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Hras12V转基因小鼠肝癌发生的性别差异性蛋白质组学研究 被引量:4
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作者 戎卓娜 李慧玲 +4 位作者 郑旭 董鹏辉 王福金 王爱国 王靖宇 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2017年第21期1487-1494,共8页
目的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的发生具有显著的性别差异,但其分子机制尚不清楚。本研究通过检测Hras12V转基因小鼠雌雄肝肿瘤组织的蛋白质组学表达差异,探讨肝肿瘤发生的性别差异机制。方法采用双向荧光差异凝胶电泳(two... 目的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的发生具有显著的性别差异,但其分子机制尚不清楚。本研究通过检测Hras12V转基因小鼠雌雄肝肿瘤组织的蛋白质组学表达差异,探讨肝肿瘤发生的性别差异机制。方法采用双向荧光差异凝胶电泳(two dimension difference gel electrophoresis,2D-DIGE)和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术检测Hras12V雌雄小鼠肝肿瘤组织的蛋白质组学差异表达谱,分离并鉴定差异表达蛋白,应用蛋白质印迹法验证2D-DIGE结果,并对差异表达蛋白进行生物信息学分析,包括蛋白功能注释、分类(gene ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析。结果经双向荧光差异凝胶电泳-图像分析得到1 313个蛋白点,其中差异倍数≥1.5(P<0.05)的蛋白点553个。从中选择94个差异蛋白点进行MALDI-TOF-MS鉴定,得到56种差异性表达的蛋白质。其中,与雌鼠相比,雄鼠肝肿瘤组织中高表达的蛋白有43种,低表达的蛋白有13种。选取4个差异蛋白FABP1、Albumin、Prdx6和CALR进行了蛋白质印迹法验证,其中FABP1在雄鼠肝癌中显著上调,Albumin和Prdx6在雄鼠肝癌中显著下调,CALR在雌雄小鼠肝癌中差异无统计学意义,结果与质谱数据基本一致,证明了2D-DIGE结果的可靠性。对雌雄鼠肝肿瘤组织中的差异蛋白进行GO分析,细胞组分分析显示,差异蛋白主要分布在细胞质、细胞溶质、线粒体和细胞核中;分子功能分析显示,差异蛋白主要承担poly(A)RNA结合、ATP结合和酶结合等功能;生物过程分析显示,差异蛋白主要参与运输、脂代谢过程和凋亡过程的负调控等。KEGG通路分析结果表明,差异蛋白涉及9条信号通路,主要通路包括代谢途径、内质网加工过程和细胞色素P450的异物代谢等通路。结论 Hras12V转基因小鼠雌雄肝肿瘤组织的差异性蛋白表达的检测,为研究性别差异性肝癌发生分子机制提供了基础生物学信息和有益的线索。 展开更多
关键词 肝癌 hras12v 性别差异 蛋白质组学 生物信息学 双向荧光差异凝胶电泳
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全基因组DNA甲基化和表达分析揭示ras癌基因诱发小鼠肝癌的表观遗传学机制
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作者 李娟 王虹 +2 位作者 狄怀源 焦开颜 王爱国 《中华肿瘤防治杂志》 北大核心 2025年第5期292-303,共12页
目的探究ras癌基因所诱导的肝肿瘤发生发展过程中,甲基化组学和转录组学变化特点,为研究肝肿瘤的发病机制、雄性倾向性及临床诊断提供参考。方法采集9和15月龄野生型C57BL/6J雌雄小鼠正常肝组织及与其具有相同遗传背景的Hras12V转基因... 目的探究ras癌基因所诱导的肝肿瘤发生发展过程中,甲基化组学和转录组学变化特点,为研究肝肿瘤的发病机制、雄性倾向性及临床诊断提供参考。方法采集9和15月龄野生型C57BL/6J雌雄小鼠正常肝组织及与其具有相同遗传背景的Hras12V转基因肝癌雌雄小鼠肝肿瘤组织及肿瘤周围组织进行全基因组DNA甲基化组测序和RNA转录组测序。综合全基因组DNA甲基化组学和转录组学数据,分析ras癌基因诱导的肝肿瘤发生发展过程中通过DNA甲基化调控的基因表达谱图。应用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对DNA甲基化调控的基因表达谱图进行生物信息学分析。结果综合分析发现,肝肿瘤的发生与DNA启动子区域甲基化相关,且ras癌基因诱导的肝肿瘤发生相关的差异表达基因中,主要以高甲基化的沉默调节为主,并且存在性别间共同和特异性甲基化调控的基因,其中共同甲基化调控基因如Rnf152、Gnmt、Cxcl12等与人类肝癌的表达调控机制相一致。生物信息学分析结果表明,雌雄鼠中共有的差异甲基化基因所富集的信号通路以代谢通路为主,如苯丙氨酸、花生四烯酸、甘氨酸等代谢通路。雌雄鼠差异甲基化基因所富集的信号通路有明显不同,其中视黄醇代谢和PPAR信号通路为雌性鼠所特有。结论Ras癌基因诱导的小鼠肝癌发生与启动子区域的异常甲基化有关联,且以高甲基化沉默调控为主。生物信息学富集分析表明,甲基化主要调控代谢通路。肝癌发生的甲基化调控存在雌雄差异,对视黄醇代谢和PPAR信号通路的甲基化调控为雌鼠所特有。 展开更多
关键词 肝肿瘤 甲基化组学 转录组学 hras12v 转基因小鼠
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