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水稻中HSP20家族基因鉴定及表达 被引量:1
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作者 李文杰 杨慧鑫 +5 位作者 胡丽 吴翠丽 付兴悦 周嘉裕 李辉 廖海 《应用与环境生物学报》 北大核心 2025年第8期1238-1248,共11页
热激蛋白20(HSP20)作为植物中的一类抗性蛋白,参与植物的生长发育与逆境响应等重要过程.运用生物信息学分析、转录组与定量PCR验证等方法和技术,鉴定水稻中的OsHSP20基因成员,并分析部分成员在生长发育与逆境响应中的表达调控,为阐明HS... 热激蛋白20(HSP20)作为植物中的一类抗性蛋白,参与植物的生长发育与逆境响应等重要过程.运用生物信息学分析、转录组与定量PCR验证等方法和技术,鉴定水稻中的OsHSP20基因成员,并分析部分成员在生长发育与逆境响应中的表达调控,为阐明HSP20基因家族调控水稻生长发育与逆境响应等过程的分子功能奠定基础.从水稻基因组中鉴定获得34个OsHSP20基因,其中大部分成员位于第1-3号染色体上.Motif 1与2属于该家族中的保守基序.系统进化树显示27个成员分属于明确的亚家族.共线性分析表明水稻与拟南芥中存在2条同源序列,与大麦存在23条同源序列,物种内存在3对片段复制.顺式作用元件预测与转录组分析数据显示,OsHSP20参与了水稻的生长发育与逆境响应等多个生物学过程.随后的定量PCR证实,干旱诱导OsHsp20-8等基因上调表达、抑制OsHsp20-29基因的表达;低温诱导OsHsp20-32等基因上调表达、抑制OsHsp20-31等基因的表达.蛋白互作预测发现OsHsp20-31与多个OsHSP20家族成员互作.本研究表明Os HSP20基因可能参与调控水稻穗与种子的生长发育与形态建成以及对干旱与低温胁迫的响应;其中的OsHsp20-31基因可能同时参与调控以上生物学过程,在水稻分子育种中可能具有一定的应用潜力.(图9表2参32) 展开更多
关键词 水稻 热激蛋白(hsp20) 基因家族 生物信息学分析 基因表达分析
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鲍姆桑黄(Sanghuangporus baumii)HSP20基因家族的分子特征及不同发育阶段的表达模式分析
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作者 田彦挺 齐欣 +2 位作者 刘昊 廖方舟 仝雅娜 《天津农业科学》 2025年第5期1-7,共7页
为阐明药用真菌鲍姆桑黄(Sanghuangporus baumii)热休克蛋白20(HSP20)基因家族的生物学功能及其分子机制,基于全基因组数据系统鉴定了SbHSP20基因家族成员,并探究其在菌株生长调控中的作用。结果表明:在鲍姆桑黄中共鉴定出11个Sb HSP20... 为阐明药用真菌鲍姆桑黄(Sanghuangporus baumii)热休克蛋白20(HSP20)基因家族的生物学功能及其分子机制,基于全基因组数据系统鉴定了SbHSP20基因家族成员,并探究其在菌株生长调控中的作用。结果表明:在鲍姆桑黄中共鉴定出11个Sb HSP20基因,其编码蛋白分子量范围为17.5~89.6 kDa,等电点分布范围为5.07~10.38。系统发育分析显示,SbHSP20与糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)HSP20蛋白具有高度同源性(平均序列一致性76.8%)。启动子区域含有ABRE、MBS、STRE等12类胁迫响应元件,其中SbHSP20-7基因启动子包含7种不同类型的胁迫相关元件。表达谱分析表明,SbHSP20-2和SbHSP20-10在培养5 d的菌丝体中转录水平较高,分别为23.20和9.023;SbHSP20-6、SbHSP20-7和SbHSP20-10在培养9 d的菌丝体中表达量分别为5.212、6.209和10.098。共线性分析显示,桑黄与双孢蘑菇(Agaricus bisporus)之间存在染色体同源区段。综上,本研究首次系统解析了鲍姆桑黄SbHSP20基因家族的分子特征及表达调控模式,笔者发现SbHSP20-10可作为关键候选基因用于菌株抗逆性改良,为药用真菌抗逆分子育种提供了理论依据和基因资源。 展开更多
关键词 小热激蛋白(hsp20) 基因结构 系统发育 染色体定位
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藜麦 HSP20 基因家族全基因组分析及其对非生物胁迫的响应
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作者 卢秋巍 常雅琴 +4 位作者 王晴 张晔荷 张丽 张鸿苑 郭富烨 《安徽农业科学》 2025年第18期110-117,共8页
