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基于PacBio平台的扇穗茅全长转录组测序及热激转录因子家族(HSFs)分析 被引量:1
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作者 曲荣举 刘玉萍 +7 位作者 苏旭 富贵 靳佳瑞 杨倩 张朋辉 余明君 孙成林 毛轩睿 《草地学报》 北大核心 2025年第2期370-381,共12页
为了明晰扇穗茅(Littledalea racemosa)的转录组特征和热激转录因子家族(HSFs)的功能与系统位置,本研究基于PacBio平台对扇穗茅全长转录组进行了测序和生物信息学分析。结果表明:测序获得高质量的Unigenes 62016条,平均长度为2752 bp,N5... 为了明晰扇穗茅(Littledalea racemosa)的转录组特征和热激转录因子家族(HSFs)的功能与系统位置,本研究基于PacBio平台对扇穗茅全长转录组进行了测序和生物信息学分析。结果表明:测序获得高质量的Unigenes 62016条,平均长度为2752 bp,N50长度为2971 bp,蛋白编码区序列(CDS)48127个,简单重复序列(SSR)8858个;扇穗茅Unigenes在5大公共数据库中的注释量分别为27566(NR)、17961(GO)、18300(KOG)、17381(KEGG)和23737(SwissProt),有7663条Unigenes在5个数据库中均得到注释;扇穗茅转录本鉴定到1165个转录因子,隶属于48个转录因子家族,大多与高原极端环境适应有关;其中包含17个热激转录因子(HSF),大部分位于细胞核,为亲水蛋白,cDNA常包含5~10个保守结构域;系统发育研究表明扇穗茅和拟南芥(Arabidopsis thaliana)HSF转录因子聚为9个分支(CladeA-I),扇穗茅的11个HSF与HSFA2聚为一支,彼此具有较近的亲缘关系,可能具有相似的功能。本研究丰富了扇穗茅属物种的遗传信息,为后续关键功能基因的挖掘提供了理论依据。 展开更多
关键词 扇穗茅 全长转录组 功能注释 转录因子 hsfs
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糖尿病与肥厚型心肌病的因果关系:GWAS数据库信息分析
2
作者 赵迎新 郎彤 +1 位作者 孟令丙 高玉霞 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第11期2933-2948,共16页
背景:糖尿病与肥厚型心肌病相互影响,糖尿病患者心血管并发症风险显著升高,但两者之间的因果关系及分子机制尚不明确。目的:利用孟德尔随机化方法,结合GWAS和GEO数据库数据,评估糖尿病对肥厚型心肌病的因果效应,通过生物信息学分析筛选... 背景:糖尿病与肥厚型心肌病相互影响,糖尿病患者心血管并发症风险显著升高,但两者之间的因果关系及分子机制尚不明确。目的:利用孟德尔随机化方法,结合GWAS和GEO数据库数据,评估糖尿病对肥厚型心肌病的因果效应,通过生物信息学分析筛选关键调控因子。方法:从最新的全基因组关联研究(GWAS,由美国国家人类基因组研究所和欧洲生物信息研究所合作建立)数据库中获取162个与糖尿病相关的单核苷酸多态性,这些数据来自24659例糖尿病患者和459939名对照参与者,获取肥厚型心肌病数据,包括507例肥厚型心肌病病例和489220名对照参与者,进行两样本孟德尔随机化分析,使用逆方差加权法评估糖尿病与肥厚型心肌病之间的因果关系。下载基因表达数据库(GEO)中的糖尿病数据集GSE184050和肥厚型心肌病数据集GSE160997,利用WGCNA探讨与糖尿病和肥厚型心肌病相关的重要模块及核心基因。通过GSEA探讨核心基因相关的富集术语和通路。将核心基因输入比较毒理学基因组数据库(CTD)网站以确定与核心基因相关的疾病。采用多种算法探讨HSF1在糖尿病和肥厚型心肌病中的作用。结果与结论:①以糖尿病为暴露因子,提取了160个单核苷酸多态性的分析结果,采用逆方差加权、MR-Egger和加权中位数回归方法评估遗传预测的糖尿病与肥厚型心肌病之间的因果关系,MR-Egger检验显示糖尿病与肥厚型心肌病之间存在显著因果关联,确定HSF1为糖尿病与肥厚型心肌病因果关系的核心生物标志物(P=0.01802898),加权中位数和逆方差加权法也提供了一致趋势。通过GEO数据库的数据验证确认了HSF1是同时影响糖尿病和肥厚型心肌病的潜在核心生物标志物。HSF1在糖尿病中高表达、在肥厚型心肌病中低表达。通过逐一移除单核苷酸多态性并重复孟德尔随机化分析的敏感性分析显示,没有单一单核苷酸多态性显著影响因果关系估计。将HSF1输入CTD网站以识别与核心基因相关的疾病,结果显示HSF1与糖尿病、2型糖尿病、肥厚型心肌病、心脏病、高血压、代谢紊乱和炎症等相关联。②研究主要基于国际大型数据库(如欧洲人群的GWAS和GEO表达谱数据),采用遗传工具变量进行因果推断,具有较强的科学性。中国生物医学研究应加强本土多组学数据的积累和整合,借助类似方法探索适用于中国人群的精准预防和治疗靶点。 展开更多
关键词 糖尿病 肥厚型心肌病 孟德尔随机化 HSF1 遗传学 差异表达基因
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积雪草提取物体外舒缓和修复作用研究
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作者 黄晓燕 胡敬 +3 位作者 耿长安 张雪梅 李天泽 陈纪军 《中国化妆品科学》 2025年第1期31-37,共7页
