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利用基因芯片技术筛选棉花产量性状相关的基因
被引量:
4
1
作者
张利媛
于霁雯
+7 位作者
吴嫚
马建辉
范术丽
宋美珍
庞朝友
李兴丽
张金发
喻树迅
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2013年第5期417-425,共9页
根据皮棉产量数据的重复性测验及显著性分析,从SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium Barbadense L.)的回交自交系群体中选取高产组和低产组品系各3个材料,取这2组材料和其父母本开花后10 d的纤维进行芯片分析。比较芯片数据...
根据皮棉产量数据的重复性测验及显著性分析,从SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium Barbadense L.)的回交自交系群体中选取高产组和低产组品系各3个材料,取这2组材料和其父母本开花后10 d的纤维进行芯片分析。比较芯片数据,获得了1508个差异表达基因。对这些差异表达基因进行聚类分析,结果显示高产组品系和低产组品系分别聚类在一起,符合基于田间数据分组的预期结果。利用Blast2GO软件对1508个差异表达基因进行Blast-Mapping-Annotation-KEGG分析,结果表明参与细胞质膜发育、过氧化物酶活性、抗逆和营养物质运输等生物学过程的基因最多。进一步利用RT-PCR分析,得到一系列与纤维品质和产量等性状密切相关的基因。研究结果为棉花高产基因工程和分子育种提供了丰富的基因资源。
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关键词
棉花
产量
基因芯片
GhMKRP2
ghpod
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职称材料
题名
利用基因芯片技术筛选棉花产量性状相关的基因
被引量:
4
1
作者
张利媛
于霁雯
吴嫚
马建辉
范术丽
宋美珍
庞朝友
李兴丽
张金发
喻树迅
机构
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
华中农业大学植物科技学院.武汉
中国石油集团工程设计有限责任公司华北分公司
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2013年第5期417-425,共9页
基金
国家863计划(2013AA102601-01-14)
国家科技支撑计划(2011BAD35B05-1-6)
国家973计划(2010CB126006)
文摘
根据皮棉产量数据的重复性测验及显著性分析,从SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium Barbadense L.)的回交自交系群体中选取高产组和低产组品系各3个材料,取这2组材料和其父母本开花后10 d的纤维进行芯片分析。比较芯片数据,获得了1508个差异表达基因。对这些差异表达基因进行聚类分析,结果显示高产组品系和低产组品系分别聚类在一起,符合基于田间数据分组的预期结果。利用Blast2GO软件对1508个差异表达基因进行Blast-Mapping-Annotation-KEGG分析,结果表明参与细胞质膜发育、过氧化物酶活性、抗逆和营养物质运输等生物学过程的基因最多。进一步利用RT-PCR分析,得到一系列与纤维品质和产量等性状密切相关的基因。研究结果为棉花高产基因工程和分子育种提供了丰富的基因资源。
关键词
棉花
产量
基因芯片
GhMKRP2
ghpod
Keywords
cotton
yield
gene chip
GhMKRP2
ghpod
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用基因芯片技术筛选棉花产量性状相关的基因
张利媛
于霁雯
吴嫚
马建辉
范术丽
宋美珍
庞朝友
李兴丽
张金发
喻树迅
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2013
4
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