在全基因组分析的基础上鉴定了CqHSP20基因家族,获得83个CqHSP20s基因,系统发育分析表明,CqHSP20可分为7个亚组。重复事件分析表明,串联重复(21.3%)和片段重复(56.3%)事件在促进CqHSP20基因家族的扩展中起着至关重要的作用。转录组分析... 在全基因组分析的基础上鉴定了CqHSP20基因家族,获得83个CqHSP20s基因,系统发育分析表明,CqHSP20可分为7个亚组。重复事件分析表明,串联重复(21.3%)和片段重复(56.3%)事件在促进CqHSP20基因家族的扩展中起着至关重要的作用。转录组分析表明,83个CqHSP20s基因中有35个在根或苗中响应高温胁迫,其中18个CqHSP20s基因显著上调,18个CqHSP20s基因显著下调。此外,83个CqHSP20s基因中有17个在根或苗中响应干旱胁迫,7个响应缺磷胁迫,10个响应高盐胁迫。 展开更多
关键词 藜麦 hsp20 基因家族 全基因组分析 非生物胁迫
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西蒙得木HSP20基因家族的进化、表达和功能分析 被引量:1
4
作者 李博静 郑腊梅 +2 位作者 吴乌云 高飞 周宜君 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期190-202,共13页
【目的】研究西蒙得木HSP20家族成员的结构和功能,为后续研究提供支撑。【方法】从结构分析、系统发育、表达模式等方面对西蒙得木HSP20家族成员(ScHSP20s)进行系统分析,并对ScHSP20-17进行功能分析。【结果】西蒙得木基因组中包含35个H... 【目的】研究西蒙得木HSP20家族成员的结构和功能,为后续研究提供支撑。【方法】从结构分析、系统发育、表达模式等方面对西蒙得木HSP20家族成员(ScHSP20s)进行系统分析,并对ScHSP20-17进行功能分析。【结果】西蒙得木基因组中包含35个HSP20基因座位,其中8个基因涉及串联重复,5个涉及片段重复。系统发育分析表明,35个ScHSP20聚为12个亚家族,其中核质亚家族数量最多。启动子分析表明,多数ScHSP20家族成员启动子区域含有激素响应和非生物胁迫等相关顺式作用元件。转录组分析表明,ScHSP20-35和ScHSP20-17等部分热激蛋白基因在花和种子发育过程中表达量发生显著性改变,而ScHSP20-17和ScHSP20-28等基因受高温诱导。亚细胞定位分析表明,ScHSP20-17编码的蛋白定位于细胞核中,并且在大肠杆菌、酵母和烟草中过表达ScHSP20-17能显著提高它们对高温胁迫的耐受性。【结论】部分ScHSP20家族成员参与了西蒙得木生殖发育和非生物胁迫应答。 展开更多
关键词 西蒙得木 hsp20 亚细胞定位 表达分析 高温胁迫
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水稻HSP20家族的群体基因组差异及功能单倍型分析 被引量:1
5
作者 梁伦平 冯庭 +2 位作者 马赛 郝芷圻 黎珉 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第14期4534-4548,共15页
HSP20家族是植物中非常丰富的一类小热休克蛋白(sHSPs),它们能够与细胞内的各个组分相互作用,从而维持细胞的稳定性。相较于大分子热激蛋白家族(如HSP70和HSP90),HSP20家族的研究相对较少,尤其是在水稻(Oryza sativa L.)群体基因组中的... HSP20家族是植物中非常丰富的一类小热休克蛋白(sHSPs),它们能够与细胞内的各个组分相互作用,从而维持细胞的稳定性。相较于大分子热激蛋白家族(如HSP70和HSP90),HSP20家族的研究相对较少,尤其是在水稻(Oryza sativa L.)群体基因组中的分析和功能单倍型研究更不多见。本研究对HSP20基因家族在水稻中的序列组成及基因结构进行了系统分析。在籼稻(O.sativa Xian/Indica group)基因组中鉴定到41个HSP20基因,粳稻(O.sativa Geng/Japonica group)基因组中鉴定出33个HSP20基因,其中有27个基因在籼粳基因组中都被鉴定到。这些基因共分为8个亚家族,分布在第1、第2、第3和第10号染色体上。通过MEME(Multiple em for motif elicitation)和基因结构分析,发现除了个别成员存在差异外,大部分家族成员序列都较为保守。利用3000份水稻泛基因组数据库对HSP20家族进行存在/缺失变异(presence/absence variations,PAV)分析,发现33个HSP20基因中有26个核心基因(在所有水稻亚群中都存在)和7个分散式基因(特异分布于某些亚群)。分散式基因中包含1个粳稻特有基因和2个籼稻特有基因,推测这3个基因可能与籼/粳分化有关。利用水稻功能基因单倍型数据库,结合抽穗期和株高表型对6个在水稻亚群中分布具有特异性的基因进行了单倍型分析。结果显示,这6个基因一共关联到了20个高频单倍型,其中对株高和抽穗期效应显著的各有6个,对两者均显著的单倍型有2个。此外,外源激素响应分析表明,Os01g0136100和Os02g0782500基因的表达受外源脱落酸显著诱导,在根部中表达上调,而在茎段中表达下调。本研究为后期HSP家族基因的功能分析及其功能单倍型的发掘提供了重要的参考信息。 展开更多
