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基于数据挖掘分析HOXA3在急性髓系白血病中的表达及意义 被引量:2
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作者 张媛 吴隼 +3 位作者 郭燕 王莉华 刘宪凯 黄琰 《河南大学学报(医学版)》 CAS 2021年第1期33-37,共5页
[目的]基于Oncomine等生物信息数据挖掘阐述HOXA3基因在急性髓系白血病中的表达及临床意义。[方法]检索Oncomine、String-DB、DAVID、TCGA等数据库,分析HOXA3在不同肿瘤中的表达情况,及其在AML中的差异表达和预后的关系,并分析与HOXA3... [目的]基于Oncomine等生物信息数据挖掘阐述HOXA3基因在急性髓系白血病中的表达及临床意义。[方法]检索Oncomine、String-DB、DAVID、TCGA等数据库,分析HOXA3在不同肿瘤中的表达情况,及其在AML中的差异表达和预后的关系,并分析与HOXA3相互作用的蛋白。[结果]在Oncomine数据库中,共收集了343项有关HOXA3在各种肿瘤和健康人之间的对比研究,其中HOXA3表达差异有统计学意义的结果共有28项,白血病中高表达的研究有3项。通过检索,共有4项研究涉及HOXA3在AML患者中的表达。综合比较4项结果,发现与对照组相比,HOXA3在AML患者中的表达量高于正常人(P=0.013)。利用R筛选出与HOXA3存在共表达关系的基因,并通过DAVID在线工具分析相关的GO注释和KEGG通路,结果显示:HOXA3与细胞的凋亡、白细胞迁移、造血发生、肿瘤、代谢等相关。此外,在String-DB数据库中寻找与HOXA3相互作用的蛋白,发现HOXA3与CTCF、PBX1、HOXB1、MAFB、KDM6A、KMT2C等蛋白关系密切。进一步挖掘TCGA数据库中的LAML数据,利用R的Survival包进行生存分析,发现高表达HOXA3的AML患者生存期明显低于低表达者(P<0.05),即高表达者预后更差。[结论]HOXA3在AML患者中呈现高表达,并与其预后相关,提示HOXA3有望成为AML诊断及药物治疗的新靶点。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 hoxa3 Oncomine数据库 String-DB数据库 TCGA数据库
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HOXA3基因对口腔癌细胞增殖及侵袭能力的影响 被引量:2
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作者 方盛华 柳子川 邓旭斌 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2018年第11期1839-1842,共4页
目的研究HOXA3基因对口腔癌细胞增殖及侵袭能力的影响。方法使用Western blot检测HOXA3基因在口腔癌细胞及组织中的表达情况。使用RT-PCR检测HOXA3基因在口腔癌组织及癌旁组织中的表达差异。使用慢病毒干扰载体建立稳定低表达HOXA3蛋白... 目的研究HOXA3基因对口腔癌细胞增殖及侵袭能力的影响。方法使用Western blot检测HOXA3基因在口腔癌细胞及组织中的表达情况。使用RT-PCR检测HOXA3基因在口腔癌组织及癌旁组织中的表达差异。使用慢病毒干扰载体建立稳定低表达HOXA3蛋白的口腔癌细胞。平板克隆、MTT试验验证HOXA3对口腔癌细胞生长能力的影响。流式细胞仪检测敲除HOXA3之后对口腔癌细胞凋亡比率的影响。细胞迁徙试验,划痕试验验证HOXA3对口腔癌细胞侵袭能力的影响。结果 HOXA3基因在口腔癌组织及细胞中表达水平明显升高。敲除HOXA3之后,可以使口腔癌细胞生长能力减弱并促进细胞凋亡。HOXA3敲除后,还可以降低口腔癌细胞的侵袭能力。结论 HOXA3为促进口腔癌细胞生长及侵袭一个癌基因,HOXA3可能作为口腔癌治疗的新靶点。 展开更多
关键词 hoxa3 口腔癌 肿瘤侵袭 肿瘤生长
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慢病毒Hoxa3载体的构建及其对人脐静脉内皮细胞迁移和血管新生的影响
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作者 毕雪飞 陶贵周 黄建华 《中国动脉硬化杂志》 CAS 2019年第1期18-22,共5页
