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产酸克雷伯氏菌(K.oxytoca) α-乙酰乳酸脱羧酶基因(BudA)的克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
王长丽
孙雯
+1 位作者
黄守锋
葛菁萍
《黑龙江大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2016年第6期795-801,共7页
以Klebsiella oxytoca(K.oxytoca)HD79为出发菌株,根据α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列相似的特点,利用Primer5.0设计一对引物,以K.oxytoca HD79为模板,PCR扩增,获得K.oxytoca HD79基因片段Bud A,此片段经测序显示长度为780 bp,无碱基缺失。...
以Klebsiella oxytoca(K.oxytoca)HD79为出发菌株,根据α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列相似的特点,利用Primer5.0设计一对引物,以K.oxytoca HD79为模板,PCR扩增,获得K.oxytoca HD79基因片段Bud A,此片段经测序显示长度为780 bp,无碱基缺失。利用生物信息学软件对该序列进行了同源性分析、氨基酸组成分析、疏水性分析、磷酸化位点预测、亚细胞定位分析及二、三级结构预测。结果表明,该片段为K.oxytoca HD79的α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列。对该酶进行的生物信息学特异性分析为其构建产2,3-丁二醇的工程菌株提供一定的理论参考。
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关键词
KLEBSIELLA
oxytoca
hd79
Α-乙酰乳酸脱羧酶
生物信息学分析
结构预测
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职称材料
题名
产酸克雷伯氏菌(K.oxytoca) α-乙酰乳酸脱羧酶基因(BudA)的克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
王长丽
孙雯
黄守锋
葛菁萍
机构
黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室
黑龙江大学农业微生物技术教育部工程研究中心
出处
《黑龙江大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2016年第6期795-801,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(31590492
31270534
+1 种基金
31470537)
黑龙江省高等学校科技创新团队项目(2012td009)
文摘
以Klebsiella oxytoca(K.oxytoca)HD79为出发菌株,根据α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列相似的特点,利用Primer5.0设计一对引物,以K.oxytoca HD79为模板,PCR扩增,获得K.oxytoca HD79基因片段Bud A,此片段经测序显示长度为780 bp,无碱基缺失。利用生物信息学软件对该序列进行了同源性分析、氨基酸组成分析、疏水性分析、磷酸化位点预测、亚细胞定位分析及二、三级结构预测。结果表明,该片段为K.oxytoca HD79的α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列。对该酶进行的生物信息学特异性分析为其构建产2,3-丁二醇的工程菌株提供一定的理论参考。
关键词
KLEBSIELLA
oxytoca
hd79
Α-乙酰乳酸脱羧酶
生物信息学分析
结构预测
Keywords
Klebsiella oxytoca
hd79
α- acetolactate decarboxylase
bioinformatics analysis
structureprediction
分类号
O935 [理学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
产酸克雷伯氏菌(K.oxytoca) α-乙酰乳酸脱羧酶基因(BudA)的克隆及生物信息学分析
王长丽
孙雯
黄守锋
葛菁萍
《黑龙江大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2016
2
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