关键词 水稻 hsp20 基因结构 群体差异 单倍型
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高温胁迫下茄子小热激蛋白基因SmsHSP20的克隆与表达分析
6
作者 周亚东 赵恩鹏 +5 位作者 申磊 杜丽慧 姜政 胡雪 夏昕 杨旭 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第20期6653-6660,共8页
利用茄子SmsHSP20(基因编号>Smechr0302276.1)在杭茄数据库中搜索得到其ORF(open reading frame)序列,然后参考此序列设计特异引物及荧光定量PCR引物。以茄子品种‘AC013’叶片cDNA为模板克隆获得了该基因,该基因大小为714 bp,编码23... 利用茄子SmsHSP20(基因编号>Smechr0302276.1)在杭茄数据库中搜索得到其ORF(open reading frame)序列,然后参考此序列设计特异引物及荧光定量PCR引物。以茄子品种‘AC013’叶片cDNA为模板克隆获得了该基因,该基因大小为714 bp,编码237个氨基酸,C端含有一个Hsp20功能域。对SmsHSP20进行生物信息学分析,发现SmsHSP20蛋白与马铃薯、辣椒、番茄、枸杞等茄科植物有较高的同源性。对SmsHSP20的启动子序列进行分析,发现其包含2个光反应顺式作用元件、多个植物激素响应顺式作用元件以及多个转录因子结合位点。采用RT-qPCR研究了SmsHSP20在高温胁迫下茄子中的表达情况,结果显示该基因在茄子受到高温胁迫时其表达量急剧升高,在0.5h达到最高值,说明该基因可能在茄子响应高温胁迫的过程中起正调节作用。 展开更多
关键词 茄子 hsp20 高温胁迫 生物信息学分析 荧光定量PCR
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番茄HSP20基因家族的全基因组鉴定、系统进化及表达分析 被引量:11
7
作者 张宁 姜晶 史洁玮 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期137-144,共8页
热激蛋白是从细菌到高等真核生物中普遍存在的一种在受到环境胁迫的响应后迅速合成的蛋白。因为小分子热激蛋白的分子量普遍在20k Da左右,故称为HSP20。借助番茄基因组数据库,利用生物信息学方法对HSP20基因家族进行鉴定及分析,结果表明... 热激蛋白是从细菌到高等真核生物中普遍存在的一种在受到环境胁迫的响应后迅速合成的蛋白。因为小分子热激蛋白的分子量普遍在20k Da左右,故称为HSP20。借助番茄基因组数据库,利用生物信息学方法对HSP20基因家族进行鉴定及分析,结果表明,番茄中至少含有43个HSP20基因,不均匀的分布在番茄的12条染色体上。通过对茄科植物番茄、辣椒、马铃薯HSP20进行系统进化分析发现,三者存在同源关系。对HSP20基因启动子序列分析发现多个响应植物糖代谢和逆境胁迫的顺式作用元件,包括SURE、W-box等。基于RNA-Seq数据库中2种测序番茄(Heinz1706和pimpinellifolium)的表达分析发现,大多数家族成员在果实发育时期表达量高,在其他组织中的表达量相对较低。这些研究结果为鉴定番茄HSP20基因的进化及其功能奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 hsp20 生物信息学 系统发育 表达分析
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菜粉蝶HSP20基因的克隆及温度胁迫下表达分析 被引量:2
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作者 袁远 张连根 +4 位作者 高熹 吴国星 张慧 龙华 朱家位 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期286-291,共6页
【目的】克隆分析菜粉蝶(Pieris rapae)热激蛋白20基因(HSP20),并检测其在温度胁迫下的表达情况,为探析菜粉蝶适应温度胁迫机制提供参考。【方法】以菜粉蝶为试验材料,采用RT-PCR和RACE克隆获得菜粉蝶HSP20基因cDNA全长,并通过生物学软... 【目的】克隆分析菜粉蝶(Pieris rapae)热激蛋白20基因(HSP20),并检测其在温度胁迫下的表达情况,为探析菜粉蝶适应温度胁迫机制提供参考。【方法】以菜粉蝶为试验材料,采用RT-PCR和RACE克隆获得菜粉蝶HSP20基因cDNA全长,并通过生物学软件分析其序列,明确其基因结构特征和亲缘关系;采用实时荧光定量PCR检测菜粉蝶HSP20基因在低温(-20~0℃)和高温(5~45℃)胁迫下的表达响应。【结果】菜粉蝶HSP20基因全长725 bp,5'-端非编码区105 bp,3'-端非编码区109 bp,开放阅读框531 bp,编码176个氨基酸,预测蛋白分子量19.5 kD,理论等电点6.61;其编码氨基酸序列中含有1个典型的HSP20家族结构域(位于第60~142位氨基酸)、1个α-晶体蛋白(位于第60~157位氨基酸)和1个Allato allatostatin(位于第14~24位氨基酸);基序列相似度分析其与二化螟、家蚕和甘蓝夜蛾HSP20蛋白氨基酸相似度较高并聚为一族。该基因随环境温度的升高或降低发生变化,在-5和40℃诱发该基因高效表达。【结论】低温和高温均能诱导菜粉蝶HSP20基因高效表达。 展开更多
