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麦洼牦牛HOXA6基因编码区的克隆、组织表达特征及生物信息学分析 被引量:1
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作者 李宇 熊显荣 +1 位作者 宋虎 李键 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期88-93,共6页
利用分子克隆技术成功获得麦洼牦牛HOXA6基因编码区序列,并结合内参基因通过实时相对定量PCR法检测HOXA6基因在麦洼牦牛各组织中的表达分布。采用生物信息学方法对该基因及其编码的蛋白进行基本理化性质、疏水性、二级结构等分析,并构... 利用分子克隆技术成功获得麦洼牦牛HOXA6基因编码区序列,并结合内参基因通过实时相对定量PCR法检测HOXA6基因在麦洼牦牛各组织中的表达分布。采用生物信息学方法对该基因及其编码的蛋白进行基本理化性质、疏水性、二级结构等分析,并构建原核重组表达系统。结果表明,该基因包含一个大小为702 bp的开放阅读框,编码233个氨基酸;所编码的蛋白属于亲水性蛋白,二级结构主要由无规则卷曲和α螺旋为主。HOXA6基因的编码产物氨基酸进化树表明,HOXA6基因进化极其保守,牦牛HOXA6与牛、绵羊、马等物种氨基酸遗传距离较近。对其编码区序列比对显示,该序列具有高度保守性,与其他物种同源性较高。 展开更多
关键词 麦洼牦牛 hoxa6基因 克隆 组织表达 生物信息学分析
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HOXA-AS3通过调控HOXA6/7基因对人肺腺癌细胞增殖凋亡作用机制 被引量:1
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作者 张超 曲晓翰 韩立波 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第17期2371-2375,共5页
目的研究HOXA-AS3通过调控HOXA6/7基因对人肺腺癌细胞增殖凋亡的作用机制。方法人肺腺癌细胞株经培养后随机分为LA组(单纯人肺腺癌细胞株)和EX组(HOXA-AS3转染的人肺腺癌细胞株)。使用TUNEL法、CCK-8法、划痕实验、Western blot法及RT-... 目的研究HOXA-AS3通过调控HOXA6/7基因对人肺腺癌细胞增殖凋亡的作用机制。方法人肺腺癌细胞株经培养后随机分为LA组(单纯人肺腺癌细胞株)和EX组(HOXA-AS3转染的人肺腺癌细胞株)。使用TUNEL法、CCK-8法、划痕实验、Western blot法及RT-PCR法分析两组细胞凋亡、增殖、迁移能力、HOXA6/7蛋白表达及HOXA6/7 mRNA表达的差异。结果TUNEL法结果表明LA组细胞凋亡较EX组多且分布明显稀疏(P<0.05);CCK-8检测结果表明EX组细胞的增殖数量明显高于LA组(P<0.05);划痕实验显示,与EX组相比,LA组无细胞区域宽度较大,表明其细胞迁移能力较低;Western blot法对两组细胞内HOXA6/7蛋白的免疫印迹分析显示,EX组的HOXA6/7蛋白表达明显上升(P<0.05);RT-PCR结果显示,EX组的HOXA6/7 mRNA表达明显升高(P<0.05)。结论HOXA-AS3激活HOXA6/7基因的表达,加快人肺腺癌细胞的增殖、迁移,促进疾病发展。深入研究HOXB6/7基因对肺腺癌的作用机制可为控制肺腺癌的发展与转移提供临床帮助。 展开更多
关键词 肺腺癌 HOXA-AS3 hoxa6/7 细胞增殖 凋亡
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组织和血浆cfDNA中HOXA6和HOXA7基因的异常甲基化在肺癌诊断中的作用 被引量:2
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作者 郭丹 杨亮 +1 位作者 石科 张邵薇 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期4732-4737,共6页
DNA高甲基化是肿瘤抑制基因失活的重要机制,也是各种类型癌症早期诊断的生物标志物。本研究旨在揭示组织和血浆cfDNA中HOXA6和HOXA7基因的异常甲基化在肺癌诊断中的作用。2016年1月至2018年3月期间,收集54例非小细胞肺癌(NSCLC)患者作... DNA高甲基化是肿瘤抑制基因失活的重要机制,也是各种类型癌症早期诊断的生物标志物。本研究旨在揭示组织和血浆cfDNA中HOXA6和HOXA7基因的异常甲基化在肺癌诊断中的作用。2016年1月至2018年3月期间,收集54例非小细胞肺癌(NSCLC)患者作为研究对象,另外选择50名健康志愿者作为对照。检测受试者组织和血浆cfDNA中HOXA6和HOXA7基因甲基化阳性率,结果发现,NSCLC患者血浆cfDNA中的HOXA6甲基化率(40.74%)显著高于健康体检者(6.00%);NSCLC患者血浆cfDNA中的HOXA7甲基化率(35.19%)显著高于健康体检者(2.00%)。