目的构建慢病毒Hoxa3载体,观察其对人脐静脉内皮细胞(HUVEC)的转染效率,研究其对细胞迁移和血管新生的影响,并探讨Hoxa3促进血管新生的机制。方法以基因合成法从聚合酶链式反应文库获取人Hoxa3基因,酶切后插入慢病毒骨架载体,以三质粒... 目的构建慢病毒Hoxa3载体,观察其对人脐静脉内皮细胞(HUVEC)的转染效率,研究其对细胞迁移和血管新生的影响,并探讨Hoxa3促进血管新生的机制。方法以基因合成法从聚合酶链式反应文库获取人Hoxa3基因,酶切后插入慢病毒骨架载体,以三质粒联合转染293T细胞获得慢病毒Hoxa3载体,并进行滴度测定。转染HUVEC,获取最大转染效率。转染HUVEC后分对照组和慢病毒Hoxa3转染组,进行HUVEC迁移实验和小管形成实验,观察Hoxa3对HUVEC迁移和小管形成的影响。Western blot检测慢病毒Hoxa3载体转染HUVEC后尿激酶型纤溶酶原激活物受体(uPAR)和基质金属蛋白酶14(MMP-14)蛋白表达的变化。结果成功构建慢病毒Hoxa3载体,病毒的滴度为8×1011TU/L; 30 MOI慢病毒载体对HUVEC的转染效率达到99%以上。Western blot结果显示慢病毒Hoxa3载体转染HUVEC后Hoxa3能够有效在HUVEC中表达。与对照组比较,慢病毒Hoxa3载体转染HUVEC后显著增强HUVEC的迁移和小管形成,显著增加uPAR和MMP-14蛋白的表达(P<0.05)。结论成功构建的慢病毒Hoxa3载体可促进HUVEC的迁移和小管形成,其作用机制可能为上调HUVEC的uPAR和MMP-14蛋白表达。 展开更多
关键词 慢病毒载体 hoxa3 人脐静脉内皮细胞 细胞迁移 血管新生
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超声微泡介导miR-545-3p调节HOXA3对结直肠癌细胞增殖、凋亡、侵袭的影响
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作者 李偲琦 陈汉威 +1 位作者 叶琼 罗劲根 《中华介入放射学电子杂志》 2025年第2期143-151,共9页
目的探讨超声微泡介导miR-545-3p调节HOXA3对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)细胞增殖、凋亡、侵袭的影响。方法采用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测SW620、SW480、LoVo、C... 目的探讨超声微泡介导miR-545-3p调节HOXA3对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)细胞增殖、凋亡、侵袭的影响。方法采用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测SW620、SW480、LoVo、CACO-2及正常结肠上皮细胞系NCM460中miR-545-3p、同源盒基因3(homeobox geneA3,HOXA3)mRNA表达水平;将生长较好的SW480细胞分为空白组、微泡组、miR组、过表达miR-545-3p组、微泡+miR组、微泡+过表达miR-545-3p组、微泡+过表达miR-545-3p+空载体(pcDNA6.2/nLumio-DEST,pcDNA)组、微泡+过表达miR-545-3p+HOXA3组,采用qRT-PCR法检测各组miR-545-3p和HOXA3表达,采用MTT检测细胞增殖,采用流式细胞术检测细胞凋亡,采用Transwell实验检测细胞侵袭,采用Western blotting检测HOXA3、增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)、金属基质蛋白酶9(matrix metalloproteinase,MMP-9)、(Bcl-2-associated X protein,Bax)蛋白表达水平。通过皮下注射SW480细胞悬液,建立裸鼠移植瘤模型,并分为对照组、微泡组、miR微泡组、miR-545-3p微泡组,每组10只,检测裸鼠移植瘤瘤重。结果CRC细胞中miR-545-3p表达下调,HOXA3 mRNA表达上调(P<0.05),以SW480细胞变化最为显著,故作为后续研究对象。过表达miR-545-3p与HOXA3-WT共转染的荧光素酶活性低于miR NC与HOXA3-WT共转染(P<0.05)。过表达miR-545-3p组可上调miR-545-3p表达,下调HOXA3表达,抑制细胞增殖、侵袭数及PCNA、MMP-9蛋白表达,促进细胞凋亡及Bax蛋白表达(P<0.05),微泡+过表达miR-545-3p组上调miR-545-3p表达,下调HOXA3表达,抑制细胞增殖、侵袭数及PCNA、MMP-9蛋白表达,促进细胞凋亡及Bax蛋白表达效果优于过表达miR-545-3p组(P<0.05)。miR-545-3p微泡组裸鼠移植瘤瘤重显著低于对照组、微泡组、miR微泡组(P<0.05)。结论超声微泡介导miR-545-3p可通过下调HOXA3抑制CRC细胞增殖、侵袭,诱导其凋亡,为临床治疗CRC提供新的给药方式及潜在靶点,为CRC分子靶向治疗技术提供依据。 展开更多