关键词 菜粉蝶 热激蛋白 hsp20 基因克隆 序列分析 温度胁迫 表达分析
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柑橘HSP20家族基因鉴定及其响应溃疡病菌侵染表达分析 被引量:2
9
作者 张凯 麻明英 +5 位作者 王萍 李益 金燕 盛玲 邓子牛 马先锋 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1213-1232,共20页
为探究HSP20在柑橘(Citrus L.)响应溃疡病菌(Xanthomonas citri subsp.citri,Xcc)侵染过程中发挥的作用,鉴定CsHSP20家族基因。生物学信息分析显示共有42个,分为11个亚族,分布在9条染色体上,编码135~373个氨基酸,蛋白分子量15.17~41.71 ... 为探究HSP20在柑橘(Citrus L.)响应溃疡病菌(Xanthomonas citri subsp.citri,Xcc)侵染过程中发挥的作用,鉴定CsHSP20家族基因。生物学信息分析显示共有42个,分为11个亚族,分布在9条染色体上,编码135~373个氨基酸,蛋白分子量15.17~41.71 kD,等电点4.53~10.07,92.9%的基因没有或只有1个内含子,各亚族基因间有高度相似的结构和保守基序,每个基因的启动子都具有与激素或胁迫相关的顺式作用元件。其次,对感病的冰糖橙和抗病的枸橼C-05进行接种Xcc和40℃热胁迫处理,qRT-PCR结果显示CsHSP20家族中的HSP17.9、HSP23.3、HSP18.5和HSP18.0均上调表达,但抗感材料之间差异明显,HSP23.3在枸橼C-05中受Xcc上调表达水平极显著,该结果与受Xcc侵染的转录组结果一致。在冰糖橙叶片瞬时超表达候选基因,Xcc定量分析结果显示枸橼C-05的HSP23.3抑制Xcc繁殖速度更明显。 展开更多
关键词 柑橘 枸橼 hsp20 溃疡病 表达分析
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牛双芽巴贝斯虫新疆株HSP20基因的克隆和真核表达质粒的构建 被引量:2
10
作者 简子健 孙其喆 +1 位作者 马素贞 王晓萍 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期359-363,共5页
通过设计牛双芽巴贝斯虫热休克蛋白HSP20基因序列的特异性引物,采用PCR方法从疑似"牛焦虫病"的患牛全血基因组中扩增得到699 bp的HSP20基因,将其连入pMD18-T测序、鉴定,再将验证的699 bp的HSP20基因克隆至真核表达载体pcDNA3.... 通过设计牛双芽巴贝斯虫热休克蛋白HSP20基因序列的特异性引物,采用PCR方法从疑似"牛焦虫病"的患牛全血基因组中扩增得到699 bp的HSP20基因,将其连入pMD18-T测序、鉴定,再将验证的699 bp的HSP20基因克隆至真核表达载体pcDNA3.1(+)中,构建真核载体PCDNA3.1-HSP20。经再次测序、鉴定后,尾静脉注射小白鼠进行HSP20基因的瞬时表达,取其肝脏提取总RNA,经RT-PCR方法扩增出一条534bp的目的条带,表明真核表达质粒构建成功。 展开更多
关键词 牛双芽巴贝斯虫 hsp20基因 PCDNA3.1(+) 真核表达
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棘阿米巴HSP20蛋白的原核表达及免疫原性鉴定 被引量:1
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作者 王宁宁 郑文彧 +6 位作者 孙宏宇 王月华 李婷婷 韩漫漫 曲寿月 冯宪敏 时文艳 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2020年第11期1283-1288,共6页