TNM分期为Ⅰ~Ⅱ期的患者的血浆cfDNA中HOXA6和HOXA7甲基化率均显著低于Ⅲ~Ⅳ期患者(p<0.05)。NSCLC患者肿瘤组织中的HOXA6和HOXA7甲基化率显著高于癌旁组织(p<0.05)。Spearman相关分析显示,血浆cfDNA和肿瘤组织中HOXA6基因甲基化的相关系数为r=0.834,p<0.001;血浆cfDNA和肿瘤组织中HOXA7基因甲基化的相关系数为r=0.882,p<0.001。血浆cfDNA中HOXA6和HOXA7基因异常甲基化诊断非小细胞肺癌的特异度分别为94.00%和98.00%。本研究表明,血浆cfDNA中HOXA6和HOXA7基因异常甲基化在诊断非小细胞肺癌中具有较高的特异度,并且可反映患者的疾病严重程度。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 甲基化 cfDNA 特异度 hoxa6 HOXA7
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HOXA6基因过表达对肺癌A549细胞增殖和凋亡的影响 被引量:1
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作者 郭丹 闫秀明 +1 位作者 杨亮 石科 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2019年第6期909-912,共4页
目的:探讨HOXA6基因过表达对肺癌A549细胞增殖和凋亡的影响。方法:采用qRT-PCR和Western blot法检测正常支气管上皮BEAS-2B细胞和A549细胞中HOXA6 mRNA和蛋白的表达。将A549细胞分为正常对照组、阴性对照组(感染阴性对照慢病毒)和HOXA6... 目的:探讨HOXA6基因过表达对肺癌A549细胞增殖和凋亡的影响。方法:采用qRT-PCR和Western blot法检测正常支气管上皮BEAS-2B细胞和A549细胞中HOXA6 mRNA和蛋白的表达。将A549细胞分为正常对照组、阴性对照组(感染阴性对照慢病毒)和HOXA6过表达组(感染HOXA6过表达慢病毒),采用qRT-PCR法检测HOXA6 mRNA的表达,CCK-8法检测细胞增殖情况,用Annexin V-APC/7-AAD法检测细胞凋亡情况,Western blot法检测HOXA6、cleaved Caspase-3、cleaved Caspase-9、Bax和Bcl-2蛋白的表达。结果:与BEAS-2B细胞相比,A549细胞中HOXA6 mRNA和蛋白的表达均下降(P<0.05);与阴性对照组相比,HOXA6过表达组A549细胞中HOXA6 mRNA和蛋白的表达增加,细胞存活减少,细胞凋亡增加,cleaved Caspase-3和cleaved Caspase-9蛋白的表达升高,Bax/Bcl-2比值增加(P均<0.05)。结论:HOXA6可能通过Bcl-2相关通路诱导肺癌细胞凋亡,抑制其增殖。 展开更多
关键词 hoxa6 肺癌 增殖 凋亡
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血浆cfDNA中HOXA6、FHIT甲基化水平在前列腺癌诊断中的作用
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作者 李丹 陈学栋 谭琳 《医学研究杂志》 2024年第10期157-160,177,共5页
目的 探索血浆中循环游离DNA(circulating free DNA,cfDNA)中HOXA6、脆性组氨酸三联体基因(fragile histidine triad gene, FHIT)甲基化水平及其在前列腺癌(prostate cancer, PCa)诊断中的作用。方法 选取2021年2月~2023年2月在笔者医... 目的 探索血浆中循环游离DNA(circulating free DNA,cfDNA)中HOXA6、脆性组氨酸三联体基因(fragile histidine triad gene, FHIT)甲基化水平及其在前列腺癌(prostate cancer, PCa)诊断中的作用。方法 选取2021年2月~2023年2月在笔者医院就诊的192例前列腺疾病患者作为研究对象,其中PCa患者112例作为疾病组,前列腺增生患者80例作为对照组。采用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)法对血浆cfDNA中HOXA6及FHIT的甲基化水平进行检测;分析血浆cfDNA中HOXA6及FHIT的甲基化水平与临床资料的关系;多因素Logistic分析PCa发生的影响因素;评价HOXA6及FHIT甲基化对PCa的诊断价值。结果 疾病组血浆cfDNA中HOXA6及FHIT甲基化率显著高于对照组(P<0.05);TNM分期在Ⅰ~Ⅱ期的患者HOXA6及FHIT甲基化率均低于Ⅲ~Ⅳ期患者,有淋巴结转移的患者HOXA6及FHIT甲基化率高于无淋巴结转移的患者(P<0.05);HOXA6、FHIT甲基化联合诊断PCa的敏感度为75.89%、特异性为95.00%,二者联合的诊断效能高于HOXA6、FHIT甲基化单独诊断的效能;多因素Logistic分析显示,HOXA6及FHIT甲基化是PCa发生的影响因素(P<0.05)。结论 PCa患者血浆cfDNA中HOXA6及FHIT甲基化水平升高,二者是PCa的影响因素,二者联合的诊断效能高于单独诊断的效能,具有一定的诊断价值。 展开更多
