶基因 MIRNA 生物信息学
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代谢相关脂肪性肝病中hsa-miR-30a-5p调控SLC7A11促进铁死亡
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作者 柯月 梁灿灿 +1 位作者 纪文静 姚萍 《中国肝脏病杂志(电子版)》 2025年第2期42-48,共7页
目的探讨代谢相关脂肪性肝病(metabolic associated fatty liver disease,MAFLD)中微小RNA(microRNA,miRNA)对铁死亡的调控。方法在GSE135251数据集中进行差异表达分析及基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)。在GSE11492... 目的探讨代谢相关脂肪性肝病(metabolic associated fatty liver disease,MAFLD)中微小RNA(microRNA,miRNA)对铁死亡的调控。方法在GSE135251数据集中进行差异表达分析及基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)。在GSE114923数据集中进行差异分析,并识别靶向调控铁死亡相关基因的miRNA。以2022年3月1日至2023年4月30日于新疆医科大学第一附属医院经腹部超声确诊为MAFLD的10例患者作为MAFLD组,以同期性别和年龄匹配的10例健康志愿者作为健康对照组,采集外周血样本。通过反转录定量聚合酶链式反应(reverse transcription quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)和Western blot检测miRNA及铁死亡相关蛋白[溶质载体家族7成员11(solute carrier family 7 member 11,SLC7A11)、谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)、血红素加氧酶1(heme oxygenase 1,HMOX1)]的表达。通过酶联免疫吸附试验检测谷胱甘肽(glutathione,GSH)、丙二醛(malondialdehyde,MDA)和炎症因子[白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factorα,TNF-α)]水平。结果GSE135251和GSE114923数据集分析表明,与健康对照组相比,MAFLD患者中细胞坏死(t=3.229,P=0.022)和铁死亡(t=2.008,P=0.006)通路显著激活,差异分析结果表明MAFLD和对照组间有8687个有差异表达的基因,其中有31个为铁死亡相关基因。在31个差异表达的miRNA中鉴定了7个靶向调控铁死亡的miRNA,hsa-miR-192-5p(4.628±1.234比3.171±0.456;t=2.217,P=0.068)、hsa-miR-122-5p(13.532±0.946比10.536±1.444;t=3.472,P=0.013)、hsa-miR-30a-5p(6.081±0.770比4.106±0.269;t=4.841,P=0.003)、hsa-miR-100-5p(5.888±0.933比3.888±0.721;t=3.395,P=0.015)在MAFLD患者中表达上调,hsa-miR-10b-5p(5.077±0.876比6.439±1.076;t=1.963,P=0.097)、hsa-miR-223-5(0.626±0.723比2.790±1.912;t=2.111,P=0.079)、hsa-miR-215-5p(0.595±0.771比2.738±0.885,t=3.652,P=0.011)表达下调,其中hsa-miR-30a-5p上调水平最显著。RT-qPCR结果表明,与对照组比较,MAFLD患者中hsa-miR-30a-5p表达水平显著升高(1.591±0.229比1.012±0.031;t=9.676,P<0.001),SLC7A11 mRNA(0.598±0.108比0.997±0.034;t=13.64,P<0.001)、GPX4 mRNA(0.724±0.064比1.003±0.029,t=15.34;P<0.001)和HMOX1 mRNA(0.688±0.078比0.993±0.034;t=13.92,P<0.001)表达水平显著降低。Western blot结果显示,与对照组相比,SLC7A11蛋白(0.712±0.074比1.000±0.053;t=10.01,P<0.001)、GPX4蛋白(0.810±0.034比1.000±0.019;t=15.25,P<0.001)和HMOX1蛋白(0.673±0.026比1.000±0.029;t=26.75,P<0.001)在MAFLD患者中表达显著下调。与健康对照组相比,MAFLD患者GSH[(163.684±15.857)U/g比(197.728±11.009)U/g;t=6.109,P<0.001]水平显著降低,MDA[(2.494±0.253)μmol/g比(1.0612±.205)μmol/g;t=7.602,P=0.002]、IL-6[(55.219±0.743)ng/L比(46.456±1.831)ng/L;t=14.48,P<0.001]和TNF-α[(22.883±2.893)μg/L比(13.885±0.169)μg/L;t=10.78,P<0.001]水平显著升高。结论hsa-miR-30a-5p可能通过靶向SLC7A11促进铁死亡,在MAFLD中发挥促炎和促氧化作用。 展开更多
关键词 代谢相关脂肪性肝病 hsa-mir-30a-5p 铁死亡 炎症
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Hsa-miR-146b-3p靶向CREB3L3调控PI3K/Akt通路促进内皮细胞功能障碍及动脉粥样硬化进程 被引量:1
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作者 周世繁 张书铭 +4 位作者 陈宁园 黄玲 宋重阳 潘尚领 彭均华 《广西医科大学学报》 2025年第3期342-350,共9页