目的重组表达棘阿米巴热休克蛋白20(Heat shock protein 20,HSP20),并对HSP20作为疫苗候选分子的免疫活性进行验证。方法以棘阿米巴滋养体cDNA为模板,PCR扩增HSP20基因,构建pET-22b-HSP20原核表达载体,并将其转化大肠杆菌感受态细胞BL21... 目的重组表达棘阿米巴热休克蛋白20(Heat shock protein 20,HSP20),并对HSP20作为疫苗候选分子的免疫活性进行验证。方法以棘阿米巴滋养体cDNA为模板,PCR扩增HSP20基因,构建pET-22b-HSP20原核表达载体,并将其转化大肠杆菌感受态细胞BL21;采用1mmol/L IPTG诱导重组HSP20蛋白(Recombinant heat shock protein 20,rHSP20)表达,并进行可溶性分析。采用His亲和层析法纯化r-HSP20,并免疫家兔制备兔多克隆抗体;采用ELISA试剂盒检测多克隆抗体IgG1及IgG2a分型;Western blot鉴定r-HSP20的免疫反应性。结果经PCR扩增得到579bp的目的基因片段,与预期大小一致;经菌落PCR及双酶切证明成功构建pET22b-HSP20原核表达载体;经可溶性分析r-HSP20主要存在于重组菌超声破碎上清中;经SDS-PAGE鉴定柱层析300mmol/L咪唑洗脱的蛋白为高纯度r-HSP20;用该蛋白免疫获得的兔多克隆抗体效价为1∶12800,其抗体亚型IgG1及IgG2a含量分别为183.8mg/ml和21.4mg/ml;Western blot鉴定r-HSP20能被兔多克隆抗体识别。结论成功构建pET-22b-HSP20原核表达载体,获得高纯度r-HSP20蛋白。抗体分型检测证明r-HSP20具有高效诱导体液免疫应答和细胞免疫应答的免疫原性,并具有良好的免疫反应性。 展开更多
关键词 棘阿米巴 hsp20 原核表达载体 多克隆抗体制备 免疫原性鉴定
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细粒棘球蚴Eg HSP20蛋白基因的分子特征、表达及其反应原性研究
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作者 陈英 乔军 +6 位作者 孟庆玲 钟文强 刘田莉 贡莎莎 王熙凤 黄运福 才学鹏 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第7期1547-1552,共6页
【目的】本文构建细粒棘球蚴(Echinococcus granulosus,Eg)HSP20基因的重组表达载体并表达、纯化重组蛋白,研究其反应原性。【方法】根据Gen Bank中Eg HSP20蛋白基因c DNA序列设计特异性引物,以细粒棘球蚴Eg头节总RNA为模板,进行RTPCR扩... 【目的】本文构建细粒棘球蚴(Echinococcus granulosus,Eg)HSP20基因的重组表达载体并表达、纯化重组蛋白,研究其反应原性。【方法】根据Gen Bank中Eg HSP20蛋白基因c DNA序列设计特异性引物,以细粒棘球蚴Eg头节总RNA为模板,进行RTPCR扩增,将PCR产物克隆至p MD19-T载体,测序验证后,将Eg HSP20抗原基因亚克隆至表达载体p ET-32a中,再将其转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞内,用IPTG进行诱导表达,并对表达的蛋白进行纯化及反应原性分析。【结果】Eg HSP20 c DNA全长945个核苷酸,编码314个氨基酸。该多肽含有1个N端糖基化位点,1个CAMP磷酸化位点,5个PKC磷酸化位点,10个CKⅡ磷酸化位点;抗原表位区集中在39~53位和120~168位。SDS-PAGE检测显示,重组菌可表达分子量为51 k Da的重组蛋白;Western blot结果显示,表达的重组蛋白Eg HSP20抗原能与Eg阳性血清发生特异性反应。【结论】证实Eg HSP20蛋白具有较强的反应原性,为进一步利用Eg HSP20重组蛋白作为Eg感染诊断中候选标识分子奠定了前期基础。 展开更多
关键词 细粒棘球蚴 EG hsp20抗原基因 克隆 表达 反应原性
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中药火麻仁基原植物Hsp20基因家族鉴定及表达分析 被引量:6
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作者 怀浩 董林林 +5 位作者 宁康 侯聪 代飞 刘霞 汪鋆植 陈士林 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期1203-1215,共13页
Hsp20 (heat shock protein 20)基因家族在植物生长发育和胁迫响应中发挥着重要的作用。为探究大麻(Cannabis sativa L.) Hsp20 (CsHsp20)基因的功能,本研究在全基因组和转录组水平上采用生物信息学手段对CsHsp20基因家族进行系统性研... Hsp20 (heat shock protein 20)基因家族在植物生长发育和胁迫响应中发挥着重要的作用。为探究大麻(Cannabis sativa L.) Hsp20 (CsHsp20)基因的功能,本研究在全基因组和转录组水平上采用生物信息学手段对CsHsp20基因家族进行系统性研究。结果表明,在大麻中鉴定到35个CsHsp20基因家族成员(CsHsp20-1~CsHsp20-35),分布在9条染色体上,属于10个亚家族,同一亚家族成员之间蛋白基序分布相似。多种激素和胁迫响应顺式作用元件存在于CsHsp20基因的启动子区,表明其可参与植物的生长发育和多种胁迫响应。蛋白互作分析表明CsHsp20蛋白与Hsp家族其他成员之间存在互作关系且受转录因子Hop和HSFA2的调控。转录组数据表明在大麻的不同组织器官及不同发育时期中CsHsp20基因家族成员表达水平存在差异,主要在火麻仁及其成熟期高表达,表明CsHsp20家族成员可调控火麻仁的生长发育。本研究为CsHsp20基因家族功能研究和火麻仁基原植物的定向培育奠定了基础。 展开更多