以研究积雪草提取物对皮肤的舒缓和修复作用为目的,通过体外清除2,2-二苯基-1-苦酰基(DPPH)、对H_(2)O_(2)损伤的人皮肤成纤维细胞(HSF)和人永生化表皮细胞(HaCaT)的保护作用和促HaCaT细胞分泌Ⅰ型胶原蛋白(ColⅠ)和透明质酸(HA)活性,... 以研究积雪草提取物对皮肤的舒缓和修复作用为目的,通过体外清除2,2-二苯基-1-苦酰基(DPPH)、对H_(2)O_(2)损伤的人皮肤成纤维细胞(HSF)和人永生化表皮细胞(HaCaT)的保护作用和促HaCaT细胞分泌Ⅰ型胶原蛋白(ColⅠ)和透明质酸(HA)活性,评价其体外活性。结果表明,积雪草提取物在200.0μg/mL浓度时,对两个皮肤细胞安全无毒性,对DPPH自由基清除率为21.8%;25.0μg/mL浓度时,对H_(2)O_(2)损伤的HSF和HaCaT细胞修复率分别为34.9%和23.5%,对ColⅠ分泌的促进率为29.5%;对HA分泌促进率为20.0%。表明积雪草提取物兼具代表性成分(积雪草酸、羟基积雪草酸、积雪草苷、羟基积雪草苷)活性,在体外能有效抗氧化、促进细胞分泌细胞外基质,具有效舒缓和修复皮肤功效。 展开更多
关键词 积雪草 舒缓 修复 皮肤成纤维细胞(HSF) 人永生化表皮细胞(HaCaT)
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花苜蓿HSF基因家族鉴定及其对干旱胁迫的响应分析
4
作者 贺诗淼 李彭真 +2 位作者 王召明 刘志鹏 周强 《中国草地学报》 北大核心 2025年第11期1-14,共14页
HSF转录因子(Heat shock transcription factors)被称为热休克转录因子或热激转录因子,其在植物生长发育过程中具有重要作用,也参与生物和非生物胁迫响应。本研究基于花苜蓿(Medicago ruthenica)基因组数据,进行MruHSF基因鉴定和生物信... HSF转录因子(Heat shock transcription factors)被称为热休克转录因子或热激转录因子,其在植物生长发育过程中具有重要作用,也参与生物和非生物胁迫响应。本研究基于花苜蓿(Medicago ruthenica)基因组数据,进行MruHSF基因鉴定和生物信息学分析,并通过转录组数据和荧光定量PCR综合分析MruHSF基因在干旱胁迫下的表达模式,初步探讨MruHSF基因在干旱胁迫中的作用。结果表明,MruHSF基因家族共27个成员,基因编码的氨基酸数量在97~505 aa之间,等电点范围4.64~8.72,分子量范围10998.3~55296.45 Da。该基因家族成员中,有3个基因未装配到染色体上,其余基因分布在8条染色体上。系统发育分析显示,MruHSF基因可分为3个进化分支。保守基序分析显示,除MruHSF02、MruHSF03和MruHSF27蛋白外,其余MruHSF均同时含有Motif 1、2、4,Motif 1、2、4在花苜蓿HSF蛋白序列中高度保守。在MruHSF基因的启动子区域,鉴定出多种与激素响应、光响应及非生物胁迫相关的顺式作用元件。表达模式分析结果表明,MruHSF01、MruHSF08、MruHSF13、MruHSF16和MruHSF22在干旱胁迫下显著差异表达,可能在花苜蓿的干旱响应机制中具有重要作用。 展开更多
关键词 花苜蓿 HSF基因家族 干旱胁迫 基因表达分析
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粗毛纤孔菌乙酸乙酯提取物及活性成分的抗氧化作用机理
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作者 吕雪 包海鹰 +1 位作者 李玉 霍慧敏 《菌物学报》 北大核心 2025年第9期138-162,共25页
本文对粗毛纤孔菌乙酸乙酯提取物(EAE)及其主要成分(组分Fr1-Fr5和hispidin)体外抗氧化作用和保护人皮肤成纤维细胞(HSF)氧化应激损伤效果及机制进行研究。通过UPLC-MS检测、体外抗氧化实验、网络药理学等实验方法,检测EAE中多酚类化合... 本文对粗毛纤孔菌乙酸乙酯提取物(EAE)及其主要成分(组分Fr1-Fr5和hispidin)体外抗氧化作用和保护人皮肤成纤维细胞(HSF)氧化应激损伤效果及机制进行研究。通过UPLC-MS检测、体外抗氧化实验、网络药理学等实验方法,检测EAE中多酚类化合物组成、EAE、Fr1-Fr5和hispidin还原能力和自由基清除能力、hispidin治疗氧化应激疾病潜在靶点和通路。研究表明,EAE中含有多种多酚类化合物,且hispidin是其中主要的多酚化合物;EAE、Fr1-Fr5和hispidin均有一定的还原能力和自由基清除能力,且抗氧化能力表现为EAE>Fr1-Fr5>hispidin;网络药理学分析推测hispidin治疗氧化应激疾病的核心靶点有9个,主要富集于MAPK信号通路等多条信号通路。建立HSF细胞氧化应激损伤模型,用多种方法检测细胞存活率、活性氧(ROS)水平、胶原蛋白水平及相关蛋白和相对信使RNA(mRNA)表达。结果表明,200μg/mL的EAE、Fr4和hispidin能提高氧化应激损伤下HSF的存活率及抗氧化能力,降低丙二醛(MDA)含量和ROS水平,促进I型胶原蛋白(COLI)合成并可能通过调节MAPK通路中的MMPs/TIMPs系统抑制其降解。其中EAE对氧化损伤的HSF有显著保护作用。总之,本研究验证了粗毛纤孔菌乙酸乙酯提取物及其活性成分具有较强的抗氧化能力,且能够通过MAPK信号通路作用于多个靶点来改善由于氧化应激引起的损伤。为粗毛纤孔菌在抗氧化领域中的应用提供依据。 展开更多
关键词 粗毛纤孔菌 抗氧化活性 人皮肤成纤维细胞(HSF) 氧化应激
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IGF-1对HSF细胞分泌近视相关因子的影响及机制探索 被引量:2
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作者 晁荣荣 丁芝祥 +1 位作者 范晶 郑柳 《国际眼科杂志》 2025年第2期198-205,共8页
