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江苏省南京市和无锡市两地首次检出人星状病毒HAstV-1a基因亚型 被引量：3
1
作者 阎岩 宫辉 +1 位作者 陆建荣 夏刚 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期842-847,共6页
了解江苏省南京市和无锡市两地夏秋季急性胃肠炎人星状病毒(HastV)的基因亚型。收集2015~2016年6~11月江苏省南京市和无锡市两地夏秋季急性胃肠炎患者粪便标本,采用real-time RT-PCR法检测粪便中HAstV的病毒核酸,对阳性标本ORF2区进行RT... 了解江苏省南京市和无锡市两地夏秋季急性胃肠炎人星状病毒(HastV)的基因亚型。收集2015~2016年6~11月江苏省南京市和无锡市两地夏秋季急性胃肠炎患者粪便标本,采用real-time RT-PCR法检测粪便中HAstV的病毒核酸,对阳性标本ORF2区进行RT-PCR扩增及测序,与GenBank公开的序列进行比对,分析基因亚型情况。江苏省南京市和无锡市两地夏秋季急性胃肠炎HAstV感染的比例为15.26%,其中50%为合并其它急性胃肠炎病毒感染,HAstV感染以秋季流行为主,包含HAstV-1a(group 2)亚型和HAstV-4c基因亚型,并且这2个亚型在两地均有分布。HastV在婴幼儿人群中感染率较高;HAstV-1a亚型为在江苏省南京市和无锡市两地首次发现及报道的亚型,可能为欧美输入性毒株,本研究为进一步了解国内HAstV分子流行特征提供依据。 展开更多
关键词 星状病毒(AstV) 人星状病毒(hastv) 急性胃肠炎 ORF2 基因亚型
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人星状病毒、肠道腺病毒双重实时荧光RT-PCR方法的建立及应用 被引量：4
2
作者 毛彤瑶 刘诗琪 +8 位作者 裴银辉 王萌璇 章青 王宏 孔翔羽 李慧莹 张佳艳 段招军 李丹地 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期855-864,共10页
人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)、肠道腺病毒(Enteric adenovirus,EAdV)是引起急性胃肠炎的两种常见病原体,目前尚未实现这两种病原体荧光定量RT-PCR的单管双重检测。为建立一种灵敏特异的双重荧光定量RT-PCR检测方法并应用于实验... 人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)、肠道腺病毒(Enteric adenovirus,EAdV)是引起急性胃肠炎的两种常见病原体,目前尚未实现这两种病原体荧光定量RT-PCR的单管双重检测。为建立一种灵敏特异的双重荧光定量RT-PCR检测方法并应用于实验室样本检测,本研究选择HAstV、EAdV特异性引物和探针,优化反应体系和反应条件,并对该方法的灵敏性、特异性和稳定性进行评价。结果显示,该方法针对HAstV和EAdV的检出限分别可以达到522拷贝/μL和53.5拷贝/μL;与多种常见和罕见的人腹泻病毒没有交叉反应;批内和批间等重复性实验变异系数均小于5%;灵敏度高于常规PCR。本研究提示,建立的HAstV、EAdV双重荧光定量RT-PCR检测方法具有较好的灵敏度、特异性和稳定性,可用于实验室HAstV和EAdV的快速筛查。 展开更多
关键词 人星状病毒(hastv) 肠道腺病毒(EAdV) 急性胃肠炎 荧光定量RT-PCR
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南通地区9株4型星状病毒的全基因组序列分析 被引量：2
3
作者 季霄雷 郭陈 +9 位作者 丛辉 熊海平 陈璐 陈雨佳 孙怡华 严炳清 蔡秀丽 苏婧 梁如悦 陈诗瑶 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1261-1271,共11页