关键词 火麻仁 大麻 hsp20基因家族 生长发育 表达模式
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沙鼠前脑缺血再灌注后脑组织HSP20和EPO的表达变化及相关性 被引量:2
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作者 周洁 王建明 +4 位作者 王岚 曾晓云 熊玲 罗志秀 刘正芳 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第13期2519-2522,共4页
目的观察沙鼠前脑短暂性缺血再灌注后,HSP20与EPO在脑组织中的表达,探讨二者的相关性和保护机制,并评估它们的临床应用前景。方法 45只健康雄性蒙古沙鼠随机分为三组:正常对照组、假手术组和脑缺血再灌注组,其中假手术组和脑缺血再灌注... 目的观察沙鼠前脑短暂性缺血再灌注后,HSP20与EPO在脑组织中的表达,探讨二者的相关性和保护机制,并评估它们的临床应用前景。方法 45只健康雄性蒙古沙鼠随机分为三组:正常对照组、假手术组和脑缺血再灌注组,其中假手术组和脑缺血再灌注组又分为4个亚组:6 h组,1 d组,3 d组和7 d组。予以夹闭双侧颈总动脉并再通造成脑缺血再灌注模型。HE染色观察沙鼠前脑组织的病理变化。免疫组织化学染色观察HSP20和EPO的表达情况。结果 HE染色:正常对照组和各假手术组的沙鼠前脑组织形态结构没有明显的变化;脑缺血再灌注组根据时间点的不同可见胶质细胞肥大、增生,细胞和细胞间质水肿,神经元坏死。免疫组化染色:与对照组及假手术组相比,缺血再灌注损伤后HSP20及EPO的表达均上调,于第三天达到高峰,后开始下降至7 d时仍高于正常组和假手术组(P<0.05),且两者的表达趋势相同呈正相关(r=0.777,P<0.05)。结论缺血再灌注的沙鼠脑组织中HSP20及EPO表达均升高并可能减轻缺血再灌注所导致的脑损伤。 展开更多
关键词 脑缺血再灌注 hsp20 EPO 蒙古沙鼠
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拟南芥Hsp20基因家族的特征及其在干旱和盐胁迫下的表达分析 被引量:5
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作者 黄思沛 黄德娅 +5 位作者 付连郭 秦余 唐婕 吕思慧 廖海 周嘉裕 《生命科学研究》 CAS 2023年第2期162-169,共8页
热激蛋白20(heat shock protein 20,Hsp20)是植物响应非生物胁迫时广泛合成的一类功能蛋白质,参与植物的抗逆过程。借助拟南芥基因组数据库,利用生物信息学方法分析Hsp20基因家族。HMMER搜索和蛋白质的理化性质分析表明,拟南芥至少含有3... 热激蛋白20(heat shock protein 20,Hsp20)是植物响应非生物胁迫时广泛合成的一类功能蛋白质,参与植物的抗逆过程。借助拟南芥基因组数据库,利用生物信息学方法分析Hsp20基因家族。HMMER搜索和蛋白质的理化性质分析表明,拟南芥至少含有30个Hsp20基因,其编码蛋白的分子质量为14.6~41.4 kD,且均含有α-晶状体蛋白结构域。系统发育分析表明,在30个拟南芥Hsp20成员中,22个归属于12个不同的亚家族,其余8个归于未知分类,可能为Hsp20类蛋白质(Hsp20-like)。共线性分析表明,片段复制与串联复制是Hsp20成员的主要扩增事件,大部分Hsp20不含或只含1个内含子。MEME分析结果表明,基序1、2、9是Hsp20共有的保守基序。转录组分析提示,15个Hsp20的表达水平在干旱和(或)盐胁迫后出现了上调,该结果得到了qRT-PCR实验的验证。以上结果为人们进一步探究Hsp20基因的生物学功能提供了理论依据。 展开更多
关键词 拟南芥 热激蛋白20(hsp20) 基因家族 生物信息学分析 非生物胁迫 表达分析
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双芽巴贝斯虫Hsp20一新基因型的发现及生物学特性分析 被引量:1
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作者 曲志强 张亮 +10 位作者 罗金 陈泽 任巧云 刘文阁 倪军 许肖枫 吴泽功 罗建勋 殷宏 孙晓林 刘光远 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期567-573,共7页