目的:探讨胰岛素样生长因子-1(IGF-1)对人巩膜成纤维细胞(HSF)分泌转化生长因子-β2(TGF-β2)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)的影响及其机制。方法:分别使用IGF-1和PI3K/AKT通路抑制剂LY294002培养细胞,采用CCK-... 目的:探讨胰岛素样生长因子-1(IGF-1)对人巩膜成纤维细胞(HSF)分泌转化生长因子-β2(TGF-β2)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)的影响及其机制。方法:分别使用IGF-1和PI3K/AKT通路抑制剂LY294002培养细胞,采用CCK-8法检测细胞活力,确定药物的最佳作用浓度和时间。采用细胞划痕法观察细胞迁移活性。为明确IGF-1对HSF细胞的影响以及PI3K/AKT通路在其中的调控作用,将细胞分为对照组(不含药物)、IGF-1(80μg/L)组、IGF-1+LY294002(80μg/L+5 mmol/L)组、LY294002(5 mmol/L)组,培养24 h;Western blot检测细胞中TGF-β2、MMP-2、HIF-1α、PI3K、AKT的蛋白表达水平;细胞免疫荧光检测TGF-β2、MMP-2、HIF-1α的荧光表达。结果:CCK-8结果显示不同浓度IGF-1培养的细胞活力以80μg/L IGF-1组最高(均P<0.05),且在不同培养时间下,以24 h时80μg/L IGF-1组细胞活力最高,因此确定后续实验中IGF-1的浓度为80μg/L,作用时间为24 h。不同浓度LY294002培养的细胞活力从6 h起逐渐降低(均P<0.05),根据IC50值确定后续实验中LY294002浓度为5 mmol/L,作用时间为24 h。细胞划痕结果显示,与对照组相比40、80μg/L IGF-1组细胞迁移率均升高(均P<0.05)。与对照组相比2.5、5 mmol/L LY294002组细胞迁移率均降低(均P<0.05)。Western blot结果显示,与对照组相比,IGF-1组细胞TGF-β2、MMP-2、HIF-1α、PI3K、AKT的蛋白表达量均升高,LY294002组的蛋白表达量均下降(均P<0.05);与IGF-1组比较,IGF-1+LY294002组的TGF-β2、MMP-2、HIF-1α、PI3K、AKT蛋白表达量表达均下降(均P<0.05)。细胞免疫荧光结果显示,与对照组相比,IGF-1组细胞TGF-β2、MMP-2、HIF-1α的荧光表达均升高,LY294002组的荧光表达均下降(均P<0.05);与IGF-1组比较,IGF-1+LY294002组的TGF-β2、MMP-2、HIF-1α荧光表达均显著下降(均P<0.05)。结论:IGF-1促进了人HSF细胞增殖与迁移;IGF-1可能通过PI3K/AKT信号通路上调人HSF细胞中TGF-β2、MMP-2、HIF-1α的表达,参与近视的发生与发展。 展开更多
关键词 近视 人巩膜成纤维细胞(HSF) 胰岛素生长因子-1(IGF-1) 转化生长因子-β2(TGF-β2) 基质金属蛋白酶-2(MMP-2) 缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)
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火龙果热激转录因子HSF基因家族鉴定及生物信息学分析
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作者 邓健炜 孙清明 +1 位作者 申迎宾 李俊成 《福建农业学报》 北大核心 2025年第3期280-290,共11页
【目的】探究火龙果(Selenicereus spp.)热激转录因子(heat shock transcription factors, HSF)基因家族的生物学特性,为探明火龙果抵抗高温胁迫反应机制提供依据。【方法】运用生物信息学手段,对火龙果HSF基因家族进行理化性质、Motif... 【目的】探究火龙果(Selenicereus spp.)热激转录因子(heat shock transcription factors, HSF)基因家族的生物学特性,为探明火龙果抵抗高温胁迫反应机制提供依据。【方法】运用生物信息学手段,对火龙果HSF基因家族进行理化性质、Motif分析、基因结构分析、基因结构域的预测、染色体定位、启动子分析和系统进化树分析等。并通过转录组数据和qPCR技术分析基因家族各成员在逆境胁迫的表达情况。【结果】从火龙果基因组中鉴定出13个HSF基因家族成员。理化性质分析结果表明,其编码的热转录因子均为不稳定蛋白;基因结构分析显示,火龙果HSF基因家族大部分成员仅含一个内含子;系统进化树分析结果表明,火龙果HSF基因家族根据亲缘关系分为4类,Motif分析结果也从侧面印证同一分支的基因具有相似或相同的保守基序;HSF基因家族成员随机分布在火龙果的6条染色体中;其启动子中包含激素响应、逆境胁迫、植物生长发育调控和光响应等多种元件;基因结构域预测分析发现,火龙果HSF基因家族成员均含有特定的HSF结构域。基因表达分析表明,火龙果HSF基因的表达具有较强的时间与空间特异性;其中仅5个成员在枝条表达且表达趋势不同,HU05G00210.1和HU05G01887.1的表达量在24 h和48 h均显著升高,HU02G02398.1和HU10G01257.1在经过48 h高温处理后表达量才显著升高,而HU04G00163.1表达量则没有显著变化,体现了HSF基因对热胁迫的响应。【结论】初步鉴定并验证了HSF基因家族成员参与了火龙果热胁迫反应过程,为进一步探究HSF基因家族成员在火龙果高温响应机制提供参考。 展开更多
关键词 火龙果 HSF基因家族 热激转录因子 生物信息学
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苋菜Hsf家族基因全基因组鉴定及其在高温胁迫下的表达分析
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作者 张爱冬 田梓萌 +3 位作者 肖凯 颜丽美 查丁石 吴雪霞 《安徽农业科学》 2025年第21期91-99,共9页