关键词 前列腺癌 甲基化 cfDNA hoxa6 FHIT
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SOX9和HOXA6在结直肠癌组织中的表达情况及相关性研究 被引量:1
6
作者 赵侠 《西藏医药》 2021年第5期23-26,共4页
目的探讨结直肠癌组织中Y染色体性别决定区相关高速泳动族框因子9(SOX9)与同源异型盒基因6(HOXA6)表达情况及其相关性研究。方法选取2019 年9月~2020年9月在我院临床诊断及治疗结直肠癌患者的粘膜组织130份作为肿瘤组,选取同一时期的正... 目的探讨结直肠癌组织中Y染色体性别决定区相关高速泳动族框因子9(SOX9)与同源异型盒基因6(HOXA6)表达情况及其相关性研究。方法选取2019 年9月~2020年9月在我院临床诊断及治疗结直肠癌患者的粘膜组织130份作为肿瘤组,选取同一时期的正常结直肠黏膜组织的患者50例作为对照组。两组均采用免疫组化染色检测组织中SOX9、HOXA6,分析与结直肠癌患者临床特征的关系。结果肿瘤组中SOX9和HOXA6表达水平为73.85%(96/130)、66.97%(87/130),对照组4%(2/50)、10%(5/50),差异具有统计学意义(P < 0.05);肿瘤组中SOX9、HOXA6 高表达与肿瘤分化程度、TNM分期、淋巴结转移,差异均有统计学意义(P<0.05);结直肠癌组织中SOX9表达与HOXA6蛋白表达呈正相关(P<0.05)。结论 SOX9和HOXA6在结直肠癌的发生发展中有着重要影响作用,二者联合检测可作为判断结直肠癌恶性程度的有效指标. 展开更多
关键词 结直肠癌 SOX9 hoxa6 免疫组织化学
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Study on the Expression,Prognosis,and Clinical Features of HOXA6 in Liver Cancer
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作者 Huiqiong Zhu 《Proceedings of Anticancer Research》 2024年第5期159-164,共6页
Objective:To study and analyze the expression level of homeobox A6(HOXA6)in patients with liver cancer and its correlation with prognosis.Methods:From January 2020 to July 2021,43 patients with liver cancer who underw... Objective:To study and analyze the expression level of homeobox A6(HOXA6)in patients with liver cancer and its correlation with prognosis.Methods:From January 2020 to July 2021,43 patients with liver cancer who underwent surgery without prior radiotherapy or chemotherapy were selected.Liver cancer tissues and adjacent tissues were collected,and the expression levels of HOXA6 mRNA and protein were measured using RT-qPCR and Western blot.The expression level of HOXA6 in tumor tissues(without radiotherapy and chemotherapy)was compared with that in adjacent tissues.Additionally,the prognosis and clinical characteristics of patients with low HOXA6 expression were compared to those with high HOXA6 expression,and the factors influencing high HOXA6 expression in liver cancer patients were analyzed.Results:HOXA6 mRNA and protein expression levels in tumor tissues were