为了鉴定分离自甘肃永靖的1株双芽巴贝斯虫Hsp20基因型为一新基因型,参考双芽巴贝斯虫Hsp20核苷酸序列,设计特异性引物。对其进行扩增,利用生物信息学方法对其进行比对分析。结果显示,扩增获得了700 bp的核苷酸片段。与GenBank中公布的1... 为了鉴定分离自甘肃永靖的1株双芽巴贝斯虫Hsp20基因型为一新基因型,参考双芽巴贝斯虫Hsp20核苷酸序列,设计特异性引物。对其进行扩增,利用生物信息学方法对其进行比对分析。结果显示,扩增获得了700 bp的核苷酸片段。与GenBank中公布的18种不同物种的氨基酸序列构建遗传发育树,结果表明本实验获得的双芽巴贝斯虫与美国株和中国新疆株的亲缘关系最近。对其氨基酸序列进行比对分析,发现在第31~85位点存在冗余,与公布的Hsp20氨基酸序列存在明显的差异。通过同源建模分析,发现该冗余致使Hsp20蛋白在第7号位形成1个环形结构,从而引起了第3号位的拉伸。通过生物信息学分析得出,获得的双芽巴贝斯虫甘肃株的Hsp20基因是一新基因型。该基因型的存在为更加准确诊断双芽巴贝斯虫病提供了依据。 展开更多
关键词 双芽巴贝斯虫 hsp20 基因型 生物学特征
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玉米种胚HSP20基因对人工老化处理的响应 被引量:7
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作者 邢芦蔓 吕伟增 +3 位作者 雷薇 梁雨欢 卢洋 陈军营 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1733-1742,共10页
以玉米杂交种"郑单958"为材料,采用高温(45°C)高湿(100%相对湿度)对玉米种子进行人工老化处理,并用转录组技术,研究植物HSP20基因对种子人工老化处理的响应,旨在为揭示种子衰老的分子机制提供依据。结果表明,随着老化时... 以玉米杂交种"郑单958"为材料,采用高温(45°C)高湿(100%相对湿度)对玉米种子进行人工老化处理,并用转录组技术,研究植物HSP20基因对种子人工老化处理的响应,旨在为揭示种子衰老的分子机制提供依据。结果表明,随着老化时间的延长,种子活力和种胚内过氧化氢酶的活性均表现下降趋势;过氧化氢含量在老化第3天达到最大值,随后下降;丙二醛含量逐渐升高;转录组检测表明,种子老化过程中差异显著的HSP20基因有25个,这些基因编码的HSP20蛋白主要被定位在细胞核、线粒体、以及叶绿体上,其序列中均含有ACD保守序列(RVDWRETPDAHEIVVDVP GMRREDLRIEVEDNRVLRVSGERRRAEERKGDHWHREERSYGRFWRRFRLPENADLDSVAASLDSGVLTVRFRK)。该序列中含有较多的Arg (11.2%)、Lys(7.2%)、Pro(4.2%)、Thr(3.9%)等氨基酸,老化过程中积累的ROS可能氧化这些氨基酸,导致HSP20结构破坏、功能丧失。利用qRT-PCR技术对挑选的编码细胞质、叶绿体和线粒体HSP20的基因的表达模式分析显示,随着老化程度的加深,2个编码细胞质HSP20的基因上调表达,另外两个编码叶绿体和线粒体HSP20基因的表达量在老化第3天达最大值,随后下降。推测HSP20基因对种子老化有重要作用,HSP20蛋白的ACD结构域中Arg、Lys等氨基酸的靶向氧化可能是种子衰老的主要原因之一。 展开更多
关键词 玉米 种胚 种子老化 差异表达基因 hsp20
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不同浓度白藜芦醇对脑缺血-再灌注大鼠HSP20表达的影响 被引量:1
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作者 张莉峰 滕军放 +1 位作者 袁学谦 朱太卿 《中国急救医学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期653-658,F0003,共7页
目的探讨不同浓度白藜芦醇对缺血-再灌注脑损伤大鼠神经功能损伤及热休克蛋白20(HSP20)表达的影响。方法将150只健康的成年雄性SD大鼠随机分成五组:假手术组,模型组(I/R组),小剂量白藜芦醇(2.5mS/kg)组,中剂量白藜芦醇(5m... 目的探讨不同浓度白藜芦醇对缺血-再灌注脑损伤大鼠神经功能损伤及热休克蛋白20(HSP20)表达的影响。方法将150只健康的成年雄性SD大鼠随机分成五组:假手术组,模型组(I/R组),小剂量白藜芦醇(2.5mS/kg)组,中剂量白藜芦醇(5mS/kg)组,大剂量白藜芦醇(10mS/kg)组,每组30只,制作脑缺血一再灌注大鼠模型,灌注前20min给予生理盐水或不同浓度白藜芦醇腹腔注射,术后6h、24h、48h、72h、7d时间节点分别评定神经功能缺损评分。