目的:研究hsa-miR-146b-3p对内皮细胞的影响及其在动脉粥样硬化中的潜在作用和机制。方法:通过慢病毒构建EA.hy926内皮细胞干预模型,将细胞分为4组,(1)过表达组:OE_hsa-miR-146b-3p组和OE_control组;(2)沉默组:SH_hsa-miR-146b-3p组和SH... 目的:研究hsa-miR-146b-3p对内皮细胞的影响及其在动脉粥样硬化中的潜在作用和机制。方法:通过慢病毒构建EA.hy926内皮细胞干预模型,将细胞分为4组,(1)过表达组:OE_hsa-miR-146b-3p组和OE_control组;(2)沉默组:SH_hsa-miR-146b-3p组和SH_control组。采用CCK-8实验检测细胞的增殖能力,细胞划痕及Transwell实验检测迁移能力,细胞周期和凋亡检测分别探讨细胞的分布特征和凋亡率;通过转录组测序(RNA-seq测序)和双荧光素酶实验验证hsa-miR-146b-3p的下游靶点;通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和蛋白质免疫印迹实验(western blotting)检测靶基因的表达量。结果:与对照组比较,过表达hsa-miR-146b-3p显著促进EA.hy926细胞增殖(P<0.01)、迁移(P<0.0001)及S期细胞比例(P<0.01),并升高晚期凋亡率和总凋亡率(P<0.05);沉默组则呈现增殖抑制(P<0.05)、迁移能力减弱(P<0.0001)并降低S期比例(P<0.05),同时减少早期凋亡率(P<0.05)。RNA-seq测序联合双荧光素酶实验证实hsa-miR-146b-3p调控PI3K/Akt通路上的CREB3L3(P<0.001)。RT-qPCR和western blotting结果显示,hsa-miR-146b-3p过表达导致CREB3L3表达水平下降。结论:Hsa-miR-146b-3p可能通过下调CREB3L3的表达水平及其所在的PI3K/Akt通路影响内皮细胞的功能并促进动脉粥样硬化的发生发展。 展开更多
关键词 hsa-mir-146b-3p 冠心病 转录组测序 PI3K/AKT信号通路
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肿瘤组织miR-421、SLFN11表达与胃癌临床病理特征及预后的相关性
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作者 祝凯 郭振南 +4 位作者 吴婉 聂述敏 张友俊 石良 张万里 《湖北科技学院学报(医学版)》 2025年第4期340-344,共5页
目的探讨肿瘤组织miR-421、SLFN11表达与胃癌临床病理特征及预后的相关性。方法选择某院诊治的93例胃癌患者(胃癌组)及68例胃良性疾病患者(对照组)为研究对象。实时荧光定量聚合酶链式反应检测病理组织miR-421、SLFN11表达并比较其差异... 目的探讨肿瘤组织miR-421、SLFN11表达与胃癌临床病理特征及预后的相关性。方法选择某院诊治的93例胃癌患者(胃癌组)及68例胃良性疾病患者(对照组)为研究对象。实时荧光定量聚合酶链式反应检测病理组织miR-421、SLFN11表达并比较其差异,比较不同临床病理特征中miR-421及SLFN11表达的差异。相关性分析采用Spearman或Pearson相关;miR-421联合SLFN11预测胃癌死亡效能采用ROC分析;胃癌死亡危险因素采用Cox回归分析;K-M生存模型比较miR-421、SLFN11表达与胃癌生存期的差异。结果胃癌组肿瘤组织miR-421显著高于癌旁组织和对照组,SLFN11显著低于癌旁组织和对照组(P<0.05)。胃癌组肿瘤组织miR-421表达与Ki-67、原发肿瘤T分期、转移淋巴结数、远处转移及TNM分期呈正相关(r>0,P<0.05),SLFN11表达与Ki-67、原发肿瘤T分期、转移淋巴结数、远处转移及TNM分期呈负相关(r<0,P<0.05)。肿瘤组织miR-421联合SLFN11预测胃癌患者死亡的敏感度、特异度及AUC显著高于miR-421、SLFN11(P<0.05)。miR-421≥2.31、SLFN11≤0.64为胃癌死亡的独立危险因素(P<0.05)。miR-421≥2.31且SLFN11≤0.64胃癌患者中位生存期显著低于miR-421<2.31或SLFN11>0.64患者(Log Rank=9.608,P=0.002)。结论胃癌肿瘤组织miR-421、SLFN11表达与临床病理特征及死亡风险及生存期密切相关,可为胃癌病情及预后评估提供客观证据,两者联合检测可显著提高在胃癌死亡预测中的临床价值。 展开更多
关键词 胃癌 miR-421 SLFN11 临床病理特征 相关性
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不同热处理工艺对新型Ti421合金组织及性能的影响
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作者 桑卓越 王帅 +8 位作者 尹万兵 朱春明 白张 王鹏 罗金山 张永伟 方略 李晓燚 周志明 《精密成形工程》 北大核心 2025年第9期70-78,共9页
目的实现新型Ti421合金的良好强塑匹配效果。方法研究水冷、空冷及炉冷等不同固溶冷却方式及不同时效温度热处理工艺对合金组织及性能的影响。结果在相同的时效处理工艺条件下,固溶冷却速率的降低会导致在合金组织中等轴初生α相(α_(p)... 目的实现新型Ti421合金的良好强塑匹配效果。方法研究水冷、空冷及炉冷等不同固溶冷却方式及不同时效温度热处理工艺对合金组织及性能的影响。结果在相同的时效处理工艺条件下,固溶冷却速率的降低会导致在合金组织中等轴初生α相(α_(p))含量显著提高的同时尺寸略微增加。同时α_(p)的存在也会抑制时效处理过程中次生α相(α_(s))的生长。结合静态拉伸测试结果发现,含量较多的α_(p)对合金的塑性较有利。在经过900℃固溶炉冷后500℃时效处理的合金试样组织中,α_(p)的体积分数达到了最大值72.8%,此时合金具有最好的塑性(14.2%)。此外,在固溶工艺固定的条件下,时效处理制度的改变基本不影响α_(p)含量及尺寸的变化,但随着时效温度的升高,β_(t)上α_(s)含量增加且尺寸增大,导致合金强度呈现出先升高后降低的趋势。经过900℃固溶水冷+550℃时效处理后的合金实现了抗拉强度(UTS)为1484MPa、延伸率(EL)为11.2%的良好强塑匹配效果。 展开更多
关键词 新型Ti421合金 微观组织 固溶时效处理 静态拉伸性能
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金龟子绿僵菌CQMa421对二化螟幼虫的毒力与生长发育影响
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作者 邓璇璇 何勇 +4 位作者 袁伏才 方宝华 匡炜 张亚 刘双清 《湖南农业科学》 2025年第7期56-60,共5页
为明确金龟子绿僵菌CQMa421制剂对二化螟(Chilo suppressalis)幼虫的致死效应及生长发育的影响,评估该药剂在生物防治中的应用潜力,本研究采用浸虫-饲料混药综合法测定了金龟子绿僵菌CQMa421对二化螟1~5龄幼虫的室内毒力,并以对应LC_(50... 为明确金龟子绿僵菌CQMa421制剂对二化螟(Chilo suppressalis)幼虫的致死效应及生长发育的影响,评估该药剂在生物防治中的应用潜力,本研究采用浸虫-饲料混药综合法测定了金龟子绿僵菌CQMa421对二化螟1~5龄幼虫的室内毒力,并以对应LC_(50)处理评估其对3龄幼虫生长发育的影响。结果表明:金龟子绿僵菌CQMa421对二化螟1~5龄幼虫的致死效应随龄期增大而减弱,对1龄幼虫的致死效应最强,LC_(50)为4.80×10^(5)个/mL(孢子浓度,下同),室内5 d校正死亡率最高达77.34%,对5龄幼虫的致死效应最弱,LC_(50)为5.84×10^(7)个/mL,室内5 d校正死亡率最高仅为13.76%;药剂处理组二化螟幼虫的取食量、化蛹率和羽化率均明显低于对照组,体重抑制率呈先升后降趋势,最高达48.98%。综上,金龟子绿僵菌CQMa421能有效控制二化螟种群数量,抑制其生长发育,减少下一代虫口数量,研究为二化螟生物防治提供了理论参考。 展开更多