significantly higher than in adjacent tissues(P<0.05).There was no significant difference in the 1-year and 2-year survival rates between the high HOXA6 expression group and the low HOXA6 expression group(P>0.05).However,the 3-year survival rate was lower in the high HOXA6 expression group compared to the low HOXA6 expression group(P<0.05).There were no statistically significant differences between the two groups in terms of gender,age,tumor diameter,alpha-fetoprotein levels,or hepatitis B virus DNA levels(P>0.05).However,significant differences were found in the number of tumor lesions,degree of differentiation,and the proportion of tumor metastasis between the two groups(P<0.05).Multivariate logistic regression analysis revealed that the number of tumor lesions,degree of differentiation,and tumor metastasis were influencing factors for high HOXA6 expression in liver cancer patients(P<0.05).Conclusion:HOXA6 expression levels are abnormally elevated in liver cancer patients,and higher HOXA6 expression is associated with a worse 3-year survival rate.The factors influencing HOXA6 expression include the number of tumor lesions,degree of differentiation,and tumor metastasis. 展开更多
关键词 Liver cancer hoxa6 Expression level Clinical features Influencing factors
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血清HOXA6与HOXA10水平对DOR患者子宫内膜容受性的预测价值
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作者 朱红丽 石盼盼 《中国综合临床》 2025年第6期458-465,共8页
目的探讨血清HOXA6与HOXA10水平对卵巢储备功能减退(decreased ovarian reserve,DOR)患者子宫内膜容受性的预测价值。方法本研究为病例对照研究。选取2021年1月至2023年10月在西安市人民医院接受治疗的248例DOR患者为研究对象,另选取20... 目的探讨血清HOXA6与HOXA10水平对卵巢储备功能减退(decreased ovarian reserve,DOR)患者子宫内膜容受性的预测价值。方法本研究为病例对照研究。选取2021年1月至2023年10月在西安市人民医院接受治疗的248例DOR患者为研究对象,另选取200名同期就诊的卵巢储备功能正常的女性患者作为对照组。通过酶联免疫吸附试验检测血清HOXA6和HOXA10浓度。使用经阴道超声测量两组受试者在月经周期第20~24天的子宫内膜厚度,并根据子宫内膜容受性分为高容受性组(≥8 mm)、中等容受性组(≥6~<8 mm)、低容受性组(<6 mm)。此外,采用化学发光免疫分析法检测两组月经周期第3天的促卵泡激素(follicle-stimulating hormone,FSH)、抗缪勒管激素(anti-müllerian hormone,AMH),并使用经阴道超声检查记录卵泡数量。呈正态分布的计量资料以x^(-)±s表示,两组间比较采用独立样本t检验;多组间比较采用单因素方差分析,两两比较采用Tukey's HSD检验。计数资料以例(%)表示,组间比较采用χ²检验。使用Logistic回归分析影响卵巢储备功能的独立影响因素,应用Pearson相关分析分析HOXA6和HOXA10与子宫内膜容受性、卵巢储备功能的关系。绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估HOXA6和HOXA10在预测子宫内膜容受性方面的诊断价值。