应用四氮唑红染色(TFC)脑组织后计算脑梗死病灶体积并比较五组的差异;分别应用免疫组织化学染色和Western blot检测缺血脑组织周边区组织的HSP20表达量并比较五组的差异。结果①各组神经功能缺损评分比较:各模型组大鼠在缺血-再灌注后各时间节点均有神经功能缺损,同时白藜芦醇剂量越大,大鼠的神经功能缺损改善越明显;②各组脑梗死病灶体积比较:不同浓度白藜芦醇干预各组大鼠的脑梗死体积显著减少(P〈0.05),且白藜芦醇剂量越大,大鼠的脑梗死体积减少程度越大,呈显著剂量依赖性;③在各个时间点,各组大鼠缺血周边区脑组织的HSP20阳性细胞数为:大剂量白藜芦醇组〉中剂量白藜芦醇组〉小剂量白藜芦醇组〉模型组〉假手术组(P〈0.05),并且白藜芦醇剂量越大,大鼠的HSP20蛋白表达量越多。结论①缺血一再灌注脑损伤过程中,白藜芦醇能有效地保护大鼠脑神经细胞,减少脑梗死体积,改善神经功能缺损评分,这一作用可能是通过促进HSP20表达来完成的;②白藜芦醇对脑缺血一再灌注损伤的保护作用与剂量相关,并且呈现显著剂量依赖性。 展开更多
关键词 白藜芦醇 脑缺血-再灌注损伤 热休克蛋白20(hsp20)
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圆齿野鸦椿Hsp20基因家族鉴定及功能分析 被引量:2
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作者 李一凡 丁乐 +3 位作者 陈淑颖 曾姣艳 蔡丽娟 邹双全 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2023年第2期211-221,共11页
为了探究圆齿野鸦椿Hsp20基因在强光、高温胁迫中的作用,利用生物信息学的方法对圆齿野鸦椿Hsp20基因家族进行全基因组鉴定,并从理化性质、系统进化、保守基序及基因结构、染色体定位及物种间共线性、顺式作用元件预测、蛋白网络互作和... 为了探究圆齿野鸦椿Hsp20基因在强光、高温胁迫中的作用,利用生物信息学的方法对圆齿野鸦椿Hsp20基因家族进行全基因组鉴定,并从理化性质、系统进化、保守基序及基因结构、染色体定位及物种间共线性、顺式作用元件预测、蛋白网络互作和表达模式等方面进行分析.结果表明:圆齿野鸦椿含有32个Hsp20基因,分布在9条染色体中,分为5个大家族和12个亚家族,多数基因有1个内含子.EkHsp20家族的主要扩增方式为片段复制.圆齿野鸦椿含有多个非生物胁迫响应元件和激素类响应元件,如光响应元件、脱落酸响应元件等.表达量分析结果表明,圆齿野鸦椿Hsp20基因与Hsp101基因有蛋白网络互作关系.ER家族是一类提高植株的抗冷性的基因,圆齿野鸦椿基因组中缺失ER基因家族,这可能与其不耐寒相关.根据高温、持续强光导致叶片蜷缩的现象,结合EkHsp20-04、EkHsp20-20、EkHsp20-25在系统发育树中与拟南芥Hsp17.6b聚合在一起、与拟南芥Hsp101呈现蛋白互作关系,且均为CⅠ家族成员,推测EkHsp20-20、EkHsp20-04、EkHsp20-25可能是促使圆齿野鸦椿在高温条件下产生自我防御行为的主要基因. 展开更多
关键词 圆齿野鸦椿 hsp20 生物信息学 基因家族
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牛双芽巴贝斯虫GST-HSP20(exon)融合蛋白间接ELISA检测方法的建立 被引量:8
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作者 简子健 马素贞 +3 位作者 孙其喆 沈炯玉 苗中秋 吕伟 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期980-985,共6页
【目的与方法】以纯化的牛双芽巴贝斯虫GST-HSP20(exons)融合蛋白作为检测抗原,通过优化ELISA反应条件,建立了检测牛双芽巴贝斯虫血清特异性抗体的新型间接ELISA方法。【结果】方阵试验确定的GST-HSP20抗原的最适包被浓度为5μg/mL,血... 【目的与方法】以纯化的牛双芽巴贝斯虫GST-HSP20(exons)融合蛋白作为检测抗原,通过优化ELISA反应条件,建立了检测牛双芽巴贝斯虫血清特异性抗体的新型间接ELISA方法。【结果】方阵试验确定的GST-HSP20抗原的最适包被浓度为5μg/mL,血清最佳稀释倍数为40倍,ELISA阳性反应的临界值为OD450≥0.292,批内和批间重复试验的变异系数均小于10%。HSP20间接ELISA方法能排除GST的干扰,与其它梨形虫病无交叉反应,与巢式PCR检测方法的阳性符合率为96%。【结论】所建立的ELSIA检测法重复性好、特异性强、灵敏度高。这是国内首次利用重组蛋白建立的牛双芽巴贝斯病血清学诊断方法,为大规模地进行牛巴贝斯虫病的流行病学调查和血清学诊断提供有效的技术手段。 展开更多
关键词 牛双芽巴贝斯虫 热休克蛋白20 重组抗原间接ELISA 比对
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