关键词 金龟子绿僵菌CQMa421 二化螟 毒力测定 生长发育
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长链非编码RNA组蛋白去甲基化酶1同系物D反义RNA1靶向微小RNA-421对过氧化氢诱导的心肌细胞氧化损伤的影响
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作者 王帅 吴申 谷阳 《实用临床医药杂志》 2025年第5期88-94,共7页
目的探讨长链非编码RNA组蛋白去甲基化酶1同系物D反义RNA1(lncRNA JHDM1D-AS1)靶向微小RNA-421(miR-421)对过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导的心肌细胞(H9C2细胞)氧化损伤的影响。方法将H9C2细胞分为对照(Con)组、H_(2)O_(2)组、H_(2)O_(2)+pc... 目的探讨长链非编码RNA组蛋白去甲基化酶1同系物D反义RNA1(lncRNA JHDM1D-AS1)靶向微小RNA-421(miR-421)对过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导的心肌细胞(H9C2细胞)氧化损伤的影响。方法将H9C2细胞分为对照(Con)组、H_(2)O_(2)组、H_(2)O_(2)+pcDNA组、H_(2)O_(2)+pcDNA-JHDM1D-AS1组、H_(2)O_(2)+anti-miR-NC组、H_(2)O_(2)+anti-miR-421组、H_(2)O_(2)+pcDNA-JHDM1D-AS1+miR-NC组、H_(2)O_(2)+pcDNA-JHDM1D-AS1+miR-421组。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测JHDM1D-AS1和miR-421表达。采用比色法测定H9C2细胞中超氧化物歧化酶(SOD)活性、丙二醛(MDA)水平以及培养液中乳酸脱氢酶(LDH)水平。采用流式细胞术评估H9C2细胞凋亡率。JHDM1D-AS1和miR-421的靶向关系通过双荧光素酶报告基因法验证。结果与Con组比较,H_(2)O_(2)组H9C2细胞JHDM1D-AS1水平、SOD活性降低,MDA水平、LDH水平、细胞凋亡率、miR-421水平升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。与H_(2)O_(2)+pcDNA组比较,H_(2)O_(2)+pcDNA-JHDM1D-AS1组H9C2细胞SOD活性升高,miR-421表达水平、MDA水平、LDH水平、细胞凋亡率降低,差异有统计学意义(P<0.05)。与H_(2)O_(2)+anti-miR-NC组比较,H_(2)O_(2)+anti-miR-421组H9C2细胞SOD活性升高,MDA水平、LDH水平、细胞凋亡率降低,差异有统计学意义(P<0.05)。miR-421是JHDM1D-AS1的靶基因。与H_(2)O_(2)+pcDNA-JHDM1D-AS1+miR-NC组比较,H_(2)O_(2)+pcDNA-JHDM1D-AS1+miR-421组H9C2细胞SOD活性降低,MDA水平、LDH水平、细胞凋亡率升高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论lncRNA JHDM1D-AS1通过靶向下调miR-421表达抑制细胞凋亡和氧化应激,减轻H_(2)O_(2)诱导的心肌细胞氧化损伤。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 组蛋白去甲基化酶1同系物D反义RNA1 微小RNA-421 过氧化氢 心肌细胞 细胞凋亡 氧化应激反应
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Hsa-miR-214-3p inhibits breast cancer cell growth and improves the tumor immune microenvironment by downregulating B7H3
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作者 YAN LU KANG WANG +9 位作者 YUANHONG PENG MENG CHEN LIN ZHONG LUJI HUANG FU CHENG XINDAN SHENG XIN YANG MANZHAO OUYANG GEORGE A.CALIN ZHIWEI HE 《Oncology Research》 SCIE 2025年第1期103-121,共19页
Background:Immune checkpoint inhibitors play an important role in the treatment of solid tumors,but the currently used immune checkpoint inhibitors targeting programmed cell death-1(PD-1),programmed cell death ligand-... Background:Immune checkpoint inhibitors play an important role in the treatment of solid tumors,but the currently used immune checkpoint inhibitors targeting programmed cell death-1(PD-1),programmed cell death ligand-1(PD-L1),and cytotoxic T-lymphocyte antigen-4(CTLA-4)show limited clinical efficacy in many breast cancers.B7H3 has been widely reported as an immunosuppressive molecule,but its immunological function in breast cancer patients remains unclear.Methods:We analyzed the expression of B7H3 in breast cancer samples using data from the Cancer Genome Atlas Program(TCGA)and the Gene Expression Omnibus(GEO)databases.MicroRNAs were selected using the TarBase,miRTarBase,and miRBase databases.The