以苋菜全基因组数据为基础,共鉴定出21个Hsf基因家族成员,分布在14条染色体上,其氨基酸残基数256~535个,分子量为29.71~59.73 kD,等电点为4.69~9.22,19个酸性蛋白,2个碱性蛋白,20个亲水性不稳定蛋白,1个亲水性稳定蛋白,定位于细胞核上。... 以苋菜全基因组数据为基础,共鉴定出21个Hsf基因家族成员,分布在14条染色体上,其氨基酸残基数256~535个,分子量为29.71~59.73 kD,等电点为4.69~9.22,19个酸性蛋白,2个碱性蛋白,20个亲水性不稳定蛋白,1个亲水性稳定蛋白,定位于细胞核上。AtrHsf基因家族成员结构较为保守,启动子区具有大量环境及激素响应元件,成员间具有明显的共线性。高温转录组数据表明,大部分AtrHsf基因受高温诱导,表现出不同的表达模式,qRT-PCR结果与转录组结果基本一致。该研究为苋菜高温胁迫下Hsf基因的调控机制分析奠定了基础,为耐高温种质资源创制及新品种选育提供了重要基因资源和理论基础。 展开更多
关键词 苋菜 Hsf基因家族 高温胁迫 表达分析
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向日葵热激转录因子基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析
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作者 宋慧芳 薛宏宇 +3 位作者 王茜 卢俊洁 李晨雨 刘阿克 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 北大核心 2025年第2期303-317,共15页
热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF)广泛分布于植物中,参与多种转录调控途径,特别是热应激信号传导和其他应激反应。本研究利用生物信息学方法研究HSF基因家族,对其系统发育关系、基因结构和表达模式等进行了分析。结... 热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF)广泛分布于植物中,参与多种转录调控途径,特别是热应激信号传导和其他应激反应。本研究利用生物信息学方法研究HSF基因家族,对其系统发育关系、基因结构和表达模式等进行了分析。结果表明:在向日葵中共鉴定到39个HSF家族成员(HaHSF),并将其分为3个组、8个亚家族;全基因组重复和转座重复是向日葵HSF家族扩增的主要原因。由于功能约束强烈,大多重复基因经历了纯化选择。转录组分析明确了HaHSF基因在不同组织中和激素或非生物胁迫条件下的表达模式。HaHSF12、HaHSF22、HaHSF27和HaHSF33基因能响应脱落酸、水杨酸等外源植物激素;而HaHSF17、HaHSF18和HaHSF33基因可能参与向日葵幼苗的多种非生物抗逆性。高温胁迫下基因的共表达网络分析发现,HaHSF23、HaHSF18和HaHSF29基因处于网络的核心,与其共表达的基因主要参与响应高温、响应活性氧、促分裂原活化的蛋白质激酶信号通路以及次生代谢物生物合成等功能。通过对向日葵HSF基因家族的系统研究,可为后期向日葵HSF基因功能和分子育种研究提供参考。 展开更多
关键词 向日葵 HSF基因家族 系统进化分析 基因重复 基因表达
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甜樱桃HSF基因家族的鉴定及温度胁迫下表达模式分析
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作者 王雨青 侯黔东 +2 位作者 陈发利 乔光 文晓鹏 《华中农业大学学报》 北大核心 2025年第6期195-209,共15页
为探究甜樱桃热休克转录因子(heat shock transcription factors,HSF)在非生物胁迫中的功能,对甜樱桃HSF基因家族成员进行全基因组特征分析,利用qRT-PCR技术分析了HSF基因家族成员在甜樱桃不同器官/组织中的表达谱,以及在高低温胁迫下... 为探究甜樱桃热休克转录因子(heat shock transcription factors,HSF)在非生物胁迫中的功能,对甜樱桃HSF基因家族成员进行全基因组特征分析,利用qRT-PCR技术分析了HSF基因家族成员在甜樱桃不同器官/组织中的表达谱,以及在高低温胁迫下的应答情况。结果显示,甜樱桃基因组中共有17个HSF,根据在染色体上的位置,依次命名为PavHSF1~PavHSF17,所有成员均为亲水蛋白,且均定位在细胞核中。除6号和8号染色体外,其余染色体均有分布。启动子区域中存在低温等胁迫响应元件,暗示PavHSF可能参与非生物胁迫响应。PavHSF在进化上分为3类和13个亚类,有2对共线性基因对;与单子叶植物的共线性基因对最少。组织特异性表达分析显示,PavHSF在休眠花芽及叶芽中表达量最高,PavHSF3在甜樱桃所有组织中均呈现较高表达水平。在高温胁迫下,PavHSF11、PavHSF13、PavHSF15、PavHSF16表达量显著升高,为主要响应高温的基因;低温胁迫时,PavHSF13、PavHSF15、PavHSF17表达量上升最显著,暗示PavHSF13和PavHSF15为温度胁迫响应转录因子。以上结果表明,PavHSF转录因子广泛参与了甜樱桃的生长发育,且与温度胁迫关系密切。 展开更多
关键词 甜樱桃 HSF转录因子 基因家族分析 高温胁迫 低温胁迫 表达分析
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植物热激蛋白HSP100/ClpB及其在提高植物抗热性和抗寒性中的应用 被引量:10
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作者 许声涛 孙文香 +1 位作者 田进平 王崇英 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2008年第4期804-810,共7页