关键词 超声微泡 结直肠癌 miR-545-3p hoxa3
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法洛四联症患儿心肌组织HOXA3基因表达及凋亡检测 被引量:1
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作者 姜红堃 安东 +4 位作者 李雷 白英龙 邱广蓉 姜红 孙开来 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第13期970-972,共3页
目的 通过检测法洛四联症(TOF)患儿心肌组织 HOXA3基因表达及心肌细胞凋亡,探讨其在 TOF发病中的分子遗传学机制。方法 选取22例经产前彩超检查及尸检确诊为 TOF的胎儿右心室流出道心肌组织为 TOF组[胎龄(25.67±7.68)周],1... 目的 通过检测法洛四联症(TOF)患儿心肌组织 HOXA3基因表达及心肌细胞凋亡,探讨其在 TOF发病中的分子遗传学机制。方法 选取22例经产前彩超检查及尸检确诊为 TOF的胎儿右心室流出道心肌组织为 TOF组[胎龄(25.67±7.68)周],12例同胎龄心脏结构正常胎儿右心室流出道心肌组织为对照组[胎龄(26.55±6.36)周];提取心肌组织总 RNA,采用实时定量 PCR 法检测 HOXA3 mRNA 表达;提取心肌组织总蛋白并采用W estern blot法检测 HOXA3蛋白表达;原位末端标记法(TUNEL)检测心肌细胞凋亡。采用 SPSS13.0软件比较2组的差异及相关性分析。结果 与对照组比较,TOF组心肌组织 HOXA3 mRNA 表达下调(P 〈0.01),蛋白表达亦呈相同趋势(P 〈0.01)。TOF组凋亡心肌细胞数较对照组增多,差异有统计学意义(P 〈0.01)。TOF组心肌细胞凋亡数与HOXA3 mRNA及蛋白表达水平呈负相关(r= -0.566、-0.759,P均 〈 0.01)。结论 在胚胎心脏发育过程中,HOXA3基因表达降低及心肌细胞过度凋亡可能是 TOF发生的一种潜在致病机制。 展开更多
关键词 hoxa3基因 法洛四联症 凋亡 心脏发育
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Unveiling DNA methylation in Alzheimer’s disease:a review of array-based human brain studies 被引量:3
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作者 Victoria Cunha Alves Eva Carro Joana Figueiro-Silva 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2024年第11期2365-2376,共12页
The intricacies of Alzheimer’s disease pathogenesis are being increasingly illuminated by the exploration of epigenetic mechanisms,particularly DNA methylation.This review comprehensively surveys recent human-centere... The intricacies of Alzheimer’s disease pathogenesis are being increasingly illuminated by the exploration of epigenetic mechanisms,particularly DNA methylation.This review comprehensively surveys recent human-centered studies that investigate whole genome DNA methylation in Alzheimer’s disease neuropathology.The examination of various brain regions reveals distinctive DNA methylation patterns that associate with the Braak stage and Alzheimer’s disease progression.The entorhinal cortex emerges as a focal point due to its early