regulatory role of the microRNA hsa-miR-214-3p on B7H3 was investigated through dual-luciferase reporter assays,which identified the specific action sites of interaction.The expression levels of B7H3 and hsa-miR-214-3p in human breast cancer tissues and adjacent normal tissues were quantified using Western blotting and quantitative PCR(qPCR).In vitro experiments were performed to observe the effects of modulating the expression of B7H3 or hsa-miR-214-3p on breast cancer cell proliferation and apoptosis.Additionally,the regulatory impact of hsa-miR-214-3p on B7H3 was examined.Enzyme-linked immunosorbent assays(ELISA)and flow cytometry were employed to assess the effects of co-cultured breast cancer cells and normal human peripheral blood mononuclear cells(PBMCs)on immune cells and associated cytokines.Results:In breast cancer tissues,the expression level of B7H3 is inversely correlated with that of hsa-miR-214-3p,as well as with the regulatory effects on breast cancercell behavior.Hsa-miR-214-3p was found to inhibit breast cancer cell growth by downregulating B7H3.Importantly,our research identified,for the first time,two binding sites for hsa-miR-214-3p on the 3’UTR of B7H3,both of which exert similar effects independently.Co-culture experiments revealed that hsamiR-214-3p obstructs the suppressive function of B7H3 on CD8^(+)T cells and natural killer cells.Conclusions:This study confirms the existence of two hsa-miR-214-3p binding sites on the 3’UTR of B7H3,reinforcing the role of hsamiR-214-3p as a regulatory factor for B7H3.In breast cancer,hsa-miR-214-3p reduces tumor cell proliferation and enhances the tumor immune microenvironment by downregulating B7H3.These findings suggest new potential targets for the clinical treatment of breast cancer. 展开更多
关键词 Breast cancer B7H3 hsa-mir-214-3p IMMUNOTHERAPY
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Bioinformatics analysis of the association between hsa-miR-101-3p–induced downregulation of PIEZO1 and poor prognosis in head and neck squamous cell carcinoma mediated by the focal adhesion pathway
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作者 Wei Dong Hongquan Wei +2 位作者 Lingdi Duan Hongguang Hu Min Zhao 《Oncology and Translational Medicine》 2025年第5期240-248,共9页
Background:In regard to head and neck squamous cell carcinoma(HNSC),a common type of head and neck malignant tumor with high mortality,the role of Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1(PIEZO1)is poorly u... Background:In regard to head and neck squamous cell carcinoma(HNSC),a common type of head and neck malignant tumor with high mortality,the role of Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1(PIEZO1)is poorly understood.PIEZO1,a mechanosensitive ion channel,is implicated in tumorigenesis,but its expression,prognostic significance,and mechanisms in HNSC remain unclear.Our study aimed to clarify these aspects through in vitro experiments and bioinformatics analyses.Methods:In order to investigate PIEZO1 expression in normal and cancerous tissues,we used The Cancer Genome Atlas data.Our bioinformatics analyses explored PIEZO1 mRNA