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HABP4基因在大白猪和莱芜猪杂交一代中表达量差异研究
1
作者
邱峥艳
孟纪伦
+4 位作者
郭将
李传民
刘一诺
姜运良
赵志辉
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第9期1249-1252,共4页
采用实时荧光定量PCR技术检测透明质酸接合蛋白(HABP4)基因在大白猪和莱芜猪2种杂交子代背最长肌组织中的表达水平差异情况。试验结果表明,HABP4基因在所检测的背最长肌组织中均有表达。且在2种杂交一代背最长肌组织中的表达水平有所不...
采用实时荧光定量PCR技术检测透明质酸接合蛋白(HABP4)基因在大白猪和莱芜猪2种杂交子代背最长肌组织中的表达水平差异情况。试验结果表明,HABP4基因在所检测的背最长肌组织中均有表达。且在2种杂交一代背最长肌组织中的表达水平有所不同。HABP4基因的表达量在正交一代的背最长肌中显著高于反交一代。本试验为猪屠宰性状的改良提供了分子遗传学依据,并为深入研究不同品种猪体内HABP4基因的生物学作用及作用机制奠定了基础。
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关键词
莱芜猪
大白猪
habp4
实时荧光定量PCR
表达水平
原文传递
山羊HABP4基因的克隆、序列分析及功能预测
被引量:
5
2
作者
王宪军
向华
+2 位作者
张焕容
任玉鹏
朱江江
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期3426-3438,共13页
旨在克隆简州山羊HABP4基因,鉴定与HABP4互作蛋白的mRNA表达水平并分析其相关性,为进一步探讨HABP4基因在调控山羊细胞凋亡中的作用奠定基础。于四川省简阳大哥大牧业有限公司随机选取10月龄左右,体重为55 kg左右的健康简州大耳羊公羊(1...
旨在克隆简州山羊HABP4基因,鉴定与HABP4互作蛋白的mRNA表达水平并分析其相关性,为进一步探讨HABP4基因在调控山羊细胞凋亡中的作用奠定基础。于四川省简阳大哥大牧业有限公司随机选取10月龄左右,体重为55 kg左右的健康简州大耳羊公羊(16只),清晨空腹屠宰后迅速采集各山羊心、肝、脾、肺、肾、小肠、大肠、瘤胃和胰腺9个组织样本,TRIzol法提取组织总RNA,并反转录cDNA。RT-PCR技术克隆山羊HABP4基因cDNA序列,利用在线软件进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测HABP4基因在不同组织中的表达量(n=16)以及分析在胰腺(n=16)组织中与该HABP4蛋白可能存在相互作用的10个蛋白的mRNA表达特性及其相关性。结果,成功扩增山羊HABP4基因1 496 bp,包含5′UTR 61 bp, CDS区1 254 bp, 3′UTR 181 bp,编码417个氨基酸残基。HABP4 mRNA在山羊各组织中均有表达,在胰腺中表达水平最高,且与UAB52呈极显著正相关,和RPL32、RPS9呈显著正相关,推测其在细胞定位、新陈代谢、多生物过程及生物过程负调节以及翻译起始、核糖体转录、细胞质代谢等方面发挥着重要作用。本研究成功克隆山羊HABP4基因cDNA全长1 496 bp,其可能与UAB52、RPL32和RPS9呈显著正相关。这些结果也为进一步探讨HABP4在调控细胞凋亡过程中的作用提供了参考数据。
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关键词
山羊
habp4
克隆
表达特性
功能预测
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职称材料
肾细胞癌组织中高表达的miRNA let-7i-5p通过透明质酸结合蛋白4调控769-P细胞的恶性生物学行为
被引量:
2
3
作者
扈星
刘玉洁
张志红
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1075-1080,共6页
目的:探讨miRNA let-7i-5p在肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)组织中的表达水平及其对RCC细胞769-P的增殖、迁移、侵袭和透明质酸结合蛋白4(hyaluronan-binding protein 4,HABP4)表达的影响。方法:利用TCGA RCC数据库及GEO数据库对le...
