目的探讨DIRAS家族GTP酶3(DIRAS3)在胶质瘤中的表达及其预后预测价值。方法使用阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(The University of ALabama at Birmingham Cancer data analysis Portal,UALCAN)、基因表达谱交互分析2.0(Gene E...目的探讨DIRAS家族GTP酶3(DIRAS3)在胶质瘤中的表达及其预后预测价值。方法使用阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(The University of ALabama at Birmingham Cancer data analysis Portal,UALCAN)、基因表达谱交互分析2.0(Gene Expression Profiling Interactive Analys,GEPIA 2.0)和人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库评估DIRAS3在癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas Program,TCGA)数据库中低级别胶质瘤(low-grade glioma,LGG)和胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)中的表达及对临床预后的预测价值,并利用反转录实时定量PCR(real-time quantitative reverse tranion PCR,qRT-PCR)和蛋白印迹(western blotting,WB)验证DIRAS3在人星型胶质细胞和胶质瘤细胞中的表达。基于cBioPortal数据库分析GBM中与DIRAS3正相关的基因,利用STRING数据库进行聚类,选择包含DIRAS3的Cluster进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。利用泛癌药物敏感性的综合分析(comprehensive analysis of drug sensitivity in pancancer,CADSP)数据库进行药物敏感性分析。结果DIRAS3在胶质瘤中高表达并与世界卫生组织(World Health Organization,WHO)分级、异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)状态、1p/19q共缺失状态、年龄以及较差的预后相关。此外,DIRAS3被预测参与细胞运动正向调节、焦点粘附、血管发育,以及癌症中的转录失调,并对多种抗肿瘤药物敏感。结论DIRAS3在胶质瘤中具有致癌作用,是一种新的、预后相关的候选基因,并且是胶质瘤的潜在诊断标志物和有希望的治疗靶点。展开更多
文摘目的探讨DIRAS家族GTP酶3(DIRAS3)在胶质瘤中的表达及其预后预测价值。方法使用阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(The University of ALabama at Birmingham Cancer data analysis Portal,UALCAN)、基因表达谱交互分析2.0(Gene Expression Profiling Interactive Analys,GEPIA 2.0)和人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库评估DIRAS3在癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas Program,TCGA)数据库中低级别胶质瘤(low-grade glioma,LGG)和胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)中的表达及对临床预后的预测价值,并利用反转录实时定量PCR(real-time quantitative reverse tranion PCR,qRT-PCR)和蛋白印迹(western blotting,WB)验证DIRAS3在人星型胶质细胞和胶质瘤细胞中的表达。基于cBioPortal数据库分析GBM中与DIRAS3正相关的基因,利用STRING数据库进行聚类,选择包含DIRAS3的Cluster进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。利用泛癌药物敏感性的综合分析(comprehensive analysis of drug sensitivity in pancancer,CADSP)数据库进行药物敏感性分析。结果DIRAS3在胶质瘤中高表达并与世界卫生组织(World Health Organization,WHO)分级、异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)状态、1p/19q共缺失状态、年龄以及较差的预后相关。此外,DIRAS3被预测参与细胞运动正向调节、焦点粘附、血管发育,以及癌症中的转录失调,并对多种抗肿瘤药物敏感。结论DIRAS3在胶质瘤中具有致癌作用,是一种新的、预后相关的候选基因,并且是胶质瘤的潜在诊断标志物和有希望的治疗靶点。