文章介绍了植物热激蛋白HSP100/ClpB的表达及其与抗逆性的关系,以及HSP100/ClpB在提高植物抗逆性应用中的研究进展,并对这一领域未来可能的发展方向作了展望。
关键词 热激蛋白 HSP100/ClpB 热激转录因子(hsfs) 抗逆性
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大麦HSF基因家族成员的鉴定与表达分析
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作者 石明玉 冯浩 李柱刚 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第7期922-931,共10页
热激转录因子(heat shock transcription factor,HSF)家族与植物生长发育、胁迫响应密切相关。为了解大麦HSF家族成员的功能,本研究利用生物信息学方法在大麦全基因组水平进行HSF家族成员鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、进化关系和... 热激转录因子(heat shock transcription factor,HSF)家族与植物生长发育、胁迫响应密切相关。为了解大麦HSF家族成员的功能,本研究利用生物信息学方法在大麦全基因组水平进行HSF家族成员鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、进化关系和共线性关系及基因结构、启动子顺式作用元件、蛋白互作网络进行了分析。结果发现,在大麦中共鉴定到的29个HSF基因,HvHSF蛋白的分子量介于10.24~56.59 kDa之间,属于稳定性较差的亲水蛋白,均预测定位于细胞核。进化树将大麦HvHSF基因分为A、B、C三类;共线性分析显示,HvHSF5d和HvHSF7b为共线基因对。结构域和基因结构分析发现,亲缘关系较近的HvHSF具有相似的结构域和基因结构。启动子顺式作用元件分析发现,HvHSF启动子含有多种与生长发育以及抗逆相关的顺式作用元件。蛋白互作网络预测表明,HvHSF可能参与植物胁迫响应调节和H_(2)O_(2)的清除。通过大麦地下部盐、碱胁迫转录组测序结合qRT-PCR验证发现,HvHSF在盐、碱胁迫下表达存在差异。盐、碱胁迫下,HvHSF1a、HvHSF1b、HvHSF2a、HvHSF3c、HvHSF5b表达量均有所增加;HvHSF6在盐胁迫下表达量增加,碱胁迫下降低。综上,HSF家族成员可能参与大麦耐盐、碱调控。 展开更多
关键词 大麦 热激转录因子(HSF) 生物信息学 基因表达 系统进化发育
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植物热激转录因子在非生物逆境中的作用 被引量:29
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作者 翁锦周 洪月云 《分子植物育种》 CAS CSCD 2006年第1期88-94,共7页
非生物逆境通常导致生物体内蛋白变性。热激蛋白(Hsp)作为分子伴侣协助蛋白的重新折叠、稳定、胞内运输和降解,以阻止受损蛋白的累积,维护细胞内环境的稳定。而热激蛋白的表达是通过热激转录因子(Hsfs)结合于热激蛋白基因的启动子的热... 非生物逆境通常导致生物体内蛋白变性。热激蛋白(Hsp)作为分子伴侣协助蛋白的重新折叠、稳定、胞内运输和降解,以阻止受损蛋白的累积,维护细胞内环境的稳定。而热激蛋白的表达是通过热激转录因子(Hsfs)结合于热激蛋白基因的启动子的热激元件上(heatshockelement,HSE),以募集其它转录因子而形成转录复合体,促进热激蛋白基因的表达。植物热激转录因子比动物系统更为多样性。根据其基本的结构域,植物热激转录因子可分为三类:HsfA、HsfB、HsfC。A类Hsfs已有大量深入的研究和报道,特别是在番茄方面。HsfB和HsfC的作用尚不清楚。在其复杂的网络中,每一热激转录因子均有其独特的作用,取决于其表达模式、亚细胞定位、聚合化、活性及与其他蛋白的相互作用。在非生物逆境,尤其是热激逆境下,A类热激转录因子在调节热激蛋白的表达起着重要作用。番茄的HsfA1起着主导作用,其缺失无法被其他相近的Hsfs所取代,但在持续热逆境下,在HsfA1的配合下,HsfA2可成为主要调节因子。B类热激转录因子可作为A类Hsfs的阻抑蛋白。然而,基于对不同的单个突变体的研究,以及对酵母Hsf1致死突变体的拯救恢复,一些热激转录因子的作用又是丰余的。此外,热激蛋白也对热激转录因子起负反馈调节作用。 展开更多
关键词 热激转录因子(hsfs) 热激蛋白(Hsps) 热胁迫 非生物逆境
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Testis-specific protein HSF5 is essential for proper chromatin organization and transcriptional reprogramming to drive pachynema progression
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作者 Chun-Hai Luo Zhi-Wei Fan +10 位作者 Zi-Qi Yu Da-Lin Liu Hao-Ran Xu Shu-Min Zhou Xuan-Jing Zhu Han-Chao Liu Li-Fu Shao Zhe-An Li Chong Xie Jun-Feng Zhan Fei Sun 《Zoological Research》 2025年第5期1079-1092,共14页