目的:探讨miRNA let-7i-5p在肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)组织中的表达水平及其对RCC细胞769-P的增殖、迁移、侵袭和透明质酸结合蛋白4(hyaluronan-binding protein 4,HABP4)表达的影响。方法:利用TCGA RCC数据库及GEO数据库对let-7i-5p在RCC组织中的表达进行meta分析。体外常规培养人RCC细胞769-P并对其进行转染,根据转染物不同分为过表达组(转染let-7i-5p模拟物)、抑制组(转染let-7i-5p抑制物)和对照组(转染NC序列)。采用CCK-8、细胞划痕实验、Transwell实验及WB法检测let-7i-5p对769-P细胞增殖活力、划痕愈合率、穿膜侵袭细胞数及HABP4表达水平的影响。双荧光素酶报告基因实验验证let-7i-5p与HABP4 mRNA的靶向关系。结果:分析TCGA RCC数据库及5个GEO数据集(GSE23085、GSE47582、GSE95385、GSE16441和GSE71302)中数据结果显示,let-7i-5p在RCC组织中的表达水平显著高于正常肾组织(均P<0.05)。体外实验结果显示,与对照组相比,过表达组在24、48及72 h时细胞增殖活力显著升高,而抑制组显著降低(均P<0.01);过表达组的划痕愈合率[(37.276±2.058)%vs(15.663±2.949)%,P<0.01]和穿膜侵袭细胞数[(377.000±34.044)vs(255.667±25.384)个,P<0.01]均显著升高,而抑制组的划痕愈合率[(8.791±2.568)%vs(15.663±2.949)%,P<0.05]和穿膜侵袭细胞数[(170.333±14.978)vs(255.667±25.384)个,P<0.01]均显著降低。在野生型HABP4-3’URT质粒组中,过表达let-7i-5p可显著抑制细胞的荧光素酶活性(P<0.01);而在突变型HABP4-3’URT质粒组中,过表达let-7i-5p对细胞的荧光素酶活性无影响(NS,P>0.05)。WB检测结果显示,与对照组相比,过表达组的HABP4和E-cadherin的水平均降低(均P<0.01)、CDK2的水平升高(P<0.01),而抑制组则相反(均P<0.01)。结论:Let-7i-5p在RCC组织中呈高表达,其可能通过靶向HABP4基因来促进769-P细胞的增殖、迁移和侵袭。
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关键词
肾细胞癌
微小RNA
let-7i-5p
769-P细胞
透明质酸结合蛋白4
增殖
迁移
侵袭
原文传递
题名
HABP4基因在大白猪和莱芜猪杂交一代中表达量差异研究
1
作者
邱峥艳
孟纪伦
郭将
李传民
刘一诺
姜运良
赵志辉
机构
吉林大学畜牧兽医学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第9期1249-1252,共4页
基金
国家"863"计划资助项目(2008AA10Z136)
文摘
采用实时荧光定量PCR技术检测透明质酸接合蛋白(HABP4)基因在大白猪和莱芜猪2种杂交子代背最长肌组织中的表达水平差异情况。试验结果表明,HABP4基因在所检测的背最长肌组织中均有表达。且在2种杂交一代背最长肌组织中的表达水平有所不同。HABP4基因的表达量在正交一代的背最长肌中显著高于反交一代。本试验为猪屠宰性状的改良提供了分子遗传学依据,并为深入研究不同品种猪体内HABP4基因的生物学作用及作用机制奠定了基础。
关键词
莱芜猪
大白猪
habp4
实时荧光定量PCR
表达水平
Keywords
Laiwu pigs
Large White pigs
habp4
RT-PCR
expression level
分类号
S813 [农业科学—畜牧学]
S852.2 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
山羊HABP4基因的克隆、序列分析及功能预测
被引量:
5
2
作者
王宪军
向华
张焕容
任玉鹏
朱江江
机构
西南民族大学畜牧兽医学院
青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期3426-3438,共13页
基金
四川省科技计划(2020JDJQ0010)
四川省畜禽育种攻关项目(2021YFYZ0003)
西南民族大学优秀学术培养工程项目(2021 NYYXS95)。
文摘
旨在克隆简州山羊HABP4基因,鉴定与HABP4互作蛋白的mRNA表达水平并分析其相关性,为进一步探讨HABP4基因在调控山羊细胞凋亡中的作用奠定基础。于四川省简阳大哥大牧业有限公司随机选取10月龄左右,体重为55 kg左右的健康简州大耳羊公羊(16只),清晨空腹屠宰后迅速采集各山羊心、肝、脾、肺、肾、小肠、大肠、瘤胃和胰腺9个组织样本,TRIzol法提取组织总RNA,并反转录cDNA。RT-PCR技术克隆山羊HABP4基因cDNA序列,利用在线软件进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测HABP4基因在不同组织中的表达量(n=16)以及分析在胰腺(n=16)组织中与该HABP4蛋白可能存在相互作用的10个蛋白的mRNA表达特性及其相关性。结果,成功扩增山羊HABP4基因1 496 bp,包含5′UTR 61 bp, CDS区1 254 bp, 3′UTR 181 bp,编码417个氨基酸残基。HABP4 mRNA在山羊各组织中均有表达,在胰腺中表达水平最高,且与UAB52呈极显著正相关,和RPL32、RPS9呈显著正相关,推测其在细胞定位、新陈代谢、多生物过程及生物过程负调节以及翻译起始、核糖体转录、细胞质代谢等方面发挥着重要作用。本研究成功克隆山羊HABP4基因cDNA全长1 496 bp,其可能与UAB52、RPL32和RPS9呈显著正相关。这些结果也为进一步探讨HABP4在调控细胞凋亡过程中的作用提供了参考数据。