expression,correlations,survival curves,upstream mRNA targets,and coexpressed genes.Gene Ontology analysis functionally annotated these coexpressed genes,and pathway enrichment studies further clarified their roles.In addition,we conducted in vitro experiments to examine and compare PIEZO1 expression in normal and cancerous human tissue samples.We performed immunohistochemical analyses to detect PIEZO1 expression in human HNSC tissues.Results:Our results have revealed significantly elevated PIEZO1 expression in HNSC tissue samples compared with adjacent noncancerous tissues.Bioinformatics analysis further showed that PIEZO1 expression was notably higher in high-grade HNSC tumors and was associated with lower survival rates.OncomiR database analysis showed that the downregulation of hsa-miR-101-3p correlated with increased PIEZO1 expression in HNSC.Mechanistic studies identified 4 focal adhesion-related genes(ITGA5,LAMC2,PXN,and VEGFC)modulated by PIEZO1.These findings underscore the potential of PIEZO1 as a therapeutic target and prognostic marker for HNSC.Conclusions:Our study has revealed the expression profile of PIEZO1 in HNSC,emphasizing its potential as a diagnostic and therapeutic target along with hsa-miR-101-3p. 展开更多
关键词 Head and neck squamous cell carcinoma PIEZO1 BIOINFORMATICS hsa-mir-101-3p
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hsa-miR-17-3p在膀胱癌中的表达及其与预后、免疫浸润及免疫治疗效果的关系
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作者 蒋曼妃 王宝锋 +2 位作者 黄清迈 胡强华 车宪平 《海南医学》 2025年第7期913-918,共6页
目的探讨hsa-miR-17-3p在膀胱癌(BLCA)中的表达及其与预后、免疫浸润及免疫治疗效果的关系。方法从TCGA数据库(截至2024年)下载418例BLCA组织样本和19例正常组织样本的miRNA表达数据以及相应的临床数据。首先,使用R语言中的“limma”包... 目的探讨hsa-miR-17-3p在膀胱癌(BLCA)中的表达及其与预后、免疫浸润及免疫治疗效果的关系。方法从TCGA数据库(截至2024年)下载418例BLCA组织样本和19例正常组织样本的miRNA表达数据以及相应的临床数据。首先,使用R语言中的“limma”包分析hsa-miR-17-3p在BLCA中的表达情况,随后,使用R语言中的“pROC”包绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析hsa-miR-17-3p对BLCA的诊断价值,并使用R语言中的“survival”和“survminer”包绘制生存曲线,并通过“rms”“regplot”“survcomp”和“survival”包构建列线图和校准曲线分析hsa-miR-17-3p在BLCA中的预后价值。此外,从肿瘤免疫功能缺陷与排斥(TIDE)数据库下载免疫治疗打分数据,分析hsa-miR-17-3p与免疫细胞浸润的相关性及其对免疫治疗的影响。最后,通过TargetscanHuman、miRDB和mirwalk数据库预测hsa-miR-17-3p的靶基因,并利用Venny工具对三者预测的靶基因取交集,并通过DAVID对交集靶基因进行GO和KEGG富集分析。结果BLCA肿瘤组织中hsa-miR-17-3p的表达量为(8.962±0.042)TPM,明显高于正常组织的(7.043±0.038)TPM,差异有显著统计学意义(P<0.001)。K-M生存曲线显示,hsa-miR-17-3p高表达组的总生存期优于低表达组,差异有显著统计学意义(P<0.001)。ROC曲线下面积为0.920,表明hsa-miR-17-3p在诊断BLCA中具有较高的特异性和敏感性。1、3、5年的总生存率分别为0.91、0.716和0.61,校准曲线的C-index为0.665,说明hsa-miR-17-3p预测BLCA的生存期结果的准确性较高。hsa-miR-17-3p免疫细胞浸润的相关性分析发现,其与NK细胞和CD8+T细胞呈正相关(P<0.05),而与调节性T细胞和单核细胞呈负相关(P<0.05),且高表达组的TIDE评分明显低于低表达组,差异有统计学意义(P<0.05)。三个数据库预测的靶基因交集获得25个交集靶基因。25个交集靶基因进行GO分析显示,其功能主要与细胞内信号转导途径、蛋白质的质膜定位以及质膜到内体的运输有关,KEGG富集分析显示靶基因富集于PI3K-Akt信号通路和FoxO信号通路等通路上。结论hsa-miR-17-3p在膀胱癌中高表达,并可能通过调节免疫细胞浸润参与BLCA的发生发展,有望成为BLCA患者诊疗的预后标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 hsa-mir-17-3p 膀胱癌 癌症基因组图谱 免疫细胞浸润 富集分析
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金龟子绿僵菌CQMa421开启微生物农药国际标准化新纪元——访聚立信董事长林立祥
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作者 林立祥 《中国农药》 2025年第1期18-20,共3页