结果DOR组患者血清HOXA6水平[(120.34±15.16)ng/L]和HOXA10水平[(98.46±12.61)ng/L]均高于对照组[(80.27±10.54)、(60.36±8.80)ng/L,t值分别为31.70、36.20,均P<0.001]。DOR组患者的子宫内膜厚度[(7.4±1.3)mm]薄于对照组[(10.0±1.1)mm],血清FSH水平[(12.03±2.54)U/L]高于对照组[(8.08±2.82)U/L],AMH水平[(1.56±0.45)µg/L]低于对照组[(3.52±1.63)µg/L],卵泡数量[(5.07±1.05)个]少于对照组[(10.09±2.06)个],两组比较差异均有统计学意义(t值分别为22.52、15.58、18.10、33.58,均P<0.001)。Pearson相关性分析结果表明,血清HOXA6和HOXA10水平与DOR患者子宫内膜厚度、AMH水平和卵泡数量均成负相关(血清HOXA6:r值分别为-0.773、-0.647、-0.721,均P<0.001;HOXA10:r值分别为-0.788、-0.682、-0.834,均P<0.001),与血清FSH水平均成正相关(r值分别为0.667、0.670,均P<0.001)。多因素Logistic回归分析结果表明,血清HOXA6(OR=1.179,95%CI:1.144~1.215,P<0.001)、HOXA10(OR=1.223,95%CI:1.177~1.270,P<0.001)、FSH水平(OR=1.827,95%CI:1.569~2.129,P<0.001)均为影响女性发生DOR的独立危险因素,子宫内膜厚度(OR=0.264,95%CI:0.205~0.340,P<0.001)、血清AMH水平(OR=0.126,95%CI:0.078~0.205,P<0.001)、卵泡数量(OR=0.058,95%CI:0.024~0.143,P<0.001)均为影响女性发生DOR的保护因素。ROC曲线分析结果表明,血清HOXA6和HOXA10及二者联合预测DOR患者高子宫内膜容受性的AUC分别为0.770、0.820、0.864,其中HOXA10的AUC值略高于HOXA6,且二者联合预测的AUC值最高。结论血清HOXA6和HOXA10水平与卵巢储备功能及子宫内膜容受性密切相关,可以作为评估DOR患者子宫内膜容受性的潜在生物标志物。 展开更多
关键词 卵巢储备功能减退 hoxa6 HOXA10 子宫内膜容受性
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利用同源重组技术构建Hoxa5、BMP6真核表达载体及共转染成纤维细胞表达
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作者 李晶 张梦瑶 +2 位作者 刘开东 柳楠 贺建宁 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2020年第4期187-194,共8页
旨在利用同源重组构建敖汉细毛羊Hoxa5、BMP6基因表达载体及共转染成纤维细胞后通过基因表达量变化研究两基因之间的相互作用关系。以敖汉细毛羊为研究对象,采集30日龄的胎羊。首先,通过RNA的提取反转录成cDNA参照GenBank中Hoxa5、BMP6... 旨在利用同源重组构建敖汉细毛羊Hoxa5、BMP6基因表达载体及共转染成纤维细胞后通过基因表达量变化研究两基因之间的相互作用关系。以敖汉细毛羊为研究对象,采集30日龄的胎羊。首先,通过RNA的提取反转录成cDNA参照GenBank中Hoxa5、BMP6基因序列和pcDNA3.1序列分别设计1对含有同源臂的引物,通过PCR反应扩增获得Hoxa5、BMP6基因片段、利用SoSo试剂盒将目的片段连接到pcDNA3.1真核表达载体上。鉴定构建pcDNA3.1-Hoxa5、pcDNA3.1-BMP6重组表达载体,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞;其次对敖汉细毛羊的成纤维细胞进行分离培养,并将构建的质粒pcDNA3.1-Hoxa5、pcDNA3.1-BMP6共转染至成纤维细胞,采用RT-PCR技术和Western Blot技术检测Hoxa5、BMP6基因单转染和共转染在成纤维细胞中表达量的变化。结果显示:经酶切、测序鉴定质粒pcDNA3.1-Hoxa5、pcDNA3.1-BMP6构建成功,并且共转染成纤维细胞Hoxa5基因的表达量极显著下降,BMP6基因的表达量极显著升高且共转染组的表达量极显著地高于单转染组(P<0.01)。利用同源重组技术成功构建了敖汉细毛羊Hoxa5、BMP6基因的表达载体,并且成功共转染成纤维细胞,BMP6基因的表达量升高,Hoxa5基因的表达量极显著下降,因而初步推断基因BMP6抑制了Hoxa5基因的表达,相反地Hoxa5基因促进了BMP6基因的表达,结果可为进一步研究其功能奠定基础。 展开更多
关键词 同源重组 成纤维细胞 Hoxa5、BMP6质粒共转染 RT-PCR Western Blot
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