关键词
山羊
habp4
克隆
表达特性
功能预测
Keywords
goat
HABP 4
clone
expression characteristics
functional prediction
分类号
S858.26 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
肾细胞癌组织中高表达的miRNA let-7i-5p通过透明质酸结合蛋白4调控769-P细胞的恶性生物学行为
被引量:
2
3
作者
扈星
刘玉洁
张志红
机构
西南医科大学附属医院全科医学科
西南医科大学附属医院老年医学科
出处
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1075-1080,共6页
基金
西南医科大学青年基金资助项目(No.2018-ZRQN-142
No.2018-ZRQN-041)。
文摘
目的:探讨miRNA let-7i-5p在肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)组织中的表达水平及其对RCC细胞769-P的增殖、迁移、侵袭和透明质酸结合蛋白4(hyaluronan-binding protein 4,HABP4)表达的影响。方法:利用TCGA RCC数据库及GEO数据库对let-7i-5p在RCC组织中的表达进行meta分析。体外常规培养人RCC细胞769-P并对其进行转染,根据转染物不同分为过表达组(转染let-7i-5p模拟物)、抑制组(转染let-7i-5p抑制物)和对照组(转染NC序列)。采用CCK-8、细胞划痕实验、Transwell实验及WB法检测let-7i-5p对769-P细胞增殖活力、划痕愈合率、穿膜侵袭细胞数及HABP4表达水平的影响。双荧光素酶报告基因实验验证let-7i-5p与HABP4 mRNA的靶向关系。结果:分析TCGA RCC数据库及5个GEO数据集(GSE23085、GSE47582、GSE95385、GSE16441和GSE71302)中数据结果显示,let-7i-5p在RCC组织中的表达水平显著高于正常肾组织(均P<0.05)。体外实验结果显示,与对照组相比,过表达组在24、48及72 h时细胞增殖活力显著升高,而抑制组显著降低(均P<0.01);过表达组的划痕愈合率[(37.276±2.058)%vs(15.663±2.949)%,P<0.01]和穿膜侵袭细胞数[(377.000±34.044)vs(255.667±25.384)个,P<0.01]均显著升高,而抑制组的划痕愈合率[(8.791±2.568)%vs(15.663±2.949)%,P<0.05]和穿膜侵袭细胞数[(170.333±14.978)vs(255.667±25.384)个,P<0.01]均显著降低。在野生型HABP4-3’URT质粒组中,过表达let-7i-5p可显著抑制细胞的荧光素酶活性(P<0.01);而在突变型HABP4-3’URT质粒组中,过表达let-7i-5p对细胞的荧光素酶活性无影响(NS,P>0.05)。WB检测结果显示,与对照组相比,过表达组的HABP4和E-cadherin的水平均降低(均P<0.01)、CDK2的水平升高(P<0.01),而抑制组则相反(均P<0.01)。结论:Let-7i-5p在RCC组织中呈高表达,其可能通过靶向HABP4基因来促进769-P细胞的增殖、迁移和侵袭。
关键词
肾细胞癌
微小RNA
let-7i-5p
769-P细胞
透明质酸结合蛋白4
增殖
迁移
侵袭
Keywords
renal cell carcinoma(RCC)
miRNA
let-7i-5p
769-P cell
hyaluronan-binding protein 4(
habp4
)
proliferation
migration
invasion
分类号
R737.11 [医药卫生—肿瘤]
R730.2 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HABP4基因在大白猪和莱芜猪杂交一代中表达量差异研究
邱峥艳
孟纪伦
郭将
李传民
刘一诺
姜运良
赵志辉
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
原文传递
2
山羊HABP4基因的克隆、序列分析及功能预测
王宪军
向华
张焕容
任玉鹏
朱江江
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
肾细胞癌组织中高表达的miRNA let-7i-5p通过透明质酸结合蛋白4调控769-P细胞的恶性生物学行为
扈星
刘玉洁
张志红
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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