近日,江苏聚立信生物科技有限公司宣布其核心技术平台公司:重庆聚立信生物工程有限公司(以下简称“江苏聚立信”)研发的真菌类生物农药“金龟子绿僵菌CQMa421”母药和可分散油悬浮剂,正式通过联合国粮农组织(FAO)和世界卫生组织(WHO)联... 近日,江苏聚立信生物科技有限公司宣布其核心技术平台公司:重庆聚立信生物工程有限公司(以下简称“江苏聚立信”)研发的真菌类生物农药“金龟子绿僵菌CQMa421”母药和可分散油悬浮剂,正式通过联合国粮农组织(FAO)和世界卫生组织(WHO)联合专家组评审,由FAO发布成为全球首个符合《FAO/WHO微生物农药标准制定与使用手册》的微生物农药产品。记者对江苏聚立信生物科技有限公司董事长林立祥进行了专访。 展开更多
关键词 金龟子绿僵菌CQMa421 国际标准化
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肿瘤源性外泌体hsa-miR-29c-3p通过靶向ATAD2B调控宫颈鳞状细胞癌的血管生成
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作者 张芳 李亚 +1 位作者 周菲 谭松红 《中国肿瘤生物治疗杂志》 北大核心 2025年第2期151-160,共10页
目的:探讨宫颈癌(CC)细胞SiHa源性外泌体hsa-miR-29c-3p在CC血管生成中的作用。方法∶收集2019年1月至2021年12月在衡阳市中心医院妇科就诊的45例宫颈鳞状细胞癌(CSCC)患者的癌组织标本和15例正常宫颈组织标本。常规培养SiHa细胞和人脐... 目的:探讨宫颈癌(CC)细胞SiHa源性外泌体hsa-miR-29c-3p在CC血管生成中的作用。方法∶收集2019年1月至2021年12月在衡阳市中心医院妇科就诊的45例宫颈鳞状细胞癌(CSCC)患者的癌组织标本和15例正常宫颈组织标本。常规培养SiHa细胞和人脐静脉内皮细胞(HUVEC),用Lipofectamine 2000将hsa-miR-29c-3p、miRNA-NC、si-hsa-miR-29c-3p和si-miRNA-NC转染至SiHa细胞中,记为miRNA-NC组、hsa-miR-29c-3p组、si-miRNA-NC组和si-hsa-miR-29c-3p组。用Lipofectamine 2000将mimic-NC、miR-29c-3p-mimic、pCMV-NC、pCMV-含AAA结构域的ATPase家族蛋白2B(ATAD2B)载体分别转染HUVEC,记为mimic-NC组、miR-29c-3p-mimic组、pCMV-NC组、pCMV-ATAD2B组和pCMV-ATAD2B+miR-29c-3p-mimic组。原位杂交(ISH)法检测CSCC组织中hsa-miR-29c-3p的表达,免疫组化(IHC)法检测CSCC组织和移植瘤组织中的CD31阳性血管。分离纯化SiHa、C33a细胞来源的外泌体,用透射电镜技术和WB法对其表征进行鉴定及进行HUVEC摄取实验。qPCR法检测SiHa、C33a细胞和外泌体中hsa-miR-29c-3p和ATAD2B mRNA的表达。成管试验、Transwell小室实验和划痕愈合实验检测外泌体对HUVEC成管和迁移能力的影响。双萤光素酶报告基因实验验证hsa-miR-29c-3p与ATAD2B的靶向结合关系,移植瘤实验检测各组SiHa细胞来源外泌体对移植瘤生长和血管增生的影响。结果:hsa-miR-29c-3p在CSCC组织中呈高表达且与其微血管密度(MVD)正相关(均P<0.05);SiHa、C33a细胞来源的外泌体完全符合典型外泌体形态和蛋白表达表征;在体外HUVEC摄取SiHa、C33a细胞来源的外泌体和其包含的hsa-miR-29c-3p;SiHa细胞来源的外泌体hsa-miR-29c-3p可在体外促进HUVEC的成管和迁移能力(均P<0.05);SiHa细胞来源的外泌体hsa-miR-29c-3p可促进移植瘤生长和血管增生;hsa-miR-29c-3p可与ATAD2B基因直接结合并调节其表达(均P<0.05)。过表达ATAD2B可逆转hsa-miR-29c-3p对HUVEC的成管、迁移和划痕愈合能力的促进作用(均P<0.05)。结论:SiHa细胞源性外泌体hsa-miR-29c-3p通过靶向ATAD2B调控CSCC组织中的血管生成。外泌体hsa-miR-29c-3p可能是CC诊疗的潜在标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 宫颈鳞状细胞癌 外泌体 SiHa细胞 人脐静脉内皮细胞 血管生成 hsa-mir-29c-3p 含AAA结构域的ATPase家族蛋白2B(ATAD2B)
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hsa-miR-381-3p的靶基因预测及生物信息学分析
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作者 黄亚楠 杨晓菲 +2 位作者 汤涓 李林倬 李兵 《医学理论与实践》 2025年第4期559-563,共5页
目的:通过分析hsa-miR-381-3p的保守性及靶基因,探索其可能发挥的生物学作用。方法:首先,通过UCSC基因组浏览器,比较人类与其他物种的基因组序列,分析hsa-miR-381-3p的序列保守性。再利用miR-Gator数据库探索hsa-miR-381-3p在不同器官... 目的:通过分析hsa-miR-381-3p的保守性及靶基因,探索其可能发挥的生物学作用。方法:首先,通过UCSC基因组浏览器,比较人类与其他物种的基因组序列,分析hsa-miR-381-3p的序列保守性。再利用miR-Gator数据库探索hsa-miR-381-3p在不同器官和疾病中的表达情况。随后,预测hsa-miR-381-3p的潜在靶基因,使用miRDB、mirDIP和TargetScan数据库,并与miRTarBase数据库整合以提高准确性。进行蛋白质—蛋白质相互作用分析,揭示基因相互作用网络。最后,通过DAVID 6.8工具进行GO功能和KEGG通路富集分析,深入理解hsa-miR-381-3p的生物学功能和作用机制。结果:miR-381-3p序列在多个物种间保守,表明其在生物学过程中的重要性和演化稳定性。鉴定出279个与miR-381-3p相互作用的靶基因,包括BRD4、MDM2等,主要功能是与蛋白质和RNA结合,调控转录因子和辅因子活性,在基因表达调控中起关键作用。KEGG通路分析显示,这些靶基因涉及35个信号通路,包括干细胞多能性、轴突导向等,这些通路在细胞生命活动中至关重要。结论:hsa-miR-381-3p在调控关键信号通路中的作用,使其在肿瘤诊断和治疗领域具有应用前景。 展开更多
关键词 hsa-mir-381-3p 生物信息学 靶基因预测 蛋白质—蛋白质相互作用 肿瘤
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金龟子绿僵菌CQMa421等八种杀虫剂防治韭菜迟眼蕈蚊的效果比较
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作者 杨华连 石磊利 +4 位作者 邱尧 王永 江小菱 梁莉 刘建华 《中南农业科技》 2025年第5期17-19,44,共4页