Chromatin remodeling and transcriptional reprogramming play critical roles during mammalian meiotic prophase I;however,the precise mechanisms regulating these processes remain poorly understood.Our previous work demon... Chromatin remodeling and transcriptional reprogramming play critical roles during mammalian meiotic prophase I;however,the precise mechanisms regulating these processes remain poorly understood.Our previous work demonstrated that deletion of heat shock factor 5(HSF5),a member of the heat shock factor family,induces meiotic arrest and male infertility.However,the molecular pathways through which HSF5 governs meiotic progression have not yet been fully elucidated.In this study,a comprehensive multi-omics approach was applied to investigate the role of HSF5 in modulating chromatin dynamics and transcriptional reprogramming during pachynema progression.Analysis of ATAC-seq and single-cell RNA sequencing data revealed significant alterations in chromatin accessibility and disruption of the transcriptional regulatory network(TRN)in Hsf5−/−spermatocytes.Additionally,HSF5 deficiency resulted in defective XY body formation and altered histone modifications.Notably,Hsf5−/−spermatocytes also exhibited abnormal spermatoproteasome activity specifically on sex chromosomes,with evidence indicating that HSF5 may form a complex with USP7 in vivo to suppress H2AK119ub on meiotic sex chromosomes.These findings provide new insights into the complex,multifunctional role of HSF5 in regulating key meiotic events and advancing our understanding of its function during pachynema progression. 展开更多
关键词 HSF5 Cell biology Molecular biology MEIOSIS XY body formation Transcriptional regulatory network
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胰腺癌组织miR-340-5p、RARS2 mRNA、HSF1 mRNA表达水平与其对术后早期复发的预测价值
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作者 吴永融 揭毅 +2 位作者 陈义林 宋俊荣 覃远浩 《检验医学与临床》 2025年第13期1746-1751,1756,共7页
目的探讨胰腺癌组织微小RNA-340-5p(miR-340-5p)、线粒体精氨酸-tRNA合成酶(RARS2)基因、热休克转录因子1(HSF1)mRNA的表达水平,及其对胰腺癌患者术后早期复发的预测价值。方法选择该院2020年7月至2023年8月收治的行根治性R0切除术的19... 目的探讨胰腺癌组织微小RNA-340-5p(miR-340-5p)、线粒体精氨酸-tRNA合成酶(RARS2)基因、热休克转录因子1(HSF1)mRNA的表达水平,及其对胰腺癌患者术后早期复发的预测价值。方法选择该院2020年7月至2023年8月收治的行根治性R0切除术的195例胰腺癌患者作为研究对象。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测癌组织miR-340-5p、RARS2 mRNA、HSF1 mRNA表达水平。根据术后1年内复发情况,将患者分为复发组和未复发组。比较2组一般资料及癌组织miR-340-5p、RARS2 mRNA、HSF1 mRNA表达水平。采用多因素Logistic回归分析腺癌患者术后复发的影响因素;绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析癌组织miR-340-5p、RARS2 mRNA、HSF1 mRNA对腺癌患者术后复发的预测价值,采用DeLong检验比较曲线下面积(AUC)。结果随访结果显示,复发组有107例,未复发组有88例。复发组肿瘤最大径、T分期、N分期高于未复发组,差异均有统计学意义(P<0.05)。