人类星状病毒(Human astrovirus,HAstV)是全球流行的引起急性胃肠炎常见病原体,主要引起幼儿、老年人及免疫功能低下人群的感染。本研究收集了江苏南通地区定点监测医院门、急诊<5岁儿童急性胃肠炎腹泻监测粪便标本712份,共检测出HA... 人类星状病毒(Human astrovirus,HAstV)是全球流行的引起急性胃肠炎常见病原体,主要引起幼儿、老年人及免疫功能低下人群的感染。本研究收集了江苏南通地区定点监测医院门、急诊<5岁儿童急性胃肠炎腹泻监测粪便标本712份,共检测出HAstV阳性22例。对Ct<30的样本进行病毒的分离培养,共得到9个HAstV分离株。对这9个分离株进行了全基因组的测序及分析,以表征其遗传变异及进化特征。所有分离株经blastn比对后,发现其基因序列均与4型HAstV一致性最高。与HAstV-4原型株MK059952相比有较大变异,核苷酸一致性为88.15%~91.98%。重组分析发现9个分离株呈现出两种不同的进化重组方向。氨基酸置换熵值分析及选择压力分析发现有3个氨基酸位点同时满足易突变位点及适应性演化位点,这可能是HAstV能持续在全球流行的因素之一。本研究为南通地区流行的HAstV的遗传多样性和重组提供了进一步的证据,对HAstV引起相关疾病的预防控制将发挥重要作用。 展开更多
关键词 星状病毒 全基因组 hastv-4c 病毒重组 选择压力分析
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人星状病毒1型衣壳蛋白原核表达、纯化及多克隆抗体制备的研究 被引量：1
4
作者 吴立梦 翁康生 +3 位作者 陆晔 陈敏 吴凡 王文静 《生物医学工程与临床》 CAS 2012年第3期272-278,共7页
目的表达纯化人星状病毒1型(HAstV-1)衣壳蛋白VP26片段,制备多克隆抗体,初步建立夹心酶联免疫吸附分析(ELISA)检测病毒抗原方法,为进一步大量表达VP26片段、构建基因工程疫苗和临床检测奠定基础。方法利用原核表达系统在大肠杆菌中克隆... 目的表达纯化人星状病毒1型(HAstV-1)衣壳蛋白VP26片段,制备多克隆抗体,初步建立夹心酶联免疫吸附分析(ELISA)检测病毒抗原方法,为进一步大量表达VP26片段、构建基因工程疫苗和临床检测奠定基础。方法利用原核表达系统在大肠杆菌中克隆、表达重组VP26蛋白,并以Ni2+-NTA亲和层析法纯化重组蛋白,运用十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)、二噻啉甲酸法(BCA)实验、Western blot等方法对重组蛋白纯度、浓度、抗原性进行评价鉴定。以重组VP26蛋白作为抗原,免疫新西兰大耳兔获得多抗血清并对其效价、特异性用ELISA鉴定。结果原核表达载体pET30a(+)-VP26构建成功,重组VP26蛋白可在大肠杆菌Rosetta 2宿主菌中大量表达。免疫兔所得多抗血清效价达到1∶8 000,可以满足夹心法ELISA实验的需要。结论HAstV-1衣壳蛋白原核表达系统建立和多克隆抗体制备可以作为今后相关研究的基础,有助于对HAstV-1感染致病机制、免疫诊断和疫苗研制的更深入研究。 展开更多
关键词 人星状病毒1型 VP26片段 原核表达 多克隆抗体
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贝类水产品星状病毒高效NanoPCR检测方法的建立及初步应用 被引量：1
5
作者 林鹏 李倩楠 +3 位作者 宋姗姗 李学鹏 吴清平 励建荣 《渤海大学学报（自然科学版）》 CAS 2024年第1期1-11,共11页
人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)是导致全球腹泻的主要病原体之一,主要存在于贝类水产品中.消费者通过加工、烹饪贝类水产品等过程感染HAstV,并伴有腹泻、呕吐等临床症状.因此,为及时发现贝类水产品中的HAstV和保障消费者食品安全,... 人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)是导致全球腹泻的主要病原体之一,主要存在于贝类水产品中.消费者通过加工、烹饪贝类水产品等过程感染HAstV,并伴有腹泻、呕吐等临床症状.因此,为及时发现贝类水产品中的HAstV和保障消费者食品安全,本研究将纳米材料融入到PCR检测方法中,建立一种操作简便、灵敏度高和特异性强的HAstV检测方法.针对具有保守HAstVORF2基因序列设计特异性引物,通过优化纳米金颗粒含量、引物浓度及退火温度,建立HAstV纳米PCR(Nanomaterial-assisted PCR,NanoPCR)检测方法.研究发现HAstVNanoPCR检测方法具有较高的敏感性和特异性,其最低病毒检测限为2.0×10^(0)copies/μL,灵敏度是传统PCR的1000倍,与贝类水产品中其他常见的病毒无交叉反应;HAstV NanoPCR方法检测贝类水产品HAstV检出率为7.5%,而传统PCR检出率为5.35%.研究表明建立的HAstV NanoPCR检测方法适用于筛选贝类水产品中的HAstV,后续可应用于检测水产品中HAstV流行情况,为保障消费者食品安全提供技术保障. 展开更多
关键词 NanoPCR hastv 贝类水产品 食品安全
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