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南通地区9株4型星状病毒的全基因组序列分析 被引量：2
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作者 季霄雷 郭陈 +9 位作者 丛辉 熊海平 陈璐 陈雨佳 孙怡华 严炳清 蔡秀丽 苏婧 梁如悦 陈诗瑶 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1261-1271,共11页
人类星状病毒(Human astrovirus,HAstV)是全球流行的引起急性胃肠炎常见病原体,主要引起幼儿、老年人及免疫功能低下人群的感染。本研究收集了江苏南通地区定点监测医院门、急诊<5岁儿童急性胃肠炎腹泻监测粪便标本712份,共检测出HA... 人类星状病毒(Human astrovirus,HAstV)是全球流行的引起急性胃肠炎常见病原体,主要引起幼儿、老年人及免疫功能低下人群的感染。本研究收集了江苏南通地区定点监测医院门、急诊<5岁儿童急性胃肠炎腹泻监测粪便标本712份,共检测出HAstV阳性22例。对Ct<30的样本进行病毒的分离培养,共得到9个HAstV分离株。对这9个分离株进行了全基因组的测序及分析,以表征其遗传变异及进化特征。所有分离株经blastn比对后,发现其基因序列均与4型HAstV一致性最高。与HAstV-4原型株MK059952相比有较大变异,核苷酸一致性为88.15%~91.98%。重组分析发现9个分离株呈现出两种不同的进化重组方向。氨基酸置换熵值分析及选择压力分析发现有3个氨基酸位点同时满足易突变位点及适应性演化位点,这可能是HAstV能持续在全球流行的因素之一。本研究为南通地区流行的HAstV的遗传多样性和重组提供了进一步的证据,对HAstV引起相关疾病的预防控制将发挥重要作用。 展开更多
关键词 星状病毒 全基因组 hastv-4c 病毒重组 选择压力分析
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