为探索金龟子绿僵菌CQMa421等杀虫剂对韭菜迟眼蕈蚊(Bradysia odoriphaga)的防治效果,选用80亿孢子/mL金龟子绿僵菌CQMa421可分散油悬浮剂、1.5%除虫菊素水乳剂、0.5%藜芦胺可溶液剂、1.3%苦参碱水剂、1%印楝素水分散粒剂、48%噻虫胺悬... 为探索金龟子绿僵菌CQMa421等杀虫剂对韭菜迟眼蕈蚊(Bradysia odoriphaga)的防治效果,选用80亿孢子/mL金龟子绿僵菌CQMa421可分散油悬浮剂、1.5%除虫菊素水乳剂、0.5%藜芦胺可溶液剂、1.3%苦参碱水剂、1%印楝素水分散粒剂、48%噻虫胺悬浮剂、30%氟啶虫酰胺·联苯菊酯(15%+15%)悬浮剂和10%高效氯氟氰菊酯水乳剂8种生物和化学杀虫剂进行田间试验。结果表明,第2次施药后10 d,药剂防治区的虫口减退率为89.0%~99.8%,防治效果达76.0%~99.5%;韭菜受害株率为9.0%~16.4%,显著低于空白对照(45.2%);韭菜产量为33616.5~44821.5 kg/hm^(2),较空白对照增产16.67%~55.56%。金龟子绿僵菌CQMa421单用或混用效果最佳,韭菜产量达41620.5~44821.5 kg/hm^(2),显著高于其他处理。 展开更多
关键词 金龟子绿僵菌CQMa421 韭菜迟眼蕈蚊(Bradysia odoriphaga) 生物防治 化学防治 增产效果
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Mark 421天体多波段辐射机制研究 被引量:6
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作者 康世举 黄邦蓉 +2 位作者 康婷 梁继华 郑永刚 《天文学报》 CSCD 北大核心 2011年第5期357-364,共8页
基于对数抛物线型电子分布,用单区、均匀同步自康普顿(Synchrotron Self-Compton,SSC)辐射模型计算BL Lac天体S5 0716+714的多波段能谱,并与Paggi等人的结果进行了比较.模型的计算结果与Paggi等人直接用δ函数近似得到的结果不同,导致... 基于对数抛物线型电子分布,用单区、均匀同步自康普顿(Synchrotron Self-Compton,SSC)辐射模型计算BL Lac天体S5 0716+714的多波段能谱,并与Paggi等人的结果进行了比较.模型的计算结果与Paggi等人直接用δ函数近似得到的结果不同,导致该差异的主要原因可能是由于单电子同步辐射的δ函数近似丢失了电子的部分能量而影响逆康普顿散射结果.把该模型分别应用于Mark 421天体的高、中、低3种不同状态下的多波段观测结果,理论计算结果能与不同状态下的观测结果符合得很好.分析认为,观测到的Mark 421天体的不同状态可能是由于喷流内电子分布变化引起的. 展开更多
关键词 星系 BL Lac天体 个别 MARK 421 辐射机制 非热
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hsa-miR-126和hsa-miR-518b在食管鳞癌中的表达 被引量:10
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作者 蔡惠 王健生 +2 位作者 张明鑫 段小艺 马仁强 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期23-27,共5页
目的探讨食管鳞癌及正常组织微小RNA(miRNA)分子表达谱的差异,寻找并验证具有差异表达的miRNA。方法随机选3例首次诊治食管鳞癌患者的手术切除标本,取癌组织及正常粘膜。采用荧光探针杂交芯片扫描技术,获得食管鳞癌miRNA表达谱,并对表... 目的探讨食管鳞癌及正常组织微小RNA(miRNA)分子表达谱的差异,寻找并验证具有差异表达的miRNA。方法随机选3例首次诊治食管鳞癌患者的手术切除标本,取癌组织及正常粘膜。采用荧光探针杂交芯片扫描技术,获得食管鳞癌miRNA表达谱,并对表达谱的可靠性进行荧光实时定量RT-PCR验证。另取15例首次诊治食管鳞癌患者手术切除标本的癌组织及正常粘膜,对其中具有表达差异的hsa-miR-126和hsa-miR-518b进行进一步验证。结果得到了食管鳞癌及正常组织的MicroRNA表达谱,分析得到表达变化且具有统计学意义(单侧t检验,P<0.05)的miRNA11个,其中上调1个,下调10个。在另外15对验证样本中,hsa-miR-126上调10例(配对t检验,P<0.05),hsa-miR-518b下调12例(配对t检验,P<0.05)。结论 hsa-miR-126和hsa-miR-518b在食管鳞癌组织和正常组织中存在差异表达,hsa-miR-126在食管癌组织中上调,hsa-miR-518b下调。 展开更多
关键词 食管鳞癌 hsa-mir-126 hsa-mir-518b MIRNA
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抑制miR-421表达增强宫颈癌细胞放疗敏感性 被引量:5
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作者 潘雨露 吴淑霞 +1 位作者 石翠格 任兴业 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期798-804,共7页
目的:研究抑制miR-421表达增强宫颈癌细胞放疗敏感性的分子机制。方法:运用脂质体2000将miR-421 inhibitor转染4株宫颈癌细胞系HeLa、SiHa、C33A和CaSki,以转染阴性核苷酸为对照,real-time PCR检测子宫内膜上皮细胞ESC细胞和4株宫颈癌... 目的:研究抑制miR-421表达增强宫颈癌细胞放疗敏感性的分子机制。方法:运用脂质体2000将miR-421 inhibitor转染4株宫颈癌细胞系HeLa、SiHa、C33A和CaSki,以转染阴性核苷酸为对照,real-time PCR检测子宫内膜上皮细胞ESC细胞和4株宫颈癌细胞中miR-421的表达水平;转染的细胞经不同剂量电离辐射(0、2、4、6和8 Gy)处理48 h后运用MTT法、ELISA和Annexin V-FITC/PI染色法联合流式细胞术分别测定细胞活力、乳酸脱氢酶(LDH)漏出率和细胞凋亡率;运用Western blot检测细胞中cleaved caspase-9、caspase-9、cleaved PARP、PARP、Bcl-2和Bax蛋白的水平。结果:miR421在ESC细胞中低表达,而在4株宫颈癌细胞中高表达,转染miR-421 inhibitor后miR-421显著低于阴性对照组(P<0.05)。相同条件下,辐照后低表达miR-421的宫颈癌细胞活力和LDH漏出率显著低于阴性对照组,72 h的细胞凋亡率明显增加(P<0.05)。Western blot结果显示,电离辐射后与阴性对照组比较,低表达miR-421的宫颈癌细胞中cleaved caspase-9、cleaved PARP和Bcl-2的蛋白水平明显增高,而Bax蛋白水平显著降低(P<0.05)。结论:miR-421在正常子宫内膜上皮ESC细胞中低表达,而在宫颈癌细胞系中高表达;下调miR-421表达能抑制宫颈癌细胞的活力,显著增强宫颈癌细胞的辐射敏感性,其机制至少部分通过激活caspase-9细胞凋亡通路进而促进抗凋亡蛋白Bcl-2表达和抑制促凋亡蛋白Bax表达而实现。 展开更多