复发组miR-340-5p表达水平低于未复发组,RARS2 mRNA和HSF1 mRNA表达水平高于未复发组,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,miR-340-5p表达水平升高是胰腺癌患者术后复发的独立保护因素(P<0.05),而RARS2 mRNA、HSF1 mRNA表达水平升高均是胰腺癌患者术后复发的独立危险因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,癌组织miR-340-5p、RARS2 mRNA、HSF1 mRNA单独及联合预测胰腺癌患者术后复发的AUC分别为0.794、0.790、0.765、0.949,且三者联合预测的AUC明显大于各指标单独预测(P<0.05)。结论癌组织miR-340-5p、RARS2 mRNA、HSF1 mRNA表达水平与胰腺癌术后的早期复发有关,均可作为复发的候选标志物,且三者联合应用时能进一步提高预测价值,可为临床个性化、精准化的预防干预提供重要的参考依据。 展开更多
关键词 miR-340-5p RARS2 HSF1 胰腺癌 术后早期复发 预测价值
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天然椰子油提取物对H_2O_2诱导的HSF细胞氧化损伤的保护作用 被引量:13
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作者 宋菲 王挥 +3 位作者 唐敏敏 沈晓君 张玉锋 邓福明 《日用化学工业》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期517-521,共5页
采用倒置生物显微镜观察人皮肤成纤维细胞(HSF)的形态,通过MTT法检测细胞存活率,并通过检测细胞内活性氧(ROS)水平、总抗氧化能力和抗氧化酶活性探讨天然椰子油提取物对H_2O_2诱导的HSF细胞氧化损伤的保护作用。结果表明,天然椰子油提... 采用倒置生物显微镜观察人皮肤成纤维细胞(HSF)的形态,通过MTT法检测细胞存活率,并通过检测细胞内活性氧(ROS)水平、总抗氧化能力和抗氧化酶活性探讨天然椰子油提取物对H_2O_2诱导的HSF细胞氧化损伤的保护作用。结果表明,天然椰子油提取物在质量浓度为12.5~50 mg/L范围内对H_2O_2诱导的HSF细胞氧化损伤具有保护作用,且呈浓度依赖性。天然椰子油提取物可以抑制H_2O_2引起的细胞形态损伤,提高细胞存活率,还可以通过降低细胞内ROS水平、提高细胞总抗氧化能力以及提高细胞内超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性,进而起到保护HSF细胞氧化应激损伤的作用。 展开更多
关键词 化妆品原料 天然椰子油 HSF细胞 抗氧化 抗衰老
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中国荷斯坦牛HSF1基因microRNA SNPs与耐热性能的相关性研究 被引量:9
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作者 李秋玲 鞠志花 +6 位作者 贾祥捷 黄金明 李建斌 李荣岭 李芳 王长法 仲跻峰 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期570-578,共9页
【目的】分析638头中国荷斯坦牛HSF1基因多态性与耐热性的关系,以期为中国耐热奶牛分子育种提供参考依据。【方法】设计引物扩增HSF1基因,通过DNA测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP技术筛查SNPs并分型,利用miRBASE数据库定位microRNA SNPs,利用S... 【目的】分析638头中国荷斯坦牛HSF1基因多态性与耐热性的关系,以期为中国耐热奶牛分子育种提供参考依据。【方法】设计引物扩增HSF1基因,通过DNA测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP技术筛查SNPs并分型,利用miRBASE数据库定位microRNA SNPs,利用SHEsis软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型构建,利用SAS软件对不同基因型和单倍型组合个体耐热指标包括红细胞钾浓度、产奶量下降率、直肠温度和耐热系数进行相关分析。应用荧光定量RT-PCR技术研究热应激状态下HSF1 mRNA的转录水平。【结果】发现2个microRNA种子序列新SNPs,T909C和G4693T。其中909位碱基距离microRNA种子序列5'端3 bp,4 693位突变直接使microRNA种子序列破坏。909位点CC、CT基因型奶牛耐热性能显著高于TT基因型(P<0.05);4693位点TT基因型奶牛耐热性能显著高于GG基因型(P<0.05)。共构建出4种单倍型、发现10种单倍型组合。其中H2H4单倍型组合红细胞钾浓度和直肠温度显著低于H1H3单倍型组合(P<0.05),耐热系数显著高于H1H3组合(P<0.05),H2H4组合个体产奶量下降率显著低于H1H1组合个体(P<0.05),H2H4为耐热单倍型组合。热应激状态下HSF1 mRNA的转录水平在不同组织中存在差异,在心脏中最高,是肌肉中的11.24倍(P<0.05)。【结论】HSF1基因microRNA SNPs可作为奶牛抗热应激的候选分子标记应用于育种实践。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 HSF1 耐热性能 MICRORNA 多态性
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下调miR-21通过PTEN/PI3K/Akt信号转导抑制人增生性瘢痕成纤维细胞增殖的实验研究 被引量:8
