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陆地棉GhSPL3基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
被引量:
8
1
作者
李洁
范术丽
+2 位作者
宋美珍
庞朝友
喻树迅
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2012年第5期414-419,共6页
利用生物信息学结合RT-PCR技术从陆地棉中克隆出SPL转录因子,命名为GhSPL3,在GenBank的登录号为JN795132。该基因包含一个426 bp的ORF(开放阅读框),推测编码141个氨基酸的多肽。生物信息学分析表明GhSPL3包含一个典型的SBP结构域和一个...
利用生物信息学结合RT-PCR技术从陆地棉中克隆出SPL转录因子,命名为GhSPL3,在GenBank的登录号为JN795132。该基因包含一个426 bp的ORF(开放阅读框),推测编码141个氨基酸的多肽。生物信息学分析表明GhSPL3包含一个典型的SBP结构域和一个核定位信号;进化树分析发现,GhSPL3与AtSPL3聚为一组,推测棉花GhSPL3和拟南芥AtSPL3在结构和功能上可能有着一定的相似性。亚细胞定位表明,GhSPL3定位于细胞核中,荧光定量RT-PCR结果表明,GhSPL3基因在棉花各组织中都有表达,但表达量不同。在花中表达量最高,其次是在顶芽和茎中的表达量,在根和叶中表达量较低。通过分析GhSPL3在顶芽的不同发育时期的表达量发现,GhSPL3在三片真叶展平时的顶芽中表达量最高,推测GhSPL3可能在花芽的分化、生长阶段的转变和花器官的形成上起着重要作用。
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关键词
陆地棉
ghspl3
亚细胞定位
荧光定量RT—PCR
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职称材料
题名
陆地棉GhSPL3基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
被引量:
8
1
作者
李洁
范术丽
宋美珍
庞朝友
喻树迅
机构
西北农林科技大学
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2012年第5期414-419,共6页
基金
国家高技术研究发展计划(2011AA10A102)
国家棉花产业技术体系(CARS-18)
文摘
利用生物信息学结合RT-PCR技术从陆地棉中克隆出SPL转录因子,命名为GhSPL3,在GenBank的登录号为JN795132。该基因包含一个426 bp的ORF(开放阅读框),推测编码141个氨基酸的多肽。生物信息学分析表明GhSPL3包含一个典型的SBP结构域和一个核定位信号;进化树分析发现,GhSPL3与AtSPL3聚为一组,推测棉花GhSPL3和拟南芥AtSPL3在结构和功能上可能有着一定的相似性。亚细胞定位表明,GhSPL3定位于细胞核中,荧光定量RT-PCR结果表明,GhSPL3基因在棉花各组织中都有表达,但表达量不同。在花中表达量最高,其次是在顶芽和茎中的表达量,在根和叶中表达量较低。通过分析GhSPL3在顶芽的不同发育时期的表达量发现,GhSPL3在三片真叶展平时的顶芽中表达量最高,推测GhSPL3可能在花芽的分化、生长阶段的转变和花器官的形成上起着重要作用。
关键词
陆地棉
ghspl3
亚细胞定位
荧光定量RT—PCR
Keywords
Gossypium hirsutum L.
ghspl3
subcellular localization
quantitative RT-PCR
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陆地棉GhSPL3基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
李洁
范术丽
宋美珍
庞朝友
喻树迅
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2012
8
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