关键词 宫颈癌 miR-421 电离辐射 放疗敏感性 细胞凋亡
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miR-421靶向调控Menin/Caspase-3影响抑郁症的机制 被引量:2
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作者 刘永辉 谭庆晶 +4 位作者 陈清 韦理萍 杨俊威 杨侃 高玉广 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2024年第4期453-459,共7页
目的探讨miR-421影响抑郁症发生发展的作用机制。方法采取单次腹腔注射脂多糖(LPS)方法建立抑郁大鼠模型,采用糖水偏好度测试和旷场实验进行抑郁行为检测。通过miRNA微阵列芯片和RT-PCR分析miR-421在抑郁大鼠海马组织中的表达量,运用Tar... 目的探讨miR-421影响抑郁症发生发展的作用机制。方法采取单次腹腔注射脂多糖(LPS)方法建立抑郁大鼠模型,采用糖水偏好度测试和旷场实验进行抑郁行为检测。通过miRNA微阵列芯片和RT-PCR分析miR-421在抑郁大鼠海马组织中的表达量,运用TargetScan数据库和mi RDB数据库进行预测miR-421的靶基因,采用双荧光素酶报告基因实验观察其与靶基因的结合情况,观察过表达和抑制miR-421对靶基因的影响,随后过表达和抑制靶基因,观察其对下游因子的影响,最终探究miR-421影响抑郁症的相关机制。结果miRNA微阵列芯片和RT-PCR检测表明miR-421在抑郁大鼠海马组织中呈高表达(P<0.001),抑制miR-421的表达可显著恢复抑郁大鼠的体重和运动能力(P<0.001)。TargetScan数据库预测得到Menin与miR-421存在结合靶点,双荧光素酶报告基因实验表明Menin与miR-421具有相互作用;当miR-421过表达时,Menin表达量会下调(P<0.001),相反,当抑制miR-421表达时,Menin表达量会上调(P<0.001)。qPCR检测提示,Menin下游因子Caspase-3、NF-κB在抑郁大鼠模型海马组织中的表达显著提高(P<0.001),IL-1β在抑郁大鼠模型海马组织中的表达明显提高(P<0.01),当抑制Menin表达时,Caspase-3、NF-κB、IL-1β表达量会升高(P<0.001),当过表达Menin时,Caspase-3、NF-κB、IL-1β表达量则降低(P<0.001)。结论抑制miR-421表达可升高Menin表达,降低Caspase-3含量,减少神经炎症反应,从而改善抑郁症状。 展开更多
关键词 抑郁症 miR-421 MENIN CASPASE-3 动物实验 作用机制
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气相色谱-质谱法测定蔬菜中八氯二丙醚(S-421)的残留量 被引量:5
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作者 张卫锋 洪振涛 +1 位作者 李嘉静 邱瑞霞 《福建分析测试》 CAS 2008年第1期1-3,共3页
建立了蔬菜中八氯二丙醚(S-421)农药残留的气相色谱-质谱分析方法。样品采用乙腈提取,氯化钠盐析分层,取部分提取液使用氮气吹干,以正己烷溶解,加浓硫酸进行净化,最后用气相色谱-质谱法进行定量定性分析。在三个添加水平的八氯二丙醚(S-... 建立了蔬菜中八氯二丙醚(S-421)农药残留的气相色谱-质谱分析方法。样品采用乙腈提取,氯化钠盐析分层,取部分提取液使用氮气吹干,以正己烷溶解,加浓硫酸进行净化,最后用气相色谱-质谱法进行定量定性分析。在三个添加水平的八氯二丙醚(S-421)平均回收率(n=5)为86%~102%,相对标准偏差为3.2%~6.4%。该方法的检出限为0.005mg/kg。 展开更多
关键词 气相色谱-质谱法 八氯二丙醚(S-421) 残留量 蔬菜
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lncRNA FGD5-AS1靶向miR-421对缺氧/复氧诱导的心肌细胞损伤的影响 被引量:4
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作者 孟晓京 刘亚军 项宁 《山东医药》 CAS 2021年第16期30-34,共5页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)FGD5-AS1与微小RNA-421(miR-421)的靶向调控关系及其对缺氧/复氧(H/R)诱导的心肌细胞损伤的影响。方法利用H/R诱导心肌细胞H9C2损伤,采用实时荧光定量PCR检测lncRNAFGD5-AS1和miR-421表达。在心肌细胞中转... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)FGD5-AS1与微小RNA-421(miR-421)的靶向调控关系及其对缺氧/复氧(H/R)诱导的心肌细胞损伤的影响。方法利用H/R诱导心肌细胞H9C2损伤,采用实时荧光定量PCR检测lncRNAFGD5-AS1和miR-421表达。在心肌细胞中转染pcDNA-FGD5-AS1、anti-miR-421,或共转染pcDNAFGD5-AS1和miR-421,之后进行H/R损伤。采用试剂盒评估丙二醛(MDA)含量和超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性,流式细胞术分析凋亡率,Westernblotting法测定B细胞淋巴瘤/白血病-2(Bcl-2)和Bcl-2相关X蛋白(Bax)蛋白表达。生物信息学预测与双荧光素酶报告实验验证lncRNAFGD5-AS1对miR-421的靶向调控。结果缺氧/复氧使心肌细胞中lncRNAFGD5-AS1表达、SOD活性、GSH-Px活性、Bcl-2蛋白表达减少,并使miR-421表达、MDA含量、凋亡率、Bax蛋白表达增多(P均<0.05)。lncRNAFGD5-AS1过表达降低缺氧/复氧诱导的心肌细胞的MDA含量、凋亡率、Bax蛋白表达,提高SOD活性、GSH-Px活性、Bcl-2蛋白表达(P均<0.05),抑制miR-421表达与其效果相同。lncRNAFGD5-AS1靶向调控miR-421的表达。共转染pcDNA-FGD5-AS1和miR-421提高缺氧/复氧诱导的心肌细胞的MDA含量、凋亡率、Bax蛋白表达,降低SOD活性、GSH-Px活性、Bcl-2蛋白表达(P均<0.05)。结论在缺氧/复氧诱导的心肌细胞中,lncRNAFGD5-AS1通过靶向miR-421,减轻细胞氧化应激,并抑制其凋亡,从而减轻缺氧/复氧诱导的心肌细胞损伤。 展开更多
关键词 缺氧/复氧 心肌细胞 长链非编码RNAFGD5-AS1 微小RNA-421 细胞凋亡 氧化应激
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