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作者 刘韵 展望 +3 位作者 游文健 林遐 高飞 章杰 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期27-31,91,共6页
目的探讨miR-21与PTEN相互作用关系及对PI3K/Akt信号通路和增生性瘢痕成纤维细胞增殖的影响,以期为临床诊断治疗增生性瘢痕提供新靶点。方法分别用qPCR和Western blot检测增生性瘢痕组织和细胞中miR-21和PTEN表达;双荧光素酶报告基因检... 目的探讨miR-21与PTEN相互作用关系及对PI3K/Akt信号通路和增生性瘢痕成纤维细胞增殖的影响,以期为临床诊断治疗增生性瘢痕提供新靶点。方法分别用qPCR和Western blot检测增生性瘢痕组织和细胞中miR-21和PTEN表达;双荧光素酶报告基因检测实验验证miR-21与PTEN调控关系;Western blot检测miR-21对HSF细胞中PTEN蛋白表达的影响;MTT检测细胞增殖能力的变化。结果在增生性瘢痕组织和细胞中miR-21普遍高表达,PTEN普遍低表达;双荧光素酶报告实验和Western blot证实了miR-21对PTEN的靶向调控作用;下调miR-21可通过上调PTEN表达来抑制PI3K/Akt通路活性进而抑制HSF细胞增殖。结论下调miR-21可通过PTEN/PI3K/Akt信号转导抑制人增生性瘢痕成纤维细胞增殖,显示出其诊断治疗增生性瘢痕的潜能,并可能为临床治疗提供新靶点。 展开更多
关键词 MIR-21 PTEN 增生性瘢痕 HSF细胞 PI3K/Akt
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地龙蛋白对人增生性瘢痕细胞增殖抑制作用机制研究 被引量:12
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作者 黄敬文 王景 +3 位作者 安丽凤 段剑飞 代宇 高宏伟 《现代生物医学进展》 CAS 2017年第35期6828-6832,6864,共6页
目的:研究地龙蛋白对人增生性瘢痕细胞增殖抑制作用机制。方法:培养人增生性瘢痕成纤维细胞(HSF),将传代好的HSF细胞分为四组,分别加入地龙样品浓度为0 mg/m L(对照组)、0.3125 mg/m L(低剂量组)、0.625 mg/m L(中剂量组)、1.25 mg/m L... 目的:研究地龙蛋白对人增生性瘢痕细胞增殖抑制作用机制。方法:培养人增生性瘢痕成纤维细胞(HSF),将传代好的HSF细胞分为四组,分别加入地龙样品浓度为0 mg/m L(对照组)、0.3125 mg/m L(低剂量组)、0.625 mg/m L(中剂量组)、1.25 mg/m L(高剂量组)。应用MTS法检测细胞活力,流式细胞仪检测细胞凋亡率,RT-PCR法和Western-blot法测定Cyclin D1、Caspase-3、TGF-β1的表达,Western-blot法测定Bcl-2、Mcl-2的表达。结果:地龙蛋白对HSF细胞的增殖活力有抑制作用。浓度0.625mg/m L、1.25 mg/m L样品组作用细胞48 h后凋亡率为分别为31.5%和69.2%,(P<0.01);RT-PCR显示,浓度0.625 mg/m L、1.25mg/m L样品组能够增加Caspase-3的基因表达,降低Cyclin D1的基因表达,降低TGF-β1的基因表达,(P<0.01);浓度0.3125mg/m L样品组与空白对照组比较有显著性差异(P<0.05)。W-B方法显示,各样品组能够增加Caspase-3的蛋白表达量,降低Cyclin D 1的蛋白表达量,降低TGF-β1的蛋白表达量,(P<0.01);浓度0.625 mg/m L、1.25 mg/m L样品组能够降低Bcl-2蛋白表达量,(P<0.01);浓度0.3125 mg/m L样品组Bcl-2的蛋白表达量与空白对照组比较有显著性差异(P<0.05)。结论:地龙蛋白诱导细胞死亡,作用机制与下调Cyclin D1的基因和蛋白表达,上调Caspase-3的基因和蛋白表达,下调TGF-β1的基因和蛋白表达,下调Bcl-2蛋白表达量有关。 展开更多
关键词 地龙 HSF细胞 CYCLIND1 CASPASE-3 TGF—1β Bcl-2 Mcl-2
原文传递
植物热激反应的信号转导机理 被引量:34
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作者 李冰 刘宏涛 +1 位作者 孙大业 周人纲 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 2002年第1期1-10,共10页
热刺激能诱导机体产生热激响应 (heatshockre sponse ,HSR)。在热激基因 (编码热激蛋白的基因 ,heatshockgene ,HSgene)表达之前许多信号转导组分已经发生了改变。已有一些直接或间接的证据表明Ca2 + 及CaM参与了植物HSR的信号转导。真... 热刺激能诱导机体产生热激响应 (heatshockre sponse ,HSR)。在热激基因 (编码热激蛋白的基因 ,heatshockgene ,HSgene)表达之前许多信号转导组分已经发生了改变。已有一些直接或间接的证据表明Ca2 + 及CaM参与了植物HSR的信号转导。真核生物中热激基因的表达被热激转录因子 (heatshocktranscriptionfactor,HSF)所介导。热胁迫时 ,HSF被激活并结合到热激元件 (heatshockelement,HSE)上。在这篇综述中 ,主要介绍与植物热激信号转导途径 (包括基因调控过程 )中上游的Ca2 + CaM信号系统及下游的热激基因表达调控相关的一些研究进展 。 展开更多
关键词 热激反应 信号转导 CAM 基因表达 HSE HSF 植物
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