histological alterations and subsequent impact on downstream regions like the hippocampus.Notably,ANK1 hypermethylation,a protein implicated in neurofibrillary tangle formation,was recurrently identified in the entorhinal cortex.Further,the middle temporal gyrus and prefrontal cortex were shown to exhibit significant hypermethylation of genes like HOXA3,RHBDF2,and MCF2L,potentially influencing neuroinflammatory processes.The complex role of BIN1 in late-onset Alzheimer’s disease is underscored by its association with altered methylation patterns.Despite the disparities across studies,these findings highlight the intricate interplay between epigenetic modifications and Alzheimer’s disease pathology.Future research efforts should address methodological variations,incorporate diverse cohorts,and consider environmental factors to unravel the nuanced epigenetic landscape underlying Alzheimer’s disease progression. 展开更多
关键词 Alzheimer’s disease ANK1 BIN1 DNA methylation epigenome-wide association studies hoxa3 MCF2L RHBDF2
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间充质干细胞来源的胞外囊泡通过装载miR-375对结直肠癌发生的影响机制 被引量:3
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作者 张亮亮 周兴华 +2 位作者 范丁文 付皓 严涛 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第13期3291-3297,共7页
目的探究间充质干细胞来源的胞外囊泡通过装载miR-375对结直肠癌发生的影响机制。方法分离培养并鉴定结直肠癌组织中间充质干细胞,从间充质干细胞中分离并鉴定胞外囊泡。将胞外囊泡装载miR-375过表达模拟物,qRT-聚合酶链反应(PCR)检测... 目的探究间充质干细胞来源的胞外囊泡通过装载miR-375对结直肠癌发生的影响机制。方法分离培养并鉴定结直肠癌组织中间充质干细胞,从间充质干细胞中分离并鉴定胞外囊泡。将胞外囊泡装载miR-375过表达模拟物,qRT-聚合酶链反应(PCR)检测细胞中miR-375的表达情况。培养结直肠癌细胞系SW480,将胞外囊泡和SW480细胞共培养。双荧光素酶报告分析miR-375和同源框蛋白(HOX)A3的靶向关系。qRT-PCR检测共培养后,细胞中miR-375和HOXA3 mRNA的表达情况。Western印迹检测HOXA3蛋白的表达情况。对细胞分别进行miR-375和HOXA3过表达处理,CCK-8法、Transwell实验分别检测各组细胞增殖和侵袭能力变化情况。流式细胞术检测细胞凋亡情况。结果成功分离间充质干细胞来源的胞外囊泡,并将miR-375过表达模拟物装载至胞外囊泡。miR-375可靶向负调控HOXA3的表达。过表达miR-375后抑制SW480细胞增殖、侵袭,促进细胞凋亡,而过表达HOXA3则会促进SW480细胞增殖、侵袭,抑制细胞凋亡,且过表达HOXA3后,会阻断miR-375对SW480细胞增殖和侵袭的抑制作用及对细胞凋亡的促进作用。结论间充质干细胞来源的胞外囊泡通过装载miR-375,进入结直肠癌细胞后,通过靶向抑制HOXA3的表达,进而抑制结直肠癌细胞增殖、侵袭,并促进细胞凋亡。 展开更多
关键词 间充质干细胞 胞外囊泡 miR-375 同源框蛋白(HOXA)3 结直肠癌
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